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凝胶微球芯片实验数据分析方法的设计与应用
被引量：
2
1
作者
李成
黄欢
+1 位作者
孙啸
周国华
《中国生物医学工程学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第4期492-497,共6页
在一种使用凝胶微球芯片新技术进行基因突变分析的生物学方法中,芯片上红绿两种颜色微球个数的比例代表了正常基因与突变基因的比例。针对微球芯片扫描的图像,发展一种新的方法对图像进行处理和分析,自动识别不同颜色的微球,得到分别代...
在一种使用凝胶微球芯片新技术进行基因突变分析的生物学方法中,芯片上红绿两种颜色微球个数的比例代表了正常基因与突变基因的比例。针对微球芯片扫描的图像,发展一种新的方法对图像进行处理和分析,自动识别不同颜色的微球,得到分别代表野生型和突变型的红色微球和绿色微球的各自个数,并开发了相应软件。取单色通道,然后灰度化,使用迭代法和大津法进行二值化的阈值选取,再用中值滤波算法进行噪声杂点消除,最后进行信号点识别及计数。通过对扫描图像的人工计数和软件计数结果的对比,新的方法相对于人工计数结果的偏差率小于10%。实践表明,新方法在处理和分析微球芯片图像时,目标识别结果达到要求,相应软件已在大肠癌早期诊断的生物学研究中应用,提高了分析效率。
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关键词
图像分析
微球芯片
图像识别
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职称材料
题名
凝胶微球芯片实验数据分析方法的设计与应用
被引量：
2
1
作者
李成
黄欢
孙啸
周国华
机构
生物
电子学国家重点实验室东南大学
生物医学
工程学院
华东生物医学技术研究所
出处
《中国生物医学工程学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第4期492-497,共6页
基金
国家自然科学基金资助项目(30470454)
南京科学技术发展项目支持(200801087)
文摘
在一种使用凝胶微球芯片新技术进行基因突变分析的生物学方法中,芯片上红绿两种颜色微球个数的比例代表了正常基因与突变基因的比例。针对微球芯片扫描的图像,发展一种新的方法对图像进行处理和分析,自动识别不同颜色的微球,得到分别代表野生型和突变型的红色微球和绿色微球的各自个数,并开发了相应软件。取单色通道,然后灰度化,使用迭代法和大津法进行二值化的阈值选取,再用中值滤波算法进行噪声杂点消除,最后进行信号点识别及计数。通过对扫描图像的人工计数和软件计数结果的对比,新的方法相对于人工计数结果的偏差率小于10%。实践表明,新方法在处理和分析微球芯片图像时,目标识别结果达到要求,相应软件已在大肠癌早期诊断的生物学研究中应用,提高了分析效率。
关键词
图像分析
微球芯片
图像识别
Keywords
image analysis
bead-array
image identification
分类号
R318 [医药卫生—生物医学工程]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
凝胶微球芯片实验数据分析方法的设计与应用
李成
黄欢
孙啸
周国华
《中国生物医学工程学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010
2
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