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M^(pro)-C蛋白三维结构域交换的机理:来自分子模拟的线索(英文) 被引量：1
1
作者 黄永棋 康雪 +1 位作者 夏斌 刘志荣 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2012年第10期2411-2417,共7页
SARS冠状病毒主蛋白酶(Mpro)在病毒的蛋白酶切过程中发挥着重要作用.Mpro的晶体结构显示它存在两种形式的二聚体:一种是发生三维结构域交换的形式,另一种是非交换的形式.Mpro的C端结构域(Mpro-C)单独表达时也能形成与全长Mpro类似的三... SARS冠状病毒主蛋白酶(Mpro)在病毒的蛋白酶切过程中发挥着重要作用.Mpro的晶体结构显示它存在两种形式的二聚体:一种是发生三维结构域交换的形式,另一种是非交换的形式.Mpro的C端结构域(Mpro-C)单独表达时也能形成与全长Mpro类似的三维结构域交换二聚体.三维结构域交换通常发生在蛋白质的表面,但Mpro-C的结构域交换却发生在疏水核心.在本文中,我们利用分子动力学模拟及三维结构域交换预测算法研究了Mpro-C中被高度埋藏的核心螺旋片段发生交换的机理.我们发现基于结构与基于序列的已有算法都不能正确预言出Mpro-C和Mpro中发生结构域交换的铰链区位置.分子模拟结果表明Mpro-C中的交换片段在天然态下埋藏得很好,但在变性单体中则会被释放并暴露在外面.因此,在完全或部分解折叠状态下交换片段的打开有助于促进单体间的相互作用及结构域交换二聚体的形成. 展开更多
关键词 SARS冠状病毒 主蛋白酶 分子模拟 结构域交换 蛋白质-蛋白质相互作用 蛋白质解折叠
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罗丹明标记的磷脂分子聚集态的光谱与AFM研究(英文)
2
作者 柳汀汀 于安池 +4 位作者 罗国斌 赵新生 应立明 黄岩谊 黄春辉 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2000年第1期49-54,共6页
在不同表面压的ＬＢ膜上，应用光谱学和原子力显微镜学研究了由罗丹明标记的磷脂分子形成的多种聚集态．这些分子聚集态使光谱的峰值位移，谱带加宽．ＡＦＭ的形貌图进一步说明了膦脂单分子膜的不均一性．根据激子理论，以４５°取... 在不同表面压的ＬＢ膜上，应用光谱学和原子力显微镜学研究了由罗丹明标记的磷脂分子形成的多种聚集态．这些分子聚集态使光谱的峰值位移，谱带加宽．ＡＦＭ的形貌图进一步说明了膦脂单分子膜的不均一性．根据激子理论，以４５°取向角存在的罗丹明染料聚集体更符合－Ａ曲线． 展开更多
关键词 聚集态 AFM 膦脂分子 LB膜 光谱学
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罗丹明标记的磷脂分子在亲水表面的单个分子行为(英文) 被引量：5
3
作者 洪莲 柳汀汀 +1 位作者 罗国斌 赵新生 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2002年第9期769-775,共7页
单个分子实验有很重要的意义,一方面,对于非均相体系,单个分子实验可得到分子性质分布信息;另一方面,对于均相和非均相体系,单个分子轨迹直接记录了分子性质的涨落,包含了丰富的动力学信息.在诸多单个分子检测技术中,单分子光学检测技... 单个分子实验有很重要的意义,一方面,对于非均相体系,单个分子实验可得到分子性质分布信息;另一方面,对于均相和非均相体系,单个分子轨迹直接记录了分子性质的涨落,包含了丰富的动力学信息.在诸多单个分子检测技术中,单分子光学检测技术具有快速、无损、可探测到凝聚相内部单个分子的能力.进行单分子检测的关键是消除拉曼和瑞利散射以及杂质荧光等背景的干扰,利用共焦、近场和隐失场激发减少激发体积和检测体积,可以降低背底,提高信噪比.本实验利用共焦荧光显微镜观测单个罗丹明标记的磷脂分子在亲水玻璃表面的扩散、脱附,及其荧光闪烁的行为.实验表明,除由表面的平均力场阻碍分子运动外,还有一些特殊位点会造成长时间的特异性吸附,并得到特异性吸附的分子的脱附速率,(5.9±0.2)s-1.用穿越时间分布函数测得分子在表面的扩散速率为(3.3±0.1)×10-8cm2·s-1,与分子在磷脂膜中的扩散速率相当.观测到了一些吸附的分子出现了荧光闪烁的现象,并对其产生原因进行了一些分析. 展开更多
关键词 罗丹明 标记 磷脂分子 亲水表面 单个分子检测 共焦荧光显微镜 荧光闪烁 扩散 脱附 吸附
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全反射红外逐层检测含重氮高分子薄膜的生长
4
作者 廖玮 魏芳 +1 位作者 曹维孝 赵新生 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2004年第4期405-408,共4页
运用全反射红外技术对逐层组装的含重氮高分子薄膜进行了分步定量分析.利用-CH2-峰的逐层变化规律,确认了在组装过程中每层吸附高分子的量是一致的.通过重氮基一N=N+特征的吸收峰,定量计算了在特定实验条件下,-N=N+分解生成共价键的比例... 运用全反射红外技术对逐层组装的含重氮高分子薄膜进行了分步定量分析.利用-CH2-峰的逐层变化规律,确认了在组装过程中每层吸附高分子的量是一致的.通过重氮基一N=N+特征的吸收峰,定量计算了在特定实验条件下,-N=N+分解生成共价键的比例.这些结果为认识重氮高分子薄膜的生长提供了更为直接和细致的信息. 展开更多
关键词 重氦高分子薄膜 生长 全反射红外技术 逐层组装 检测 共价键 高分子材料
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有色粉体材料对太阳辐射吸收性能的UV-Vis-NIR光谱法表征 被引量：1
5
作者 郭洪猷 李秀艳 +1 位作者 吴念祖 王平 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2003年第8期1482-1484,共3页
进一步研究了粉体材料对太阳辐射吸收能力的定量表征方法 .结果表明 ,当 Vcolored/V(Ti O2 ) (有色粉体与 Ti O2 的体积比 ) <5 %时 ,lg(1 /R) (R是试样对太阳辐射的反射率 )和 Vcolored/V(Ti O2 )呈直线关系 .从直线的斜率和截距可... 进一步研究了粉体材料对太阳辐射吸收能力的定量表征方法 .结果表明 ,当 Vcolored/V(Ti O2 ) (有色粉体与 Ti O2 的体积比 ) <5 %时 ,lg(1 /R) (R是试样对太阳辐射的反射率 )和 Vcolored/V(Ti O2 )呈直线关系 .从直线的斜率和截距可得出粉体材料的吸光系数和最大穿透厚度 .该方法具有普遍性 ,适用于各种有色粉体的测定 . 展开更多
关键词 有色粉体材料 太阳辐射吸收性能 UV-Vis-NIR光谱法 表征 吸光系数 紫外-可见-近红外反射光谱
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亚硫酸根离子在硅和二氧化硅的湿法腐蚀中的作用(英文) 被引量：1
6
作者 欧阳贱华 吴念祖 赵新生 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2004年第6期612-615,共4页
运用光刻技术和原子力显微技术(AFM)研究了亚硫酸根离子对硅和二氧化硅在40％(w)氟化铵水溶液中腐蚀速率的影响.结果表明硅和二氧化硅的腐蚀速率和亚硫酸根离子浓度有关.高分辨X射线光电子能谱(XPS)分析在有/没有亚硫酸根的溶液中腐蚀... 运用光刻技术和原子力显微技术(AFM)研究了亚硫酸根离子对硅和二氧化硅在40％(w)氟化铵水溶液中腐蚀速率的影响.结果表明硅和二氧化硅的腐蚀速率和亚硫酸根离子浓度有关.高分辨X射线光电子能谱(XPS)分析在有/没有亚硫酸根的溶液中腐蚀后的硅和二氧化硅表面氟元素的结果表明在这两种溶液中腐蚀得到的表面化学成分是有差别的.实验结果证明亚硫酸根离子在硅和二氧化硅的湿腐蚀中不只是表现为一种除氧剂,还干预了表面腐蚀反应过程. 展开更多
关键词 硅 二氧化硅 腐蚀速率 氟化铵 亚硫酸铵 光刻术
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基因芯片检测技术的一些进展 被引量：2
7
作者 魏芳 赵新生 《大学化学》 CAS 2003年第5期1-6,共6页
简单回顾了基因芯片检测技术的发展 ,讨论了进一步改进基因芯片检测技术的若干问题 ,介绍了基因芯片检测技术研究开发的一些最新进展。
关键词 基因芯片 检测技术 探针分子 生物识别 检测方式
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单个蓝藻细胞的光谱 被引量：1
8
作者 应丽贞 黄旭 +2 位作者 黄波 赵进东 赵新生 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2002年第8期673-675,共3页
利用共焦显微和光栅光谱技术,得到了蓝藻AnabaenastrainPCC7120完整藻丝体中的单细胞吸收和荧光发射光谱.发现了前人未观察到的不同异形胞之间有显著光谱差异的现象,该现象可能与异形胞不同发育阶段的藻胆体和光系统的演化相关联.
关键词 蓝藻 单个细胞 异形胞 共焦显微术 吸收光谱 荧光发射光谱 光栅光谱 发育
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