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叶锈菌侵染的小麦叶片转录组数据分析被引量：11: 1; 作者刘娜乔妹 +4 位作者孙嘉伟陈琰侯春燕韩胜芳王冬梅《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期991-1000,共10页; 选取小麦近等基因系Tc Lr26与其轮回亲本Thatcher(Tc),与叶锈菌生理小种260分别组成不亲和及亲和组合,通过Illumina/Solexa平台的HiSeq^TM2000高通量测序技术对接种叶锈菌后的小麦转录组进行测序,利用Trinity软件将数据组装形成转录本,... 展开更多; 关键词小麦叶锈菌转录组; 在线阅读下载PDF 职称材料

胃癌脂代谢通路基因表达的转录组学高通量分析被引量：8: 2; 作者向丽娟汪圣毅 +3 位作者包楚阳张焱韩坤刘虎《安徽医科大学学报》 CAS 北大核心 2019年第1期5-9,共5页; 目的探讨胃癌(GC)脂代谢(LM)通路的基因表达情况。方法转录组测序筛选8例GC及4例癌旁组织之间的差异表达基因,京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析GC脂代谢相关通路中的关键基因(KGS)。结果高通量测序获得3 198个长度大于200 bp的... 展开更多; 关键词胃肿瘤转录组测序脂代谢关键基因; 在线阅读下载PDF 职称材料

罕见宫颈大细胞神经内分泌癌患者的维持妊娠与母婴管理被引量：1: 3; 作者戴戈扬陈高文 +7 位作者李肖璇郑友红王袁李兴嵩李菁周璟谢郁王沂峰《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期1-9,共9页; 目的探讨妊娠合并生殖道神经内分泌肿瘤(NETs)患者维持妊娠及母婴管理策略。方法结合癌灶体细胞系与母子胚系WGS测序和系统分析妊娠合并生殖道NETs报道病例诊疗方案,优化罕见宫颈大细胞NETs合并妊娠的诊疗策略。结果病例分析提示阴性淋... 展开更多; 关键词女性生殖道神经内分泌肿瘤大细胞神经内分泌癌维持妊娠母婴管理肿瘤易感基因; 在线阅读下载PDF 职称材料

环丙沙星胁迫对小麦生理及代谢的影响被引量：4: 4; 作者赵里曼牟美睿 +3 位作者武丽娟贲蓓倍杨仁杰刘海学《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2022年第10期2311-2318,共8页; 【目的】探究环丙沙星(Ciprofloxacin, CIP)对小麦幼苗生理及代谢的影响,拓展植物对抗生素响应机制的理解。【方法】对小麦‘百农207’幼苗进行不同浓度CIP胁迫处理,测定小麦幼苗的生理指标,并通过气相色谱质谱联用技术(GC-MS)测定其代... 展开更多; 关键词环丙沙星小麦生理代谢组差异代谢物代谢通路; 在线阅读下载PDF 职称材料

副干酪乳杆菌ZG19发酵烟草废水产L-乳酸的响应面优化被引量：2: 5; 作者陈辰朱润琪 +5 位作者刘丽马轩叶晓婉杨增光席宇朱大恒《中国酿造》 CAS 北大核心 2018年第2期100-105,共6页; 烟草废水中含有大量的可溶性糖、含氮化合物和矿物质等营养成分。为资源化利用烟草废水,以本实验室分离并保藏的一株产L-乳酸的副干酪乳杆菌(Lactobacillus paracasei)ZG19为发酵菌株,以烟草废水为发酵底料,L-乳酸产量为响应值,采用响... 展开更多; 关键词 L-乳酸副干酪乳杆菌烟草废水发酵工艺响应面法; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名叶锈菌侵染的小麦叶片转录组数据分析被引量：11: 1; 作者刘娜乔妹孙嘉伟陈琰侯春燕韩胜芳王冬梅; 机构河北省植物生理与分子病理学重点实验室/河北农业大学生命科学学院北京诺禾致源科技股份有限公司; 出处《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期991-1000,共10页; 基金国家自然科学基金(31171472,31871548) 高等学校博士学科点专项科研基金(优先发展领域,20111302130001) 河北省应用基础研究计划重点基础研究项目(12967149D)~~; 文摘选取小麦近等基因系Tc Lr26与其轮回亲本Thatcher(Tc),与叶锈菌生理小种260分别组成不亲和及亲和组合,通过Illumina/Solexa平台的HiSeq^TM2000高通量测序技术对接种叶锈菌后的小麦转录组进行测序,利用Trinity软件将数据组装形成转录本,对所有转录本进行COG、GO和KEGG分类和功能注释、Pathway注释以及蛋白编码区的预测。结果表明,转录组测序片段经de novo拼接共得到87291条平均长度866 bp的Unigenes;通过功能聚类,分别获得25个COG分类、55个GO功能亚类和128条KEGG通路;差异表达基因分析显示,相对于亲和组合,不亲和组合在接种叶锈菌后8 h上调Unigenes4037条,下调Unigenes 1949条;接种后24 h,上调Unigenes 2122条,下调Unigenes 3248条。其中植物与病原物互作过程中的钙信号通路,活性氧爆发及SA信号通路相关基因在不同时间有差异表达,在接种后8 h所表达的差异基因可能与基础防卫反应诱发密切相关,而在接种后24 h的差异表达基因可能与Lr26介导的过敏性防卫反应表达有紧密联系。这为深入分析和发掘小麦抗叶锈病相关基因及系统研究小麦抗锈病分子机制奠定了坚实基础。; 关键词小麦叶锈菌转录组; Keywords wheat Puccinia triticina transcriptome; 分类号 S435.121.43 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名胃癌脂代谢通路基因表达的转录组学高通量分析被引量：8: 2; 作者向丽娟汪圣毅包楚阳张焱韩坤刘虎; 机构安徽医科大学第一附属医院肿瘤内科安徽医科大学第一附属医院普外科北京诺禾致源科技股份有限公司中国科学技术大学附属第一医院西区(安徽省肿瘤医院); 出处《安徽医科大学学报》 CAS 北大核心 2019年第1期5-9,共5页; 基金国家自然科学基金(编号:81472750) 安徽省自然科学基金(编号:1508085MH171); 文摘目的探讨胃癌(GC)脂代谢(LM)通路的基因表达情况。方法转录组测序筛选8例GC及4例癌旁组织之间的差异表达基因,京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析GC脂代谢相关通路中的关键基因(KGS)。结果高通量测序获得3 198个长度大于200 bp的差异表达基因。KEGG富集分析发现6个显著富集代谢通路,其中脂肪消化与吸收代谢通路有9个基因(MOGAT3、FABP2、FABP1、APOA4、NPC1L1、PLA2G2A、ABCG5、PLA2G4A、PLA2G12B)显著上调,2个基因(LIPF、PLA2G1B)显著下调。结论 GC脂代谢关键基因表达的异常状态为寻求胃癌诊断标志物提供了线索。; 关键词胃肿瘤转录组测序脂代谢关键基因; Keywords stomach neoplasms transcriptome sequencing lipid metabolism key genes; 分类号 R735.2 [医药卫生—肿瘤]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名罕见宫颈大细胞神经内分泌癌患者的维持妊娠与母婴管理被引量：1: 3; 作者戴戈扬陈高文李肖璇郑友红王袁李兴嵩李菁周璟谢郁王沂峰; 机构南方医科大学珠江医院妇产科北京诺禾致源科技股份有限公司复旦大学附属妇产科医院南方医科大学珠江医院信息科; 出处《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期1-9,共9页; 基金国家自然科学基金(81773291)。; 文摘目的探讨妊娠合并生殖道神经内分泌肿瘤(NETs)患者维持妊娠及母婴管理策略。方法结合癌灶体细胞系与母子胚系WGS测序和系统分析妊娠合并生殖道NETs报道病例诊疗方案,优化罕见宫颈大细胞NETs合并妊娠的诊疗策略。结果病例分析提示阴性淋巴结转移和FIGO分期早与患者良好预后相关,评价本病例后采用维持妊娠治疗,经新辅助化疗等综合措施,随访迄今19月母子健康。WGS发现6个体细胞系错义致病性突变,其中KARS、VEGFA等与靶向药物选择相关;母子胚系共发现5个致病性肿瘤易感基因突变。结论优化临床处置策略,妊娠合并宫颈NETs患者可获得良好母婴结局;WGS有利于制定精准的临床诊疗与随访方案。; 关键词女性生殖道神经内分泌肿瘤大细胞神经内分泌癌维持妊娠母婴管理肿瘤易感基因; Keywords primary gynecologic neuroendocrine tumors large cell neuroendocrine carcinoma pregnancy-preserving management maternal-fetal management cancer predisposing genes; 分类号 R737.33 [医药卫生—肿瘤]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名环丙沙星胁迫对小麦生理及代谢的影响被引量：4: 4; 作者赵里曼牟美睿武丽娟贲蓓倍杨仁杰刘海学; 机构天津农学院农学与资源环境学院农业农村部环境保护科研监测所北京诺禾致源科技股份有限公司天津农学院工程技术学院; 出处《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2022年第10期2311-2318,共8页; 基金国家自然科学基金项目(41771357)。; 文摘【目的】探究环丙沙星(Ciprofloxacin, CIP)对小麦幼苗生理及代谢的影响,拓展植物对抗生素响应机制的理解。【方法】对小麦‘百农207’幼苗进行不同浓度CIP胁迫处理,测定小麦幼苗的生理指标,并通过气相色谱质谱联用技术(GC-MS)测定其代谢物及代谢途径。【结果】随着CIP浓度的增加,叶绿素a、类胡萝卜素、总叶绿素、MDA含量先上升后下降,叶绿素b含量和POD活性降低,CAT和SOD活性也呈先升后降的变化趋势;此外,对GC-MS检测的55种代谢物进行定性及多元统计分析,筛选出显著差异代谢物10种,其中氨基酸类比重占40%;对差异代谢物进行代谢通路分析,得到13条代谢通路,其中显著变化的5条代谢通路为甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸代谢,丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢,乙醛酸和二羧酸代谢,氰基氨基酸代谢,氨酰-tRNA生物合成。【结论】在CIP胁迫条件下小麦会通过提高叶绿素、MDA含量,以及提高保护酶CAT和SOD的活性来忍耐CIP胁迫的伤害。经多元统计分析发现不同浓度CIP胁迫下小麦叶片代谢物质发生显著性变化。氨基酸类代谢物为小麦幼苗响应CIP胁迫的关键代谢物,代谢通路中氨基酸相关通路占比较大,说明通过氨基酸代谢途径研究抗生素对小麦幼苗代谢物的影响具有可行性,研究结果可为探究小麦响应CIP提供理论依据。; 关键词环丙沙星小麦生理代谢组差异代谢物代谢通路; Keywords Ciprofloxacin(CIP) Wheat Physiology Metabolomics Differential metabolites Metabolic pathway; 分类号 S512.1 [农业科学—作物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名副干酪乳杆菌ZG19发酵烟草废水产L-乳酸的响应面优化被引量：2: 5; 作者陈辰朱润琪刘丽马轩叶晓婉杨增光席宇朱大恒; 机构郑州大学生命科学学院华中科技大学药学院北京诺禾致源科技股份有限公司; 出处《中国酿造》 CAS 北大核心 2018年第2期100-105,共6页; 基金国家级大学生创新创业训练计划资助项目(201610459070) 中国烟草总公司科技重点项目(110201402011); 文摘烟草废水中含有大量的可溶性糖、含氮化合物和矿物质等营养成分。为资源化利用烟草废水,以本实验室分离并保藏的一株产L-乳酸的副干酪乳杆菌(Lactobacillus paracasei)ZG19为发酵菌株,以烟草废水为发酵底料,L-乳酸产量为响应值,采用响应面法(RSM)优化发酵工艺。通过Plackett-Burman试验筛选出对L-乳酸产量影响最显著的因素,进一步设计爬坡试验逼近最优区域,然后设计Box-Behnken响应面优化,分析并确定最佳发酵工艺。结果表明,在发酵温度39℃、发酵时间30 h、菌种接种量10%条件下,得到L-乳酸实际产量为15.16 g/L,与预测值(15.35 g/L)拟合度达到98.76%,L-乳酸产量显著提高。因此,采用此方法得到的优化工艺合理而有效,具有实际应用价值。; 关键词 L-乳酸副干酪乳杆菌烟草废水发酵工艺响应面法; Keywords L-lactic acid Lactobacillus paracasei tobacco wastewater fermentation process response surface methodology; 分类号 Q815 [生物学—生物工程]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	叶锈菌侵染的小麦叶片转录组数据分析	刘娜乔妹孙嘉伟陈琰侯春燕韩胜芳王冬梅	《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心	2019	11	在线阅读下载PDF 职称材料
2	胃癌脂代谢通路基因表达的转录组学高通量分析	向丽娟汪圣毅包楚阳张焱韩坤刘虎	《安徽医科大学学报》 CAS 北大核心	2019	8	在线阅读下载PDF 职称材料
3	罕见宫颈大细胞神经内分泌癌患者的维持妊娠与母婴管理	戴戈扬陈高文李肖璇郑友红王袁李兴嵩李菁周璟谢郁王沂峰	《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心	2021	1	在线阅读下载PDF 职称材料
4	环丙沙星胁迫对小麦生理及代谢的影响	赵里曼牟美睿武丽娟贲蓓倍杨仁杰刘海学	《西南农业学报》 CSCD 北大核心	2022	4	在线阅读下载PDF 职称材料
5	副干酪乳杆菌ZG19发酵烟草废水产L-乳酸的响应面优化	陈辰朱润琪刘丽马轩叶晓婉杨增光席宇朱大恒	《中国酿造》 CAS 北大核心	2018	2	在线阅读下载PDF 职称材料