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基于蛹虫草转录物组学的虫草素生物合成相关基因的表达和功能分析
1
作者
张虎成
邓丽娜
+8 位作者
章宇宁
罗帅
刘霖颖
杨军
杨国伟
范海涛
高博
杨冬清
柴智
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第3期448-461,共14页
蛹虫草Cordyceps militaris是我国著名的中药,而虫草素是蛹虫草重要的生物活性成分之一。通过转录物组分析野生型C.militaris、虫草素高产菌株C.militaris GYS60和低产菌株C.militaris GYS80虫草素生物合成相关基因的表达和功能变化。利...
蛹虫草Cordyceps militaris是我国著名的中药,而虫草素是蛹虫草重要的生物活性成分之一。通过转录物组分析野生型C.militaris、虫草素高产菌株C.militaris GYS60和低产菌株C.militaris GYS80虫草素生物合成相关基因的表达和功能变化。利用Illumina NovaSeq 6000测序获得3株菌株的转录物组数据,以鉴定差异表达基因。与C.militaris相比,在GYS60和GYS80中,分别有145和470个上调基因及96和594个下调基因;GYS60与GYS80相比,GYS60有306个上调基因和207个下调基因。这些基因经过GO和KEGG分析,与C.militaris相比,GYS60和GYS80分别有10和8个与嘌呤途径相关的基因差异表达;与GYS80相比,GYS60有12个基因差异表达。定量聚合酶链式反应验证8个关键酶的基因表达与转录物组分析一致。在GYS60中,参与虫草素生物合成的嘌呤核苷酸代谢中的氧化还原酶(CCM_07507,cmORE)、3′,5′-环AMP磷酸二酯酶(CCM_02777,cmAPE)、转移酶(CCM_04722,cmTRF)和腺苷酸环化酶(CCM_06928,cmADC)表达量显著上调。这些发现提高了我们对虫草素生物合成相关基因的理解和对其他次级代谢产物代谢通路的启示。
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关键词
蛹虫草
虫草素
转录物组分析
生物合成途径
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题名
基于蛹虫草转录物组学的虫草素生物合成相关基因的表达和功能分析
1
作者
张虎成
邓丽娜
章宇宁
罗帅
刘霖颖
杨军
杨国伟
范海涛
高博
杨冬清
柴智
机构
北京
电子科技
职业
学院
生物工程
学院
生物化学系
北京卫生职业学院英语系
北京
联合大学学报编辑部
出处
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第3期448-461,共14页
基金
北京电子科技职业学院校级重大课题:虫草素高产菌株基因组、转录组和蛋白质组整合研究(No.2022X002-KXD)资助。
文摘
蛹虫草Cordyceps militaris是我国著名的中药,而虫草素是蛹虫草重要的生物活性成分之一。通过转录物组分析野生型C.militaris、虫草素高产菌株C.militaris GYS60和低产菌株C.militaris GYS80虫草素生物合成相关基因的表达和功能变化。利用Illumina NovaSeq 6000测序获得3株菌株的转录物组数据,以鉴定差异表达基因。与C.militaris相比,在GYS60和GYS80中,分别有145和470个上调基因及96和594个下调基因;GYS60与GYS80相比,GYS60有306个上调基因和207个下调基因。这些基因经过GO和KEGG分析,与C.militaris相比,GYS60和GYS80分别有10和8个与嘌呤途径相关的基因差异表达;与GYS80相比,GYS60有12个基因差异表达。定量聚合酶链式反应验证8个关键酶的基因表达与转录物组分析一致。在GYS60中,参与虫草素生物合成的嘌呤核苷酸代谢中的氧化还原酶(CCM_07507,cmORE)、3′,5′-环AMP磷酸二酯酶(CCM_02777,cmAPE)、转移酶(CCM_04722,cmTRF)和腺苷酸环化酶(CCM_06928,cmADC)表达量显著上调。这些发现提高了我们对虫草素生物合成相关基因的理解和对其他次级代谢产物代谢通路的启示。
关键词
蛹虫草
虫草素
转录物组分析
生物合成途径
Keywords
Cordyceps militais
cordycepin
transcriptome analysis
biosynthetic pathway
分类号
Q525 [生物学—生物化学]
Q936 [生物学—微生物学]
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1
基于蛹虫草转录物组学的虫草素生物合成相关基因的表达和功能分析
张虎成
邓丽娜
章宇宁
罗帅
刘霖颖
杨军
杨国伟
范海涛
高博
杨冬清
柴智
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
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