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题名中国李品种“秋姬”基因组Survey测序分析
被引量：2
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作者
黄振宇
申飞
夏乐晗
陈龙
陈玉玲
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机构
中国农业科学院郑州果树研究所
北京市生物技术研究中心/北京市农林科学院
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出处
《中国南方果树》
北大核心
2020年第3期102-104,共3页
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基金
中国农业科学院科技创新工程专项经费(CAAS-ASTIP-2016-ZFRI)
河南省重点研发与推广专项(科技攻关)(202102110049)
中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(1610192019206)资助。
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文摘
中国李是重要的落叶果树之一,具有较高的经济价值与生态价值,但其全基因组信息尚未被解析,限制了相关研究的深入开展。通过二代基因组Survey测序分析,对中国李品种"秋姬"全基因组信息进行初步解析,质控后共获得22.9 Gb高质量数据,经17-mer分析,预估其基因组大小为305.6 Mb,基因组杂合度为0.92%,属于高杂合中型基因组;采用SOAPdenovo软件进行组装,所得Contig N50为440 bp,Scaffold总长约为267 Mb。后续拟用第三代测序技术进行精细组装。
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关键词
李
基因组
Survey测序
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分类号
S662.3
[农业科学—果树学]
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