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无底物情况下来自Rhodococcus zopfii的腈水解酶中亲核进攻试剂CYS165的活性状态的探究(英文)
1
作者
张慧珠
高旭丹
梅晔
《南京大学学报(自然科学版)》
北大核心
2025年第1期129-139,共11页
腈水解酶作为一类在工业应用中具有巨大价值的绿色生物催化剂,能够高效地催化腈基化合物转化为羧酸.尽管其应用广泛,但腈水解酶的具体催化机制仍然不明确.先前的研究揭示了腈水解酶活性中心的GLU-LYS-GLU-CYS四联体在催化中起到关键作用...
腈水解酶作为一类在工业应用中具有巨大价值的绿色生物催化剂,能够高效地催化腈基化合物转化为羧酸.尽管其应用广泛,但腈水解酶的具体催化机制仍然不明确.先前的研究揭示了腈水解酶活性中心的GLU-LYS-GLU-CYS四联体在催化中起到关键作用,其中CYS残基作为亲核试剂攻击腈基,其硫醇基团的电离是反应中的一个关键步骤,然而,CYS的去质子化过程尚未被清晰揭示.研究聚焦于来自Rhodococcus zopfii(RzNIT)的腈水解酶,并研究了底物尚未进入酶活性位点时CYS165的质子化状态.通过对CYS165去质子化可能路径的详细分析,确认了在无底物状态下RzNIT中的CYS165处于中性状态.这一发现为进一步研究RzNIT的催化机制奠定了基础.
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关键词
ONIOM(the
Own
n-Layered
Integrated
Molecular
Orbital
and
Molecular
Mechanics)
腈水解酶
能垒
催化机制
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职称材料
题名
无底物情况下来自Rhodococcus zopfii的腈水解酶中亲核进攻试剂CYS165的活性状态的探究(英文)
1
作者
张慧珠
高旭丹
梅晔
机构
精密光谱学国家重点实验室
华东师范大学⁃上海纽约大学计算化学联合中心
山西省极端光学协同创新
中心
出处
《南京大学学报(自然科学版)》
北大核心
2025年第1期129-139,共11页
基金
国家自然科学基金(22073030)
文摘
腈水解酶作为一类在工业应用中具有巨大价值的绿色生物催化剂,能够高效地催化腈基化合物转化为羧酸.尽管其应用广泛,但腈水解酶的具体催化机制仍然不明确.先前的研究揭示了腈水解酶活性中心的GLU-LYS-GLU-CYS四联体在催化中起到关键作用,其中CYS残基作为亲核试剂攻击腈基,其硫醇基团的电离是反应中的一个关键步骤,然而,CYS的去质子化过程尚未被清晰揭示.研究聚焦于来自Rhodococcus zopfii(RzNIT)的腈水解酶,并研究了底物尚未进入酶活性位点时CYS165的质子化状态.通过对CYS165去质子化可能路径的详细分析,确认了在无底物状态下RzNIT中的CYS165处于中性状态.这一发现为进一步研究RzNIT的催化机制奠定了基础.
关键词
ONIOM(the
Own
n-Layered
Integrated
Molecular
Orbital
and
Molecular
Mechanics)
腈水解酶
能垒
催化机制
Keywords
ONIOM(the Own n⁃Layered Integrated Molecular Orbital and Molecular Mechanics)
nitrilase
energy barrier
catalytic mechanism
分类号
O643 [理学—物理化学]
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作者
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被引量
操作
1
无底物情况下来自Rhodococcus zopfii的腈水解酶中亲核进攻试剂CYS165的活性状态的探究(英文)
张慧珠
高旭丹
梅晔
《南京大学学报(自然科学版)》
北大核心
2025
0
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