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无PERV传染性“中畜”五指山小型猪近交系全基因组重测序分析
1
作者
章冰艳
范瑞
+3 位作者
冯书堂
贾俊婷
张建斌
马玉媛
《中国畜牧兽医》
北大核心
2025年第6期2459-2467,共9页
【目的】自前期选育获得的无猪内源性反转录病毒(Porcine endogenous retrovirus,PERV)传染性“中畜”五指山小型猪近交系(Zhong Xu Wuzhishan Mini-pig Inbred line,ZXWIPIG)新品系中,选取1头雌性猪(ZXWIPIG505)进行全基因组重测序分析...
【目的】自前期选育获得的无猪内源性反转录病毒(Porcine endogenous retrovirus,PERV)传染性“中畜”五指山小型猪近交系(Zhong Xu Wuzhishan Mini-pig Inbred line,ZXWIPIG)新品系中,选取1头雌性猪(ZXWIPIG505)进行全基因组重测序分析,以进一步从分子水平上阐释无PERV传染性猪新品系的序列特征。【方法】分离ZXWIPIG505外周血单个核细胞并提取其基因组DNA,利用Illumina HiSeq-4000测序平台进行全基因组重测序。分别使用BLAST和SAMtools 0.1.19软件,提取ZXWIPIG505基因组中整合的PERV长片段和PERV-pol基因序列片段,并使用DNAStar软件对整合的PERV结构基因序列进行分析。将ZXWIPIG505中整合的PERV-pol基因序列特征与前期鉴定的PERV-pol缺陷型ZXWIPIG452中PERV-pol基因序列进行比较研究。【结果】ZXWIPIG505全基因组重测序平均测序深度为14.32×,测序数据有效率为97.21%,Q20为94.37%,Q30为87.03%,GC含量为43.38%,表明本次测序数据质量较高。ZXWIPIG505基因组中共整合5条PERV长片段,其中仅scaffold5028含有PERV全部结构基因,但均为缺陷型。ZXWIPIG505基因组中共整合85条PERV-pol基因片段序列,比对发现所有PERV-pol基因片段均不完整,为缺陷型。ZXWIPIG505和ZXWIPIG452基因组中整合的PERV-pol基因序列存在高度相似性,60条序列长度相同,75条序列在猪基因组中的整合位点相同,42条序列的PERV-pol基因提前终止位点相同。【结论】前期选育的ZXWIPIG505为PERV-pol基因缺陷型猪,并且ZXWIPIG505和ZXWIPIG452中整合的PERV-pol基因序列具有高度相似性。
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关键词
猪内源性反转录病毒
“中畜”五指山小型猪近交系
基因缺陷型
全基因组重测序
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职称材料
中国小型猪内源性反转录病毒研究进展与对策
被引量:
3
2
作者
冯书堂
马玉媛
夏颖
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2017年第4期1244-1248,共5页
作者介绍了国内外猪内源性反转录病毒(PERV)研究进展,简述了中国不同品种小型猪PERV存在情况、PERV前病毒全基因克隆与序列分析、细胞水平鉴定方法、感染HEK293细胞研究平台的创建、猪A3F对PERV的抑制作用研究,以及从分子遗传学上揭示...
作者介绍了国内外猪内源性反转录病毒(PERV)研究进展,简述了中国不同品种小型猪PERV存在情况、PERV前病毒全基因克隆与序列分析、细胞水平鉴定方法、感染HEK293细胞研究平台的创建、猪A3F对PERV的抑制作用研究,以及从分子遗传学上揭示不同品系PERV特异性等创新性研究成果,分析了五指山小型猪近交系具有PERV基因拷贝少且没有PERV-C等特异性,以及展望培育中国PERV阴性猪新品系方法等研究,以期为人类异种器官移植和生物医用材料产品安全性研发,解决小型猪PERV疾病传播危险性提供科学对策和新的方向。
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关键词
中国小型猪
猪内源性反转录病毒
感染性克隆
异种移植
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职称材料
GGTA1/β4GalNT2双基因敲除近交系五指山小型猪的建立
被引量:
6
3
作者
李楚
任雪洋
+11 位作者
李琳
厉小雪
金永
张曼玲
刘晓蕊
熊强
张立宁
王盈
李荣凤
杨海元
冯书堂
戴一凡
《南京医科大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第6期835-840,共6页
目的:利用CRISPR/Cas9技术建立五指山小型猪近交系GGTA1/β4GalNT2双基因敲除克隆猪。方法:设计合成靶向猪GGTA1和β4GalNT2基因的单导向RNA(single guide RNA,sgRNA),以pX330质粒为骨架,分别构建GGTA1和β4GalNT2的Cas9打靶载体,转染...
目的:利用CRISPR/Cas9技术建立五指山小型猪近交系GGTA1/β4GalNT2双基因敲除克隆猪。方法:设计合成靶向猪GGTA1和β4GalNT2基因的单导向RNA(single guide RNA,sgRNA),以pX330质粒为骨架,分别构建GGTA1和β4GalNT2的Cas9打靶载体,转染至近交系五指山小型猪胎儿成纤维细胞(porcine fetal fibroblast,PFF)中,通过G418药物筛选和测序鉴定获得双基因敲除的单细胞克隆,然后利用体细胞克隆技术(somatic cell nuclear transfer,SCNT)获得双基因敲除的近交系五指山小型猪,并利用流式细胞技术检测克隆猪外周血单核细胞(peripheral blood mononuclear cell,PBMC)中αGal和Sd(a)抗原的表达。结果:成功构建GGTA1和β4GalNT2基因的Cas9/sgRNA表达载体,转染后获得双基因敲除的近交系五指山小型猪PFF细胞克隆9个。SCNT成功获得了10只五指山小型猪近交系双基因敲除的克隆猪,其PBMC无αGal和Sd(a)抗原的表达。结论:CRISPR/Cas9技术可以实现对猪GGTA1/β4GalNT2基因的编辑。本实验首次成功制备了GGTA1/β4GalNT2双基因敲除的近交系五指山型猪,为异种器官移植研究与应用提供了新的供体材料。
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关键词
近交系五指山小型猪
GGTA1/β4GalNT2
CRISPR/Cas9
异种移植
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职称材料
五指山小型猪近交系异种移植产业化研发进展
被引量:
4
4
作者
冯书堂
戴一凡
+1 位作者
章金刚
潘志强
《器官移植》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第6期469-473,共5页
为了早日实现五指山小型猪(WZSP)近交系异种移植产业化目标,努力推进近交繁育获得近交系,同时开展克服异种移植免疫排斥和猪内源性逆转录病毒(PERV)传染生物安全性两大难题的研发内容。本文从WZSP近交系双基因敲除克隆猪繁育成功、猪-...
为了早日实现五指山小型猪(WZSP)近交系异种移植产业化目标,努力推进近交繁育获得近交系,同时开展克服异种移植免疫排斥和猪内源性逆转录病毒(PERV)传染生物安全性两大难题的研发内容。本文从WZSP近交系双基因敲除克隆猪繁育成功、猪-猴异种角膜内皮移植取得突破性进展、WZSP近交系PERV无传染性群体建立、WZSP近交系是理想的动物模型和异种移植供体等方面,介绍WZSP近交系异种移植产业化的研发进展。
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关键词
五指山小型猪
近交系猪
异种移植
免疫排斥反应
α-1
3-半乳糖基转移酶基因敲除(αGTKO)
猪内源性逆转录病毒(PERV)
非α-1
3-半乳糖(Gal)抗原
CRISPR/Cas9基因编辑技术
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职称材料
题名
无PERV传染性“中畜”五指山小型猪近交系全基因组重测序分析
1
作者
章冰艳
范瑞
冯书堂
贾俊婷
张建斌
马玉媛
机构
天津农学院动物科学与动物医学学院
军事医学研究院
北京盖兰德生物科技有限公司
出处
《中国畜牧兽医》
北大核心
2025年第6期2459-2467,共9页
基金
国家自然科学基金面上项目(32070538)。
文摘
【目的】自前期选育获得的无猪内源性反转录病毒(Porcine endogenous retrovirus,PERV)传染性“中畜”五指山小型猪近交系(Zhong Xu Wuzhishan Mini-pig Inbred line,ZXWIPIG)新品系中,选取1头雌性猪(ZXWIPIG505)进行全基因组重测序分析,以进一步从分子水平上阐释无PERV传染性猪新品系的序列特征。【方法】分离ZXWIPIG505外周血单个核细胞并提取其基因组DNA,利用Illumina HiSeq-4000测序平台进行全基因组重测序。分别使用BLAST和SAMtools 0.1.19软件,提取ZXWIPIG505基因组中整合的PERV长片段和PERV-pol基因序列片段,并使用DNAStar软件对整合的PERV结构基因序列进行分析。将ZXWIPIG505中整合的PERV-pol基因序列特征与前期鉴定的PERV-pol缺陷型ZXWIPIG452中PERV-pol基因序列进行比较研究。【结果】ZXWIPIG505全基因组重测序平均测序深度为14.32×,测序数据有效率为97.21%,Q20为94.37%,Q30为87.03%,GC含量为43.38%,表明本次测序数据质量较高。ZXWIPIG505基因组中共整合5条PERV长片段,其中仅scaffold5028含有PERV全部结构基因,但均为缺陷型。ZXWIPIG505基因组中共整合85条PERV-pol基因片段序列,比对发现所有PERV-pol基因片段均不完整,为缺陷型。ZXWIPIG505和ZXWIPIG452基因组中整合的PERV-pol基因序列存在高度相似性,60条序列长度相同,75条序列在猪基因组中的整合位点相同,42条序列的PERV-pol基因提前终止位点相同。【结论】前期选育的ZXWIPIG505为PERV-pol基因缺陷型猪,并且ZXWIPIG505和ZXWIPIG452中整合的PERV-pol基因序列具有高度相似性。
关键词
猪内源性反转录病毒
“中畜”五指山小型猪近交系
基因缺陷型
全基因组重测序
Keywords
Porcine endogenous retrovirus
Zhong Xu Wuzhishan Mini-pig inbred line
gene deficient variant
whole genome resequencing
分类号
S858.292 [农业科学—临床兽医学]
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职称材料
题名
中国小型猪内源性反转录病毒研究进展与对策
被引量:
3
2
作者
冯书堂
马玉媛
夏颖
机构
中国农业科学院
北京
畜牧兽医研究所
北京盖兰德生物科技有限公司
军事医学科学院输血医学研究所
出处
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2017年第4期1244-1248,共5页
基金
国家"863"(2012AA020603)
国家转基因专项(2008ZX08012-002-05)
北京市科技成果转化项目(2015-02)
文摘
作者介绍了国内外猪内源性反转录病毒(PERV)研究进展,简述了中国不同品种小型猪PERV存在情况、PERV前病毒全基因克隆与序列分析、细胞水平鉴定方法、感染HEK293细胞研究平台的创建、猪A3F对PERV的抑制作用研究,以及从分子遗传学上揭示不同品系PERV特异性等创新性研究成果,分析了五指山小型猪近交系具有PERV基因拷贝少且没有PERV-C等特异性,以及展望培育中国PERV阴性猪新品系方法等研究,以期为人类异种器官移植和生物医用材料产品安全性研发,解决小型猪PERV疾病传播危险性提供科学对策和新的方向。
关键词
中国小型猪
猪内源性反转录病毒
感染性克隆
异种移植
Keywords
Chinese miniature pig
porcine endogenous retrovirus
infectious clone
xenotransplantation
分类号
S852.659.3 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
GGTA1/β4GalNT2双基因敲除近交系五指山小型猪的建立
被引量:
6
3
作者
李楚
任雪洋
李琳
厉小雪
金永
张曼玲
刘晓蕊
熊强
张立宁
王盈
李荣凤
杨海元
冯书堂
戴一凡
机构
南京医科大学江苏省异种移植重点实验室
北京盖兰德生物科技有限公司
出处
《南京医科大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第6期835-840,共6页
基金
国家重点研发计划(2017YFC1103701)
文摘
目的:利用CRISPR/Cas9技术建立五指山小型猪近交系GGTA1/β4GalNT2双基因敲除克隆猪。方法:设计合成靶向猪GGTA1和β4GalNT2基因的单导向RNA(single guide RNA,sgRNA),以pX330质粒为骨架,分别构建GGTA1和β4GalNT2的Cas9打靶载体,转染至近交系五指山小型猪胎儿成纤维细胞(porcine fetal fibroblast,PFF)中,通过G418药物筛选和测序鉴定获得双基因敲除的单细胞克隆,然后利用体细胞克隆技术(somatic cell nuclear transfer,SCNT)获得双基因敲除的近交系五指山小型猪,并利用流式细胞技术检测克隆猪外周血单核细胞(peripheral blood mononuclear cell,PBMC)中αGal和Sd(a)抗原的表达。结果:成功构建GGTA1和β4GalNT2基因的Cas9/sgRNA表达载体,转染后获得双基因敲除的近交系五指山小型猪PFF细胞克隆9个。SCNT成功获得了10只五指山小型猪近交系双基因敲除的克隆猪,其PBMC无αGal和Sd(a)抗原的表达。结论:CRISPR/Cas9技术可以实现对猪GGTA1/β4GalNT2基因的编辑。本实验首次成功制备了GGTA1/β4GalNT2双基因敲除的近交系五指山型猪,为异种器官移植研究与应用提供了新的供体材料。
关键词
近交系五指山小型猪
GGTA1/β4GalNT2
CRISPR/Cas9
异种移植
Keywords
Wuzhishan miniature inbred pigs
GGTA1/β4GalNT2
CRISPR/Cas9
xenotransplantation
分类号
R-332 [医药卫生]
R617 [医药卫生—外科学]
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职称材料
题名
五指山小型猪近交系异种移植产业化研发进展
被引量:
4
4
作者
冯书堂
戴一凡
章金刚
潘志强
机构
北京盖兰德生物科技有限公司
南京医科大学
军事科学院军事医学研究院卫生勤务与血液研究所
北京
同仁医院
出处
《器官移植》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第6期469-473,共5页
基金
国家重点研发计划重点专项(2017YFC11037000、2017YFD0501606)。
文摘
为了早日实现五指山小型猪(WZSP)近交系异种移植产业化目标,努力推进近交繁育获得近交系,同时开展克服异种移植免疫排斥和猪内源性逆转录病毒(PERV)传染生物安全性两大难题的研发内容。本文从WZSP近交系双基因敲除克隆猪繁育成功、猪-猴异种角膜内皮移植取得突破性进展、WZSP近交系PERV无传染性群体建立、WZSP近交系是理想的动物模型和异种移植供体等方面,介绍WZSP近交系异种移植产业化的研发进展。
关键词
五指山小型猪
近交系猪
异种移植
免疫排斥反应
α-1
3-半乳糖基转移酶基因敲除(αGTKO)
猪内源性逆转录病毒(PERV)
非α-1
3-半乳糖(Gal)抗原
CRISPR/Cas9基因编辑技术
分类号
R617 [医药卫生—外科学]
S828 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
无PERV传染性“中畜”五指山小型猪近交系全基因组重测序分析
章冰艳
范瑞
冯书堂
贾俊婷
张建斌
马玉媛
《中国畜牧兽医》
北大核心
2025
0
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职称材料
2
中国小型猪内源性反转录病毒研究进展与对策
冯书堂
马玉媛
夏颖
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2017
3
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职称材料
3
GGTA1/β4GalNT2双基因敲除近交系五指山小型猪的建立
李楚
任雪洋
李琳
厉小雪
金永
张曼玲
刘晓蕊
熊强
张立宁
王盈
李荣凤
杨海元
冯书堂
戴一凡
《南京医科大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2019
6
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职称材料
4
五指山小型猪近交系异种移植产业化研发进展
冯书堂
戴一凡
章金刚
潘志强
《器官移植》
CAS
CSCD
北大核心
2018
4
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