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利用计算机模拟筛选可特异性结合并抑制FtsZ聚合的小分子化合物
1
作者
余浩源
陈亨野
杨冬
《北京师范大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第6期593-598,共6页
FtsZ(丝状温度敏感蛋白Z)是微管蛋白在原核生物中的同源物,在细胞分裂过程中起着关键作用.利用枯草芽孢杆菌的FtsZ晶体结构,针对其GTPase位点,对8万个小分子进行了虚拟筛选,结果发现了7个可以结合到GTPase口袋中的小分子化合物.依据预...
FtsZ(丝状温度敏感蛋白Z)是微管蛋白在原核生物中的同源物,在细胞分裂过程中起着关键作用.利用枯草芽孢杆菌的FtsZ晶体结构,针对其GTPase位点,对8万个小分子进行了虚拟筛选,结果发现了7个可以结合到GTPase口袋中的小分子化合物.依据预测的结合模式,这些小分子可以分为2组.其中组1基本上完全占据了GTP/GDP的结合位置,与GTP的嘌呤结合口袋附近的疏水氨基酸F136、F183、L190可能具有相互作用.而组2的小分子所占据的结合位置则与GTP/GDP有明显区别.本工作预测的小分子化合物可以成为潜在的抑制剂,以它们作为起点,我们下一步将通过生化试验检测其抑制效果,从而为开发抑制剂提供基础.
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关键词
丝状温度敏感蛋白Z
细胞分裂
虚拟筛选
抑制剂
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职称材料
题名
利用计算机模拟筛选可特异性结合并抑制FtsZ聚合的小分子化合物
1
作者
余浩源
陈亨野
杨冬
机构
北京师范大学生命科学学院、北京市基因工程药物与生物技术重点实验室
出处
《北京师范大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第6期593-598,共6页
基金
国家自然科学基金资助项目(31070682)
中央高校基本科研业务费专项资金资助项目
+1 种基金
教育部留学回国人员科研启动基金资助项目
霍东英教育基金会资助项目
文摘
FtsZ(丝状温度敏感蛋白Z)是微管蛋白在原核生物中的同源物,在细胞分裂过程中起着关键作用.利用枯草芽孢杆菌的FtsZ晶体结构,针对其GTPase位点,对8万个小分子进行了虚拟筛选,结果发现了7个可以结合到GTPase口袋中的小分子化合物.依据预测的结合模式,这些小分子可以分为2组.其中组1基本上完全占据了GTP/GDP的结合位置,与GTP的嘌呤结合口袋附近的疏水氨基酸F136、F183、L190可能具有相互作用.而组2的小分子所占据的结合位置则与GTP/GDP有明显区别.本工作预测的小分子化合物可以成为潜在的抑制剂,以它们作为起点,我们下一步将通过生化试验检测其抑制效果,从而为开发抑制剂提供基础.
关键词
丝状温度敏感蛋白Z
细胞分裂
虚拟筛选
抑制剂
Keywords
FtsZ
cell division
inhibitor
virtual screening
分类号
Q966 [生物学—昆虫学]
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作者
出处
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1
利用计算机模拟筛选可特异性结合并抑制FtsZ聚合的小分子化合物
余浩源
陈亨野
杨冬
《北京师范大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2013
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