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题名小麦DA1基因家族成员的鉴定及其表达谱分析
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作者
宫盼盼
陈浩
宋成祥
许书豪
张杏
茆海亮
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机构
华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室/华中农业大学植物科学技术学院
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出处
《麦类作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第6期659-668,共10页
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基金
中央高校基本科研业务费专项(11041810314)。
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文摘
泛素受体DA1在控制种子和器官大小上发挥着重要作用。本研究以中国春小麦为材料,采用生物信息学的方法对小麦DA1基因家族成员进行了全基因组鉴定和分析,共鉴定到12个小麦DA1同源基因(TaDA1s),分别位于2B、2D、4A、4B、4D、5A、5B和5D染色体上,亚细胞定位预测结果表明其位于细胞核中。系统进化分析发现,TaDA1s可分为TaDA1、TaDAR1和TaDAR2三类。除TaDA1-2D1编码的蛋白只含有DA1-like结构域外,其他成员编码的蛋白均含有DA1-like、UIM和LIM结构域。启动子序列分析发现,TaDA1s的启动子区含有较多的响应激素、逆境以及与生长发育相关的顺式作用元件。通过公共的转录组数据和qRT-PCR试验验证,发现TaDA1s在不同组织中都有表达,在籽粒发育过程中,不同的小麦DA1基因呈现不同的表达模式,暗示存在基因功能分化现象;脱落酸(ABA)能够抑制TaDA1s的表达;在低温和盐胁迫条件下,TaDA1s基因表达有明显的差异。酵母双杂交和荧光素酶互补试验发现,TaDA1-2B、TaDAR1-5A和TaGW2存在转录自激活现象,且TaDAR1-5A与TaGW2有微弱的互作效应。本研究结果为进一步探究DA1基因家族在小麦中的生物学功能奠定了基础。
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关键词
小麦
DA1基因家族
生物信息学
基因表达
蛋白互作
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Keywords
Wheat
DAI gene family
Bioinformatics
Gene expression
Protein interaction
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分类号
S512.1
[农业科学—作物学]
S330
[农业科学—作物遗传育种]
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