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2017年～2018年四川省猪δ冠状病毒的检测与遗传进化分析 被引量：6
1
作者 冯宇 殷鑫欢 +4 位作者 徐雷 杨晓宇 鲁令华 徐志文 朱玲 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第10期1059-1062,1071,共5页
为调查猪δ冠状病毒(PDCoV)在四川省的流行情况,本研究对2017年~2018年采集的141份仔猪腹泻病料样品经RT-PCR检测,并对检测为PDCoV的两株病毒进行全基因扩增与序列分析。结果显示,PDCoV的阳性率为4.96%(7/141),且PDCoV与猪流行性腹泻病... 为调查猪δ冠状病毒(PDCoV)在四川省的流行情况,本研究对2017年~2018年采集的141份仔猪腹泻病料样品经RT-PCR检测,并对检测为PDCoV的两株病毒进行全基因扩增与序列分析。结果显示,PDCoV的阳性率为4.96%(7/141),且PDCoV与猪流行性腹泻病毒的混合感染阳性率为2.84%(4/141)。全基因组序列分析显示两株PDCoV之间的同源性为99.3%,与其它PDCoV病毒株间的同源性为97.6%~99.0%。两株PDCoV均与越南和泰国PDCoV株的同源性最低,而之前发现的四川PDCoVCH/Sichuan/S27株与越南和泰国病毒株有较高的同源性。两株PDCoV的全基因组中均有部分碱基的插入或缺失,包括ORF1ab基因中的9 nt插入和S基因中的3 nt缺失,以及在3’UTR区域的11 nt缺失。遗传进化树分析显示,PDCoV呈现出明显的地域特征,同时中国PDCoV株呈现出4个小分支,其中两个新PDCoV株与CH/Sichuan/S27位于不同分支,表明PDCoV的基因存在多样性。本研究丰富了PDCoV在中国的分子流行特征及其遗传进化规律,为后续PDCoV的病毒学研究提供参考。 展开更多
关键词 猪δ冠状病毒 流行 全基因 遗传进化
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四川省腹泻病猪的猪萨佩罗病毒检测及1B基因序列比较分析 被引量：4
2
作者 李雨濛 郭博 +6 位作者 徐逸飞 陈瑛琪 蔡瑶 李小璟 龚双燕 徐志文 朱玲 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2016年第12期1992-1999,共8页
为了解猪萨佩罗病毒（porcine sapelovirus,PSV）的流行及变异情况,采集2015-2016年四川地区12个县市34个猪场共计428份腹泻病料,采用QRT-PCR方法对PSV进行检测。结果显示：在428份病料中,共有114份为PSV阳性,阳性率为26.6%;所检测的34... 为了解猪萨佩罗病毒（porcine sapelovirus,PSV）的流行及变异情况,采集2015-2016年四川地区12个县市34个猪场共计428份腹泻病料,采用QRT-PCR方法对PSV进行检测。结果显示：在428份病料中,共有114份为PSV阳性,阳性率为26.6%;所检测的34个猪场中,共有20个猪场显示PSV阳性,猪场阳性率为58.8%,表明PSV在四川地区普遍存在。此外,对来自不同县市共14份PSV阳性病料1B全基因进行PCR扩增,通过分子克隆,测序,再利用序列分析软件对四川部分地区猪萨佩罗病毒1B基因进行序列分析。结果表明,14条猪萨佩罗病毒1B基因核苷酸序列及推导出的氨基酸序列相似性分别为90.6%~100%和97.1%~100%。遗传进化分析显示,该研究获得的四川株与已知中国株分属于一个大的分支,说明我国猪萨佩罗病毒1B基因序列较为保守,没有发生大的基因变异。所有中国分离株与韩国株、德国株、英国株处在不同分支,又说明我国PSV的流行毒株可能存在独立进化。 展开更多
关键词 猪萨佩罗病毒 流行病学调查 1B基因 遗传进化分析
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一例多种病毒混合感染的实验室诊断及综合防制措施 被引量：1
3
作者 杨凡 李萍 +4 位作者 樊毅 赵军 陈盼 朱玲 徐志文 《养猪》 2016年第3期113-116,共4页
2016年3月,彭州某猪场出现疑似猪蓝耳病病毒(PRRSV)、猪伪狂犬病病毒(PRV)、猪流行性腹泻病毒(PEDV)和猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)混合感染严重疫情,猪群发病率和死亡率较高。为进一步确诊和提供科学的防控依据,采集10头繁殖障碍母猪(未... 2016年3月,彭州某猪场出现疑似猪蓝耳病病毒(PRRSV)、猪伪狂犬病病毒(PRV)、猪流行性腹泻病毒(PEDV)和猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)混合感染严重疫情,猪群发病率和死亡率较高。为进一步确诊和提供科学的防控依据,采集10头繁殖障碍母猪(未曾注射PRRSV疫苗)血样,用IDEXX试剂盒进行猪瘟病毒(CSFV)、PRRSV和PRVgE抗体检测。同时采集2头流产胎儿(对应2头流产母猪)组织分别进行CSFV、PRRSV的RT-PCR检测和PRV gE的PCR检测,采集2头腹泻同时伴随神经症状的仔猪组织进行TGEV、PEDV、猪轮状病毒(RV)的RT-PCR检测和PRV gE的PCR检测。结果显示,母猪CSFV抗体阳性率达90%,对应流产胎儿未检出CSFV,表明无CSFV感染,免疫合格;PRRSV和PRV gE抗体阳性率达100%,对应流产胎儿均测出PRRSV和PRV,表明这两种病毒感染情况严重;2头仔猪PCR和RT-PCR结果提示均有PRV、PEDV和TGEV野毒感染,并根据以上检测结果提出紧急防控措施。 展开更多
关键词 PRRSV PRV gE TGEV PEDV 混合感染
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2014—2016年四川省猪瘟、猪繁殖与呼吸综合征病毒的血清学调查 被引量：6
4
作者 杨凡 吕文婷 +3 位作者 许思遥 毛汐语 殷玥 徐志文 《猪业科学》 2017年第1期106-109,共4页
为掌握近年来四川省现有防控体系下猪瘟(CSF)、猪繁殖与呼吸综合征(PRRS)的感染和流行情况,对2014年1月—2016年6月采集于四川省共16个地区的6 489份血样,运用ELISA方法进行CSFV和PRRSV血清学调查。结果显示,2014—2016年CSFV抗体阳性... 为掌握近年来四川省现有防控体系下猪瘟(CSF)、猪繁殖与呼吸综合征(PRRS)的感染和流行情况,对2014年1月—2016年6月采集于四川省共16个地区的6 489份血样,运用ELISA方法进行CSFV和PRRSV血清学调查。结果显示,2014—2016年CSFV抗体阳性率分别为78.70%、80.25%和82.08%,PRRSV抗体阳性率分别为75.97%、87.16%和88.31%;绵阳、眉山、乐山和宜宾等地的CSFV或PRRSV抗体水平低于60%,与另一种相比差异较大,可能存在免疫干扰或野毒感染;哺乳仔猪和断奶仔猪的CSFV抗体阳性率偏低,各日龄段猪群PRRSV抗体水平较理想。结果提示,四川地区猪群的CSFV、PRRSV抗体阳性率良莠不齐,有必要对饲养管理方式和免疫程序等做适当调整,以防控临床野毒的感染。 展开更多
关键词 猪瘟 猪繁殖与呼吸综合征 ELISA 血清学调查
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四川省猪源盖塔病毒的分离鉴定及遗传进化分析 被引量：7
5
作者 江朝源 李飞 +7 位作者 曾喻兵 彭珂楠 张儒博 杜佩珊 冯宇 殷鑫欢 朱玲 徐志文 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第9期805-814,共10页
目的对检测到的疑似盖塔病毒进行分离鉴定和全基因序列遗传进化分析。方法从四川某猪场1例混合感染猪繁殖与呼吸综合征的仔猪血液中,进行RT-RCR检测,检测到GETV阳性。对样品进行无菌处理后,接种至BHK21细胞,连续传代培养,通过细胞病变... 目的对检测到的疑似盖塔病毒进行分离鉴定和全基因序列遗传进化分析。方法从四川某猪场1例混合感染猪繁殖与呼吸综合征的仔猪血液中,进行RT-RCR检测,检测到GETV阳性。对样品进行无菌处理后,接种至BHK21细胞,连续传代培养,通过细胞病变、蚀斑纯化、RT-RCR扩增和全基因序列测定鉴定细胞培养物。结果我们成功分离到四川首株猪盖塔病毒,并将其命名为SC201807;对该病毒全基因扩增测序并进行序列分析,发现SC201807与GenBank中上传的35株GETV序列相似性为99.0%~96.1%,E2序列高度保守仅在E310(天冬氨酸→谷氨酸)发生突变。全基因组核苷酸以及E2氨基酸序列遗传进化分析显示SC201807株与中国猪源HNJZ-S2及日本蚊源15-I-752、15-I-1105、14-I-605-C2、14-I-605-C1、12IH26亲缘关系最近,处于同一进化分支。结论SC201807株扩充了猪源GETV的感染谱,对其致病性、感染和传播机制、环境微生物学及公共卫生等相关研究提供素材。 展开更多
关键词 猪 盖塔病毒 分离鉴定 序列分析
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四川省猪流行性腹泻病毒SNJ-P株的分离鉴定与遗传进化分析 被引量：1
6
作者 庞茂楠 蒋子睿 +3 位作者 王印 罗燕 姚学萍 杨泽晓 《云南农业大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2022年第5期790-798,共9页
【目的】探究四川省猪流行性腹泻病毒(PEDV)毒株流行变异情况,并分析疫苗免疫效果不佳的原因。【方法】从四川某猪场采集仔猪肠道样本进行PCR检测、病毒纯化、病毒滴度测定以及病毒感染等试验;测定分离株全基因组序列,将分离株S基因序... 【目的】探究四川省猪流行性腹泻病毒(PEDV)毒株流行变异情况,并分析疫苗免疫效果不佳的原因。【方法】从四川某猪场采集仔猪肠道样本进行PCR检测、病毒纯化、病毒滴度测定以及病毒感染等试验;测定分离株全基因组序列,将分离株S基因序列与其他地区毒株及疫苗株进行比对并构建进化树;比较分离株与经典疫苗株CV777 S蛋白氨基酸位点变异情况。【结果】成功分离获得1株PEDV毒株,并命名为PEDV SNJ-P,该毒株病毒滴度为1×107.5/100μL。动物感染试验表明:分离株能引起仔猪出现腹泻和脱水等症状并导致死亡。全基因组测序及遗传进化分析表明:PEDV SNJ-P株全基因共28003 bp,基因型为S non-INDEL型;与同型的中国分离株PEDV-WS、CH/JLDH/2016和CH/HNLH/2015等毒株亲缘关系较近,与同型的疫苗株亲缘关系相对较远,与经典疫苗株亲缘关系较远。与经典疫苗株CV777相比,SNJ-P株的S蛋白存在多处氨基酸突变、缺失和插入现象。【结论】由于毒株出现变异,SNJ-P株与疫苗株亲缘关系较远,当前所用疫苗无法提供有效保护。本研究结果以期为国内PEDV毒株的研究及疫苗开发提供借鉴。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 分离鉴定 S蛋白基因 遗传进化分析
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四川省部分地区成年山羊十二指肠贾第虫感染调查与基因分型研究
7
作者 涂蕊 但佳明 +9 位作者 严光文 郑静 田一男 肖启程 魏斌 周紫峣 刘海峰 杨亭玉 彭广能 钟志军 《华南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第5期59-64,共6页
【目的】了解四川省部分地区成年山羊贾第虫Giardia duodenalis感染情况以及感染虫种基因型。【方法】在四川省12个养殖场采集了342份成年山羊的新鲜粪便,采用多位点基因分型技术,通过巢式PCR扩增bg、tpi和gdh基因位点,对阳性样品的PCR... 【目的】了解四川省部分地区成年山羊贾第虫Giardia duodenalis感染情况以及感染虫种基因型。【方法】在四川省12个养殖场采集了342份成年山羊的新鲜粪便,采用多位点基因分型技术,通过巢式PCR扩增bg、tpi和gdh基因位点,对阳性样品的PCR产物进行了测序分析。【结果】342份成年山羊粪样中贾第虫的总感染率为14.91%(51/342)。所有阳性样品感染的虫种基因型均为集聚体E。51份阳性样品在bg、tpi和gdh这3个基因位点分别成功鉴定出4(E5、E8、E17、E18)、2(E2、E4)和2(E3、E4)种基因亚型,并且在bg位点发现了2种新的基因亚型(E17、E18)。【结论】四川省部分地区成年山羊存在较为严重的贾第虫感染,虫种类型主要为集聚体E,且具有一定的遗传多样性。 展开更多
关键词 成年山羊 贾第虫 多位点基因分型技术 集聚体E
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几种主要禽疫病诊断基因芯片的制备及初步应用 被引量：21
8
作者 曹三杰 文心田 +4 位作者 肖驰 张焕容 杨利 肖国生 黄小波 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第4期356-360,共5页
进行了几种主要禽疫病诊断基因芯片制备及其初步应用研究。试验分别设计和克隆鉴定了NDV、IBV、AIV和IBDV的靶基因重组质粒。以克隆的靶基因重组质粒为模板,分别进行PCR扩增制备靶基因并纯化,以基因芯片点样仪将制备的靶基因点制在氨基... 进行了几种主要禽疫病诊断基因芯片制备及其初步应用研究。试验分别设计和克隆鉴定了NDV、IBV、AIV和IBDV的靶基因重组质粒。以克隆的靶基因重组质粒为模板,分别进行PCR扩增制备靶基因并纯化,以基因芯片点样仪将制备的靶基因点制在氨基化的基片上,经干燥、水合、紫外线交联和洗涤后,成功制备了NDV-IBV-AIV-IBDV诊断基因芯片。试验应用CY3荧光标记制备的探针进行芯片的检验,结果表明制备的NDV-IBV-AIV-IBDV诊断基因芯片质量好,可对NDVI、BV、AIV和IBDV进行诊断检测,具有检测灵敏性好,特异性高和芯片可重复检测的优点。试验对30个临床样品进行初步应用检测,结果表明该诊断基因芯片技术与RT-PCR检测技术检出率基本一致,并具有同步诊断检测多种疫病的优点。 展开更多
关键词 鸡新城疫 鸡传染性支气管炎 禽流感 鸡传染性法氏囊病 基因芯片 诊断
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四川地区腹泻仔猪群猪圆环病毒Ⅱ型分子流行病学调查 被引量：20
9
作者 赵军 周桐枫 +4 位作者 刘鹏娟 黄剑波 姜子义 朱玲 徐志文 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第7期546-549,共4页
为了解四川地区腹泻仔猪群中猪圆环病毒Ⅱ型(PCV2)的感染情况,本实验采用PCR方法对病料样品进行PCV2检测,并对分离的病毒DNA进行测序及生物信息学分析。结果显示PCV2感染率为71.6%(312/436),阳性结果中肠系膜淋巴结检出率为100%(312/312... 为了解四川地区腹泻仔猪群中猪圆环病毒Ⅱ型(PCV2)的感染情况,本实验采用PCR方法对病料样品进行PCV2检测,并对分离的病毒DNA进行测序及生物信息学分析。结果显示PCV2感染率为71.6%(312/436),阳性结果中肠系膜淋巴结检出率为100%(312/312)。将扩增并测序的19条PCV2序列与Gene Bank中23株参考序列比较分析,构建了系统进化树,结果表明四川省腹泻仔猪群感染PCV2基因型主要为PCV2b、PCV2d基因型。针对PCV2高频突变ORF2基因编码的Cap蛋白氨基酸序列进行生物信息学分析,结果显示主要抗原表位氨基酸位点存在替换,进而引起抗原漂移,这可能促使PCV2免疫原性发生改变。本研究为四川地区PCV2的防制奠定了基础。 展开更多
关键词 腹泻仔猪 圆环病毒Ⅱ型 CAP蛋白 分子流行病学
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四川和重庆地区鸭源沙门氏菌分离鉴定及血清型分析 被引量：9
10
作者 陈俊 蒋文灿 +3 位作者 程平 谭天 许凯迪 杨丽红 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第4期262-265,共4页
为了解四川和重庆地区规模化种鸭场鸭源沙门氏菌流行情况,本研究从四川和重庆地区规模化种鸭场采集病料样品366份,分离出163株鸭源沙门氏菌。血清型鉴定结果显示163株沙门氏菌中有96株能够确定血清型,分属A、B、C1、C2、D及F共6个血清群... 为了解四川和重庆地区规模化种鸭场鸭源沙门氏菌流行情况,本研究从四川和重庆地区规模化种鸭场采集病料样品366份,分离出163株鸭源沙门氏菌。血清型鉴定结果显示163株沙门氏菌中有96株能够确定血清型,分属A、B、C1、C2、D及F共6个血清群;另有67株属于粗糙型菌落未能分型。优势菌株为伊鲁木沙门氏菌、甲型副伤寒沙门氏菌及奥雷宁堡沙门氏菌。其次为习志野沙门氏菌、鼠伤寒沙门氏菌、肠炎沙门氏菌、猪霍乱沙门氏菌、奥斯陆沙门氏菌、姆卡巴沙门氏菌及昌丹斯沙门氏菌。采用已确定血清型的7株鸭源沙门氏菌人工感染实验雏鸭,结果显示7株鸭源沙门氏菌均具有致病性,死亡率为20%～100%,平均死亡率77.14%。本研究为进一步研究鸭源沙门氏菌流行情况和血清型分布情况提供参考。 展开更多
关键词 沙门氏菌 分离鉴定 血清型 鸭 四川 重庆
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四川宜宾七种中药提取物体外抗菌活性研究 被引量：7
11
作者 李莉 殷中琼 +3 位作者 贾仁勇 代如意 李曼 蔡红 《广西植物》 CAS CSCD 北大核心 2014年第5期714-718,共5页
用肉汤二倍稀释法和琼脂平板培养计数法,研究四川宜宾七种中药的提取物对大肠杆菌、沙门氏菌和巴氏杆菌的体外抑制作用.结果表明：黄柏提取物的抗菌活性最强,最小抑菌浓度（Minimum inhibitory concentration,MIC）为15．6～125 mg＆#18... 用肉汤二倍稀释法和琼脂平板培养计数法,研究四川宜宾七种中药的提取物对大肠杆菌、沙门氏菌和巴氏杆菌的体外抑制作用.结果表明：黄柏提取物的抗菌活性最强,最小抑菌浓度（Minimum inhibitory concentration,MIC）为15．6～125 mg＆#183;mL-1,最小杀菌浓度（Minimum bactericidal concentration,MBC）为31．25～250 mg＆#183;mL-1；栀子提取物抗菌活性次之,MIC 为62．5～125 mg＆#183;mL-1,MBC 为125～＞250 mg＆#183;mL-1；佛手提取物有较稳定的抗菌活性,MIC均为125 mg＆#183;mL-1,MBC为125 mg＆#183;mL-1和250 mg＆#183;mL-1；姜黄、杜仲、何首乌、细毡毛忍冬的提取物抗菌活性相对较差,大部分 MIC≥250 mg＆#183;mL-1.说明四川宜宾的黄柏和栀子的提取物抗菌活性较强,佛手提取物抗菌活性较稳定,有进一步研究的价值. 展开更多
关键词 四川宜宾 中药提取物 抗菌活性 MIC MBC
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采用AFLP和ERIC-PCR技术研究规模化鸡场健康鸡群中产气荚膜梭菌的遗传多样性 被引量：8
12
作者 倪学勤 郑晓丽 +2 位作者 曾东 Joshua Gong 宋振银 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第5期717-724,共8页
为了调查产气荚膜梭菌在健康鸡群中的流行现状,掌握我国部分地区规模化鸡场产气荚膜梭菌的遗传多样性,分析其流行特点与地区差异的关系,利用AFLP(amplified fragment length polymorphism)和ERIC-PCR(en-terobacterial repetitive inter... 为了调查产气荚膜梭菌在健康鸡群中的流行现状,掌握我国部分地区规模化鸡场产气荚膜梭菌的遗传多样性,分析其流行特点与地区差异的关系,利用AFLP(amplified fragment length polymorphism)和ERIC-PCR(en-terobacterial repetitive intergenic consensus PCR)方法对从四川省8个市10个规模化鸡场分离得到的34株A型产气荚膜梭菌进行基因型分析。结果表明,用AFLP技术将34株菌分为12个亚型,用ERIC-PCR方法分为8个亚型。分析亚型分布情况发现:不同鸡场产气荚膜梭菌的亚型差异明显;而同一鸡场的亚型较简单,以一种亚型为主,交叉有少数其他亚型;优势基因型分别为AFLP基因Ⅷ型或ERIC-PCR基因1型。该研究结果说明:四川省规模化鸡场健康鸡群中产气荚膜梭菌的遗传多样性较低,其流行特点与地区差异相关。 展开更多
关键词 产气荚膜梭菌 健康鸡群 遗传多样性 AFLP ERIC-PCR
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对我国动物微生态制剂产业发展的战略思考 被引量：20
13
作者 程安春 潘康成 倪学勤 《中国家禽》 北大核心 2008年第14期37-39,共3页
欧盟监管委员会决定，自2006年1月起在动物养殖业中禁用抗生素生长促进剂，欧盟的抗生素禁令不仅对欧盟内部国家适用，而且欧盟所有进口饲料、饲料添加剂和动物产品出口到欧盟国家的企业都必须遵守抗生素禁令。日本是欧盟抗生素禁令的... 欧盟监管委员会决定，自2006年1月起在动物养殖业中禁用抗生素生长促进剂，欧盟的抗生素禁令不仅对欧盟内部国家适用，而且欧盟所有进口饲料、饲料添加剂和动物产品出口到欧盟国家的企业都必须遵守抗生素禁令。日本是欧盟抗生素禁令的追随者，日本对从中国进口的动物产品的抗生素检测和相关规定非常严格，迫使我国动物产品出口企业逐步将饲料中的抗生素剔除。随着人民生活水平的提高，我国对无抗生素残留食品的需求亦日益高涨。 展开更多
关键词 动物微生态制剂 抗生素生长促进剂 欧盟国家 产业 进口饲料 动物产品 出口企业 动物养殖业
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四川某些规模化猪场大肠杆菌的分离鉴定及耐药性监测 被引量：10
14
作者 舒蕾 万莉 +5 位作者 张琦 马磊 谢智勇 杨映 郭玲 颜其贵 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2012年第3期32-34,共3页
为有效监测四川某地区猪致病性大肠杆菌的耐药性,本试验采用纸片扩散法对采自该地区不同区域的8个猪场的70株致病性大肠杆菌进行药物敏感性测定,结果表明,分离菌对12种药物存在不同程度的耐药性:对阿莫西林、红霉素高度耐药,耐药率分别... 为有效监测四川某地区猪致病性大肠杆菌的耐药性,本试验采用纸片扩散法对采自该地区不同区域的8个猪场的70株致病性大肠杆菌进行药物敏感性测定,结果表明,分离菌对12种药物存在不同程度的耐药性:对阿莫西林、红霉素高度耐药,耐药率分别为100%、82.86%,敏感性最高的氧氟沙星、头孢唑啉敏感率分别为82.86%、60%,所有菌株耐药性至少3耐,最高达11耐,51.43%呈7耐以上,共39种耐药谱型。由此可见,该地区规模化猪场大肠杆菌耐药程度严重。故筛选有效抗生素,采取必要措施防治此病已势在必行。 展开更多
关键词 致病性大肠杆菌 分离鉴定 耐药性 监测
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四川地区鸡源产气荚膜梭菌的分离鉴定与基因分型 被引量：7
15
作者 倪学勤 宋振银 +2 位作者 曾东 郑晓丽 Joshua Gong 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第8期737-740,786,共5页
目的检测四川地区健康鸡群产气荚膜梭菌的分布状况。方法从四川地区规模化鸡场采集新鲜粪便样品,按产气荚膜梭菌α、β、ε、ι毒素基因cpa、cpb、etx及iA序列,设计针对4种毒素基因的4对特异引物,应用多重PCR方法对产气荚膜梭菌进行基... 目的检测四川地区健康鸡群产气荚膜梭菌的分布状况。方法从四川地区规模化鸡场采集新鲜粪便样品,按产气荚膜梭菌α、β、ε、ι毒素基因cpa、cpb、etx及iA序列,设计针对4种毒素基因的4对特异引物,应用多重PCR方法对产气荚膜梭菌进行基因分型。最后利用重复序列PCR进一步做亚型分析。结果从150份样品中分离到8株(5.3%)产气荚膜梭菌,多重PCR都只扩增出α条带,毒素基因分型结果均为A型。ERIC-PCR、REP-PCR图谱显示两者均适用于产气荚膜梭菌亚型分析,ERIC-PCR是一种更简便、快速和有效的分子流行病学调查方法。结论四川地区健康鸡群中存在的产气荚膜梭菌主要是A型。 展开更多
关键词 产气荚膜梭菌 多重PCR 基因分型 鸡
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肉鸡屠宰环节多重耐药ST314肯塔基沙门菌的全基因组序列分析
16
作者 李佳芮 孙瑞源 +7 位作者 何沛杰 刘淏天 旷如意 夏静 崔敏 黄勇 邹立扣 韩新锋 《中国人兽共患病学报》 北大核心 2025年第5期537-543,共7页
目的分析肉鸡源多重耐药ST314肯塔基沙门菌的耐药特征、毒力基因和遗传进化背景。方法测定肉鸡屠宰环节中分离得到的ST314肯塔基沙门菌对临床常见抗菌药物的敏感性。通过全基因组测序(WGS)和生物信息学方法分析其耐药基因、毒力因子和... 目的分析肉鸡源多重耐药ST314肯塔基沙门菌的耐药特征、毒力基因和遗传进化背景。方法测定肉鸡屠宰环节中分离得到的ST314肯塔基沙门菌对临床常见抗菌药物的敏感性。通过全基因组测序(WGS)和生物信息学方法分析其耐药基因、毒力因子和水平移动元件(MGEs)等相关信息。结果三株ST314克隆均表现出高度耐药性。F4-2S对7类14种药物、F4T对7类13种药物以及Y23对6类9种药物耐药。F4-2S与F4T具有高度同源性,均携带9类13种耐药基因,以及分泌系统和效应蛋白等一系列毒力因子。含有的IncR和IncX1型质粒增强了其耐药性和致病性。Y23基因组完成图包含一条染色体和两个质粒。染色体上仅有一种耐药基因,但携带与细菌入侵有关的Ⅲ型分泌系统(T3SS)等众多毒力因子,而质粒pY23-1上携带8类19种耐药基因。相似质粒的比对结果显示,pY23-1与pZ1323SSL0055、pSAL-045同源关系较近,均携带多种耐药基因,提示其在细菌耐药进化中可能扮演重要角色。结论ST314肯塔基沙门菌具有复杂的耐药机制及致病潜力,质粒上的耐药基因及其MGEs有助于细菌耐药性的产生和传播。染色体含有的多种毒力因子,可能是导致ST314克隆毒力增强的重要原因。 展开更多
关键词 肯塔基沙门菌 多重耐药 超广谱Β-内酰胺酶 全基因组测序
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四川部分地区禽源空肠弯曲菌MLST分型及遗传进化分析 被引量：4
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作者 姚学萍 张博 +6 位作者 王寒 邬旭龙 周丽军 曹随忠 王印 杨泽晓 德西措姆 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期5-10,共6页
目的为了解四川部分地区分离到的48株禽源空肠弯曲菌间的分子特征,以对来源不同的空肠弯曲菌进行分子分型及遗传进化分析。方法本研究参照MLST数据库,选取了空肠弯曲菌MLST分型7个管家基因aspA,glnA,glyA,gltA,tkt,pgm和uncA作为目的基... 目的为了解四川部分地区分离到的48株禽源空肠弯曲菌间的分子特征,以对来源不同的空肠弯曲菌进行分子分型及遗传进化分析。方法本研究参照MLST数据库,选取了空肠弯曲菌MLST分型7个管家基因aspA,glnA,glyA,gltA,tkt,pgm和uncA作为目的基因分别扩增及测序,并将所得序列经比对后进行遗传进化分析。结果 48株分离株中共含24种不同的序列型分属于9种不同的克隆系及11种独特型,其中22株分离株含有新序列型,占分离株的45.83%(22/48);9种不同的克隆系中以CC-21、CC-353、CC-464克隆系所含菌株相对较多,而克隆系CC-45、CC-48最少,均为1株分离株;11种独特型共存于21株分离株中,其中以ST-8675序列型最多,为8株。遗传进化树显示,属同一克隆系的不同型别间的分离株亲缘关系较近,如同属于CC-21克隆系的ST-298与ST-760型别分离株处于同一小分支、亲缘关系较近,但不同克隆系的分离株间遗传进化关系较远,鹌鹑源分离株(V13-20)单独处于一大分支与其余禽源分离株间的亲缘关系最远。总体而言,不同地区、宿主来源的分离株呈现遗传多样性。结论本研究中分离株间具有基因多样性,MLST分型为了解该地区空肠弯曲菌的遗传特性和分布特点提供了参考依据。 展开更多
关键词 空肠弯曲菌 MLST分型 管家基因 遗传进化
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鸭疫里氏杆菌不同临床分离株的自然转化频率和耐药谱鉴定与分析
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作者 姚弈舟 刘思齐 +3 位作者 祁英吉 朱德康 程安春 刘马峰 《中国兽医杂志》 北大核心 2025年第5期1-9,共9页
鸭疫里氏杆菌(RA)可感染多种禽类,其部分临床分离株具有多重耐药性且耐药基因可经自然转化在菌间传播,但不同的RA临床分离株自然转化频率有无差异,以及菌株生长特性和耐药谱差异与其自然转化频率是否相关尚不明确。本试验针对42株RA临... 鸭疫里氏杆菌(RA)可感染多种禽类,其部分临床分离株具有多重耐药性且耐药基因可经自然转化在菌间传播,但不同的RA临床分离株自然转化频率有无差异,以及菌株生长特性和耐药谱差异与其自然转化频率是否相关尚不明确。本试验针对42株RA临床分离株,以ton B1up-cfx A-ton B1down基因片段(携带抗性基因的DNA片段)为底物DNA,检测其自然转化频率;测定菌液不同生长时间的OD_(600 nm)值以绘制生长曲线;测定5大类10种抗菌药对42株RA临床分离株的最小抑菌浓度(MIC)值,并探究自然转化频率与生长特性和耐药谱之间的关联。结果显示,42株RA临床分离株中自然转化频率最高达(9.78±3.6)×10^(-5),最低则低于检测限(<10^(-9));生长曲线测定结果显示,RA临床分离株14 h生长曲线最高OD_(600 nm)值为5.2±0.3,最低为3.1±0.5;RA临床分离株中88.10%(37/42)具多重耐药性,单菌株最高耐7种药物,耐5种以上药物的菌株占比23.81%(10/42),耐4种以上药物的菌株占比40.48%(17/42)。深入分析可知,自然转化频率与生长特性和耐药谱均无显著相关性(r_(pearson)均小于0.8)。本试验为探究RA耐药谱的增加与自然转化频率之间的关联性提供了数据支撑。 展开更多
关键词 鸭疫里氏杆菌(RA) 耐药谱 自然转化频率
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猪瘟病毒四川分离株E2基因的分子克隆、原核表达及免疫学活性分析 被引量：4
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作者 韩国全 郭万柱 +4 位作者 林华 王利娜 张博 陈弟诗 陈杨 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2010年第3期65-71,共7页
分子克隆猪瘟病毒(classical swine fever virus,CSFV)四川分离株E2基因,并对其进行原核表达及免疫学活性分析。PK-15细胞培养增殖CSFV四川分离株提取总RNA,运用RT-PCR扩增E2基因,定向克隆构建原核重组表达载体,转化E.coli Rosetta-gami... 分子克隆猪瘟病毒(classical swine fever virus,CSFV)四川分离株E2基因,并对其进行原核表达及免疫学活性分析。PK-15细胞培养增殖CSFV四川分离株提取总RNA,运用RT-PCR扩增E2基因,定向克隆构建原核重组表达载体,转化E.coli Rosetta-gami-TM(DE3)plysS,IPTG诱导表达,SDS-PAGE检测蛋白表达,Western blotting分析表达蛋白的免疫学活性。试验结果表明,成功克隆了E2基因,共1119 bp,包含有编码E2蛋白的完整序列,编码373个氨基酸;成功构建了CS-FVE2基因完整阅读框、主要抗原区原核表达载体pET-E2(pe)、pET-mE2(pe);蛋白质电泳结果显示,成功表达出约45.32、28.49 ku两目的蛋白,而且表达的E2(pe)、mE2(pe)融合蛋白均能被CSFV阳性血清所识别,具有良好的免疫学反应活性。因此,本试验成功获得CSFV四川分离株E2基因,表达出具有生物学活性的E2(pe)、mE2(pe)融合蛋白。 展开更多
关键词 猪瘟病毒 四川分离株 E2基因 原核表达 免疫学活性
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四川某规模化猪场仔猪腹泻病的诊疗体会 被引量：3
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作者 张曼丽 徐博文 +2 位作者 舒蕾 刘杰 颜其贵 《河南农业科学》 CSCD 北大核心 2012年第6期155-157,共3页
采用RT PCR方法,从四川某规模化猪场仔猪腹泻死亡病例病料中检测猪流行性腹泻病毒、猪传染性胃肠炎病毒、猪轮状病毒,并分离细菌,最终鉴定为猪传染性胃肠炎继发大肠杆菌感染。药敏试验结果显示,分离的致病性大肠杆菌对林可霉素和氧氟沙... 采用RT PCR方法,从四川某规模化猪场仔猪腹泻死亡病例病料中检测猪流行性腹泻病毒、猪传染性胃肠炎病毒、猪轮状病毒,并分离细菌,最终鉴定为猪传染性胃肠炎继发大肠杆菌感染。药敏试验结果显示,分离的致病性大肠杆菌对林可霉素和氧氟沙星高度敏感。根据结果制定相应防治措施,经治疗处理后,病情得到有效控制。 展开更多
关键词 产房仔猪 猪传染性胃肠炎病毒 大肠杆菌 仔猪黄痢 腹泻病 继发感染
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