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无PERV传染性“中畜”五指山小型猪近交系全基因组重测序分析
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作者 章冰艳 范瑞 +3 位作者 冯书堂 贾俊婷 张建斌 马玉媛 《中国畜牧兽医》 北大核心 2025年第6期2459-2467,共9页
【目的】自前期选育获得的无猪内源性反转录病毒(Porcine endogenous retrovirus,PERV)传染性“中畜”五指山小型猪近交系(Zhong Xu Wuzhishan Mini-pig Inbred line,ZXWIPIG)新品系中,选取1头雌性猪(ZXWIPIG505)进行全基因组重测序分析... 【目的】自前期选育获得的无猪内源性反转录病毒(Porcine endogenous retrovirus,PERV)传染性“中畜”五指山小型猪近交系(Zhong Xu Wuzhishan Mini-pig Inbred line,ZXWIPIG)新品系中,选取1头雌性猪(ZXWIPIG505)进行全基因组重测序分析,以进一步从分子水平上阐释无PERV传染性猪新品系的序列特征。【方法】分离ZXWIPIG505外周血单个核细胞并提取其基因组DNA,利用Illumina HiSeq-4000测序平台进行全基因组重测序。分别使用BLAST和SAMtools 0.1.19软件,提取ZXWIPIG505基因组中整合的PERV长片段和PERV-pol基因序列片段,并使用DNAStar软件对整合的PERV结构基因序列进行分析。将ZXWIPIG505中整合的PERV-pol基因序列特征与前期鉴定的PERV-pol缺陷型ZXWIPIG452中PERV-pol基因序列进行比较研究。【结果】ZXWIPIG505全基因组重测序平均测序深度为14.32×,测序数据有效率为97.21%,Q20为94.37%,Q30为87.03%,GC含量为43.38%,表明本次测序数据质量较高。ZXWIPIG505基因组中共整合5条PERV长片段,其中仅scaffold5028含有PERV全部结构基因,但均为缺陷型。ZXWIPIG505基因组中共整合85条PERV-pol基因片段序列,比对发现所有PERV-pol基因片段均不完整,为缺陷型。ZXWIPIG505和ZXWIPIG452基因组中整合的PERV-pol基因序列存在高度相似性,60条序列长度相同,75条序列在猪基因组中的整合位点相同,42条序列的PERV-pol基因提前终止位点相同。【结论】前期选育的ZXWIPIG505为PERV-pol基因缺陷型猪,并且ZXWIPIG505和ZXWIPIG452中整合的PERV-pol基因序列具有高度相似性。 展开更多
关键词 猪内源性反转录病毒 “中畜”五指山小型猪近交系 基因缺陷型 全基因组重测序
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中国小型猪内源性反转录病毒研究进展与对策 被引量:3
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作者 冯书堂 马玉媛 夏颖 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2017年第4期1244-1248,共5页
作者介绍了国内外猪内源性反转录病毒(PERV)研究进展,简述了中国不同品种小型猪PERV存在情况、PERV前病毒全基因克隆与序列分析、细胞水平鉴定方法、感染HEK293细胞研究平台的创建、猪A3F对PERV的抑制作用研究,以及从分子遗传学上揭示... 作者介绍了国内外猪内源性反转录病毒(PERV)研究进展,简述了中国不同品种小型猪PERV存在情况、PERV前病毒全基因克隆与序列分析、细胞水平鉴定方法、感染HEK293细胞研究平台的创建、猪A3F对PERV的抑制作用研究,以及从分子遗传学上揭示不同品系PERV特异性等创新性研究成果,分析了五指山小型猪近交系具有PERV基因拷贝少且没有PERV-C等特异性,以及展望培育中国PERV阴性猪新品系方法等研究,以期为人类异种器官移植和生物医用材料产品安全性研发,解决小型猪PERV疾病传播危险性提供科学对策和新的方向。 展开更多
关键词 中国小型猪 猪内源性反转录病毒 感染性克隆 异种移植
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GGTA1/β4GalNT2双基因敲除近交系五指山小型猪的建立 被引量:6
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作者 李楚 任雪洋 +11 位作者 李琳 厉小雪 金永 张曼玲 刘晓蕊 熊强 张立宁 王盈 李荣凤 杨海元 冯书堂 戴一凡 《南京医科大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期835-840,共6页
目的:利用CRISPR/Cas9技术建立五指山小型猪近交系GGTA1/β4GalNT2双基因敲除克隆猪。方法:设计合成靶向猪GGTA1和β4GalNT2基因的单导向RNA(single guide RNA,sgRNA),以pX330质粒为骨架,分别构建GGTA1和β4GalNT2的Cas9打靶载体,转染... 目的:利用CRISPR/Cas9技术建立五指山小型猪近交系GGTA1/β4GalNT2双基因敲除克隆猪。方法:设计合成靶向猪GGTA1和β4GalNT2基因的单导向RNA(single guide RNA,sgRNA),以pX330质粒为骨架,分别构建GGTA1和β4GalNT2的Cas9打靶载体,转染至近交系五指山小型猪胎儿成纤维细胞(porcine fetal fibroblast,PFF)中,通过G418药物筛选和测序鉴定获得双基因敲除的单细胞克隆,然后利用体细胞克隆技术(somatic cell nuclear transfer,SCNT)获得双基因敲除的近交系五指山小型猪,并利用流式细胞技术检测克隆猪外周血单核细胞(peripheral blood mononuclear cell,PBMC)中αGal和Sd(a)抗原的表达。结果:成功构建GGTA1和β4GalNT2基因的Cas9/sgRNA表达载体,转染后获得双基因敲除的近交系五指山小型猪PFF细胞克隆9个。SCNT成功获得了10只五指山小型猪近交系双基因敲除的克隆猪,其PBMC无αGal和Sd(a)抗原的表达。结论:CRISPR/Cas9技术可以实现对猪GGTA1/β4GalNT2基因的编辑。本实验首次成功制备了GGTA1/β4GalNT2双基因敲除的近交系五指山型猪,为异种器官移植研究与应用提供了新的供体材料。 展开更多
关键词 近交系五指山小型猪 GGTA1/β4GalNT2 CRISPR/Cas9 异种移植
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五指山小型猪近交系异种移植产业化研发进展 被引量:4
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作者 冯书堂 戴一凡 +1 位作者 章金刚 潘志强 《器官移植》 CAS CSCD 北大核心 2018年第6期469-473,共5页
为了早日实现五指山小型猪(WZSP)近交系异种移植产业化目标,努力推进近交繁育获得近交系,同时开展克服异种移植免疫排斥和猪内源性逆转录病毒(PERV)传染生物安全性两大难题的研发内容。本文从WZSP近交系双基因敲除克隆猪繁育成功、猪-... 为了早日实现五指山小型猪(WZSP)近交系异种移植产业化目标,努力推进近交繁育获得近交系,同时开展克服异种移植免疫排斥和猪内源性逆转录病毒(PERV)传染生物安全性两大难题的研发内容。本文从WZSP近交系双基因敲除克隆猪繁育成功、猪-猴异种角膜内皮移植取得突破性进展、WZSP近交系PERV无传染性群体建立、WZSP近交系是理想的动物模型和异种移植供体等方面,介绍WZSP近交系异种移植产业化的研发进展。 展开更多
关键词 五指山小型猪 近交系猪 异种移植 免疫排斥反应 α-1 3-半乳糖基转移酶基因敲除(αGTKO) 猪内源性逆转录病毒(PERV) 非α-1 3-半乳糖(Gal)抗原 CRISPR/Cas9基因编辑技术
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