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实用生物信息技术课程教学实例
被引量：
4
1
作者
罗静初
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第11期102-111,共10页
介绍"实用生物信息技术"研究生课程的5个教学实例。以血红蛋白序列和结构为例,介绍常用生物信息技术和分析方法,包括蛋白质和核酸序列相似性比对、蛋白质和核酸序列数据库检索、Blast数据库相似性搜索、分子系统发生树构建,...
介绍"实用生物信息技术"研究生课程的5个教学实例。以血红蛋白序列和结构为例,介绍常用生物信息技术和分析方法,包括蛋白质和核酸序列相似性比对、蛋白质和核酸序列数据库检索、Blast数据库相似性搜索、分子系统发生树构建,以及蛋白质结构比较分析等。
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关键词
生物信息技术
血红蛋白
序列比对
数据库检索
Blast数据库搜索
系统发生树构建
蛋白质结构比较分析
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职称材料
植物转录因子分类、预测和数据库构建
被引量：
25
2
作者
靳进朴
郭安源
+5 位作者
何坤
张禾
朱其慧
陈新
高歌
罗静初
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第11期68-77,共10页
转录因子在植物生长发育和应对胁迫等过程中具有重要调控作用,基因组水平上系统预测植物转录因子是研究其功能和演化的基础。通过深入全面的文献调研,总结了一套完整的植物转录因子家族分类规则,开发了转录因子预测流程,构建了转录因子...
转录因子在植物生长发育和应对胁迫等过程中具有重要调控作用,基因组水平上系统预测植物转录因子是研究其功能和演化的基础。通过深入全面的文献调研,总结了一套完整的植物转录因子家族分类规则,开发了转录因子预测流程,构建了转录因子预测平台。基于该流程,从83种绿色植物中预测到129 288个转录因子,分属58个家族。对预测到的转录因子,从家族和个体两个层次进行了详尽注释,构建了植物转录因子数据库Plant TFDB(http://planttfdb.cbi.pku.edu.cn)。Plant TFDB提供了覆盖绿色植物主要谱系的转录因子,其中大部分为具有重要经济价值的单子叶和双子叶植物,已成为植物转录因子功能和演化研究的重要信息资源和分析平台。
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关键词
转录因子
转录因子家族分类
转录因子预测
植物转录因子数据库
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职称材料
题名
实用生物信息技术课程教学实例
被引量：
4
1
作者
罗静初
机构
北京大学生命科学学院北京大学蛋白质与植物基因研究重点实验室北京大学生物信息中心
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第11期102-111,共10页
文摘
介绍"实用生物信息技术"研究生课程的5个教学实例。以血红蛋白序列和结构为例,介绍常用生物信息技术和分析方法,包括蛋白质和核酸序列相似性比对、蛋白质和核酸序列数据库检索、Blast数据库相似性搜索、分子系统发生树构建,以及蛋白质结构比较分析等。
关键词
生物信息技术
血红蛋白
序列比对
数据库检索
Blast数据库搜索
系统发生树构建
蛋白质结构比较分析
Keywords
bioinformatics
hemoglobin
sequence alignment
database query
Blast database similarity search
phylogenetic tree construction
protein structure comparison
分类号
Q811.4-4 [生物学—生物工程]
G642 [文化科学—高等教育学]
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职称材料
题名
植物转录因子分类、预测和数据库构建
被引量：
25
2
作者
靳进朴
郭安源
何坤
张禾
朱其慧
陈新
高歌
罗静初
机构
北京大学生命科学学院北京大学蛋白质与植物基因研究重点实验室北京大学生物信息中心
华中科技
大学
生命科学
与技术
学院
孟山都公司
密歇根
大学
杰克森
基因
组医学
实验室
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第11期68-77,共10页
基金
国家自然科学基金项目(31071160
31171242
+2 种基金
31470330)
博士后科学基金项目(2014M560017
2015T80015)
文摘
转录因子在植物生长发育和应对胁迫等过程中具有重要调控作用,基因组水平上系统预测植物转录因子是研究其功能和演化的基础。通过深入全面的文献调研,总结了一套完整的植物转录因子家族分类规则,开发了转录因子预测流程,构建了转录因子预测平台。基于该流程,从83种绿色植物中预测到129 288个转录因子,分属58个家族。对预测到的转录因子,从家族和个体两个层次进行了详尽注释,构建了植物转录因子数据库Plant TFDB(http://planttfdb.cbi.pku.edu.cn)。Plant TFDB提供了覆盖绿色植物主要谱系的转录因子,其中大部分为具有重要经济价值的单子叶和双子叶植物,已成为植物转录因子功能和演化研究的重要信息资源和分析平台。
关键词
转录因子
转录因子家族分类
转录因子预测
植物转录因子数据库
Keywords
transcription factor
classification of transcription factor
prediction of transcription factor
plant transcription factor database
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
实用生物信息技术课程教学实例
罗静初
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2015
4
在线阅读
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职称材料
2
植物转录因子分类、预测和数据库构建
靳进朴
郭安源
何坤
张禾
朱其慧
陈新
高歌
罗静初
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2015
25
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职称材料
已选择
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参考文献
引证文献
统计分析
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