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基于In Silicon模拟消化的北极虾DPP-Ⅳ抑制肽活性分析
1
作者
刘浩思
徐春明
+3 位作者
田源
韩爱萍
刘孝飞
李振华
《中国食品添加剂》
CAS
2024年第1期127-135,共9页
北极虾具有很高的营养价值,在食品领域已引起越来越多的关注。对北极虾蛋白进行In Silicon模拟消化获得寡肽,通过PeptideRanker活性评分及理化性质分析,从中筛选出具有潜在生物活性的寡肽。使用ToxinPred分析和BIOPEP-UWM生物活性预测,...
北极虾具有很高的营养价值,在食品领域已引起越来越多的关注。对北极虾蛋白进行In Silicon模拟消化获得寡肽,通过PeptideRanker活性评分及理化性质分析,从中筛选出具有潜在生物活性的寡肽。使用ToxinPred分析和BIOPEP-UWM生物活性预测,发现部分寡肽具有二肽基肽酶-Ⅳ(dipeptidyl peptidase-Ⅳ,DPP-Ⅳ)抑制活性,最终确定WFP(一种三肽,Trp-Phe-Pro)具有最优的DPP-Ⅳ抑制活性肽。分子对接表明,WFP和DPP-Ⅳ能够形成稳定的复合物,其结合能为-6.93 kcal/mol,进一步研究表明,WFP通过与DPP-Ⅳ S1、S2、S3三个活性口袋中的9个氨基酸残基发生相互作用而抑制其活性。本研究为阐释北极虾营养价值及生物活性肽的开发提供了理论依据。
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关键词
In
Silicon
分子对接
DPP-Ⅳ
细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ
寡肽
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职称材料
大西洋鳕鱼肌红蛋白血管紧张素转化酶抑制肽的计算机模拟评估
2
作者
武琦
徐春明
+3 位作者
田源
韩爱萍
刘孝飞
李振华
《现代食品》
2023年第11期140-145,共6页
本研究的主要目的是通过计算机模拟胃肠消化的方法推定大西洋鳕鱼的肌红蛋白中生物活性肽出现的概率及其丰度。从NCBI数据库中得到肌红蛋白的氨基酸序列并下载,将其导入Peptide Cutter中选用不同的酶模拟酶解,并在BIOPEP-UWM的“酶促工...
本研究的主要目的是通过计算机模拟胃肠消化的方法推定大西洋鳕鱼的肌红蛋白中生物活性肽出现的概率及其丰度。从NCBI数据库中得到肌红蛋白的氨基酸序列并下载,将其导入Peptide Cutter中选用不同的酶模拟酶解,并在BIOPEP-UWM的“酶促工具”中对其短肽进行分析,在Toxin Pred中分析其理化性质、毒性特征。同时,将结果导入Peptide Ranker中对肽活性进行排序,并从中筛选出两种血管紧张素转化酶(Angiotensin Converting Enzyme,ACE)抑制肽CW和LFPK,将活性较高的肽与ACE进行分子对接,分析了CW和LFPK的ACE抑制机制,为从食品中寻找ACE抑制肽的研究提供参考。
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关键词
大西洋鳕鱼肌红蛋白
血管紧张素转化酶
计算机模拟
分子对接
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职称材料
题名
基于In Silicon模拟消化的北极虾DPP-Ⅳ抑制肽活性分析
1
作者
刘浩思
徐春明
田源
韩爱萍
刘孝飞
李振华
机构
北京
工商大学轻工科学技术学院
北京玫瑰日记生物科技有限公司
北京
有肌时代
科技
有限公司
出处
《中国食品添加剂》
CAS
2024年第1期127-135,共9页
文摘
北极虾具有很高的营养价值,在食品领域已引起越来越多的关注。对北极虾蛋白进行In Silicon模拟消化获得寡肽,通过PeptideRanker活性评分及理化性质分析,从中筛选出具有潜在生物活性的寡肽。使用ToxinPred分析和BIOPEP-UWM生物活性预测,发现部分寡肽具有二肽基肽酶-Ⅳ(dipeptidyl peptidase-Ⅳ,DPP-Ⅳ)抑制活性,最终确定WFP(一种三肽,Trp-Phe-Pro)具有最优的DPP-Ⅳ抑制活性肽。分子对接表明,WFP和DPP-Ⅳ能够形成稳定的复合物,其结合能为-6.93 kcal/mol,进一步研究表明,WFP通过与DPP-Ⅳ S1、S2、S3三个活性口袋中的9个氨基酸残基发生相互作用而抑制其活性。本研究为阐释北极虾营养价值及生物活性肽的开发提供了理论依据。
关键词
In
Silicon
分子对接
DPP-Ⅳ
细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ
寡肽
Keywords
In Silicon
molecular docking
DPP-Ⅳ
cytochrome C oxidase subunit I
oligopeptide
分类号
TS254.1 [轻工技术与工程—水产品加工及贮藏工程]
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职称材料
题名
大西洋鳕鱼肌红蛋白血管紧张素转化酶抑制肽的计算机模拟评估
2
作者
武琦
徐春明
田源
韩爱萍
刘孝飞
李振华
机构
北京
工商大学轻工科学技术学院
北京玫瑰日记生物科技有限公司
北京
有肌时代
科技
有限公司
出处
《现代食品》
2023年第11期140-145,共6页
文摘
本研究的主要目的是通过计算机模拟胃肠消化的方法推定大西洋鳕鱼的肌红蛋白中生物活性肽出现的概率及其丰度。从NCBI数据库中得到肌红蛋白的氨基酸序列并下载,将其导入Peptide Cutter中选用不同的酶模拟酶解,并在BIOPEP-UWM的“酶促工具”中对其短肽进行分析,在Toxin Pred中分析其理化性质、毒性特征。同时,将结果导入Peptide Ranker中对肽活性进行排序,并从中筛选出两种血管紧张素转化酶(Angiotensin Converting Enzyme,ACE)抑制肽CW和LFPK,将活性较高的肽与ACE进行分子对接,分析了CW和LFPK的ACE抑制机制,为从食品中寻找ACE抑制肽的研究提供参考。
关键词
大西洋鳕鱼肌红蛋白
血管紧张素转化酶
计算机模拟
分子对接
Keywords
Gadus morhua myoglobin
angiotensin converting enzyme
computer simulation
molecular docking
分类号
TS201.2 [轻工技术与工程—食品科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
基于In Silicon模拟消化的北极虾DPP-Ⅳ抑制肽活性分析
刘浩思
徐春明
田源
韩爱萍
刘孝飞
李振华
《中国食品添加剂》
CAS
2024
0
在线阅读
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职称材料
2
大西洋鳕鱼肌红蛋白血管紧张素转化酶抑制肽的计算机模拟评估
武琦
徐春明
田源
韩爱萍
刘孝飞
李振华
《现代食品》
2023
0
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职称材料
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