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兰花磷酸肌醇特异性磷脂酶C基因家族生物信息学分析被引量：4: 1; 作者胡广隆陈亚娟 +2 位作者魏建华王宏芝张杰伟《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2017年第10期2218-2223,共6页; 【目的】为研究兰花(Phalaenopsis equestris)中PI-PLC基因家族各成员在兰花中的生理功能。【方法】利用兰花基因组数据库,经过生物信息学分析,获得兰花PI-PLC基因家族成员的基因结构、染色体定位和编码蛋白,经过多重序列比对进行进化... 展开更多; 关键词磷酸肌醇特异性磷脂酶C 兰花基因家族进化分析; 在线阅读下载PDF 职称材料

桃磷酸肌醇特异性磷脂酶C基因家族鉴定与分析被引量：4: 2; 作者张杰伟任飞 +2 位作者张中保谢华魏建华《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2017年第1期185-190,共6页; 为了对桃(Prunus persica var.Lovell)中PI-PLC家族基因进行系统分析,利用桃基因组数据库,通过生物信息学手段,鉴定桃PI-PLC家族基因的基因结构、染色体定位和编码蛋白,通过序列比对进行进化和分类分析。结果表明,桃中含有5个PI-PLC家... 展开更多; 关键词磷酸肌醇特异性磷脂酶C 桃进化分析基因家族; 在线阅读下载PDF 职称材料

桃钙调磷酸酶B类似蛋白基因家族鉴定与分析被引量：2: 3; 作者张杰伟吴婷 +2 位作者任飞谢华魏建华《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2017年第3期511-516,共6页; 为了研究桃钙调磷酸酶B类似蛋白(CBLs)基因家族在桃中如何发挥作用。利用桃基因组数据库,通过生物信息学手段,鉴定桃CBL家族基因的基因结构、染色体定位和编码蛋白,通过序列比对进行进化和分类分析。结果表明,桃基因组中含有8个CBL家族... 展开更多; 关键词钙调磷酸酶B类似蛋白桃基因家族进化分析序列特征; 在线阅读下载PDF 职称材料

桃钙调磷酸酶B类似蛋白互作蛋白激酶基因家族鉴定与分析: 4; 作者张杰伟杨育峰 +2 位作者任飞谢华魏建华《科学技术与工程》北大核心 2016年第24期127-131,共5页; 钙调磷酸酶B类似蛋白互作蛋白激酶(CIPKs)在植物生长发育和抗逆过程中发挥着重要作用。为了对桃中CIPK家族基因进行系统分析,利用桃基因组数据库,通过生物信息学手段,鉴定桃CIPK家族基因的基因结构、染色体定位和编码蛋白,通过序列比对... 展开更多; 关键词钙调磷酸酶B类似蛋白互作蛋白激酶桃基因家族进化分析; 在线阅读下载PDF 职称材料

谷子SiMAPK3基因的克隆和表达特性分析被引量：2: 5; 作者王海龙李雨倩 +2 位作者王勃邢国芳张杰伟《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期123-132,共10页; 丝裂原激活的蛋白激酶(MAPK)是一类丝氨酸/苏氨酸蛋白质激酶,在植物生长发育、响应逆境胁迫及激素信号转导等方面具有重要作用。以谷子品种豫谷1号为试材,克隆与拟南芥AtMAPK3同源性最高的谷子SiMAPK3基因,并系统利用生物信息学方法分析... 展开更多; 关键词谷子 SiMAPK3 叶片发育低温胁迫高盐胁迫脱落酸茉莉酸甲酯干旱胁迫; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名兰花磷酸肌醇特异性磷脂酶C基因家族生物信息学分析被引量：4: 1; 作者胡广隆陈亚娟魏建华王宏芝张杰伟; 机构北京市农林科学院农业基因资源与生物技术北京市重点实验室; 出处《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2017年第10期2218-2223,共6页; 基金北京市科技计划(Z171100001517011) 北京市农林科学院青年科研基金项目(QNJJ201416) 北京市农林科学院科技创新能力建设专项(KJCX20170203); 文摘【目的】为研究兰花(Phalaenopsis equestris)中PI-PLC基因家族各成员在兰花中的生理功能。【方法】利用兰花基因组数据库,经过生物信息学分析,获得兰花PI-PLC基因家族成员的基因结构、染色体定位和编码蛋白,经过多重序列比对进行进化和分类分析。【结果】结果表明:兰花基因组中含有3个PI-PLC家族基因成员,分别含有9~13个外显子。TMHMM跨膜区结构分析显示,兰花PI-PLC蛋白均不含有跨膜区;MEME保守结构域分析显示,兰花PI-PLC蛋白均含有4个保守的EF、X、Y和C2结构域。【结论】以上结果对解析兰花PI-PLC蛋白的生物学功能提供重要的线索。; 关键词磷酸肌醇特异性磷脂酶C 兰花基因家族进化分析; Keywords PI-PLC Phalaenopsis equestris Gene family Phylogeny analysis; 分类号 S682.31 [农业科学—观赏园艺]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名桃磷酸肌醇特异性磷脂酶C基因家族鉴定与分析被引量：4: 2; 作者张杰伟任飞张中保谢华魏建华; 机构北京市农林科学院/农业基因资源与生物技术北京市重点实验室; 出处《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2017年第1期185-190,共6页; 基金北京市农林科学院青年科研基金项目(QNJJ201416) 北京市农林科学院科技创新能力建设专项(KJCX20140202) 北京市科技计划项目(Z151100001015005); 文摘为了对桃(Prunus persica var.Lovell)中PI-PLC家族基因进行系统分析,利用桃基因组数据库,通过生物信息学手段,鉴定桃PI-PLC家族基因的基因结构、染色体定位和编码蛋白,通过序列比对进行进化和分类分析。结果表明,桃中含有5个PI-PLC家族基因,预测他们均含有9个外显子,分布于桃的2条染色体上。保守结构域分析结果显示,桃中PI-PLC蛋白均含有4个保守的EF、X、Y和C2结构域。进化树分析结果表明桃PI-PLC家族基因可分为4个亚家族。; 关键词磷酸肌醇特异性磷脂酶C 桃进化分析基因家族; Keywords PI-PLC Prunus persica phylogeny analysis gene family; 分类号 S662.1 [农业科学—果树学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名桃钙调磷酸酶B类似蛋白基因家族鉴定与分析被引量：2: 3; 作者张杰伟吴婷任飞谢华魏建华; 机构北京市农林科学院农业基因资源与生物技术北京市重点实验室中国科学院大学; 出处《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2017年第3期511-516,共6页; 基金北京市农林科学院青年科研基金项目(QNJJ201416) 北京市农林科学院科技创新能力建设专项(KJCX20140202) 北京市科技计划(Z151100001015005); 文摘为了研究桃钙调磷酸酶B类似蛋白(CBLs)基因家族在桃中如何发挥作用。利用桃基因组数据库,通过生物信息学手段,鉴定桃CBL家族基因的基因结构、染色体定位和编码蛋白,通过序列比对进行进化和分类分析。结果表明,桃基因组中含有8个CBL家族基因,分布于桃的5条染色体上。MEME和Pfam保守结构域分析显示,桃CBL蛋白均含有4个保守的EF结构域。进化树分析表明CBLs可分为4个亚家族。TMHMM 2.0Server分析显示仅PpCBL1含有1个跨膜区。PlantsPFeatureScan分析显示PpCBL2、3和5均含有1个N-豆蔻酰化位点。NetPhos 2.0 Server结果显示PpCBLs存在着大量的丝氨酸(Ser)、苏氨酸(Thr)及酪氨酸(Tyr)潜在磷酸化位点。以上结果将为今后揭示桃CBL的功能提供重要的理论基础。; 关键词钙调磷酸酶B类似蛋白桃基因家族进化分析序列特征; Keywords CBL Prunus persica Gene family Phylogeny analysis Sequence character; 分类号 S662.1 [农业科学—果树学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名桃钙调磷酸酶B类似蛋白互作蛋白激酶基因家族鉴定与分析: 4; 作者张杰伟杨育峰任飞谢华魏建华; 机构北京市农林科学院农业基因资源与生物技术北京市重点实验室河南省农业科学院; 出处《科学技术与工程》北大核心 2016年第24期127-131,共5页; 基金北京市农林科学院青年科研基金项目(QNJJ201416) 北京市农林科学院科技创新能力建设专项(KJCX20140202)资助北京市科技计划(Z151100001015005); 文摘钙调磷酸酶B类似蛋白互作蛋白激酶(CIPKs)在植物生长发育和抗逆过程中发挥着重要作用。为了对桃中CIPK家族基因进行系统分析,利用桃基因组数据库,通过生物信息学手段,鉴定桃CIPK家族基因的基因结构、染色体定位和编码蛋白,通过序列比对进行进化和分类分析。结果表明,桃基因组中含有18个CIPK基因,分布于桃的6条染色体上。MEME和Pfam保守结构域分析显示,桃CIPK蛋白均含有2个保守的PKinase和NAF结构域。进化树分析表明CIPKs可分为2个亚家族。Net Phos 2.0 Server结果显示Pp CIPKs存在着大量的丝氨酸(Ser)、苏氨酸(Thr)及酪氨酸(Tyr)潜在磷酸化位点。以上结果将为今后揭示桃CIPK蛋白的功能提供重要的理论基础。; 关键词钙调磷酸酶B类似蛋白互作蛋白激酶桃基因家族进化分析; Keywords CIPK Prunus persica gene family phylogeny analysis; 分类号 Q516 [生物学—生物化学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名谷子SiMAPK3基因的克隆和表达特性分析被引量：2: 5; 作者王海龙李雨倩王勃邢国芳张杰伟; 机构北京市农林科学院山西农业大学农学院烟台大学生命科学学院; 出处《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期123-132,共10页; 基金国家重点研发计划(2019YFD1000700,2019YFD1000703) 北京市农林科学院科技创新能力建设专项(KJCX20210101,KJCX20200205) 省部共建有机旱作农业国家重点实验室开放基金(YJHZKF2106)。; 文摘丝裂原激活的蛋白激酶(MAPK)是一类丝氨酸/苏氨酸蛋白质激酶,在植物生长发育、响应逆境胁迫及激素信号转导等方面具有重要作用。以谷子品种豫谷1号为试材,克隆与拟南芥AtMAPK3同源性最高的谷子SiMAPK3基因,并系统利用生物信息学方法分析SiMAPK3蛋白理化性质、结构与功能;利用RT-qPCR技术检测SiMAPK3基因在谷子拔节前期不同组织和不同非生物逆境胁迫下的表达水平。结果表明,谷子SiMAPK3基因开放阅读框为1128 bp,编码一个含有376个氨基酸的蛋白,预测蛋白分子量为43427.85 Da,等电点为5.46。谷子SiMAPK3为不含信号肽的亲水性膜外蛋白,其二级结构包含44.27%的α螺旋、14.67%的β折叠、5.07%的延伸链及36.00%的无规则卷曲,其第44-328位氨基酸之间含有Pkinase保守结构域,属于MAPK蛋白激酶家族。谷子SiMAPK3三级结构与拟南芥MAPK具有很高的相似度,存在着11个丝氨酸、8个苏氨酸、4个酪氨酸及大量潜在磷酸化位点。RT-qPCR分析表明,SiMAPK3在拔节前期谷子根、茎和叶中均有表达,其在叶片中的表达量最高,约为其在根中表达量的25倍。SiMAPK3响应了低温(4℃)、高盐(300 mmol/L NaCl)、干旱和ABA(200μmol/L)、JA(200μmol/L)的胁迫。在低温胁迫12 h后,SiMAPK3的表达量上调了16倍,在高盐胁迫3 h后,SiMAPK3的表达量上调了8倍。谷子SiMAPK3基因的克隆及功能分析,为进一步解析谷子叶片生长发育及响应低温和高盐等胁迫信号转导过程提供重要依据。; 关键词谷子 SiMAPK3 叶片发育低温胁迫高盐胁迫脱落酸茉莉酸甲酯干旱胁迫; Keywords Setaria italica SiMAPK3 leaf development cold stress salt stress ABA JA drought stress; 分类号 S515 [农业科学—作物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	兰花磷酸肌醇特异性磷脂酶C基因家族生物信息学分析	胡广隆陈亚娟魏建华王宏芝张杰伟	《西南农业学报》 CSCD 北大核心	2017	4	在线阅读下载PDF 职称材料
2	桃磷酸肌醇特异性磷脂酶C基因家族鉴定与分析	张杰伟任飞张中保谢华魏建华	《江苏农业学报》 CSCD 北大核心	2017	4	在线阅读下载PDF 职称材料
3	桃钙调磷酸酶B类似蛋白基因家族鉴定与分析	张杰伟吴婷任飞谢华魏建华	《西南农业学报》 CSCD 北大核心	2017	2	在线阅读下载PDF 职称材料
4	桃钙调磷酸酶B类似蛋白互作蛋白激酶基因家族鉴定与分析	张杰伟杨育峰任飞谢华魏建华	《科学技术与工程》北大核心	2016	0	在线阅读下载PDF 职称材料
5	谷子SiMAPK3基因的克隆和表达特性分析	王海龙李雨倩王勃邢国芳张杰伟	《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心	2023	2	在线阅读下载PDF 职称材料