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大豆胞囊线虫主效抗病基因Rhg4(GmSHMT)的CAPS/dCAPS标记开发和利用
被引量：
10
1
作者
史学晖
李英慧
+3 位作者
于佰双
郭勇
王家军
邱丽娟
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第10期1463-1471,共9页
大豆胞囊线虫(soybean cyst nematode,SCN)严重危害世界大豆生产,Rhg4(resistance to Heterodera glycines 4)是控制大豆SCN抗性的2个主效位点之一。本研究针对Rhg4(Gm SHMT)上的2个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP...
大豆胞囊线虫(soybean cyst nematode,SCN)严重危害世界大豆生产,Rhg4(resistance to Heterodera glycines 4)是控制大豆SCN抗性的2个主效位点之一。本研究针对Rhg4(Gm SHMT)上的2个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)位点开发了快速、经济、简便易行的CAPS(Rhg4-389)和d CAPS标记(Rhg4-1165),并用开发的2个标记鉴定了以大豆胞囊线虫应用核心种质为主的193份代表性抗感种质。结果表明,Rhg4-389和Rhg4-1165位点间存在显著连锁不平衡(P=0.0001,r2=0.87),可形成4种单倍型。Rhg4-389-G/Rhg4-1165-T和Rhg4-389-C/Rhg4-1165-A为优势单倍型,稀有单倍型Rhg4-389-G/Rhg4-1165-A和Rhg4-389-C/Rhg4-1165-T是在中国抗源中新发现的单倍型。结合193份种质对SCN 3号小种抗性鉴定分析发现,Rhg4-389-G和Rhg4-1165-T主要存在于抗病种质,它们形成的单倍型对抗病种质鉴定效率可达94.1%。本研究开发了可用于辅助大豆SCN抗性鉴定且方便育种家利用的CAPS/d CAPS标记,且用其摸清了应用核心种质等重要抗源在Rhg4位点的"本底",为育种家有效利用这些优异抗源提供了重要信息。
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关键词
大豆胞囊线虫
Rhg4
CAPS/dCAPS标记
单倍型
分子标记辅助选择
Rhg4
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职称材料
抗大豆胞囊线虫SCN3-11位点的KASP标记开发和利用
被引量：
12
2
作者
田宇
杨蕾
+1 位作者
李英慧
邱丽娟
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第11期1600-1611,共12页
大豆胞囊线虫(HeteroderaglycinesIchinohe)是严重危害世界范围大豆生产的害虫,采用合理轮作和种植抗病品种可有效控制损失。为了开展分子标记辅助选择以加速抗病品种培育,本研究针对前期发现的与大豆胞囊线虫3号小种(SCN3)抗性显著关...
大豆胞囊线虫(HeteroderaglycinesIchinohe)是严重危害世界范围大豆生产的害虫,采用合理轮作和种植抗病品种可有效控制损失。为了开展分子标记辅助选择以加速抗病品种培育,本研究针对前期发现的与大豆胞囊线虫3号小种(SCN3)抗性显著关联的非同义变异SNP位点Map-5149,开发高通量、低成本的新型分子标记—竞争性等位基因特异PCR标记(kompetitive allele specific PCR, KASP), GmSNAP11-5149。利用GmSNAP11-5149鉴定了来自8个国家的202份代表性大豆抗感资源,发现141份材料携带抗病基因型GmSNAP11-5149-AA,平均雌虫指数为6.2%,极显著低于58份携带感病基因型GmSNAP11-5149-GG材料的雌虫指数(61.1%),方差分析表明, GmSNAP11-5149与胞囊线虫的抗性显著相关(F=44.18,P<0.0001),对抗病材料的选择效率达到92%,GmSNAP11-5149可作为一个实用的分子标记应用于辅助抗大豆胞囊线虫品种选育和抗病种质资源鉴定。
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关键词
大豆胞囊线虫
KASP标记
分子标记辅助选择
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职称材料
题名
大豆胞囊线虫主效抗病基因Rhg4(GmSHMT)的CAPS/dCAPS标记开发和利用
被引量：
10
1
作者
史学晖
李英慧
于佰双
郭勇
王家军
邱丽娟
机构
农作物基因资源与基因改良国家重大科学工程/农业部北京大豆生物学重点实验室/中国农业科学院作物科学研究所
黑龙江省
农业
科学院
大豆
研究所
出处
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第10期1463-1471,共9页
基金
国家自然科学基金项目(31171575)
中国农业科学院科技创新工程(作物分子标记技术及其应用)项目资助
文摘
大豆胞囊线虫(soybean cyst nematode,SCN)严重危害世界大豆生产,Rhg4(resistance to Heterodera glycines 4)是控制大豆SCN抗性的2个主效位点之一。本研究针对Rhg4(Gm SHMT)上的2个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)位点开发了快速、经济、简便易行的CAPS(Rhg4-389)和d CAPS标记(Rhg4-1165),并用开发的2个标记鉴定了以大豆胞囊线虫应用核心种质为主的193份代表性抗感种质。结果表明,Rhg4-389和Rhg4-1165位点间存在显著连锁不平衡(P=0.0001,r2=0.87),可形成4种单倍型。Rhg4-389-G/Rhg4-1165-T和Rhg4-389-C/Rhg4-1165-A为优势单倍型,稀有单倍型Rhg4-389-G/Rhg4-1165-A和Rhg4-389-C/Rhg4-1165-T是在中国抗源中新发现的单倍型。结合193份种质对SCN 3号小种抗性鉴定分析发现,Rhg4-389-G和Rhg4-1165-T主要存在于抗病种质,它们形成的单倍型对抗病种质鉴定效率可达94.1%。本研究开发了可用于辅助大豆SCN抗性鉴定且方便育种家利用的CAPS/d CAPS标记,且用其摸清了应用核心种质等重要抗源在Rhg4位点的"本底",为育种家有效利用这些优异抗源提供了重要信息。
关键词
大豆胞囊线虫
Rhg4
CAPS/dCAPS标记
单倍型
分子标记辅助选择
Rhg4
Keywords
Soybean cyst nematode
CAPS/dCAPS marker
Haplotype
Marker assisted selection
分类号
S435.651 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
抗大豆胞囊线虫SCN3-11位点的KASP标记开发和利用
被引量：
12
2
作者
田宇
杨蕾
李英慧
邱丽娟
机构
农作物基因资源与基因改良国家重大科学工程/农业部北京大豆生物学重点实验室/中国农业科学院作物科学研究所
出处
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第11期1600-1611,共12页
基金
"十三五"国家重点研发计划项目(2016YFD0100201)
国家大豆种质资源平台(2016-004)项目资助~~
文摘
大豆胞囊线虫(HeteroderaglycinesIchinohe)是严重危害世界范围大豆生产的害虫,采用合理轮作和种植抗病品种可有效控制损失。为了开展分子标记辅助选择以加速抗病品种培育,本研究针对前期发现的与大豆胞囊线虫3号小种(SCN3)抗性显著关联的非同义变异SNP位点Map-5149,开发高通量、低成本的新型分子标记—竞争性等位基因特异PCR标记(kompetitive allele specific PCR, KASP), GmSNAP11-5149。利用GmSNAP11-5149鉴定了来自8个国家的202份代表性大豆抗感资源,发现141份材料携带抗病基因型GmSNAP11-5149-AA,平均雌虫指数为6.2%,极显著低于58份携带感病基因型GmSNAP11-5149-GG材料的雌虫指数(61.1%),方差分析表明, GmSNAP11-5149与胞囊线虫的抗性显著相关(F=44.18,P<0.0001),对抗病材料的选择效率达到92%,GmSNAP11-5149可作为一个实用的分子标记应用于辅助抗大豆胞囊线虫品种选育和抗病种质资源鉴定。
关键词
大豆胞囊线虫
KASP标记
分子标记辅助选择
Keywords
soybean cyst nematode
KASP marker
marker-assisted selection(MAS)
分类号
S435.651 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
大豆胞囊线虫主效抗病基因Rhg4(GmSHMT)的CAPS/dCAPS标记开发和利用
史学晖
李英慧
于佰双
郭勇
王家军
邱丽娟
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015
10
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
抗大豆胞囊线虫SCN3-11位点的KASP标记开发和利用
田宇
杨蕾
李英慧
邱丽娟
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018
12
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