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北京市某区腹泻患者感染小肠结肠炎耶尔森菌病原特征分析
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作者 刘雨薇 王海瑞 +6 位作者 张彦春 李首飞 王洛桐 王苗 闫爱霞 李颖 张茂俊 《中国人兽共患病学报》 北大核心 2025年第6期609-616,共8页
目的对北京市某区监测腹泻患者的粪便标本进行小肠结肠炎耶尔森菌(Yersinia enterocolitica,Ye)分离培养并对分离菌株进行病原特征分析,为Ye感染的防治提供基础数据。方法收集2019年1月至2024年6月期间北京市某区腹泻患者信息和粪便标... 目的对北京市某区监测腹泻患者的粪便标本进行小肠结肠炎耶尔森菌(Yersinia enterocolitica,Ye)分离培养并对分离菌株进行病原特征分析,为Ye感染的防治提供基础数据。方法收集2019年1月至2024年6月期间北京市某区腹泻患者信息和粪便标本。对粪便标本进行基于荧光PCR初筛下的增菌培养;对分离株完成菌种鉴定及抗生素敏感性检测。通过荧光PCR以及全基因组测序进行菌株的毒力基因分布及其它遗传特征分析。结果1439例腹泻患者共分离到Ye菌株11株,检出率为0.76%(11/1439)。加上既往1例阳性患者,12例Ye阳性患者年龄介于6~41岁;患者粪便性状构成比为水样便66.67%(8/12)、稀便33.33%(4/12);患者出现恶心、呕吐、发热的频率分别为41.67%(5/12)、41.67%(5/12)、8.33%(1/12)。12株Ye对TET、AMP和NAL三种抗生素的耐药率分别为50.00%(6/12)、33.33%(4/12)和25.00%(3/12),1株Ye菌为多重耐药菌株,耐药谱为ETP+MEM+TET+CIP+NAL+AMP。5种Ye毒力基因荧光PCR检测结果显示2株Ye为ystA+/ystB-型(ystA+/ystB-/ail+/yadA+/virF+),10株Ye为ystA-/ystB+型(ystA-/ystB+/ail-/yadA-/virF-)。基于基因组序列的VFDB数据库比对分析发现12株YE共预测出106个毒力基因和12种毒力基因谱,所有菌株均普遍携带11个关键毒力基因,包括黏附、入侵、蛋白酶及鞭毛运动相关基因。仅在2株ystA+/ystB-Ye预测到含有与TTSS分泌系统、ABC转运蛋白功能紧密关联的遗传元件。结论腹泻病例粪便分离培养ystA-/ystB+型Ye存在漏检的可能,粪便增菌液荧光PCR筛查对ystA-/ystB+型Ye分离率提升具有重要意义;腹泻病例分离Ye呈现遗传特征多样性,且含有多种类型毒力基因。 展开更多
关键词 小肠结肠炎耶尔森菌 腹泻 耐药 全基因组测序
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Salmonella Java导致食源性疾病暴发事件的实验室检测
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作者 刘雨薇 丁伟 +7 位作者 张爽 赵宇 李首飞 闫爱霞 李颖 逄波 孙雪荣 李臻鹏 《中国人兽共患病学报》 北大核心 2025年第9期960-966,共7页
目的对食源性疾病暴发事件中分离的沙门菌进行鉴定和病原特征分析。方法收集流行病学资料并采集病例粪便、厨师粪便、餐厅食品及环境样本,采用荧光PCR检测、细菌分离培养、血清分型、四重荧光PCR鉴定、全基因组测序和抗生素敏感性检测... 目的对食源性疾病暴发事件中分离的沙门菌进行鉴定和病原特征分析。方法收集流行病学资料并采集病例粪便、厨师粪便、餐厅食品及环境样本,采用荧光PCR检测、细菌分离培养、血清分型、四重荧光PCR鉴定、全基因组测序和抗生素敏感性检测等方法进行研究。结果从2名暴发病例和2名散发监测病例的粪便样本增菌后检测到4株沙门菌,血清式为1,4,12:b:1,2,均为ST42型Salmonella Java。4株基因组特征相似,均携带9个毒力岛和98种毒力基因;耐药表型均为STR单重耐药,携带氨基糖苷类耐药基因aac(6')-Iy和aac(6')-Iaa。结论此次事件是国内首次报道由S.Java导致的食源性疾病暴发,提示该菌株在本地区可能存在一定流行水平。建议餐饮行业优化食品加工流程并加强高风险病原监测,同时需进一步研究S.Java与乙型副伤寒沙门菌的鉴别诊断及致病机制差异,为国内S.Java相关监测研究提供基础资料。 展开更多
关键词 沙门菌 食源性疾病 荧光PCR 毒力基因 耐药基因
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北京市顺义区零售生猪肉中小肠结肠炎耶尔森菌的检测与病原特征分析 被引量:6
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作者 张彦春 杨波 +4 位作者 王苗 冀国强 马红梅 李颖 张茂俊 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第10期945-949,共5页
目的获得北京市顺义区零售市场生猪肉中小肠结肠炎耶尔森菌的分布及病原特征。方法采集样本,应用细菌增菌培养并同时对增菌液进行荧光PCR预筛查的方法检测小肠结肠炎耶尔森菌。对于鉴定阳性菌株应用传统PCR及多重荧光PCR方法分析5种毒... 目的获得北京市顺义区零售市场生猪肉中小肠结肠炎耶尔森菌的分布及病原特征。方法采集样本,应用细菌增菌培养并同时对增菌液进行荧光PCR预筛查的方法检测小肠结肠炎耶尔森菌。对于鉴定阳性菌株应用传统PCR及多重荧光PCR方法分析5种毒力基因的分布特征。应用肉汤稀释法获得分离菌株的耐药特征并应用脉冲场凝胶电泳(PFGE)进行菌株分子分型。结果70份样本中19份增菌液foxA基因实时荧光PCR筛查阳性,阳性率为27.14%(19/70)。19份foxA筛查阳性标本培养获得小肠结肠炎耶尔森菌。19株菌对头孢唑啉、氨苄西林、头孢西丁、氨苄西林/舒巴坦耐药率分别为97.74%、84.21%、47.39%和42.11%,其携带毒力基因特征均为ail-/ystA-/ystB+/yadA-/virF-。17株菌完成PFGE检测并被分为15种带型。结论针对增菌液进行荧光PCR预筛查,可提高食品样本中小肠结肠炎耶尔森菌分离培养的检出率。菌株毒力基因的荧光PCR组合检测可快速获得分离菌株的毒力特征。本次研究中分离自本地区零售生猪肉中的小肠结肠炎耶尔森菌未发现显著遗传聚集性特征。 展开更多
关键词 小肠结肠炎耶尔森菌 生猪肉 脉冲场凝胶电泳 抗生素敏感性 毒力基因
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一起由产气荚膜梭菌和肠聚集性大肠埃希菌共感染导致的聚集性腹泻事件病原学分析 被引量:9
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作者 张爽 张巍巍 +5 位作者 李颖 马红梅 冯宝立 张茂俊 陈倩 王丽丽 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第2期183-187,共5页
目的对一起产气荚膜梭菌和肠聚集性大肠埃希菌(PFGE)混合感染导致的腹泻暴发事件进行病原学分析。方法采集暴发事件的病例粪便样本;病原体筛查使用实时荧光PCR方法;细菌分离使用培养法;菌株毒力基因鉴定使用普通PCR方法;菌株抗生素敏感... 目的对一起产气荚膜梭菌和肠聚集性大肠埃希菌(PFGE)混合感染导致的腹泻暴发事件进行病原学分析。方法采集暴发事件的病例粪便样本;病原体筛查使用实时荧光PCR方法;细菌分离使用培养法;菌株毒力基因鉴定使用普通PCR方法;菌株抗生素敏感性测试使用微量肉汤稀释法,菌株分子分型使用脉冲场凝胶电泳方法。结果9份粪便样本核酸中,6份肠聚集性大肠埃希菌astA+(+:基因阳性),8份样本产气荚膜梭菌cpa+,5份样本同时检出2种病原体。6份粪便标本分离到肠聚集性大肠埃希菌,均astA+;8份粪便标本分离到产气荚膜梭菌,其中2株cpa+/cpe+,6株cpa+/β2+。6株肠聚集大肠埃希菌分为2种PFGE带型,其中5株同带型,也为同种耐药表型(AMP-CFZ);8株产气荚膜梭菌分为3种PFGE带型,其中6株cpa+/β2+的菌株同带型。结论本次腹泻暴发事件可能由2种病原体混合感染导致。 展开更多
关键词 肠聚集性大肠埃希菌 产气荚膜梭菌 混合感染 腹泻暴发 脉冲场凝胶电泳
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羊粪便中克罗诺菌分离与种鉴定分析 被引量:2
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作者 李颖 王海瑞 +8 位作者 王鹏 康颖 闫爱霞 王园园 李首飞 王苗 王凤双 彭涛 张茂俊 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第6期539-544,共6页
目的分析散养羊粪便中克罗诺菌的分离与种鉴定,为克罗诺菌相关风险研究奠定基础。方法采集北京市某区农村地区散养羊粪便标本,参考GB 4789.40-2016标准进行克罗诺菌分离培养;对疑似菌株进行全自动生化鉴定、16S RNA全长序列比对分析以... 目的分析散养羊粪便中克罗诺菌的分离与种鉴定,为克罗诺菌相关风险研究奠定基础。方法采集北京市某区农村地区散养羊粪便标本,参考GB 4789.40-2016标准进行克罗诺菌分离培养;对疑似菌株进行全自动生化鉴定、16S RNA全长序列比对分析以及菌株基因组测序。基于基因组序列,进行菌株基于基因组的平均核苷酸一致性(ANI)分析以及多位点序列分型(MLST)分析;对核实鉴定后的克罗诺菌使用肉汤稀释法进行15种抗生素敏感性检测。结果共采集129件羊粪便标本,其中获得26株疑似菌株。不同鉴定方法鉴定结果不完全一致。ANI分析结果显示26株菌中14株菌为克罗诺菌,分别属于4个菌种(阪崎克罗诺菌、丙二酸盐克罗诺菌、苏黎世克罗诺菌、都柏林克罗诺菌),14株克罗诺菌中8株为苏黎世克罗诺菌,样本克罗诺菌的检出率为10.85%(14/129)。1株阪崎克罗诺菌的分型为ST40,2株丙二酸盐克罗诺菌的分型分别为ST7和ST201,3株都柏林克罗诺菌分为2个亚型,其ST型别分别为ST809、ST810和ST666。8株苏黎世克罗诺菌分别为ST25(3株)、ST811、ST813、ST814(2株)和ST815。14株克罗诺菌对检测的抗生素均为敏感。结论本地区散养羊携带阪崎克罗诺菌及其它克罗诺菌菌种病原菌。全自动生化鉴定及基于16Sr RNA序列分析鉴定对于克罗诺菌的鉴定可能存在错误。 展开更多
关键词 克罗诺菌 菌种鉴定 基因组测序 平均核苷酸一致性 分子分型 抗生素敏感性
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