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基于BP网络灵敏度分析的肿瘤亚型分类特征基因选取
被引量：
4
1
作者
刘全金
李颖新
阮晓钢
《中国生物医学工程学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第5期710-715,共6页
基于肿瘤基因表达谱,提出了单隐层BP网络灵敏度分析法以有效选取肿瘤亚型分类特征基因。首先以Bhattacharyya距离为尺度滤除分类无关基因;然后从"功能基因组合"的角度出发,依据输入特征对BP网络输出的灵敏度生成候选特征基因...
基于肿瘤基因表达谱,提出了单隐层BP网络灵敏度分析法以有效选取肿瘤亚型分类特征基因。首先以Bhattacharyya距离为尺度滤除分类无关基因;然后从"功能基因组合"的角度出发,依据输入特征对BP网络输出的灵敏度生成候选特征基因子集;最后以BP网络作为样本分类器考察候选特征基因子集对肿瘤样本的亚型识别能力,得到具有最佳分类能力的基因子集作为肿瘤亚型分类特征基因。以小圆蓝细胞瘤基因表达谱数据集为例进行实验,结果表明了该方法的可行性和有效性。
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关键词
肿瘤
基因表达谱
特征选取
BP网络
灵敏度分析
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职称材料
Boosting算法在基因表达谱样本分类中的应用
被引量：
2
2
作者
刘全金
李颖新
《计算机工程与应用》
CSCD
北大核心
2008年第14期228-230,238,共4页
基于基因表达谱结构提出一种基因表达谱的样本分类方法。首先用基因的Bhattacharyya距离衡量其所含样本类别的信息,过滤Bhattacharyya距离较小的噪声基因;然后修改重复剪辑近邻算法,剔除噪声样本;再基于Boosting算法构建支持向量机组合...
基于基因表达谱结构提出一种基因表达谱的样本分类方法。首先用基因的Bhattacharyya距离衡量其所含样本类别的信息,过滤Bhattacharyya距离较小的噪声基因;然后修改重复剪辑近邻算法,剔除噪声样本;再基于Boosting算法构建支持向量机组合分类器;最后以结肠癌基因表达谱样本为例,进行了分类实验。实验结果表明该方法简单、有效,对基因表达谱样本的分类问题有强的实用性。
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关键词
BHATTACHARYYA距离
重复剪辑近邻法
BOOSTING算法
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职称材料
题名
基于BP网络灵敏度分析的肿瘤亚型分类特征基因选取
被引量：
4
1
作者
刘全金
李颖新
阮晓钢
机构
安庆师范学院物理与电气工程学院
北京经纬纺机新技术有限公司ccd部
北京
工业大学电子信息与控制工程学院
出处
《中国生物医学工程学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第5期710-715,共6页
文摘
基于肿瘤基因表达谱,提出了单隐层BP网络灵敏度分析法以有效选取肿瘤亚型分类特征基因。首先以Bhattacharyya距离为尺度滤除分类无关基因;然后从"功能基因组合"的角度出发,依据输入特征对BP网络输出的灵敏度生成候选特征基因子集;最后以BP网络作为样本分类器考察候选特征基因子集对肿瘤样本的亚型识别能力,得到具有最佳分类能力的基因子集作为肿瘤亚型分类特征基因。以小圆蓝细胞瘤基因表达谱数据集为例进行实验,结果表明了该方法的可行性和有效性。
关键词
肿瘤
基因表达谱
特征选取
BP网络
灵敏度分析
Keywords
tumor
gene expression profile
feature selection
BP neural networks
sensitivity analysis
分类号
TP391 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
Q617 [生物学—生物物理学]
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职称材料
题名
Boosting算法在基因表达谱样本分类中的应用
被引量：
2
2
作者
刘全金
李颖新
机构
安庆师范学院物理与电气工程学院
北京经纬纺机新技术有限公司ccd部
出处
《计算机工程与应用》
CSCD
北大核心
2008年第14期228-230,238,共4页
基金
安徽省教育厅自然科研项目(No.KJ2007B001)
文摘
基于基因表达谱结构提出一种基因表达谱的样本分类方法。首先用基因的Bhattacharyya距离衡量其所含样本类别的信息,过滤Bhattacharyya距离较小的噪声基因;然后修改重复剪辑近邻算法,剔除噪声样本;再基于Boosting算法构建支持向量机组合分类器;最后以结肠癌基因表达谱样本为例,进行了分类实验。实验结果表明该方法简单、有效,对基因表达谱样本的分类问题有强的实用性。
关键词
BHATTACHARYYA距离
重复剪辑近邻法
BOOSTING算法
Keywords
Bhattacharyya distance
multi-edit-nearest-neighbor algorithm
Boosting algorithm
分类号
TP181 [自动化与计算机技术—控制理论与控制工程]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于BP网络灵敏度分析的肿瘤亚型分类特征基因选取
刘全金
李颖新
阮晓钢
《中国生物医学工程学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008
4
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职称材料
2
Boosting算法在基因表达谱样本分类中的应用
刘全金
李颖新
《计算机工程与应用》
CSCD
北大核心
2008
2
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职称材料
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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