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题名蓝莓自花和异花授粉花柱转录组SSR位点分析
被引量：3
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作者
杨芩
付燕
邓洁
张婷渟
刘雅兰
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机构
贵州山地特色园艺作物分子育种与品种创制重点实验室
凯里学院发展规划处
黔东南民族职业技术学院
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出处
《安徽农学通报》
2024年第11期33-41,共9页
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基金
贵州省“千”层次创新型人才培养项目(黔千层人才〔2021〕201402)
凯里学院农业硕士专业学位培育点专项课题(kysszx2022014)
+1 种基金
凯里学院贵州省省级一流本科专业(园艺)
凯里学院一流学科(园艺学)。
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文摘
为鉴定蓝莓自交不亲和基因,本研究对“杰兔”蓝莓品种自花和异花授粉花柱进行了转录组测序,对简单重复序列(SSR)位点进行分析,对含SSR位点且差异表达的非冗余序列(Unigene)进行基因本体论(GO)功能富集和京都基因与基因组数据库(KEGG)注释分析,并开展SSR标见引物设计。结果表明,蓝莓花柱转录组共获得85890条Unigene,其中有21962个Unigene含有26557个SSR位点,发生频率为25.57%。在所有SSR位点中包含有297种重复基元,以单核苷酸和二核苷酸重复为主要重复类型,占总SSR的89.52%;其中A/T类型和AG/CT类型SSR位点数占SSR总数的83.44%。针对所有SSR位点,共设计出17212对引物,成功率78.37%。差异转录组筛选到58、27、16、3、2和1条含有SSR位点的差异表达Unigene,分别与植物激素信号转导、细胞骨架、蛋白质泛素化、花粉管生长、核糖核酸酶T2家族和细胞程序化死亡等代谢途径相关。本研究丰富了蓝莓的EST-SSR分子标记,为蓝莓自交不亲和的分子机制研究提供了参考。
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关键词
蓝莓
自花授粉
异花授粉
花柱
转录组
简单重复序列
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Keywords
blueberry
self-pollination
cross-pollination
styles
transcriptome
simple sequence repeat
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分类号
S603.2
[农业科学—园艺学]
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