-
题名水稻LEA基因家族的全基因组鉴定及综合分析
- 1
-
-
作者
赵贺
冀亚亮
梁潇
阮班普
于彦春
马殿荣
-
机构
沈阳农业大学水稻研究所
北京康普森生物技术有限公司
辽东学院农学院
杭州师范大学生命与环境科学学院
辽宁省农业科学院
-
出处
《沈阳农业大学学报》
北大核心
2025年第5期14-25,共12页
-
基金
辽宁省科技重大专项项目(2024JH1/11700006)。
-
文摘
[目的]大量研究表明,LEA蛋白能够通过多种机制帮助植物应对环境压力,在水稻中仍有大量LEA家族成员的功能尚未得到充分验证。因此,通过对水稻LEA基因家族(OsLEA)的生物信息学分析,并结合其在不同胁迫下的基因表达变化,旨在挖掘参与水稻中响应非生物胁迫的OsLEA新成员。[方法]采用全基因组生物信息学方法对OsLEA基因家族进行了鉴定和分析。[结果]水稻基因组中共包含83个OsLEA基因家族成员,这些基因不均匀地分布在12条染色体上,根据其结构域特征可分为8个亚家族。理化性质分析显示,LEA蛋白具有广泛的亲水性和较强的稳定性。亚细胞定位预测表明,大多数LEA蛋白分布在细胞质、细胞膜和线粒体等细胞组分中。启动子顺式作用元件分析表明,OsLEA基因的启动子区域富含与非生物胁迫、植物激素响应和生长发育相关的元件。组织表达模式和激素响应分析揭示,OsLEA基因在不同组织和不同植物激素处理中表现出显著的表达特异性。此外,非生物胁迫(低温、高温、盐和重金属镉)处理下,部分OsLEA基因表现出明显的应答。[结论]通过整合生物信息学分析及多种激素与逆境胁迫下的表达谱数据,初步揭示了OsLEA基因家族参与逆境响应的分子调控机制。基于此,成功筛选出Os04g0589800、Os05g0362600、Os06g0324400和Os08g0163600等核心成员基因,其在高盐、高温及低温胁迫下均呈现显著表达上调特征,证实了它们在非生物胁迫应答中的关键生物学功能,为抗逆水稻育种提供了极具应用潜力的分子靶标。
-
关键词
水稻
LEA基因家族
非生物胁迫
启动子顺式作用元件
组织表达模式
-
Keywords
rice
LEA gene family
abiotic stress
promoter cis-acting elements
tissue expression pattern
-
分类号
S511
[农业科学—作物学]
-
-
题名分子倒置探针技术的研究进展及应用
- 2
-
-
作者
罗志梅
张永彪
鄢纯
韩圆圆
呼锐
刘继强
-
机构
北京康普森生物技术有限公司
北京大数据精准医疗高精尖创新中心北京航空航天大学
-
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第10期49-57,共9页
-
基金
北京市科技计划专项课题(Z16010101462)
-
文摘
分子倒置探针技术是一项新发展起来的用于目标序列捕获的分子生物学技术,该技术通过设计特异的探针对已知的特定目的基因组序列进行捕获,将目标序列DNA富集后再利用芯片杂交或测序进行检测。此技术有助于研究人员对大样本中的基因组重要区域进行研究,避免了全基因组研究费用高、分析困难等问题。并且,分子倒置探针技术弥补了杂交捕获技术、PCR捕获技术等分子捕获手段的不足,为动植物及病原菌重要DNA片段的研究提供强有力的技术支持。目前,分子倒置探针技术广泛应用于单核苷酸多态性(SNP)分型、外显子测序、拷贝数变异、杂合性丢失、体细胞突变、DNA甲基化和可变剪接等方面的研究。由于其特异性强、重复性好、操作简单、费用低廉,并对DNA完整度要求不高,适用于福尔马林石蜡包埋样本分析等特点,分子倒置探针技术的应用越来越广泛。然而,分子倒置探针技术在探针设计及数据分析软件研发等方面仍存在一些不足,还需要进一步的优化完善。为促进相关领域学者全面了解该技术,综述了分子倒置探针技术的基本原理、发展历程、技术特点及在疾病研究领域的应用,讨论了分子倒置探针技术的价值及存在的问题。
-
关键词
分子倒置探针技术
目标序列捕获
疾病研究
-
Keywords
molecular inversion probe technology
target sequence capture
disease research
-
分类号
Q78
[生物学—分子生物学]
-
-
题名内蒙古自治区粮食作物生产及成本收益分析
- 3
-
-
作者
刘宏久
公维香
冯羿方
郝晓东
代微
刘继强
-
机构
北京康普森生物技术有限公司
-
出处
《现代农业科技》
2024年第16期171-173,181,共4页
-
文摘
通过分析国家统计局、内蒙古自治区发展和改革委员会2020—2022年调查报告,研究玉米、大豆、小麦和粳稻4种主要粮食作物生产及成本收益。结果表明,2020—2022年内蒙古自治区玉米的平均产量最高,大豆的平均产量最低;大豆的平均价格最高,玉米的平均价格最低;粳稻的平均总成本最高,大豆的平均总成本最低;玉米的平均净利润最高,小麦的平均净利润变化最小。综上所述,内蒙古自治区玉米种植的经济效益最优,小麦种植的经营风险最低,粳稻种植的经营风险最高,大豆种植前景可期。
-
关键词
粮食作物
平均产量
平均价格
平均总成本
平均净利润
内蒙古自治区
-
Keywords
grain crop
average yield
average price
average total cost
average net profit
Inner Mongolia Autono-mous Region
-
分类号
F326.11
[经济管理—产业经济]
-
