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基于宏基因组测序的肺结核患者下呼吸道微生态菌落分布特点分析
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作者 徐钰 何玉坤 +1 位作者 周德训 张平骥 《中国防痨杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期634-640,共7页
目的:探讨肺结核、其他病原感染肺炎及非感染性肺部疾病患者下呼吸道微生态菌落分布之间的差异。方法:采用回顾性研究方法,选取2021年3月1日至2023年2月28日于首都医科大学附属北京积水潭医院和北京大学人民医院住院的疑似肺结核患者作... 目的:探讨肺结核、其他病原感染肺炎及非感染性肺部疾病患者下呼吸道微生态菌落分布之间的差异。方法:采用回顾性研究方法,选取2021年3月1日至2023年2月28日于首都医科大学附属北京积水潭医院和北京大学人民医院住院的疑似肺结核患者作为研究对象,共83例。研究对象均痰涂片和结核感染T细胞斑点试验阴性,并按照诊疗常规完善支气管镜检查并进行支气管肺泡灌洗,支气管肺泡灌洗液(bronchoalveolar lavage fluid,BALF)进行病原学检查(包括宏基因组二代测序、GeneXpert MTB/RIF检测,以及常规细菌、真菌培养)。利用电子病历系统收集研究对象的基本信息及实验室检查结果等数据资料,分析不同患者之间下呼吸道微生物群的特点。结果:83例研究对象根据病原学检查结果分为结核组(28例)、肺炎组(38例)和非感染组(17例)。下呼吸道微生物丰度及多样性分析显示,结核组、肺炎组和非感染组Shannon指数[中位数(四分位数)]分别为1.2864(0.3021,1.9459)、1.1032(0.3725,1.7711)、1.2049(0.6873,1.9974);Simpson指数[中位数(四分位数)]分别为0.5693(0.1346,0.8259)、0.5503(0.1900,0.7533)、0.5141(0.3065,0.7507);Chao1指数[中位数(四分位数)]分别为8.50(3.00,20.75)、7.50(3.25,18.75)、7.00(2.00,22.00),差异均无统计学意义(H值分别为0.130、0.208、0.235,P值分别为0.973、0.901、0.889);对于β多样性,结核组样本分布分散,组内异质性较大,而在肺炎组与非感染组间存在广泛重叠。病原微生物的群落组成分析显示,结核组样本中厚壁菌门、葡萄球菌属和链球菌属丰度较高;肺炎组样本中拟杆菌门、变形菌门、棒状杆菌属、肠球菌属及假单胞菌属丰度较高;非感染组样本中放线菌门、梭杆菌门,以及呼吸道定植菌罗氏菌属及奈瑟菌属等丰度较高。LEfSe线性判别分析发现,结核组中结核分枝杆菌、黏滑罗斯菌、非典型韦荣氏球菌显著富集;而在肺炎组中纹带棒状杆菌、肺炎克雷伯菌、嗜麦芽假单胞菌明显富集;与结核组和肺炎组比较,非感染组则显示出12种微生物富集,菌种之间和上述两组存在明显差异,且更接近上呼吸道微生态菌群。在病原微生物的丰度及多样性方面,结核组和肺炎组间Shannon指数[中位数(四分位数)]分别为0.0260(0.0000,0.5283)和0.2000(0.0000,0.3335);两组Simpson指数[中位数(四分位数)]分别为0.0080(0.0000,0.5609)和0.0980(0.0000,0.4379);两组Chao1指数[中位数(四分位数)]分别为2.00(1.00,2.25)和2.00(1.00,4.00);差异均无统计学意义(Z值分别为-0.794、-1.116、-1.582,P值分别为0.430、0.260、0.110)。两组间的病原微生物菌群β多样性有明显区别,结核组样本中共检测到16种病原体,肺炎组共检出40种病原体。微生物相关性分析显示仅有结核分枝杆菌复合群与大部分微生物之间呈负相关。结论:结核分枝杆菌感染后,会影响患者下呼吸道微生态菌落分布,虽然对微生物菌群的α多样性影响较小,但对微生物菌群β多样性的影响明显高于其他病原体感染所致肺炎患者和非感染性肺部疾病患者。 展开更多
关键词 分枝杆菌 结核 呼吸道感染 支气管肺泡灌洗液 序列分析 DNA 生物多样性
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成人阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征与骨密度降低及骨质疏松相关性的Meta分析 被引量:2
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作者 王艳 申勤勤 +3 位作者 程洋 张运剑 戴丽 夏国光 《中国骨质疏松杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第2期190-197,207,共9页
目的探讨阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征(obstructive sleep apnea-hypopnea syndrome,OSAHS)与骨密度降低及骨质疏松之间的相关性。方法从PubMed、EMBASE、Web of Science、the Cochrane Library、中国生物医学文献数据库(CBM)、中国... 目的探讨阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征(obstructive sleep apnea-hypopnea syndrome,OSAHS)与骨密度降低及骨质疏松之间的相关性。方法从PubMed、EMBASE、Web of Science、the Cochrane Library、中国生物医学文献数据库(CBM)、中国知网(CNKI)、万方数据库(Wanfang data)和维普数据库(VIP)检索OSAHS与骨密度及骨质疏松相关性的研究。采用纽卡斯尔-渥太华量表(the Newcastle-Ottawa scale,NOS)对纳入研究进行质量评价。所有数据的合并、亚组分析采用Review manager 5.3软件,敏感性分析和发表偏倚检测采用Stata 15.1软件。结果检索到1091篇文献,1074篇文献被排除,17篇全文文献里的17项研究所包含的113460位研究对象的数据被提取。OSAHS组与对照组相比,骨质疏松症的发生率高(OR=1.74,95%CI:1.43~2.13,P<0.00001);性别、年龄的亚组分析显示,男性(OR=1.90,95%CI:1.33~2.72,P=0.0004)、女性(OR=2.56,95%CI:1.96~3.34,P<0.00001)、大于65岁老年人(OR=2.62,95%CI:1.86~3.71,P<0.00001)、40~65岁中年人(OR=1.73,95%CI:1.31~2.28,P=0.0001)骨质疏松症的发生率均高。OSAHS组与对照组相比,腰椎骨密度显著降低(MD=-0.12,95%CI:-0.18~-0.06,P=0.0001)。性别的亚组分析显示,男性腰椎骨密度显著降低(一般人群:MD=-0.08,95%CI:-0.15~-0.01,P=0.02;无伴随疾病人群:MD=-0.12,95%CI:-0.19~-0.05,P=0.0008);女性腰椎骨密度略低(MD=-0.08,95%CI:-0.21~0.06,P=0.27),但差异无统计学意义。OSAHS组与对照组相比,股骨颈骨密度显著降低(MD=-0.12,95%CI:-0.19~-0.05,P=0.0007)。男性亚组股骨颈骨密度显著降低(一般人群:MD=-0.09,95%CI:-0.17~-0.02,P=0.02,无伴随疾病人群:MD=-0.11,95%CI:-0.19~-0.03,P=0.006);女性亚组股骨颈骨密度略低(MD=-0.10,95%CI:-0.33~0.12,P=0.37),但差异无统计学意义。各项分析纳入的研究无明显发表偏倚。结论OSAHS组与对照组相比,骨质疏松症的发生率高,腰椎骨密度、股骨颈骨密度均有所降低。 展开更多
关键词 阻塞性睡眠呼吸暂停 骨质疏松 骨密度 META分析
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老年流感肺炎的临床特征及D-二聚体与疾病严重程度的相关性 被引量:5
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作者 李佳 徐钰 +1 位作者 王优雅 高占成 《北京大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2022年第1期153-160,共8页
目的:研究老年流感肺炎的临床特征以及D-二聚体与流感肺炎严重程度的相关性,以期提高临床医生对此类肺炎的甄别和管理。方法:回顾性收集2014年起连续5个流感季(当年10月1日至次年3月31日)于北京大学人民医院诊断为流感肺炎的住院患者,年... 目的:研究老年流感肺炎的临床特征以及D-二聚体与流感肺炎严重程度的相关性,以期提高临床医生对此类肺炎的甄别和管理。方法:回顾性收集2014年起连续5个流感季(当年10月1日至次年3月31日)于北京大学人民医院诊断为流感肺炎的住院患者,年龄>65岁,收集患者的一般资料、临床症状、实验室检查、治疗方式及预后,比较重症和非重症肺炎的临床特点,分析D-二聚体与肺炎严重程度的关系,并应用受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线评估其预测流感肺炎死亡的效能。结果:共纳入实验室确诊的老年流感肺炎住院患者52例,男性31例(59.6%),平均年龄(77.1±7.4)岁,符合重症肺炎诊断标准者19例(36.5%),约70%病例出现不同程度发热,重症肺炎组与非重症肺炎组相比,呼吸困难的发生率差异有统计学意义(14/19例,73.7%vs.10/33例,30.3%,P=0.004),重症肺炎组的CURB-65(confusion,urea,respiratory rate,blood pressure,and age>65)评分、肺炎严重度指数(pneumonia severity index,PSI)评分、C反应蛋白、乳酸脱氢酶、尿素氮、空腹血糖、D-二聚体均高于非重症肺炎组,两组间差异有统计学意义(P值分别为0.004、<0.001、<0.001、0.003、0.038、0.018、<0.001),重症肺炎组的白蛋白则低于非重症肺炎组[(35.8±5.6)g/L vs.(38.9±3.5)g/L,t=-2.348,P=0.018]。入院首次检测的D-二聚体与PSI评分呈显著正相关(r=0.540,95%CI:0.302~0.714,P<0.001),与氧合指数呈显著负相关(r=-0.559,95%CI:-0.726~-0.330,P<0.001)。以患者是否住院期间死亡绘制ROC曲线,D-二聚体曲线下面积为0.765(95%CI:0.627~0.872),PSI曲线下面积为0.843(95%CI:0.716~0.929),二者相比,检验效能差异无统计学意义(Z=2.360,P=0.174)。D-二聚体>1225μg/L预测流感肺炎住院期间死亡的敏感性为76.92%,特异性为74.36%。结论:高龄老年流感肺炎患者的发热症状不典型,呼吸困难是重症肺炎的突出表现,D-二聚体升高与老年流感肺炎严重程度相关,D-二聚体>1200μg/L对于老年重症流感肺炎住院期间死亡具有较好的预测价值。 展开更多
关键词 老年人 流感 肺炎 D-二聚体
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