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nr数据库分析及其本地化
被引量:
119
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作者
邓泱泱
荔建琦
+3 位作者
吴松锋
朱云平
陈耀文
贺福初
《计算机工程》
CAS
CSCD
北大核心
2006年第5期71-73,76,共4页
通过用NCBI的blastp程序对nr数据库与IPI数据库中属于人类的蛋白质序列进行比较,论证了nr数据库整合到蛋白质注释系统中的必要性。并在此基础上,设计方案实现了nr数据库的本地化,对nr数据库的记录进行了统计分析,提供了数据库的内部访问...
通过用NCBI的blastp程序对nr数据库与IPI数据库中属于人类的蛋白质序列进行比较,论证了nr数据库整合到蛋白质注释系统中的必要性。并在此基础上,设计方案实现了nr数据库的本地化,对nr数据库的记录进行了统计分析,提供了数据库的内部访问,为蛋白质注释系统整合nr数据库做好了第一步工作。
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关键词
蛋白质序列数据库
序列比对
蛋白质注释
本地化
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职称材料
题名
nr数据库分析及其本地化
被引量:
119
1
作者
邓泱泱
荔建琦
吴松锋
朱云平
陈耀文
贺福初
机构
汕头大学人工智能与模式识别
实验室
北京放射医学研究所系统生物学实验室
出处
《计算机工程》
CAS
CSCD
北大核心
2006年第5期71-73,76,共4页
基金
国家"863"计划基金资助项目(2002-BA711A11)
国家"973"计划基金资助项目(2001CB510209)
+1 种基金
北京市科技计划基金资助项目(H030230280590)
国家自然科学基金委员会资助项目"创新研究群体科学基金"(321003)
文摘
通过用NCBI的blastp程序对nr数据库与IPI数据库中属于人类的蛋白质序列进行比较,论证了nr数据库整合到蛋白质注释系统中的必要性。并在此基础上,设计方案实现了nr数据库的本地化,对nr数据库的记录进行了统计分析,提供了数据库的内部访问,为蛋白质注释系统整合nr数据库做好了第一步工作。
关键词
蛋白质序列数据库
序列比对
蛋白质注释
本地化
Keywords
Protein sequence database
Sequence alignment
Protein annotation
Localization
分类号
TP311 [自动化与计算机技术—计算机软件与理论]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
nr数据库分析及其本地化
邓泱泱
荔建琦
吴松锋
朱云平
陈耀文
贺福初
《计算机工程》
CAS
CSCD
北大核心
2006
119
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参考文献
引证文献
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