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萝卜根径发育候选基因的初步筛选
被引量：
4
1
作者
杜雪玲
马媛媛
+3 位作者
程洋洋
何军
宋运贤
余如刚
《西北农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第4期567-577,共11页
为了鉴定调控不同萝卜品种间根大小性状差异的关键基因,利用基于高通量测序的数字基因表达谱(DGE)技术,对2种根直径大小不同的圆球形萝卜‘扬州圆白’(直径大)和‘萨丁’(直径小)进行差异表达基因分析。测序共获得1 468个差异表达转录...
为了鉴定调控不同萝卜品种间根大小性状差异的关键基因,利用基于高通量测序的数字基因表达谱(DGE)技术,对2种根直径大小不同的圆球形萝卜‘扬州圆白’(直径大)和‘萨丁’(直径小)进行差异表达基因分析。测序共获得1 468个差异表达转录本。基于基因功能注释分析,共鉴定到参与细胞壁代谢相关的转录本28个,参与蔗糖代谢相关的转录本2个,参与激素合成与信号转导相关的转录本29个。利用RT-qPCR分析对6个细胞壁代谢相关基因的表达模式进行验证,其结果与测序结果基本一致。研究发现参与植物激素合成与激素信号转导相关基因(TIFYs、DELLA、 ERF2和 CYCD3)、蔗糖代谢相关基因( ATBETAFRUCT4和 HK3)和细胞壁代谢相关基因(XTHs、EXPs和COBs)可能是调控‘扬州圆白’和‘萨丁’萝卜根大小品种间差异的关键基因。
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关键词
数字基因表达谱
萝卜
根
大小
基因
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职称材料
题名
萝卜根径发育候选基因的初步筛选
被引量：
4
1
作者
杜雪玲
马媛媛
程洋洋
何军
宋运贤
余如刚
机构
淮北师范大学生命科学学院
北京阳光绿地生态科技有限公司
出处
《西北农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第4期567-577,共11页
基金
国家自然科学基金(31671599)
安徽省高校省级自然科学项目(KJ2016B014)
安徽自然科学基金(1708085MC55)~~
文摘
为了鉴定调控不同萝卜品种间根大小性状差异的关键基因,利用基于高通量测序的数字基因表达谱(DGE)技术,对2种根直径大小不同的圆球形萝卜‘扬州圆白’(直径大)和‘萨丁’(直径小)进行差异表达基因分析。测序共获得1 468个差异表达转录本。基于基因功能注释分析,共鉴定到参与细胞壁代谢相关的转录本28个,参与蔗糖代谢相关的转录本2个,参与激素合成与信号转导相关的转录本29个。利用RT-qPCR分析对6个细胞壁代谢相关基因的表达模式进行验证,其结果与测序结果基本一致。研究发现参与植物激素合成与激素信号转导相关基因(TIFYs、DELLA、 ERF2和 CYCD3)、蔗糖代谢相关基因( ATBETAFRUCT4和 HK3)和细胞壁代谢相关基因(XTHs、EXPs和COBs)可能是调控‘扬州圆白’和‘萨丁’萝卜根大小品种间差异的关键基因。
关键词
数字基因表达谱
萝卜
根
大小
基因
Keywords
Digital gene expression profiling
Radish
Root
Size
Gene
分类号
S631.1 [农业科学—蔬菜学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
萝卜根径发育候选基因的初步筛选
杜雪玲
马媛媛
程洋洋
何军
宋运贤
余如刚
《西北农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
4
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