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基于ITS序列的伞菌类药用食用真菌的DNA条形码鉴定研究
被引量：
7
1
作者
刘悦
汤欢
+3 位作者
李西文
陈增华
雷志勇
向丽
《世界中医药》
CAS
2016年第5期791-795,共5页
目的：伞菌类真菌物种繁多、生物多样性丰富,包括多种重要的药用、食用真菌以及有毒真菌。因此,对该类群的快速、准确鉴定,对于新的药用食用真菌资源的发现,以及对真菌毒素危害的防治都具有重要意义。方法：本研究以伞菌类13个科23个属5...
目的：伞菌类真菌物种繁多、生物多样性丰富,包括多种重要的药用、食用真菌以及有毒真菌。因此,对该类群的快速、准确鉴定,对于新的药用食用真菌资源的发现,以及对真菌毒素危害的防治都具有重要意义。方法：本研究以伞菌类13个科23个属50个物种,共计84份样本的真菌为研究对象,采用真菌通用引物ITS5和ITS4,对其核糖体DNA的内转录间隔区（Internal Transcribed Spacer,ITS）进行PCR扩增和测序。通过比较不同真菌的序列长度、碱基构成,同时利用BLAST比对法和建树法对其进行鉴定。结果：伞菌类真菌的序列长度在463-751 bp之间,平均GC含量在37.1%-59.4%之间。通过与Gen Bank中序列的比对分析以及系统进化邻接（Neighbor-joining,NJ）树结果,可以在种级水平上鉴定各个真菌物种。结论：基于ITS序列的DNA条形码可以快速、准确鉴定伞菌类真菌,具有重要的应用价值。
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关键词
药用真菌
食用真菌
伞菌类
DNA条形码
ITS
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职称材料
药用多孔菌DNA条形码鉴定研究
被引量：
2
2
作者
汤欢
苏燕燕
+2 位作者
雷志勇
李志明
李西文
《世界中医药》
CAS
2016年第5期771-776,共6页
目的:筛选采用DNA条形码技术鉴定药用多孔菌的有效条形码及该方法的可行性。方法:对29种药用多孔菌的69份样品进行DNA提取,通过聚合酶链式反应(PCR)扩增ITS序列并进行双向测序,去除低质量区和引物区,得到ITS序列,通过BLAST比对及基于K2...
目的:筛选采用DNA条形码技术鉴定药用多孔菌的有效条形码及该方法的可行性。方法:对29种药用多孔菌的69份样品进行DNA提取,通过聚合酶链式反应(PCR)扩增ITS序列并进行双向测序,去除低质量区和引物区,得到ITS序列,通过BLAST比对及基于K2P遗传距离构建系统聚类NJ树开展ITS鉴定效率评价。结果:经过优化的DNA提取方法,可对所有样品成功提取到足量DNA,PCR扩增产物测序并经过序列拼接剪切后均能得到高质量ITS序列;物种内ITS最大遗传距离均远小于物种种间最小遗传距离;基于Gen Bank数据库进行BLAST比对,鉴定效率达到100%;基于K2P遗传距离构建NJ树,结果显示相同物种均聚为一支。结论:DNA条形码技术可以对多孔菌进行快速准确鉴定,ITS序列可作为药用多孔菌有效候选DNA条形码。
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关键词
药用多孔菌
DNA条形码
真菌
ITS
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职称材料
题名
基于ITS序列的伞菌类药用食用真菌的DNA条形码鉴定研究
被引量：
7
1
作者
刘悦
汤欢
李西文
陈增华
雷志勇
向丽
机构
中国中医
科学
院中药
研究
所
北京千菌方菌物科学研究院
出处
《世界中医药》
CAS
2016年第5期791-795,共5页
基金
中央科研院所公益项目(编号:ZXKT15029
ZZ2014029)
+1 种基金
重大新药创制国家科技重大专项(编号:2014ZX09304307001-014
2014ZX09301308-007)
文摘
目的：伞菌类真菌物种繁多、生物多样性丰富,包括多种重要的药用、食用真菌以及有毒真菌。因此,对该类群的快速、准确鉴定,对于新的药用食用真菌资源的发现,以及对真菌毒素危害的防治都具有重要意义。方法：本研究以伞菌类13个科23个属50个物种,共计84份样本的真菌为研究对象,采用真菌通用引物ITS5和ITS4,对其核糖体DNA的内转录间隔区（Internal Transcribed Spacer,ITS）进行PCR扩增和测序。通过比较不同真菌的序列长度、碱基构成,同时利用BLAST比对法和建树法对其进行鉴定。结果：伞菌类真菌的序列长度在463-751 bp之间,平均GC含量在37.1%-59.4%之间。通过与Gen Bank中序列的比对分析以及系统进化邻接（Neighbor-joining,NJ）树结果,可以在种级水平上鉴定各个真菌物种。结论：基于ITS序列的DNA条形码可以快速、准确鉴定伞菌类真菌,具有重要的应用价值。
关键词
药用真菌
食用真菌
伞菌类
DNA条形码
ITS
Keywords
Medicinal Fungi
Edible Fungi
Agaricales
DNA barcode
ITS
分类号
R282 [医药卫生—中药学]
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职称材料
题名
药用多孔菌DNA条形码鉴定研究
被引量：
2
2
作者
汤欢
苏燕燕
雷志勇
李志明
李西文
机构
中国中医
科学
院中药
研究
所
北京千菌方菌物科学研究院
出处
《世界中医药》
CAS
2016年第5期771-776,共6页
基金
重大新药创制国家科技重大专项(编号:2014ZX09304307001-014
2014ZX09301308-007)
+1 种基金
国家科技支撑计划(编号:2015BAI05B02)
中央科研院所公益项目(编号:ZXKT15029,ZZ2014029)
文摘
目的:筛选采用DNA条形码技术鉴定药用多孔菌的有效条形码及该方法的可行性。方法:对29种药用多孔菌的69份样品进行DNA提取,通过聚合酶链式反应(PCR)扩增ITS序列并进行双向测序,去除低质量区和引物区,得到ITS序列,通过BLAST比对及基于K2P遗传距离构建系统聚类NJ树开展ITS鉴定效率评价。结果:经过优化的DNA提取方法,可对所有样品成功提取到足量DNA,PCR扩增产物测序并经过序列拼接剪切后均能得到高质量ITS序列;物种内ITS最大遗传距离均远小于物种种间最小遗传距离;基于Gen Bank数据库进行BLAST比对,鉴定效率达到100%;基于K2P遗传距离构建NJ树,结果显示相同物种均聚为一支。结论:DNA条形码技术可以对多孔菌进行快速准确鉴定,ITS序列可作为药用多孔菌有效候选DNA条形码。
关键词
药用多孔菌
DNA条形码
真菌
ITS
Keywords
Medicinal polypore
DNA barcoding
Fungi
ITS sequence
分类号
R512.62 [医药卫生—内科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于ITS序列的伞菌类药用食用真菌的DNA条形码鉴定研究
刘悦
汤欢
李西文
陈增华
雷志勇
向丽
《世界中医药》
CAS
2016
7
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
药用多孔菌DNA条形码鉴定研究
汤欢
苏燕燕
雷志勇
李志明
李西文
《世界中医药》
CAS
2016
2
在线阅读
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职称材料
已选择
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条
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参考文献
引证文献
统计分析
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