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空间转录组技术在植物研究中的应用及前景
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作者 梅曼 王晨璨 +3 位作者 蔺宏霞 张玉倩 丁文静 赵媛媛 《植物研究》 北大核心 2025年第1期3-14,共12页
空间转录组(spatial transcriptomics,ST)是一种用于从空间层面上解析RNA-seq数据的技术,利用该技术解析单个组织切片中的所有mRNA。空间条形码逆转录oligo(dT)引物在显微镜载玻片表面的有序附着,使得在mRNA样品处理和后续测序过程中编... 空间转录组(spatial transcriptomics,ST)是一种用于从空间层面上解析RNA-seq数据的技术,利用该技术解析单个组织切片中的所有mRNA。空间条形码逆转录oligo(dT)引物在显微镜载玻片表面的有序附着,使得在mRNA样品处理和后续测序过程中编码和获取位置信息成为可能。与传统的转录组技术相比,空间转录组技术能获得细胞在组织原位环境下真实的基因表达特征,以及与微环境的关系,为基因表达提供高精度、高分辨率原位的空间信息。近年来,空间转录组技术取得了重要进展,检测的细胞通量、转录本数量和质量不断提高,空间定位信息更加准确全面,并已在拟南芥(Arabidopsis thaliana)、水稻(Oryza sativa)、杨树(Populus)等植物中展开研究。该文阐述了空间转录组技术在植物动态发育轨迹、不同组织和细胞类型差异分析、解码植物与微生物群相互作用等研究中的成功应用,讨论了空间转录组测序在植物组织原位测序中存在的问题和挑战,揭示了其在植物研究中的巨大潜力,为相关领域的进一步研究和应用提供了新的视角。 展开更多
关键词 空间转录组技术 空间分布模式 发育谱系 细胞类型鉴定 细胞间相互作用
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空间代谢组技术在植物研究中的应用与前景 被引量:1
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作者 李晓旭 王晨璨 +4 位作者 丁文静 梅曼 张玉倩 蔺宏霞 赵媛媛 《植物科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期654-663,共10页
空间代谢组技术是一种整合了质谱成像和代谢组学的新兴研究技术,该项技术可以获得生物组织中大量已知或未知内源性代谢物分子的结构、含量和空间分布信息,精准定位组织中的代谢物分布,对揭示植物代谢物的合成、积累和调控机理至关重要... 空间代谢组技术是一种整合了质谱成像和代谢组学的新兴研究技术,该项技术可以获得生物组织中大量已知或未知内源性代谢物分子的结构、含量和空间分布信息,精准定位组织中的代谢物分布,对揭示植物代谢物的合成、积累和调控机理至关重要。本文介绍了空间代谢组技术的研究现状,重点综述了空间代谢组技术在植物组织研究方面的前沿应用,探讨了空间代谢组技术在植物单细胞水平研究领域中的应用与挑战,以期为研究植物生长发育及空间代谢网络的调控提供新的途径,为解决农业生产、植物能源开发等领域的问题提供关键支持。 展开更多
关键词 空间代谢组技术 质谱成像 代谢物空间分布 植物生长发育
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小肽激素调控植物生长发育及逆境生理研究进展
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作者 胡海琳 徐黎 +4 位作者 李晓旭 王晨璨 梅曼 丁文静 赵媛媛 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第7期13-25,共13页
小肽激素通常是指含5-100个氨基酸长度的肽段。在植物体内小肽激素含量很低、分子量小、数量多、来源及加工成熟机制复杂,这赋予了小肽多种多样的生物学功能,能够在极低浓度下与受体结合,调节植物的细胞分裂与生长、组织与器官分化、开... 小肽激素通常是指含5-100个氨基酸长度的肽段。在植物体内小肽激素含量很低、分子量小、数量多、来源及加工成熟机制复杂,这赋予了小肽多种多样的生物学功能,能够在极低浓度下与受体结合,调节植物的细胞分裂与生长、组织与器官分化、开花与结实、成熟与衰老等生理过程,协调植物响应多种胁迫环境。小肽激素作为细胞间信号转导的重要介质,参与调控生长发育的分子机制是近年来植物学科研究的热点和前沿。本文系统综述了小肽激素的结构、分类及其功能研究进展,重点讨论了CLE、RALFs、PSK、CIF、SYS等家族调控植物生长发育及逆境生理的研究进展,并展望了植物小肽激素的应用前景,为植物小肽激素的深层次研究和开发应用提供了重要的理论基础。 展开更多
关键词 小肽激素 受体 生长发育 逆境生理 CLE RALFs PSK CIF
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植物细胞外囊泡及其分析技术的进展 被引量:7
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作者 张雪萍 鲁雨晴 +1 位作者 张月倩 李晓娟 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期32-43,共12页
细胞外囊泡是细胞在生理和病理条件下通过胞吐作用释放的具有磷脂双分子层结构的纳米级囊泡。细胞外囊泡作为蛋白质、核酸、脂质和代谢物等物质的载体,能够在细胞与细胞之间穿梭,行使物质传递、信息交流的功能,是细胞间通讯的重要媒介... 细胞外囊泡是细胞在生理和病理条件下通过胞吐作用释放的具有磷脂双分子层结构的纳米级囊泡。细胞外囊泡作为蛋白质、核酸、脂质和代谢物等物质的载体,能够在细胞与细胞之间穿梭,行使物质传递、信息交流的功能,是细胞间通讯的重要媒介。近年来,植物中细胞外囊泡的研究也不断深入,其研究和分析技术也取得了很大进展。本文介绍了细胞外囊泡的组成,综述了植物中细胞外囊泡的生物学功能,分析了细胞外囊泡分离与富集方法的优缺点,以及原位成像技术的应用,最后对植物细胞外囊泡研究技术发展的重点进行了展望。 展开更多
关键词 细胞外囊泡 功能 分离方法 原位检测
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利用原子力显微术在纳米尺度上检测植物细胞质膜完整性
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作者 苏晓 高永伟 +1 位作者 林金星 李晓娟 《电子显微学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期68-74,共7页
目的:探究原子力显微镜检测植物细胞质膜的损伤程度及其定量分析的方法。方法:采用酶解法制备拟南芥原生质体,原生质体经MβCD(Methyl-β-cyclodextrin)处理造成质膜损伤后,利用原子力显微镜进行成像,最后通过NanoScope Analysis软件进... 目的:探究原子力显微镜检测植物细胞质膜的损伤程度及其定量分析的方法。方法:采用酶解法制备拟南芥原生质体,原生质体经MβCD(Methyl-β-cyclodextrin)处理造成质膜损伤后,利用原子力显微镜进行成像,最后通过NanoScope Analysis软件进行成像分析,对粗糙度Ra(平均粗糙度)、Rq(均方根粗糙度)和Rmax(最高数据点和最低数据点之间的最大垂直距离)值以及从孔隙周围的长轴和短轴上测量获得孔隙的直径和深度进行了系统的测算。结果:与对照组对比,经MβCD处理的样品表面出现大量的孔隙,且粗糙度Ra、Rq和Rmax值均显著高于对照组。结论:原子力显微镜可以检测拟南芥细胞质膜的损伤,并对损伤程度进行定量分析,为探究质膜完整性提供了一个可行的新思路。 展开更多
关键词 原子力显微镜 植物质膜 质膜完整性
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