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题名新型冠状病毒基因组的适应性进化研究进展
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作者
张林
姚卓成
陆剑
唐小鹿
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机构
北京大学生命科学学院生物信息学中心
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出处
《遗传》
北大核心
2025年第2期211-227,共17页
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基金
中华人民共和国科学技术部国家重点研发项目(编号:2021YFC2301300,2023YFC3041500,2021YFC0863400)资助。
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文摘
由严重急性呼吸综合征冠状病毒2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-Co V-2)引起的2019冠状病毒病(coronavirusdisease2019,COVID-19)大流行给人类生命安全和全球经济造成了巨大冲击。SARS-Co V-2基因组的快速变异引起了广泛关注,基因组中几乎每个位点都发生过单核苷酸变异(single nucleotidevariants,SNVs),其中刺突蛋白上的变异在病毒的适应性进化和传播中起着尤为关键的作用。本文综述了SARS-Co V-2及非人类动物中相关冠状病毒的系统发生关系,并深入分析了SARS-Co V-2的谱系划分以及关键氨基酸变异对病毒生物学特性的影响。此外,本文还概述了当前面临的挑战,并展望了深度突变扫描(deep mutational scanning,DMS)结合人工智能方法在预测新冠病毒变异株流行趋势中的广阔应用前景。
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关键词
新冠病毒
谱系划分
分子进化
适应性变异
流行趋势
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Keywords
SARS-CoV-2
lineage designation
molecular evolution
adaptive mutations
pandemic trend
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分类号
R373
[医药卫生—病原生物学]
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