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基于长短时记忆循环神经网络的北京市糖尿病合并呼吸系统疾病患者入院预测研究 被引量:1
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作者 朱倩 章萌 +6 位作者 胡耀余 徐小林 陶丽新 张杰 罗艳侠 郭秀花 刘相佟 《浙江大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2022年第1期1-9,共9页
目的:比较广义相加模型(GAM)和长短时记忆循环神经网络(LSTM-RNN)对糖尿病合并呼吸系统疾病患者入院频数的预测效果。方法:收集2014年1月1日至2019年12月31日北京市大气污染物、气象因素和呼吸系统疾病入院数据,基于LSTM-RNN预测糖尿病... 目的:比较广义相加模型(GAM)和长短时记忆循环神经网络(LSTM-RNN)对糖尿病合并呼吸系统疾病患者入院频数的预测效果。方法:收集2014年1月1日至2019年12月31日北京市大气污染物、气象因素和呼吸系统疾病入院数据,基于LSTM-RNN预测糖尿病合并呼吸系统疾病患者入院频数并与GAM对比,模型评价采用五折交叉验证法。结果:与GAM相比,LSTM-RNN具有较低的预测误差[均方根误差(RMSE)分别为21.21±3.30和46.13±7.60,P<0.01;平均绝对误差(MAE)分别为14.64±1.99和36.08±6.20,P<0.01]和较高的拟合优度(R^(2)值分别为0.79±0.06和0.57±0.12,P<0.01)。在性别分层中,预测女性入院频数时,LSTM-RNN三项指标均优于GAM(均P<0.05);预测男性入院频数时,两模型误差评价指标差异无统计学意义(均P>0.05)。在季节分层中,预测温暖季节的入院频数时,LSTM-RNN的RMSE和MAE均低于GAM(均P<0.05),R2值差异无统计学意义(P>0.05);预测寒冷季节入院频数时,两种模型的RMSE、MAE和R2值差异均无统计学意义(均P>0.05)。在功能区分层中,预测首都功能核心区入院频数时,LSTM-RNN的RMSE、MAE和R2值均优于GAM(均P<0.05)。结论:LSTM-RNN预测误差较小,拟合程度优,可作为污染天气提前精准配置医疗资源的预测手段。 展开更多
关键词 长短时记忆循环神经网络 广义相加模型 呼吸系统疾病 糖尿病 日入院频数 预测
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食管鳞癌组织中差异表达miR-17-92基因簇成员及其靶基因的筛选、生物学功能分析 被引量:2
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作者 邵毅 沈艺 +3 位作者 牛琛 阮晓莉 Rena Nakyeyune 刘芬 《山东医药》 CAS 2021年第15期1-5,共5页
目的筛选食管鳞癌(ESCC)组织中差异表达的miR-17-92基因簇及其靶基因,分析靶基因的生物学功能,并探讨miR-17-92基因簇及其靶基因与患者临床病理特征、预后的关系。方法下载癌症基因组图谱(TCGA)数据库和基因表达综合(GEO)数据库(GSE4373... 目的筛选食管鳞癌(ESCC)组织中差异表达的miR-17-92基因簇及其靶基因,分析靶基因的生物学功能,并探讨miR-17-92基因簇及其靶基因与患者临床病理特征、预后的关系。方法下载癌症基因组图谱(TCGA)数据库和基因表达综合(GEO)数据库(GSE43732数据集)中ESCC相关数据,分别采用edgeR包和GEO2R分析miR-17-92基因簇的表达情况。将ESCC组织、正常食管组织及癌旁组织中差异表达最显著(差异倍数>2倍,校正后P<0.05)的miR-17-92基因簇成员作为关键miRNAs。采用miRDB 6.0、TargetScan 7.2及miRTarBase 8.0在线网站预测关键miRNAs的靶基因,经蛋白互作网络分析及差异表达分析确定关键靶基因。对关键靶基因进行KEGG信号通路和GO功能富集分析。采用独立样本t检验或Mann-Whitney U检验分析关键miRNAs及其关键靶基因与ESCC临床病理学特征间的关系,采用生存分析评价关键miRNAs及其关键靶基因与ESCC患者预后的关系。结果相对于正常食管组织及癌旁组织,ESCC组织中miR-17-92基因簇表达均上调,其中上调的关键miRNAs是miR-17-5p、miR-18a-5p。筛选出14个差异表达的关键靶基因,分别为CNOT6L、CTDSPL、ATM、FBXL5、NHLRC3、FEM1C、HIF1A、UBE2G1、CENPQ、CNOT7、RHOC、NR3C1、RUNX1、E2F3。关键靶基因主要富集于信号传导、转录调控、癌症通路、细胞周期等肿瘤相关生物学过程或通路。miR-17-5p、miR-18a-5p和关键靶基因CTDSPL在不同ESCC分化程度间存在差异表达(P均<0.05)。关键靶基因ATM和NHLRC在ESCC不同T分期间存在差异表达(P均<0.05)。关键靶基因UBE2G1在ESCC不同N分期间存在差异表达(P=0.03)。生存分析结果表明,关键靶基因ATM的表达水平与ESCC患者的预后相关(P<0.01)。结论 ESCC组织中miR-17-92基因簇表达上调,关键miRNAs为miR-17-5p、miR-18a-5p,关键靶基因为CNOT6L、CTDSPL、ATM、UBE2G1等14个。关键靶基因主要富集于信号传导、转录调控、癌症通路等肿瘤相关生物学过程或通路。CTDSPL、ATM、NHLRC、UBE2G1与ESCC患者临床病理特征有关,ATM的低表达与ESCC患者的预后差有关。 展开更多
关键词 miR-17-92基因 miR-17-92靶基因 食管癌 食管鳞状细胞癌
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缺血性脑卒中治疗相关国内外研究热点与前沿分析 被引量:2
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作者 焦丹阳 刘昊天 +3 位作者 王金麒 邬斌强 李伟铭 郭秀花 《中华老年心脑血管病杂志》 CAS 北大核心 2024年第9期1110-1112,共3页
缺血性脑卒中(ischemic stroke, IS)是一种由于脑血管阻塞导致脑部血液供应不足而引起的神经系统疾病。2019年发表的全球疾病负担数据表明,全球每年约新增960万例IS患者[1]。我国IS呈现出发病率缓慢上涨、患病率增加、经济负担加重的趋... 缺血性脑卒中(ischemic stroke, IS)是一种由于脑血管阻塞导致脑部血液供应不足而引起的神经系统疾病。2019年发表的全球疾病负担数据表明,全球每年约新增960万例IS患者[1]。我国IS呈现出发病率缓慢上涨、患病率增加、经济负担加重的趋势[2]。因此,实现IS的有效治疗与控制是极其重要的。我们重点探讨了IS治疗过程中的关键内容以及最新研究要点,旨在为临床管理与科学研究提供新的参考依据。 展开更多
关键词 卒中 药物治疗 手术治疗 血栓溶解疗法
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MicroRNA在白血病中作用的研究进展 被引量:2
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作者 韩若乔 高艾 《山西医科大学学报》 CAS 2011年第6期523-525,共3页
microRNA(miRNA),是一种21-25 nt长的单链小分子非编码RNA^[1]。它广泛存在于真核生物中,可通过碱基配对的方式结合到靶mRNA的3’非翻译区(3’UTR),从而降解靶mRNA或抑制其翻译,但不影响其转录^[2]。miRNA的主要功能是调节与个体生... microRNA(miRNA),是一种21-25 nt长的单链小分子非编码RNA^[1]。它广泛存在于真核生物中,可通过碱基配对的方式结合到靶mRNA的3’非翻译区(3’UTR),从而降解靶mRNA或抑制其翻译,但不影响其转录^[2]。miRNA的主要功能是调节与个体生长、发育、疾病发生过程有关的基因的表达,参与生命过程中一系列的重要进程,包括早期发育、细胞增殖、细胞凋亡、细胞死亡、脂肪代谢和细胞分化^[3]。越来越多的研究显示。 展开更多
关键词 MIRNA 白血病 抑癌基因 癌基因
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维生素A缺乏对APP/PS1小鼠认知功能和补体系统的影响 被引量:1
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作者 陈博文 张凯文 +1 位作者 杨春 李鹏高 《食品安全质量检测学报》 CAS 北大核心 2021年第21期8321-8327,共7页
目的研究维生素A缺乏(vitamin A deficiency,VAD)对阿尔茨海默症(Alzheimer's disease,AD)模型APP/PS1小鼠认知功能和补体系统的影响,探索补体因子影响APP/PS1小鼠认知功能的作用机制。方法将20只雄性APP/PS1小鼠随机分为维生素A缺... 目的研究维生素A缺乏(vitamin A deficiency,VAD)对阿尔茨海默症(Alzheimer's disease,AD)模型APP/PS1小鼠认知功能和补体系统的影响,探索补体因子影响APP/PS1小鼠认知功能的作用机制。方法将20只雄性APP/PS1小鼠随机分为维生素A缺乏组(VAD)和维生素A正常组(vitamin A normal,VAN),进行45周的特殊饲料干预。45周后,进行新物体识别实验和Y迷宫实验以检测小鼠的认知功能,采用免疫组化和Western Blot检测小鼠皮质中的补体系统起始因子C1q的蛋白表达情况,采用实时荧光定量聚合酶链式反应(real-time quantitative polymerase chain reaction,RT-qPCR)检测小鼠海马中C1q以及其他补体因子的mRNA表达情况。结果新物体识别实验和Y迷宫实验的结果显示,维生素A缺乏使APP/PS1小鼠认知功能障碍加重。免疫组化和Western Blot的结果显示,与VAN组相比,VAD干预45周后皮质中的C1q的蛋白表达量显著升高(P<0.05)。RT-qPCR结果显示,VAD干预45周后,海马中C1q和C1r的mRNA表达显著上调(P<0.05),C4、C4BP和C5的mRNA表达显著下调(P<0.05),而C1s、C2、C3和C5aR1的mRNA表达无明显变化。结论长期缺乏维生素A会加重AD模型APP/PS1小鼠的认知功能障碍并影响大脑中的补体系统,且补体因子可能参与VAD影响认知功能的作用机制。 展开更多
关键词 维生素A缺乏 APP/PS1小鼠 认知功能 补体系统
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食管鳞癌患者血清差异表达miRNAs的筛选 被引量:8
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作者 丁元杰 马箐 +3 位作者 郭旭东 沈艺 魏文强 刘芬 《山东医药》 CAS 2018年第15期1-4,共4页
目的初步筛选食管癌高发区食管鳞癌患者血清中差异表达的小分子RNAs(miRNAs)。方法选择52例食管鳞癌患者(观察组)、52名健康查体者(对照组),均抽取空腹静脉血4 m L。采用AgilentTM高通量miRNA微阵列芯片检测二者血清中miRNAs。结果与对... 目的初步筛选食管癌高发区食管鳞癌患者血清中差异表达的小分子RNAs(miRNAs)。方法选择52例食管鳞癌患者(观察组)、52名健康查体者(对照组),均抽取空腹静脉血4 m L。采用AgilentTM高通量miRNA微阵列芯片检测二者血清中miRNAs。结果与对照组比较,观察组26个miRNAs(hsa-let-7b-5p、hsa-miR-107、hsamiR-1207-5p、hsa-miR-1238-3p、hsa-miR-1246、hsa-miR-1290、hsa-miR-15a-5p、hsa-miR-16-5p、hsa-miR-19b-3p、hsamiR-223-3p、hsa-miR-25-3p、hsa-miR-320c、hsa-miR-3663-3p、hsa-miR-4281、hsa-miR-4455、hsa-miR-4516、hsa-miR-451a、hsa-miR-4532、hsa-miR-4634、hsa-miR-4687-3p、hsa-miR-4763-3p、hsa-miR-486-5p、hsa-miR-574-5p、hsa-miR-6090、hsa-miR-6515-3p、hsa-miR-92a-3p)的荧光信号强度FC绝对值均>2,P均<0.05,FDR均<0.1。结论食管鳞癌患者血清中hsa-let-7b-5p、hsa-miR-107、hsa-miR-1207-5p、hsa-miR-1238-3p、hsa-miR-1246、hsa-miR-1290、hsamiR-15a-5p、hsa-miR-16-5p、hsa-miR-19b-3p、hsa-miR-223-3p、hsa-miR-25-3p、hsa-miR-320c、hsa-miR-3663-3p、hsa-miR-4281、hsa-miR-4455、hsa-miR-4516、hsa-miR-451a、hsa-miR-4532、hsa-miR-4634、hsa-miR-4687-3p、hsa-miR-4763-3p、hsa-miR-486-5p、hsa-miR-574-5p、hsa-miR-6090、hsa-miR-6515-3p、hsa-miR-92a-3p差异表达。26个miRNAs可能与食管鳞癌的发生、发展有关。 展开更多
关键词 非编码RNA 小分子RNAs 食管肿瘤 食管癌 食管鳞癌
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抗体芯片技术检测甘薯提取物对结直肠癌荷瘤鼠肝脏免疫细胞因子的影响
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作者 陈思嘉 张晓鹏 +3 位作者 陈博文 张凯文 杨春 李鹏高 《食品安全质量检测学报》 CAS 北大核心 2021年第4期1369-1373,共5页
目的研究甘薯提取物(sweet potato extract,SPE)对结直肠癌(colorectal cancer,CRC)荷瘤鼠肝脏中多种免疫细胞因子表达水平的影响。方法 20只雄性Balb/c裸鼠分为2组(对照组、SPE组,每组10只)。对照组正常饮食、饮水;SPE组经饮水摄入甘... 目的研究甘薯提取物(sweet potato extract,SPE)对结直肠癌(colorectal cancer,CRC)荷瘤鼠肝脏中多种免疫细胞因子表达水平的影响。方法 20只雄性Balb/c裸鼠分为2组(对照组、SPE组,每组10只)。对照组正常饮食、饮水;SPE组经饮水摄入甘薯提取物(平均摄入量2 g/d);2组均在第5周第1 d腹腔接种人结直肠癌LoVo细胞,第8周末处死所有动物,通过抗体芯片技术检测肝组织中多种免疫细胞因子的表达水平。结果SPE干预使肝组织中c-c基序趋化配体(c-c motif chemokine ligand,CCL)11(P<0.05)、c-x-c基序趋化配体(c-x-c motif chemokine ligand,CXCL)11(P<0.01)、白细胞介素(interleukin,IL)-10(P<0.05)、IL-12(P<0.05)、IL-22(P<0.01)、IL-23(P<0.05)、基质金属蛋白酶(matrix metalloproteinase,MMP)-2、MMP-3、MMP-9(P<0.01)、双调蛋白和血管生成素样3蛋白表达水平显著降低,巨噬细胞集落刺激因子(macrophage-colony stimulating factor,M-CSF)(P<0.01)和血管生成素样2蛋白(P<0.05)水平升高,粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子(granulocyte macrophage-colony stimulating factor,GM-CSF)、γ干扰素(interferonγ,INFγ)、CCL2、CCL3、CCL20、IL-17A、血管生成素样1蛋白无显著改变。结论经口摄入SPE可降低CRC荷瘤鼠肝组织整体炎症反应,调节血管生成及组织重塑因子,有助于恢复肝功能的动态平衡。 展开更多
关键词 甘薯提取物 结直肠癌 免疫 细胞因子 抗体芯片
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