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基于DNA甲基化的中医概念与证候量化方法及其在抑郁症和癌症筛查中的应用 被引量:1
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作者 熊江辉 梁峰吉 常素华 《中国药理学与毒理学杂志》 CAS 北大核心 2023年第S01期37-38,共2页
目的探索基于DNA甲基化的中医概念量化表征方法。方法采集集成抑郁症、轻度认知功能障碍、阿尔兹海默症、创伤后应激、焦虑障碍、产后抑郁症、骨质疏松、类风湿性关节炎、动脉硬化、脑卒中、乳腺癌、肠癌、肺癌等多种疾病的多组学数据,... 目的探索基于DNA甲基化的中医概念量化表征方法。方法采集集成抑郁症、轻度认知功能障碍、阿尔兹海默症、创伤后应激、焦虑障碍、产后抑郁症、骨质疏松、类风湿性关节炎、动脉硬化、脑卒中、乳腺癌、肠癌、肺癌等多种疾病的多组学数据,以及以中医术语注释的中药功效、药性、化学成分、靶标数据。提出了SEMO算法,计算干扰物与疾病表型的统计相关性。干扰物=药物/天然产物成分/营养素/中药/中医证候/中医治法。结果DAMOPA计算框架实现了基于DNA甲基化的中医证候、治法、方剂排序功能。在新冠重症预测、抑郁症、认知功能筛查、癌症预警等应用中,相比GO等本体论,中医证候标志物表型相关性更强,有因果涌现现象。开发的DNA甲基化捕获测序试剂盒,实现了基于唾液甲基化检测的中药复方计算(“甲基化开方”)、用证候甲基化标志物分析中药作用机制。结论通过DNA甲基化数据可以量化表征中医概念,中医证候与现代医学通路分析可以在同一个计算框架内实现。 展开更多
关键词 DNA甲基化 网络药理学 中西医融合
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从网络药理学到能力组学 被引量:2
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作者 熊江辉 《中国药理学与毒理学杂志》 CAS 北大核心 2023年第S01期9-14,共6页
随着现代生命科学的进展,现代生物医学在从现象观察到抽象提炼上取得了新的进展。一方面,系统生物学、网络药理学的研究使人们认识到基因网络的特征性变化是疾病、药物作用的本质特征,制药工业也在探讨从靶向分子向靶向信号通路的思路... 随着现代生命科学的进展,现代生物医学在从现象观察到抽象提炼上取得了新的进展。一方面,系统生物学、网络药理学的研究使人们认识到基因网络的特征性变化是疾病、药物作用的本质特征,制药工业也在探讨从靶向分子向靶向信号通路的思路扩展。另一方面,科学家试图从宏观整体角度把握健康和疾病的本质属性,一系列健康与衰老、疾病的Hallmarks(本质特征或共性特征)的提出是其典型代表。2020年,笔者提出“能力即靶标”的观点。认为应在生命体的结构(structure)、功能(function)之外,提出单独的内在能力(capability)概念。疾病干预、药物治疗靶标本质上是靶向生物体的内在能力。 展开更多
关键词 网络药理学 能力组学 表观遗传学DNA甲基化
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