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PCR-DGGE方法分析内蒙古不同地区青贮玉米中乳酸菌群多样性
被引量：
6
1
作者
韩吉雨
侯先志
+4 位作者
杨凯
赵子夫
郭天龙
王丽
王海荣
《动物营养学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第6期974-981,共8页
本文旨在研究内蒙古不同地区青贮玉米中乳酸菌菌群结构的变化。试验采用氯化苄方法提取青贮玉米中微生物基因组DNA,以P2f和P3r为引物,对扩增的目的片段,利用变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)法研究不同地区青贮玉米中乳酸菌菌群结构。结果表...
本文旨在研究内蒙古不同地区青贮玉米中乳酸菌菌群结构的变化。试验采用氯化苄方法提取青贮玉米中微生物基因组DNA,以P2f和P3r为引物,对扩增的目的片段,利用变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)法研究不同地区青贮玉米中乳酸菌菌群结构。结果表明:3个地区9个牧场的青贮玉米中乳酸菌DGGE图谱相似性较高,大多数序列代表乳酸菌(lactic acid bacteria,LAB)类细菌,并以?-Lactobacillus类最多;窖藏半年以上的青贮玉米中仍能发现Lactococcus、Weissella、Leuconostoc3个球菌属菌存在。另外,10号条带与?-Acetobacter相似性达94%,4号条带与?-Lactobacillus相似性达93%,但仍不能鉴定到属的水平,这2株菌属于未培养的或者说是未经测序的菌株。
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关键词
变性梯度凝胶电泳
青贮玉米
不同地区
多样性
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职称材料
PCR-DGGE方法分析玉米及苜蓿青贮动态发酵体系中菌群多样性
被引量：
9
2
作者
韩吉雨
王海荣
+3 位作者
侯先志
杨凯
赵子夫
郭天龙
《安徽农业科学》
CAS
北大核心
2009年第19期8888-8892,共5页
[目的]探讨玉米青贮和苜蓿青贮动态发酵过程。[方法]以玉米和苜蓿为青贮原料，利用氯化苄方法对青贮中微生物基因组DNA进行提取，以P2f和P3r为引物扩增目的片段并利用PCR—DGGE方法对玉米青贮及苜蓿青贮进行动态发酵多样性研究。[结果]...
[目的]探讨玉米青贮和苜蓿青贮动态发酵过程。[方法]以玉米和苜蓿为青贮原料，利用氯化苄方法对青贮中微生物基因组DNA进行提取，以P2f和P3r为引物扩增目的片段并利用PCR—DGGE方法对玉米青贮及苜蓿青贮进行动态发酵多样性研究。[结果]玉米青贮的pH值在发酵过程中维持在4．0～4．5，而苜蓿青贮则维持在5．5—6．0。PCR-DGGE分析显示2种物料青贮在0和1d、3和7d、20和60d相似性均很高，并且它们具有基本相似的谱带类型，其中条带1、3、13、14、17、21、22为所有样品共有，只是亮度上有差异。DGGE研究结果表明大多数序列代表乳酸菌（LAB）类细菌，并以Lactobacillus类最多；其次为Lactococcus和Weissella。[结论]该研究为青贮添加剂的制作奠定基础。
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关键词
PCR—DGGE
玉米青贮
苜蓿青贮
多样性
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职称材料
亲和素磁珠分离毛竹SSR标记方法的优化
被引量：
3
3
作者
苗元
李潞滨
+3 位作者
唐征
杨凯
刘贯水
朱宝成
《河北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第3期51-55,共5页
在参考其它文献报道的基础上,构建毛竹SSR位点富集文库。用EcoRⅠ分别和DraⅠ、EcoRⅤ、SmaⅠ、PvuⅡ四种平端限制性内切酶对毛竹基因组DNA进行双酶切,酶切片段回收后与根据抑制性PCR原理设计的接头连接。在利用亲和素磁珠富集含有SSR...
在参考其它文献报道的基础上,构建毛竹SSR位点富集文库。用EcoRⅠ分别和DraⅠ、EcoRⅤ、SmaⅠ、PvuⅡ四种平端限制性内切酶对毛竹基因组DNA进行双酶切,酶切片段回收后与根据抑制性PCR原理设计的接头连接。在利用亲和素磁珠富集含有SSR序列的DNA片段过程中,对杂交、漂洗及洗脱步骤进行优化。通过三引物特异PCR筛选含有SSR序列的阳性克隆并结合测序结果对富集SSR文库进行评价,确定了一条简单、经济、高效分离竹类植物SSR标记的方法。
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关键词
毛竹
SSR
亲和素磁珠
富集文库
评价
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职称材料
题名
PCR-DGGE方法分析内蒙古不同地区青贮玉米中乳酸菌群多样性
被引量：
6
1
作者
韩吉雨
侯先志
杨凯
赵子夫
郭天龙
王丽
王海荣
机构
内蒙古
农业
大学动物科学与医学
学院
北京农学院农业应用新技术北京重点实验室
出处
《动物营养学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第6期974-981,共8页
基金
内蒙古科技厅草业虚拟研究院(项目编号20040601)
文摘
本文旨在研究内蒙古不同地区青贮玉米中乳酸菌菌群结构的变化。试验采用氯化苄方法提取青贮玉米中微生物基因组DNA,以P2f和P3r为引物,对扩增的目的片段,利用变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)法研究不同地区青贮玉米中乳酸菌菌群结构。结果表明:3个地区9个牧场的青贮玉米中乳酸菌DGGE图谱相似性较高,大多数序列代表乳酸菌(lactic acid bacteria,LAB)类细菌,并以?-Lactobacillus类最多;窖藏半年以上的青贮玉米中仍能发现Lactococcus、Weissella、Leuconostoc3个球菌属菌存在。另外,10号条带与?-Acetobacter相似性达94%,4号条带与?-Lactobacillus相似性达93%,但仍不能鉴定到属的水平,这2株菌属于未培养的或者说是未经测序的菌株。
关键词
变性梯度凝胶电泳
青贮玉米
不同地区
多样性
Keywords
PCR-DGGE
Corn silage
Different regions
Diversity
分类号
S548 [农业科学—作物学]
Q938 [生物学—微生物学]
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职称材料
题名
PCR-DGGE方法分析玉米及苜蓿青贮动态发酵体系中菌群多样性
被引量：
9
2
作者
韩吉雨
王海荣
侯先志
杨凯
赵子夫
郭天龙
机构
内蒙古
农业
大学动物科学与医学
学院
北京农学院农业应用新技术北京重点实验室
出处
《安徽农业科学》
CAS
北大核心
2009年第19期8888-8892,共5页
基金
内蒙古科技厅草业虚拟研究院项目(20040601)
文摘
[目的]探讨玉米青贮和苜蓿青贮动态发酵过程。[方法]以玉米和苜蓿为青贮原料，利用氯化苄方法对青贮中微生物基因组DNA进行提取，以P2f和P3r为引物扩增目的片段并利用PCR—DGGE方法对玉米青贮及苜蓿青贮进行动态发酵多样性研究。[结果]玉米青贮的pH值在发酵过程中维持在4．0～4．5，而苜蓿青贮则维持在5．5—6．0。PCR-DGGE分析显示2种物料青贮在0和1d、3和7d、20和60d相似性均很高，并且它们具有基本相似的谱带类型，其中条带1、3、13、14、17、21、22为所有样品共有，只是亮度上有差异。DGGE研究结果表明大多数序列代表乳酸菌（LAB）类细菌，并以Lactobacillus类最多；其次为Lactococcus和Weissella。[结论]该研究为青贮添加剂的制作奠定基础。
关键词
PCR—DGGE
玉米青贮
苜蓿青贮
多样性
Keywords
PCR-DGGE
Corn silage
Alfalfa silage
Diversity
分类号
S188 [农业科学—农业基础科学]
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职称材料
题名
亲和素磁珠分离毛竹SSR标记方法的优化
被引量：
3
3
作者
苗元
李潞滨
唐征
杨凯
刘贯水
朱宝成
机构
河北大学生命科
学院
中国林业科学研究院林业研究所
北京农学院农业应用新技术北京重点实验室
河北
农业
大学生命科
学院
出处
《河北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第3期51-55,共5页
基金
林业公益性行业科研专项“毛竹基因组测序研究”(编号200704001)
文摘
在参考其它文献报道的基础上,构建毛竹SSR位点富集文库。用EcoRⅠ分别和DraⅠ、EcoRⅤ、SmaⅠ、PvuⅡ四种平端限制性内切酶对毛竹基因组DNA进行双酶切,酶切片段回收后与根据抑制性PCR原理设计的接头连接。在利用亲和素磁珠富集含有SSR序列的DNA片段过程中,对杂交、漂洗及洗脱步骤进行优化。通过三引物特异PCR筛选含有SSR序列的阳性克隆并结合测序结果对富集SSR文库进行评价,确定了一条简单、经济、高效分离竹类植物SSR标记的方法。
关键词
毛竹
SSR
亲和素磁珠
富集文库
评价
Keywords
Phylbstachys pubescens
SSR
streptavid in - coated magnetic beads
enriched library
evaluation
分类号
Q781 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
PCR-DGGE方法分析内蒙古不同地区青贮玉米中乳酸菌群多样性
韩吉雨
侯先志
杨凯
赵子夫
郭天龙
王丽
王海荣
《动物营养学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009
6
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
PCR-DGGE方法分析玉米及苜蓿青贮动态发酵体系中菌群多样性
韩吉雨
王海荣
侯先志
杨凯
赵子夫
郭天龙
《安徽农业科学》
CAS
北大核心
2009
9
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
亲和素磁珠分离毛竹SSR标记方法的优化
苗元
李潞滨
唐征
杨凯
刘贯水
朱宝成
《河北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008
3
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职称材料
已选择
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