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河南省2015至2019年李斯特菌病分子流行病学特征
被引量：
7
1
作者
炊慧霞
李薇薇
+3 位作者
崔箐坡
贾松树
张秀丽
韩志伟
《郑州大学学报（医学版）》
CAS
北大核心
2021年第6期767-773,共7页
目的:分析河南省2015至2019年李斯特菌病分子流行病学特征。方法:对河南省2015至2019年李斯特菌病感染专项监测中分离的60株单核细胞增生李斯特菌进行全基因组测序。分析其谱系、克隆群(CC型)、序列型、血清群。通过VFDB、BIGSdb-Lm和Re...
目的:分析河南省2015至2019年李斯特菌病分子流行病学特征。方法:对河南省2015至2019年李斯特菌病感染专项监测中分离的60株单核细胞增生李斯特菌进行全基因组测序。分析其谱系、克隆群(CC型)、序列型、血清群。通过VFDB、BIGSdb-Lm和ResFinder数据库获得其毒力基因、生物杀灭剂和重金属抗性基因及耐药基因分布。采用核心基因组多位点序列(cgMLST)和脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型方法进行分子分型。结果与结论:60株中65.0%来自于围生期病例,75.0%来自于血液标本。60株分属2个谱系(Ⅰ和Ⅱ),以谱系Ⅰ为优势谱系(68.3%);分属3个血清型(Ⅱb、Ⅱa和Ⅳb),Ⅱb为优势型(63.3%);分属13个CC型以及2个未分CC型(ST619和ST382),CC87为优势型(35.0%);分属18个序列型,ST87为优势型(35.0%)。所有菌株均携带毒力岛LIPI-1,26.7%菌株携带LIPI-3,45.0%菌株携带LIPI-4。所有菌株均不携带生物杀灭剂抗性基因(bcrABC、emrE、emrC、qacA、qacC和Tn6188 qac)和重金属抗性基因cadC,10.0%菌株携带重金属抗性基因cadA;28.3%菌株携带应激生存岛SSI-1,3.3%菌株携带SSI-2。60株均携带耐药基因fosX,3.3%菌株同时携带耐药基因fosX、mef(A)、msr(D)和tet(M),主要是大环内酯类和四环素类耐药基因。60株分属52种CL型,每种CL型包括1~5株菌,等位基因差异数0~1730个,CL0029、CL0014、CL0032和CL0033为优势型。60株共获得51种PFGE带型,每种带型包括1~4株菌,相似度为56.7%~100.0%,GX6A16.HA0030、GX6A16.HA0005、GX6A16.HA0023和GX6A16.HA0011为优势带型。
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关键词
李斯特菌病
全基因组测序
多位点序列分型
脉冲场凝胶电泳
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题名
河南省2015至2019年李斯特菌病分子流行病学特征
被引量：
7
1
作者
炊慧霞
李薇薇
崔箐坡
贾松树
张秀丽
韩志伟
机构
河南省疾病预防控制中心质量管理科
国家食品安全风险评估中心
北京中科助腾科技有限公司
出处
《郑州大学学报（医学版）》
CAS
北大核心
2021年第6期767-773,共7页
基金
“十三五”国家重点研发计划项目(2017YFC1601501)
河南省医学科技攻关计划省部共建项目(SBGJ2018091)。
文摘
目的:分析河南省2015至2019年李斯特菌病分子流行病学特征。方法:对河南省2015至2019年李斯特菌病感染专项监测中分离的60株单核细胞增生李斯特菌进行全基因组测序。分析其谱系、克隆群(CC型)、序列型、血清群。通过VFDB、BIGSdb-Lm和ResFinder数据库获得其毒力基因、生物杀灭剂和重金属抗性基因及耐药基因分布。采用核心基因组多位点序列(cgMLST)和脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型方法进行分子分型。结果与结论:60株中65.0%来自于围生期病例,75.0%来自于血液标本。60株分属2个谱系(Ⅰ和Ⅱ),以谱系Ⅰ为优势谱系(68.3%);分属3个血清型(Ⅱb、Ⅱa和Ⅳb),Ⅱb为优势型(63.3%);分属13个CC型以及2个未分CC型(ST619和ST382),CC87为优势型(35.0%);分属18个序列型,ST87为优势型(35.0%)。所有菌株均携带毒力岛LIPI-1,26.7%菌株携带LIPI-3,45.0%菌株携带LIPI-4。所有菌株均不携带生物杀灭剂抗性基因(bcrABC、emrE、emrC、qacA、qacC和Tn6188 qac)和重金属抗性基因cadC,10.0%菌株携带重金属抗性基因cadA;28.3%菌株携带应激生存岛SSI-1,3.3%菌株携带SSI-2。60株均携带耐药基因fosX,3.3%菌株同时携带耐药基因fosX、mef(A)、msr(D)和tet(M),主要是大环内酯类和四环素类耐药基因。60株分属52种CL型,每种CL型包括1~5株菌,等位基因差异数0~1730个,CL0029、CL0014、CL0032和CL0033为优势型。60株共获得51种PFGE带型,每种带型包括1~4株菌,相似度为56.7%~100.0%,GX6A16.HA0030、GX6A16.HA0005、GX6A16.HA0023和GX6A16.HA0011为优势带型。
关键词
李斯特菌病
全基因组测序
多位点序列分型
脉冲场凝胶电泳
Keywords
Listeria
whole-genome sequencing
multilocus sequence typing
pulsed field gel electrophoresis
分类号
R183 [医药卫生—流行病学]
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1
河南省2015至2019年李斯特菌病分子流行病学特征
炊慧霞
李薇薇
崔箐坡
贾松树
张秀丽
韩志伟
《郑州大学学报（医学版）》
CAS
北大核心
2021
7
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