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不同生长环境下水稻氮、磷、钾利用相关性状的QTL定位分析
被引量：
6
1
作者
杨树明
曾亚文
+3 位作者
王荔
杜娟
普晓英
杨涛
《植物营养与肥料学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第4期823-835,共13页
【目的】鉴定影响水稻氮、磷、钾利用相关性状的QTL,为开展水稻养分高效利用分子标记辅助选择育种和肥高效基因的图位克隆提供依据。【方法】以云南强耐冷（2级）粳稻地方品种丽江新团黑谷与十和田杂交、回交获包含105个株系的孕穗期耐...
【目的】鉴定影响水稻氮、磷、钾利用相关性状的QTL,为开展水稻养分高效利用分子标记辅助选择育种和肥高效基因的图位克隆提供依据。【方法】以云南强耐冷（2级）粳稻地方品种丽江新团黑谷与十和田杂交、回交获包含105个株系的孕穗期耐冷性近等基因系BC4F8及双亲为材料,在云南白邑（冷水胁迫）、寻甸（自然低温胁迫）和玉溪（正常生长环境）3种生长环境下进行水稻氮、磷、钾养分吸收相关性状的鉴定,并利用构建的含有180个SSR标记,全长为1820.6 c M,标记间平均距离为15.67 c M的遗传图谱,用基于完备区间作图法的QTL Ici Mapping V3.2软件对16个性状进行QTL定位分析。【结果】3种环境下共检测到56个QTL,分布在第1、2、3、4、5、6、7、9和10染色体上,单个性状QTL数为1-10个,单个QTL可解释的各自性状表型贡献率为8.88%-35.30%。其中,氮、磷、钾利用效率QTLs数分别为12个、27个和17个。而q TNA-1a、q TPA-1、q PHI-1、q PHI-6、q PHI-7b和q KHI-6共6个QTL在冷害和正常环境下均能检测到,稳定性较高,其贡献率变幅为10.63%-31.57%。在第1、3、4、5、6、7和10染色体上有13个标记区域存在QTL成族分布,单个QTL位点控制的性状数为2-5个,其中共同控制磷总吸收量、磷素干物质生产效率、磷素收获指数、每100 kg籽粒需钾量和钾素收获指数等性状的位点数最多。【结论】获得56个影响氮、磷、钾利用相关性状的QTL,且发现的13个QTL富集区可作为水稻氮、磷、钾高效利用分子育种的重要候选区域。
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关键词
水稻(Oryza
SATIVA
L.)
近等基因系
养分吸收
数量性状基因座
QTL多效性
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职称材料
马铃薯Y病毒云南昭通烟草分离物的检测及年度间差异比较
被引量：
4
2
作者
卢训
丁铭
+4 位作者
方琦
黄韡
游堂贵
秦西云
张仲凯
《植物保护》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第3期56-60,共5页
利用DAS-ELISA检测试剂盒检测昭通烟草脉斑病样品,结果表明存在马铃薯Y病毒O株系和马铃薯Y病毒N株系两个不同株系病毒。利用Sprimer和M4引物扩增、克隆、测序,得到长度为1 771bp目的片段,该片段包含病毒的外壳蛋白基因序列、3′UTR序列...
利用DAS-ELISA检测试剂盒检测昭通烟草脉斑病样品,结果表明存在马铃薯Y病毒O株系和马铃薯Y病毒N株系两个不同株系病毒。利用Sprimer和M4引物扩增、克隆、测序,得到长度为1 771bp目的片段,该片段包含病毒的外壳蛋白基因序列、3′UTR序列以及部分Nib基因序列;序列分析表明与湖南HN-2分离物(GenBankNo.GQ200836)和美国NE-11分离物(GenBank No.DQ157180)核苷酸序列相似性均为98%,系统进化分析表明其具有较近的亲缘关系。
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关键词
马铃薯Y病毒
检测
变异分析
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职称材料
小RNA深度测序鉴定昭通市烟草脉斑病病毒
被引量：
4
3
作者
陶永萍
尹跃艳
+5 位作者
陈旭
卢训
李婷婷
赵声春
游堂贵
丁铭
《植物保护》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第2期69-74,共6页
烟草脉斑病在云南昭通市的烟草上发生危害严重,为明确昭通市烟草脉斑病的病毒种类,本研究采集昭通市的4个烟草种植区症状表现为疑似烟草脉斑病的烟草样品,采用小RNA深度测序技术对不同来源的混合样品进行小RNA测序分析。结果显示混合样...
烟草脉斑病在云南昭通市的烟草上发生危害严重,为明确昭通市烟草脉斑病的病毒种类,本研究采集昭通市的4个烟草种植区症状表现为疑似烟草脉斑病的烟草样品,采用小RNA深度测序技术对不同来源的混合样品进行小RNA测序分析。结果显示混合样品中的病毒分别属于烟草花叶病毒属Tobamovirus、马铃薯Y病毒属Potyvirus和马铃薯卷叶病毒属Polerovirus。根据不同病毒属设计通用引物,分别对不同地区的烟草样品进行RT-PCR验证,结果表明,烟草样品中病毒种类有烟草花叶病毒、烟草脉带花叶病毒、烟草脉扭病毒和马铃薯Y病毒的PVYN、PVYN-Wi和PVYNTN株系。
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关键词
烟草脉斑病
烟草病毒
小RNA深度测序
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职称材料
题名
不同生长环境下水稻氮、磷、钾利用相关性状的QTL定位分析
被引量：
6
1
作者
杨树明
曾亚文
王荔
杜娟
普晓英
杨涛
机构
云南省
农业
科学院生物技术
与种质
资源
研究所
农业部西南农业基因资源与种质创制重点实验室
云南省
农业
生物技术
重点
实验室
云南
农业
大学农学与生物技术学院
出处
《植物营养与肥料学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第4期823-835,共13页
基金
云南省技术创新人才培养项目(2011CI059和2012HB050)
云南省科技惠民计划项目(2014RA060)资助
文摘
【目的】鉴定影响水稻氮、磷、钾利用相关性状的QTL,为开展水稻养分高效利用分子标记辅助选择育种和肥高效基因的图位克隆提供依据。【方法】以云南强耐冷（2级）粳稻地方品种丽江新团黑谷与十和田杂交、回交获包含105个株系的孕穗期耐冷性近等基因系BC4F8及双亲为材料,在云南白邑（冷水胁迫）、寻甸（自然低温胁迫）和玉溪（正常生长环境）3种生长环境下进行水稻氮、磷、钾养分吸收相关性状的鉴定,并利用构建的含有180个SSR标记,全长为1820.6 c M,标记间平均距离为15.67 c M的遗传图谱,用基于完备区间作图法的QTL Ici Mapping V3.2软件对16个性状进行QTL定位分析。【结果】3种环境下共检测到56个QTL,分布在第1、2、3、4、5、6、7、9和10染色体上,单个性状QTL数为1-10个,单个QTL可解释的各自性状表型贡献率为8.88%-35.30%。其中,氮、磷、钾利用效率QTLs数分别为12个、27个和17个。而q TNA-1a、q TPA-1、q PHI-1、q PHI-6、q PHI-7b和q KHI-6共6个QTL在冷害和正常环境下均能检测到,稳定性较高,其贡献率变幅为10.63%-31.57%。在第1、3、4、5、6、7和10染色体上有13个标记区域存在QTL成族分布,单个QTL位点控制的性状数为2-5个,其中共同控制磷总吸收量、磷素干物质生产效率、磷素收获指数、每100 kg籽粒需钾量和钾素收获指数等性状的位点数最多。【结论】获得56个影响氮、磷、钾利用相关性状的QTL,且发现的13个QTL富集区可作为水稻氮、磷、钾高效利用分子育种的重要候选区域。
关键词
水稻(Oryza
SATIVA
L.)
近等基因系
养分吸收
数量性状基因座
QTL多效性
Keywords
rice（Oryza sativa L.）
near-isogenic lines
nutrient uptake
quantitative trait locus
QTL pleiotropy
分类号
S511 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
马铃薯Y病毒云南昭通烟草分离物的检测及年度间差异比较
被引量：
4
2
作者
卢训
丁铭
方琦
黄韡
游堂贵
秦西云
张仲凯
机构
云南省
农业
科学院生物技术
与种质
资源
研究所云南省
农业
生物技术
重点
实验室
农业部西南农业基因资源与种质创制重点实验室
云南省烟草公司昭通市公司
云南省烟草
农业
科学研究院
出处
《植物保护》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第3期56-60,共5页
基金
云南省烟草公司科技计划项目(09YN034
2010YN19)
中国烟草总公司重点科技项目(110200902066)
文摘
利用DAS-ELISA检测试剂盒检测昭通烟草脉斑病样品,结果表明存在马铃薯Y病毒O株系和马铃薯Y病毒N株系两个不同株系病毒。利用Sprimer和M4引物扩增、克隆、测序,得到长度为1 771bp目的片段,该片段包含病毒的外壳蛋白基因序列、3′UTR序列以及部分Nib基因序列;序列分析表明与湖南HN-2分离物(GenBankNo.GQ200836)和美国NE-11分离物(GenBank No.DQ157180)核苷酸序列相似性均为98%,系统进化分析表明其具有较近的亲缘关系。
关键词
马铃薯Y病毒
检测
变异分析
Keywords
PVY
detection
variation analysis
分类号
S432.41 [农业科学—植物病理学]
S572 [农业科学—烟草工业]
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职称材料
题名
小RNA深度测序鉴定昭通市烟草脉斑病病毒
被引量：
4
3
作者
陶永萍
尹跃艳
陈旭
卢训
李婷婷
赵声春
游堂贵
丁铭
机构
云南省烟草公司昭通市公司
云南省
农业
科学院生物技术
与种质
资源
研究所
出处
《植物保护》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第2期69-74,共6页
基金
中国烟草总公司云南省公司科技计划项目(2015YN21)
文摘
烟草脉斑病在云南昭通市的烟草上发生危害严重,为明确昭通市烟草脉斑病的病毒种类,本研究采集昭通市的4个烟草种植区症状表现为疑似烟草脉斑病的烟草样品,采用小RNA深度测序技术对不同来源的混合样品进行小RNA测序分析。结果显示混合样品中的病毒分别属于烟草花叶病毒属Tobamovirus、马铃薯Y病毒属Potyvirus和马铃薯卷叶病毒属Polerovirus。根据不同病毒属设计通用引物,分别对不同地区的烟草样品进行RT-PCR验证,结果表明,烟草样品中病毒种类有烟草花叶病毒、烟草脉带花叶病毒、烟草脉扭病毒和马铃薯Y病毒的PVYN、PVYN-Wi和PVYNTN株系。
关键词
烟草脉斑病
烟草病毒
小RNA深度测序
Keywords
tobacco vein spot disease
tobacco virus
siRNA sequencing
分类号
S432.41 [农业科学—植物病理学]
在线阅读
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
不同生长环境下水稻氮、磷、钾利用相关性状的QTL定位分析
杨树明
曾亚文
王荔
杜娟
普晓英
杨涛
《植物营养与肥料学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015
6
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
马铃薯Y病毒云南昭通烟草分离物的检测及年度间差异比较
卢训
丁铭
方琦
黄韡
游堂贵
秦西云
张仲凯
《植物保护》
CAS
CSCD
北大核心
2013
4
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
小RNA深度测序鉴定昭通市烟草脉斑病病毒
陶永萍
尹跃艳
陈旭
卢训
李婷婷
赵声春
游堂贵
丁铭
《植物保护》
CAS
CSCD
北大核心
2018
4
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职称材料
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