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秋水仙素处理杉木种子的诱变效应 被引量：9
1
作者 胡瑞阳 段红静 +4 位作者 吴博 孙宇涵 方禄明 郑仁华 李云 《西南林业大学学报（自然科学）》 CAS 2013年第6期7-12,共6页
以杉木成熟种子为试验材料,经25 mg/L的赤霉素浸种24 h处理后,分别用0.3%、0.6%、0.9%、1.2%的秋水仙素溶液浸泡1、2、3、4 d,蒸馏水浸泡种子作为对照,3周后观察统计出苗率、变异率,9个月后调查诱变苗早期长势。结果表明:秋水仙素对种... 以杉木成熟种子为试验材料,经25 mg/L的赤霉素浸种24 h处理后,分别用0.3%、0.6%、0.9%、1.2%的秋水仙素溶液浸泡1、2、3、4 d,蒸馏水浸泡种子作为对照,3周后观察统计出苗率、变异率,9个月后调查诱变苗早期长势。结果表明:秋水仙素对种子出苗率、变异率均有显著影响,随着处理浓度和时间的不同呈现出一定规律的变化,0.9%的秋水仙素浸泡种子4 d得到的变异率最大;秋水仙素浓度和处理时间对苗高影响差异显著,同一处理时间随着浓度的增加平均苗高呈现先降低后升高的变化趋势,同一浓度处理则随时间延长苗高表现为先升高后降低的变化趋势;地径大小与苗高规律一致,催芽处理抑制其分枝。 展开更多
关键词 杉木 秋水仙素 化学诱变 变异苗 诱变效应
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基于RAD-seq技术的金银花SSR标记开发及鉴定 被引量：8
2
作者 李慧 刘东超 +5 位作者 徐瑞瑞 侯立娜 王天琪 刘忠华 付晓 李圣波 《北京林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第6期108-117,共10页
【目的】通过开发特异性高的多态性分子标记位点,以弥补金银花在简单重复序列(SSR)标记方面的匮乏,推动金银花在遗传资源管理及良种鉴定等方向的研究,为后续全基因组测序及组装策略奠定基础。【方法】运用RAD-seq技术对2份金银花样品进... 【目的】通过开发特异性高的多态性分子标记位点,以弥补金银花在简单重复序列(SSR)标记方面的匮乏,推动金银花在遗传资源管理及良种鉴定等方向的研究,为后续全基因组测序及组装策略奠定基础。【方法】运用RAD-seq技术对2份金银花样品进行简化基因组测序,利用MISA软件识别contig上的SSR序列并对各类型序列特征进行归纳分析,进而设计引物并利用生物信息学的方法进行引物筛选和有效性检测。【结果】对‘九丰一号’和‘亚特’金银花进行简化基因组测序,分别获得27.805 Mbp和42.560 Mbp干净读长。在组装的45850个基因序列中共检测到46999个SSR位点,其中单核苷酸重复单元比例最高(49.15%),六核苷酸重复单元最少(0.20%)。SSR位点的重复基序以(A/T)n为主,具有偏向性。除单碱基和二碱基重复类型外,SSR位点基序的重复次数集中在5~6次,且随重复次数增加,SSR位点重复类型出现的频率呈下降趋势。金银花基因组SSR序列长度介于10~310 bp之间,随重复次数增加,各SSR序列出现的频率逐渐下降。利用Primer3.0成功设计出38507对SSR引物,设计成功率为81.93%。对挑选的35对SSR引物进行多态性分析,等位基因数、观测杂合度和多态性信息含量(PIC)的平均值分别为5.057、0.363和0.568,其中高多态信息位点26个,中度多态信息位点9个,均未偏离哈迪–温伯格平衡。【结论】利用RAD-seq技术可实现SSR标记的大量开发和多态性SSR引物的筛选,并为金银花在遗传多样性分析和种质鉴定等相关方面的研究提供数据支持。 展开更多
关键词 金银花 简单重复序列(SSR) RAD-seq 多态性
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