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应用8标iTRAQ技术结合2D LC-MS/MS分析大鼠再生肝的差异蛋白质组
被引量：
5
1
作者
张一甫
秦兆宇
+2 位作者
刘晓慧
林成招
贺福初
《分析测试学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第5期421-429,共9页
首次应用8标iTRAQ(Isobaric tags for relative and absolute quantitation)技术结合2D LC-MS/MS(Two-dimensional liquid chromatography-tandem mass spectrometry),以部分肝切除的大鼠为模型,全面分析了再生早期(6、12 h)、中期(24、...
首次应用8标iTRAQ(Isobaric tags for relative and absolute quantitation)技术结合2D LC-MS/MS(Two-dimensional liquid chromatography-tandem mass spectrometry),以部分肝切除的大鼠为模型,全面分析了再生早期(6、12 h)、中期(24、48 h)和晚期(72、120 h)肝脏蛋白质的表达差异。共鉴定357种蛋白质,6个时间点共有60种蛋白质的表达量与对照组(手术切下的正常肝组织)有显著差异。其中,ADH1(Alcohol dehy-drogenase 1)和PRDX1(Peroxiredoxin 1)等的表达变化趋势与已有报道相同,GO(Gene ontology)的蛋白质功能注释提示ADH1、CAT(Catalase)、ENO1(Enolase 1)和APOA1(Apolipoprotein A-Ⅰ)等可能通过影响细胞凋亡和能量供给等方式参与肝再生调控。聚类分析表明,术后12 h和24 h蛋白质的整体表达模式相似,6 h与此二者相近,48 h和72 h相似,而120 h与这些时间点相差最远。该研究验证了8标iTRAQ是并行处理多组样本的有效技术,适合于生理和病理过程多时间点蛋白质组的定量差异分析,可以监控关键分子的动态变化,更易发掘重要的调控靶点分子。该文为进一步探讨肝再生机理提供了有价值的线索。
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关键词
ITRAQ
2D
LC-MS/MS
肝脏再生
差异蛋白质组
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职称材料
基于膜超滤的糖肽富集新方法
被引量：
1
2
作者
卢庄
贾伟
+4 位作者
宋丽娜
蔡耘
邓玉林
张玉奎
钱小红
《分析测试学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第6期644-648,共5页
建立了一种用于糖肽富集的新型超滤方法,采用截留相对分子质量为3 000 u的超滤膜,截取相对分子质量大于3 000 u的组分,同时完成糖肽的富集、样本的脱盐及浓缩,简化了操作过程并减少了样本损失。用4种标准蛋白酶切肽段混合物测试方法的...
建立了一种用于糖肽富集的新型超滤方法,采用截留相对分子质量为3 000 u的超滤膜,截取相对分子质量大于3 000 u的组分,同时完成糖肽的富集、样本的脱盐及浓缩,简化了操作过程并减少了样本损失。用4种标准蛋白酶切肽段混合物测试方法的有效性,结果表明,采用超滤方法富集后的样品可以多鉴定1个糖肽,且所有鉴定的糖肽丰度远高于未富集的样品。将该方法用于人血浆样本,血浆全酶切肽段的1个SCX组分用超滤法富集后,其鉴定的糖肽数量超过未富集组分的6倍,且糖肽富集的选择性大于85%。该方法为糖蛋白质组学的研究及糖相关生物标志物的开发提供了有力的技术支持。
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关键词
N-连接糖肽
超滤
富集
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职称材料
题名
应用8标iTRAQ技术结合2D LC-MS/MS分析大鼠再生肝的差异蛋白质组
被引量：
5
1
作者
张一甫
秦兆宇
刘晓慧
林成招
贺福初
机构
复旦大
学
生物
医学
研究
院系统生物
学
实验室
复旦大
学
生物
医学
研究
院
蛋白质
组
研究
中心
北京放射医学研究所北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室
出处
《分析测试学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第5期421-429,共9页
基金
国家自然科学基金资助项目(30900257)
上海市自然科学基金资助项目(09ZR1404100)
北京蛋白质组学国家重点实验室自主课题资助项目(SKLP-K200808)
文摘
首次应用8标iTRAQ(Isobaric tags for relative and absolute quantitation)技术结合2D LC-MS/MS(Two-dimensional liquid chromatography-tandem mass spectrometry),以部分肝切除的大鼠为模型,全面分析了再生早期(6、12 h)、中期(24、48 h)和晚期(72、120 h)肝脏蛋白质的表达差异。共鉴定357种蛋白质,6个时间点共有60种蛋白质的表达量与对照组(手术切下的正常肝组织)有显著差异。其中,ADH1(Alcohol dehy-drogenase 1)和PRDX1(Peroxiredoxin 1)等的表达变化趋势与已有报道相同,GO(Gene ontology)的蛋白质功能注释提示ADH1、CAT(Catalase)、ENO1(Enolase 1)和APOA1(Apolipoprotein A-Ⅰ)等可能通过影响细胞凋亡和能量供给等方式参与肝再生调控。聚类分析表明,术后12 h和24 h蛋白质的整体表达模式相似,6 h与此二者相近,48 h和72 h相似,而120 h与这些时间点相差最远。该研究验证了8标iTRAQ是并行处理多组样本的有效技术,适合于生理和病理过程多时间点蛋白质组的定量差异分析,可以监控关键分子的动态变化,更易发掘重要的调控靶点分子。该文为进一步探讨肝再生机理提供了有价值的线索。
关键词
ITRAQ
2D
LC-MS/MS
肝脏再生
差异蛋白质组
Keywords
iTRAQ
2D LC-MS/MS
liver regeneration
differential proteomics
分类号
O657.63 [理学—分析化学]
O629.73 [理学—有机化学]
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职称材料
题名
基于膜超滤的糖肽富集新方法
被引量：
1
2
作者
卢庄
贾伟
宋丽娜
蔡耘
邓玉林
张玉奎
钱小红
机构
北京
理工大
学
生命科
学
与技术
学
院
北京放射医学研究所北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室
出处
《分析测试学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第6期644-648,共5页
基金
国家自然科学基金资助项目(30621063,20735005,20635010)
国家高技术研究发展计划863资助项目(2008AA02Z309)
文摘
建立了一种用于糖肽富集的新型超滤方法,采用截留相对分子质量为3 000 u的超滤膜,截取相对分子质量大于3 000 u的组分,同时完成糖肽的富集、样本的脱盐及浓缩,简化了操作过程并减少了样本损失。用4种标准蛋白酶切肽段混合物测试方法的有效性,结果表明,采用超滤方法富集后的样品可以多鉴定1个糖肽,且所有鉴定的糖肽丰度远高于未富集的样品。将该方法用于人血浆样本,血浆全酶切肽段的1个SCX组分用超滤法富集后,其鉴定的糖肽数量超过未富集组分的6倍,且糖肽富集的选择性大于85%。该方法为糖蛋白质组学的研究及糖相关生物标志物的开发提供了有力的技术支持。
关键词
N-连接糖肽
超滤
富集
Keywords
N-linked glycopeptide
ultra filtration
enrichment
分类号
O652.6 [理学—分析化学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
应用8标iTRAQ技术结合2D LC-MS/MS分析大鼠再生肝的差异蛋白质组
张一甫
秦兆宇
刘晓慧
林成招
贺福初
《分析测试学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010
5
在线阅读
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职称材料
2
基于膜超滤的糖肽富集新方法
卢庄
贾伟
宋丽娜
蔡耘
邓玉林
张玉奎
钱小红
《分析测试学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009
1
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职称材料
已选择
0
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引证文献
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