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联用多步骤虚拟筛选方法发现具有新母核的GABAA受体正性变构调节剂
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作者 孔维恺忻 廉靖靖 +10 位作者 彭超 朱杰 郑钰琳 黄巍然 张博文 段桂芳 马琳 彭晓东 马维宁 朱素杰 黄卓 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2024年第1期22-23,共2页
GABAA受体主要介导哺乳动物中枢神经系统的抑制性信号传递,是镇静催眠药的关键靶点。在寻找具有新母核的镇静催眠药的过程中,计算机辅助药物设计(CADD)方法显示出巨大的优势。在这项研究中,首先,我们通过机器学习模型、分子对接模型和... GABAA受体主要介导哺乳动物中枢神经系统的抑制性信号传递,是镇静催眠药的关键靶点。在寻找具有新母核的镇静催眠药的过程中,计算机辅助药物设计(CADD)方法显示出巨大的优势。在这项研究中,首先,我们通过机器学习模型、分子对接模型和分子力学广义玻恩比表面积(MMGBSA)方法筛选了来自于商业数据库中的41112种化合物。经过筛选,我们得到了16个化合物,然后我们通过全细胞膜片钳电生理学实验验证了4个结构新颖的化合物确实为有效的GABAA受体正性变构调节剂。其中,化合物GPR120在细胞水平和动物水平都得到了实验验证。在重组表达α1β2γ2型受体的皮层神经元中,在10和50µmol∙L^(−1)浓度下,GPR120可将GABA EC3-10电流分别增强71.5%和163.8%。通过全分解贡献分析和点突变实验,我们发现GPR120与GABAA受体结合的关键位点是H102,与阳性药物地西泮相似。为了进一步验证GPR120在动物水平上的功能,我们进行了运动活动测试和翻正反射消失(LORR)实验。GPR120对小鼠的运动活动有抑制作用,6 h后可恢复,说明GPR120是一种中度镇静剂。在戊巴比妥钠(PB)诱导的翻正反射消失实验中,与生理盐水组相比,GPR120(20 mg∙kg^(−1))可显著缩短开始LORR的时间并延长LORR的持续时间。综上所述,通过联用多种虚拟筛选方法,我们发现了GPR120是一种具有新型母核的中度强度镇静剂。 展开更多
关键词 机器学习 离子通道 分子对接 虚拟筛选 GABAA受体
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新型双核铂类配合物的合成及其抗肿瘤活性 被引量:2
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作者 张金超 李文献 +4 位作者 龚钰秋 郑小明 崔景荣 吴军 王瑞卿 《浙江大学学报(理学版)》 CAS CSCD 2003年第2期192-195,共4页
合成 3种双核铂类配合物 [{Pt(H2 O) 2 I}μ— OOC— (CH2 — ) n COO— {Pt(H2 O) 2 I}](1~ 3 ) (n=0 ,1,2 ) .用元素分析、摩尔电导、差热热重分析、红外光谱、紫外光谱和核磁共振氢谱等方法对其进行了表征 .体外抗肿瘤活性表明 ,配... 合成 3种双核铂类配合物 [{Pt(H2 O) 2 I}μ— OOC— (CH2 — ) n COO— {Pt(H2 O) 2 I}](1~ 3 ) (n=0 ,1,2 ) .用元素分析、摩尔电导、差热热重分析、红外光谱、紫外光谱和核磁共振氢谱等方法对其进行了表征 .体外抗肿瘤活性表明 ,配合物 1和 3对多种人的肿瘤细胞有较高的活性 ,配合物 展开更多
关键词 双核铂类配合物 合成 抗肿瘤活性 结构表征 抗癌活性化合物 化学结构
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中国南海圆裂短足软珊瑚的甾体成分研究 被引量:2
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作者 黄新苹 朱校斌 +1 位作者 邓志威 林文翰 《海洋科学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第6期86-93,共8页
从南海圆裂短足软珊瑚(Cladiella krempfi)中分离出12个甾体化合物,分别鉴定为:1,2-[1’,3’,4’]oxodithiin-pregna-20-en-3-one(1);19-nor-4-methylpregna-1,3,5(10),20-tetraen-1-ol(2);pregna-1-en-3-one-20-01(... 从南海圆裂短足软珊瑚(Cladiella krempfi)中分离出12个甾体化合物,分别鉴定为:1,2-[1’,3’,4’]oxodithiin-pregna-20-en-3-one(1);19-nor-4-methylpregna-1,3,5(10),20-tetraen-1-ol(2);pregna-1-en-3-one-20-01(3);pregna-1,7-dien-20-ol-3-one(4);pregna-5,20-dien-3-O-a—fucopyranoside(5);pregna-20-en-3-O-a—fucopyranoiside(6);孕甾-1,20-二烯-3-酮(7);孕甾-1,4,20-三烯-3-酮(8);24-甲基-5d-胆甾-7,22-二烯-3β,5,6β三醇(9);26-甲基-24-亚甲基胆甾-5烯-3β-醇(10);胆甾-5-烯-3β醇(11);β-谷甾醇(12)。化合物1~6系首次从Cladiella属软珊瑚中获得的孕甾类化合物。对所获得化合物的生源途径进行了初步讨论。 展开更多
关键词 圆裂短足软珊瑚(Cladiella krempfi) 孕甾类化合物 生源途径
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束生刚毛藻Cladophora fascicularis中三萜化合物的活性研究 被引量:1
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作者 黄新苹 林文翰 朱校斌 《江西师范大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2016年第1期89-92,共4页
根据生物活性筛选为导向,对采自青岛沿海的绿藻束生刚毛藻(Cladophora fascicularis)的化学成分进行研究,利用薄层制备色谱方法从中分离出一系列环阿尔廷类三萜化合物,分别为环阿尔廷-24-过氧羟基-25烯-3β-醇(1)、环阿尔廷-25-过... 根据生物活性筛选为导向,对采自青岛沿海的绿藻束生刚毛藻(Cladophora fascicularis)的化学成分进行研究,利用薄层制备色谱方法从中分离出一系列环阿尔廷类三萜化合物,分别为环阿尔廷-24-过氧羟基-25烯-3β-醇(1)、环阿尔廷-25-过氧羟基-23-烯-3β-醇(2)、环阿尔廷-23,25-二烯-3β-醇(3)、环阿尔廷-25烯-3β,24-二醇(4)、环阿尔廷-23烯-3β,25-二醇(5)和环阿尔廷-24-烯-3β-醇(6).对该类化合物首次进行体外对几种肿瘤细胞靶蛋白酶筛选,化合物1~化合物6在浓度为1μg·m L-1时对肿瘤细胞部分靶蛋白酶(ARK5、EGFR、B-RAFVE、EPHB4、CK2alpha1、ERBB2、FAK、CDK2/Cyc A、IGF1R、SRC、CDK4/Cyc D1、VEGFR2、VEGFR3、Aurora A、INSR、Aurora B、MET、PDGFRbeta、FLT3、COT、SAK、PLK1 like、TIE2)具有较强的抑制活性.该研究为束生刚毛藻(C.fascicularis)的进一步开发利用及药理活性研究提供理论依据. 展开更多
关键词 束生刚毛藻 环阿尔廷类三萜 生物活性
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组织型纤溶酶原激活剂突变体基因转染细胞株的建立
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作者 李敏 王玉炯 +2 位作者 崔景荣 扈荣良 张守峰 《北京大学学报(自然科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2004年第4期583-587,共5页
以脂质体介导法将含有t PA突变基因的真核表达载体pCSRA及pCSRK分别转染CHO dhfr ,经G4 1 8及DMEM双重选择 ,获得两者的稳定表达细胞株。结果表明 ,表达产物具有良好溶纤活性 ;Western印迹实验证明 ,产物具有特异抗原性 ;经多次传代 ,... 以脂质体介导法将含有t PA突变基因的真核表达载体pCSRA及pCSRK分别转染CHO dhfr ,经G4 1 8及DMEM双重选择 ,获得两者的稳定表达细胞株。结果表明 ,表达产物具有良好溶纤活性 ;Western印迹实验证明 ,产物具有特异抗原性 ;经多次传代 ,细胞株具有良好的稳定性。比较了无血清培养基CHO S SFMⅡ与常规培养基DMEM培养条件下pCSRK细胞株产物的表达量 ,前者约为后者的 2倍 ,表明无血清培养基SFM有可能用于药用性蛋白的生产。实验为t 展开更多
关键词 重组纤溶酶原激活剂 突变体 稳定表达
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稳定表达细胞色素P4501A1人肝癌细胞系的建立
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作者 庞莉萍 崔景荣 《中国药科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第5期438-442,共5页
目的:建立稳定表达人细胞色素P4501A1(CYP1A1)的人肝癌细胞系(Bel-7402)。方法:通过将人细胞色素P4501A1(CYP1A1)的表达质粒转染到人肝癌细胞系(Bel-7402),经G418抗性筛选得到稳定的克隆并扩大培养成系,WesternBlotting检测蛋白的表达... 目的:建立稳定表达人细胞色素P4501A1(CYP1A1)的人肝癌细胞系(Bel-7402)。方法:通过将人细胞色素P4501A1(CYP1A1)的表达质粒转染到人肝癌细胞系(Bel-7402),经G418抗性筛选得到稳定的克隆并扩大培养成系,WesternBlotting检测蛋白的表达。细胞增殖试验鉴定CYP1A1的多环芳烃类底物二甲基苯并蒽(DMBA)对Bel-7402/1A1细胞的增殖抑制作用。双核微核实验对Bel-7402/1A1细胞进行了遗传毒理的短期实验。结果:转染后筛选得到的Bel-7402抗性克隆,Western Blotting检测表明有较高的CYP1A1蛋白表达。细胞暴露于DMBA时,Bel-7402/1A1与Bel-7402细胞相比,细胞增殖明显抑制。双核微核试验表明Bel-7402/1A1细胞的微核率随DMBA浓度增高而显著增加,Bel-7402无明显变化。连续传代后仍有CYP1A1标志酶EROD的较高表达,该酶活性能被CYP1A1抑制剂α-萘黄酮抑制。结论:建立了一个新的稳定表达CYP1A1的1个肝癌细胞系(Bel-7402/CYP1A1),可代谢多环芳烃化合物产生更大的毒性。该细胞系可用来筛选能被CYP1A1代谢的化合物,或能抑制CYP1A1活性的化合物,并可用来研究CYP1A1的催化性质及被CYP1A1代谢的化合物的毒性机理。 展开更多
关键词 CYPlA1 BEL-7402 稳定转染 3-甲基胆蒽 二甲基苯并蒽
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毛细管区带电泳法测定4种抗HIV-1活性的化合物与牛血清白蛋白的结合常数 被引量:3
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作者 丁里 张新祥 +2 位作者 常文保 林伟 杨铭 《色谱》 CAS CSCD 北大核心 2004年第6期624-626,共3页
采用毛细管区带电泳紫外检测方法,在pH8 0、浓度50mmol/L的磷酸盐缓冲溶液及运行电压15kV的条件下,测定了4种新合成的具有抗HIV 1活性的化合物(IG3,iso C3,C3,MC3)与牛血清白蛋白(BSA)相互作用的结合常数。在缓冲溶液中加入不同浓度的B... 采用毛细管区带电泳紫外检测方法,在pH8 0、浓度50mmol/L的磷酸盐缓冲溶液及运行电压15kV的条件下,测定了4种新合成的具有抗HIV 1活性的化合物(IG3,iso C3,C3,MC3)与牛血清白蛋白(BSA)相互作用的结合常数。在缓冲溶液中加入不同浓度的BSA,通过测定化合物迁移时间的变化,计算得到了上述4种化合物与BSA的结合常数分别为1 07×104,1 34×104,8 51×103和9 45×103L/mol。该方法简单、快捷,可用于研究结合比为1∶1的小分子与生物大分子的相互作用。 展开更多
关键词 毛细管区带电泳 结合常数 抗HIV-1活性化合物 牛血清白蛋白 相互作用
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染色质结构之美——染色质可及性 被引量:2
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作者 彭建 张宏权 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第10期1269-1284,共16页
染色质可及性(chromatin accessibility)作为一种衡量染色质结合因子与染色质DNA结合能力高低的染色质属性,是评价染色质结构稳态的重要指标之一,在多种细胞核进程中扮演重要角色,包括基因转录调控以及DNA损伤修复等。该属性的异常调控... 染色质可及性(chromatin accessibility)作为一种衡量染色质结合因子与染色质DNA结合能力高低的染色质属性,是评价染色质结构稳态的重要指标之一,在多种细胞核进程中扮演重要角色,包括基因转录调控以及DNA损伤修复等。该属性的异常调控与多种疾病的发生发展密切相关,包括肿瘤以及神经退行性疾病等。对于该属性探究已经成为生命科学与疾病领域的热点。伴随越来越多的新技术应运而生,例如染色质构象捕获技术、高通量测序技术以及两种技术的结合等。随着技术的进步,多种参与调控染色质可及性的因素被发现和总结,包括核小体占位、组蛋白修饰以及非编码RNA等。多项大规模的染色质组学数据绘制了多种疾病的染色质可及性图谱,为揭示疾病的发生发展与染色质可及性之间的关系提供了数据支持。同时,随着单细胞染色质可及性测序技术的发展,实现了对细胞类型染色质层面的划分,弥补了单纯依赖基因表达划分细胞类型的不足。本文将从染色质的组成与可及性、影响染色质可及性的因素、染色质可及性的检测方法,以及染色质可及性与癌症的关系等方面简要阐述染色质可及性的研究进展。 展开更多
关键词 染色质可及性 癌症 组蛋白修饰 染色质结构 检测方法
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