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江苏蚕豆三叶草黄脉病毒的分子鉴定及全基因组结构特征分析
1
作者
高晓晓
涂丽琴
+5 位作者
孙枫
李硕
崔晓艳
陈新
章松柏
季英华
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2022年第5期1203-1210,共8页
三叶草黄脉病毒(Clover yellow vein virus,ClYVV)是马铃薯Y病毒属的重要成员,侵染多种豆科作物并造成严重危害。为明确从江苏省盐城市采集的蚕豆样品中检测出的ClYVV全基因组序列以及基因组结构特征,通过分段扩增的策略对ClYVV全基因...
三叶草黄脉病毒(Clover yellow vein virus,ClYVV)是马铃薯Y病毒属的重要成员,侵染多种豆科作物并造成严重危害。为明确从江苏省盐城市采集的蚕豆样品中检测出的ClYVV全基因组序列以及基因组结构特征,通过分段扩增的策略对ClYVV全基因组序列进行克隆,序列测定后拼接获得江苏蚕豆三叶草黄脉病毒(ClYVV-JS)全基因组序列。基因组序列分析结果显示该分离物基因组序列全长9585 bp,编码11个蛋白质。NCBI序列比对结果表明该分离物与已报道的日本ClYVV No.30分离物(AB011819)核苷酸序列同源性最高,达96.37%,其中编码的氨基酸序列同源性高达99.06%,而与中国合肥ClYVV分离物(KU922565)核苷酸序列同源性相对较低(94.74%)。聚类分析结果也显示ClYVV-JS归入三叶草黄脉病毒分支,与马铃薯Y病毒属其他成员分别归入不同分支。
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关键词
三叶草黄脉病毒
蚕豆
全基因组
序列分析
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职称材料
侵染广西辣椒的两种单组分菜豆金色花叶病毒属病毒的分子特征
2
作者
李金哲
汤亚飞
+6 位作者
莫翠萍
罗婉笛
陈锦清
蔡健和
邓清超
章松柏
李战彪
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2023年第12期2703-2710,共8页
【目的】明确引起广西百色市辣椒呈现叶片上卷、皱缩等症状的病毒病原,并对各病毒分离物的遗传进化关系进行分析,旨在为辣椒病毒病的防控提供科学依据。【方法】从广西百色市采集4份疑似被菜豆金色花叶病毒属病毒感染的辣椒样品,利用PC...
【目的】明确引起广西百色市辣椒呈现叶片上卷、皱缩等症状的病毒病原,并对各病毒分离物的遗传进化关系进行分析,旨在为辣椒病毒病的防控提供科学依据。【方法】从广西百色市采集4份疑似被菜豆金色花叶病毒属病毒感染的辣椒样品,利用PCR、分段克隆、核苷酸序列比对分析、进化树构建等方法对疑似样品进行鉴定及遗传进化分析。【结果】PCR结果显示,4个样品中均能扩增出约570 bp目标PCR条带,将PCR产物直接送样测序,所得序列进行blastn分析发现,4条序列分别与已登录GenBank的TYLCV和PaLCuCNV各分离物的序列具有较高的核苷酸相似性,证实所采集的辣椒植株受到菜豆金色花叶病毒属病毒侵染。参考已登录GenBank的TYLCV(GenBank登录号:MG904859和KY783940)、PaLCuCNV(GenBank登录号:KU892661和MW779523)的序列设计2对背靠背引物,随机选择2份阳性样品进行全基因组扩增和序列测定,将所得PCR产物纯化后克隆至pMD18T载体上,挑选阳性克隆进行测序,从2份阳性样品中共获得3条病毒全长基因组序列,将所得序列在GenBank中进行blastn分析,发现其中2条序列与已登录GenBank的部分TYLCV分离物的核苷酸相似性达到91%以上,1条序列与已登录GenBank的部分PaLCuCNV分离物核苷酸相似性在91%以上。根据双生病毒的分类标准,确定侵染广西辣椒的双生病毒为TYLCV和PaLCuCNV的不同分离物。进化树分析发现,TYLCV广西辣椒分离物BS66-1与TYLCVSG1分离物(GenBank登录号:MT969010,寄主为番茄)具有较近的亲缘关系,而TYLCV广西辣椒分离物BS67-1则与TYLCV GX和TYLCV BS3分离物(GenBank登录号:MW389934、MT375610,寄主均为番茄)具有较近的亲缘关系;PaLCuCNV广西辣椒分离物BS66-2则与PaLCuCNV GX01分离物(GenBank登录号:MW779523,寄主为番茄)具有较近的亲缘关系。【结论】侵染广西辣椒呈现叶片上卷、皱缩等症状的病原为TYLCV和PaLCuCNV,本研究为菜豆金色花叶病毒属病毒侵染广西辣椒的首次报道。
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关键词
广西
辣椒
序列分析
番茄黄化曲叶病毒
中国番木瓜曲叶病毒
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职称材料
题名
江苏蚕豆三叶草黄脉病毒的分子鉴定及全基因组结构特征分析
1
作者
高晓晓
涂丽琴
孙枫
李硕
崔晓艳
陈新
章松柏
季英华
机构
农林病虫害预警与调控湖北省工程技术研究中心/长江大学
江苏省农业科学院植物保护
研究
所
江苏省农业科学院经济作物
研究
所
出处
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2022年第5期1203-1210,共8页
基金
江苏省农业科技自主创新基金项目[CX(21)1011]
国家自然科学基金项目(32072506)
现代农业产业技术体系建设专项(CARS-24-C-01)。
文摘
三叶草黄脉病毒(Clover yellow vein virus,ClYVV)是马铃薯Y病毒属的重要成员,侵染多种豆科作物并造成严重危害。为明确从江苏省盐城市采集的蚕豆样品中检测出的ClYVV全基因组序列以及基因组结构特征,通过分段扩增的策略对ClYVV全基因组序列进行克隆,序列测定后拼接获得江苏蚕豆三叶草黄脉病毒(ClYVV-JS)全基因组序列。基因组序列分析结果显示该分离物基因组序列全长9585 bp,编码11个蛋白质。NCBI序列比对结果表明该分离物与已报道的日本ClYVV No.30分离物(AB011819)核苷酸序列同源性最高,达96.37%,其中编码的氨基酸序列同源性高达99.06%,而与中国合肥ClYVV分离物(KU922565)核苷酸序列同源性相对较低(94.74%)。聚类分析结果也显示ClYVV-JS归入三叶草黄脉病毒分支,与马铃薯Y病毒属其他成员分别归入不同分支。
关键词
三叶草黄脉病毒
蚕豆
全基因组
序列分析
Keywords
clover yellow vein virus
broad bean
whole genome
sequence analysis
分类号
S435.23 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
侵染广西辣椒的两种单组分菜豆金色花叶病毒属病毒的分子特征
2
作者
李金哲
汤亚飞
莫翠萍
罗婉笛
陈锦清
蔡健和
邓清超
章松柏
李战彪
机构
农林病虫害预警与调控湖北省工程技术研究中心/长江大学
广西壮族自治区农业科学院植物保护
研究
所/农业农村部华南果蔬绿色防控重点实验室/广西作物
病虫害
生物学重点实验室
广东省农业科学院植物保护
研究
所/广东省植物保护新
技术
重点实验室
出处
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2023年第12期2703-2710,共8页
基金
广西自然科学基金项目(2020GXNSFAA259003)
广西农业科学院基本科研业务专项项目(桂农科2020YM92,桂农科2021YT071)
广东省植物保护新技术重点实验室开放基金项目(植重2021-06)。
文摘
【目的】明确引起广西百色市辣椒呈现叶片上卷、皱缩等症状的病毒病原,并对各病毒分离物的遗传进化关系进行分析,旨在为辣椒病毒病的防控提供科学依据。【方法】从广西百色市采集4份疑似被菜豆金色花叶病毒属病毒感染的辣椒样品,利用PCR、分段克隆、核苷酸序列比对分析、进化树构建等方法对疑似样品进行鉴定及遗传进化分析。【结果】PCR结果显示,4个样品中均能扩增出约570 bp目标PCR条带,将PCR产物直接送样测序,所得序列进行blastn分析发现,4条序列分别与已登录GenBank的TYLCV和PaLCuCNV各分离物的序列具有较高的核苷酸相似性,证实所采集的辣椒植株受到菜豆金色花叶病毒属病毒侵染。参考已登录GenBank的TYLCV(GenBank登录号:MG904859和KY783940)、PaLCuCNV(GenBank登录号:KU892661和MW779523)的序列设计2对背靠背引物,随机选择2份阳性样品进行全基因组扩增和序列测定,将所得PCR产物纯化后克隆至pMD18T载体上,挑选阳性克隆进行测序,从2份阳性样品中共获得3条病毒全长基因组序列,将所得序列在GenBank中进行blastn分析,发现其中2条序列与已登录GenBank的部分TYLCV分离物的核苷酸相似性达到91%以上,1条序列与已登录GenBank的部分PaLCuCNV分离物核苷酸相似性在91%以上。根据双生病毒的分类标准,确定侵染广西辣椒的双生病毒为TYLCV和PaLCuCNV的不同分离物。进化树分析发现,TYLCV广西辣椒分离物BS66-1与TYLCVSG1分离物(GenBank登录号:MT969010,寄主为番茄)具有较近的亲缘关系,而TYLCV广西辣椒分离物BS67-1则与TYLCV GX和TYLCV BS3分离物(GenBank登录号:MW389934、MT375610,寄主均为番茄)具有较近的亲缘关系;PaLCuCNV广西辣椒分离物BS66-2则与PaLCuCNV GX01分离物(GenBank登录号:MW779523,寄主为番茄)具有较近的亲缘关系。【结论】侵染广西辣椒呈现叶片上卷、皱缩等症状的病原为TYLCV和PaLCuCNV,本研究为菜豆金色花叶病毒属病毒侵染广西辣椒的首次报道。
关键词
广西
辣椒
序列分析
番茄黄化曲叶病毒
中国番木瓜曲叶病毒
Keywords
Guangxi
Capsicum annuum L.
Sequence analysis
Tomato yellow leaf curl virus(TYLCV)
Papaya leaf curl China virus(PaL⁃CuCNV)
分类号
S436.418 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
江苏蚕豆三叶草黄脉病毒的分子鉴定及全基因组结构特征分析
高晓晓
涂丽琴
孙枫
李硕
崔晓艳
陈新
章松柏
季英华
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2022
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
侵染广西辣椒的两种单组分菜豆金色花叶病毒属病毒的分子特征
李金哲
汤亚飞
莫翠萍
罗婉笛
陈锦清
蔡健和
邓清超
章松柏
李战彪
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2023
0
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