期刊导航
期刊开放获取
上海教育软件发展有限公..
期刊文献
+
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
检索
高级检索
期刊导航
共找到
1
篇文章
<
1
>
每页显示
20
50
100
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
已选文献
显示方式：
文摘
详细
列表
相关度排序
被引量排序
时效性排序
结核病患者外周血单个核细胞内环状RNA表达谱分析及诊断标识的鉴定
1
作者
王颖超
刘唯夷
+8 位作者
姬秀秀
尚雪恬
贾红彦
张蓝月
孙琦
杜博平
朱传智
潘丽萍
张宗德
《中国防痨杂志》
北大核心
2025年第4期460-470,共11页
目的:揭示结核病患者外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cells,PBMCs)内环状RNA(circular RNA,circRNA)表达谱,并验证获得具有结核病诊断价值的潜在circRNAs,评估其诊断性能。方法:通过微阵列芯片检测,获得结核病患者及健...
目的:揭示结核病患者外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cells,PBMCs)内环状RNA(circular RNA,circRNA)表达谱,并验证获得具有结核病诊断价值的潜在circRNAs,评估其诊断性能。方法:通过微阵列芯片检测,获得结核病患者及健康人PBMCs内circRNAs表达谱。使用加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)筛选出结核病相关的关键模块。通过基因本体论(gene ontology,GO)、京都基因和基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)及免疫浸润分析,探索关键模块中基因的功能。再通过验证集对关键模块中的部分circRNAs进行实时荧光定量PCR检测以验证芯片结果,并进行受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线分析,评估候选circRNAs的诊断效能,同时对候选circRNAs与临床特征进行Pearson相关性分析。结果:通过WGCNA分析,共确定16个模块,其中棕色模块是结核病最强相关模块。功能富集分析显示,棕色模块中基因主要富集于T细胞受体信号通路、丝裂原活化蛋白激酶信号通路、动物细胞线粒体自噬、铁死亡、泛素介导的蛋白水解等功能途径。基于棕色模块基因的免疫浸润分析提示,CD8^(+)T细胞(P<0.001)、静息记忆CD4^(+)T细胞(P<0.0001)、单核细胞(P<0.001)等细胞比例在两组间差异均有统计学意义。在棕色模块中,以P<0.05,差异倍数(fold change,fc)>4或<0.25,同时至少一组平均表达量均值>10为标准,筛选组间差异基因,共得到9个结核病特异性circRNAs,其中hsa_circ_0052124在结核病患者样本中明显低表达(Z=―6.328,P<0.0001),ROC曲线下面积为0.976(95%CI:0.940~1.000,P<0.0001),敏感度为90.0%(95%CI:73.5%~97.9%),特异度为100.0%(95%CI:88.4%~100.0%),可以有效区分结核病患者和健康对照。经Pearson相关性分析,结核病患者外周血载脂蛋白B(r=0.715)、脂蛋白(a)(r=0.598)、血糖(r=0.575)水平与hsa_circ_0052124水平均呈正相关(P值均<0.01)。结论:通过对结核病患者circRNAs表达谱进行解析,确定了一个与结核病显著相关的关键基因模块,并鉴定出在结核病患者和健康人之间存在明显差异的circRNA——hsa_circ_0052124。
展开更多
关键词
结核
核糖核酸
分枝杆菌感染
基因表达
免疫
在线阅读
下载PDF
职称材料
题名
结核病患者外周血单个核细胞内环状RNA表达谱分析及诊断标识的鉴定
1
作者
王颖超
刘唯夷
姬秀秀
尚雪恬
贾红彦
张蓝月
孙琦
杜博平
朱传智
潘丽萍
张宗德
机构
分子生物学实验室/耐药结核病研究北京市重点实验室/首都医科大学附属北京胸科医院/北京市结核病胸部肿瘤研究所
出处
《中国防痨杂志》
北大核心
2025年第4期460-470,共11页
基金
国家自然科学基金(82172279,82402641)
北京市高层次公共卫生人才项目(G2024-2-007)
北京市自然科学基金(7242025)。
文摘
目的:揭示结核病患者外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cells,PBMCs)内环状RNA(circular RNA,circRNA)表达谱,并验证获得具有结核病诊断价值的潜在circRNAs,评估其诊断性能。方法:通过微阵列芯片检测,获得结核病患者及健康人PBMCs内circRNAs表达谱。使用加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)筛选出结核病相关的关键模块。通过基因本体论(gene ontology,GO)、京都基因和基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)及免疫浸润分析,探索关键模块中基因的功能。再通过验证集对关键模块中的部分circRNAs进行实时荧光定量PCR检测以验证芯片结果,并进行受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线分析,评估候选circRNAs的诊断效能,同时对候选circRNAs与临床特征进行Pearson相关性分析。结果:通过WGCNA分析,共确定16个模块,其中棕色模块是结核病最强相关模块。功能富集分析显示,棕色模块中基因主要富集于T细胞受体信号通路、丝裂原活化蛋白激酶信号通路、动物细胞线粒体自噬、铁死亡、泛素介导的蛋白水解等功能途径。基于棕色模块基因的免疫浸润分析提示,CD8^(+)T细胞(P<0.001)、静息记忆CD4^(+)T细胞(P<0.0001)、单核细胞(P<0.001)等细胞比例在两组间差异均有统计学意义。在棕色模块中,以P<0.05,差异倍数(fold change,fc)>4或<0.25,同时至少一组平均表达量均值>10为标准,筛选组间差异基因,共得到9个结核病特异性circRNAs,其中hsa_circ_0052124在结核病患者样本中明显低表达(Z=―6.328,P<0.0001),ROC曲线下面积为0.976(95%CI:0.940~1.000,P<0.0001),敏感度为90.0%(95%CI:73.5%~97.9%),特异度为100.0%(95%CI:88.4%~100.0%),可以有效区分结核病患者和健康对照。经Pearson相关性分析,结核病患者外周血载脂蛋白B(r=0.715)、脂蛋白(a)(r=0.598)、血糖(r=0.575)水平与hsa_circ_0052124水平均呈正相关(P值均<0.01)。结论:通过对结核病患者circRNAs表达谱进行解析,确定了一个与结核病显著相关的关键基因模块,并鉴定出在结核病患者和健康人之间存在明显差异的circRNA——hsa_circ_0052124。
关键词
结核
核糖核酸
分枝杆菌感染
基因表达
免疫
Keywords
Tuberculosis
RNA
Mycobacterium infections
Gene expression
Immunity
分类号
R52 [医药卫生—内科学]
在线阅读
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
结核病患者外周血单个核细胞内环状RNA表达谱分析及诊断标识的鉴定
王颖超
刘唯夷
姬秀秀
尚雪恬
贾红彦
张蓝月
孙琦
杜博平
朱传智
潘丽萍
张宗德
《中国防痨杂志》
北大核心
2025
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
已选文献
上一页
1
下一页
到第
页
确定
用户登录
登录
IP登录
使用帮助
返回顶部
