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我国沿海棘头梅童鱼(Collichthys lucidus)群体遗传结构的AFLP分析
被引量：
13
1
作者
郑德锋
赵金良
+1 位作者
周文玉
严骏骢
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第3期443-447,共5页
利用AFLP技术分析了我国沿海棘头梅童鱼8个地理群体(山东荣成、江苏南通、启东、上海芦潮港、浙江温州、瑞安、福建福州和广州番禺)的遗传结构特征。10对引物组合在8个群体160尾个体中共扩增出272个位点,多态位点72个,多态位点比例为26....
利用AFLP技术分析了我国沿海棘头梅童鱼8个地理群体(山东荣成、江苏南通、启东、上海芦潮港、浙江温州、瑞安、福建福州和广州番禺)的遗传结构特征。10对引物组合在8个群体160尾个体中共扩增出272个位点,多态位点72个,多态位点比例为26.47%。8个地理群体的多态位点比例、Nei遗传多样性指数分别为8.82%—15.07%、0.0291—0.0514,表明棘头梅童鱼群体遗传多样性水平较低。AMOVA分析表明,群体间差异对群体遗传总变异的贡献率为47.91%,群体内差异的贡献率为52.09%。8个群体间的遗传分化指数(Fst)为0.1151—0.5995(P<0.05),存在显著分化。聚类分析表明,荣成与南通群体聚为一支,启东、芦潮港、瑞安群体聚为一支,温州、福州和番禺群体聚为一支。我国沿海棘头梅童鱼群体初步呈现南北分化的格局,但不同类群间尚存在交叉分布。
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关键词
棘头梅童鱼
群体
遗传结构
AFLP
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职称材料
棘头梅童鱼线粒体控制区的序列变异与群体遗传结构
被引量：
12
2
作者
郑德锋
赵金良
周文玉
《渔业科学进展》
CSCD
北大核心
2011年第2期34-40,共7页
采用PCR扩增测序法获得了棘头梅童鱼Collichtysiucidus南通、启东、芦潮港、温州、瑞安、福州、番禺7个地理群体53尾鱼的mtDNA控制区全序列。棘头梅童鱼控制区序列长度为778～782bp,序列长度变异主要是由位点的插入或缺失造成,识别了终...
采用PCR扩增测序法获得了棘头梅童鱼Collichtysiucidus南通、启东、芦潮港、温州、瑞安、福州、番禺7个地理群体53尾鱼的mtDNA控制区全序列。棘头梅童鱼控制区序列长度为778～782bp,序列长度变异主要是由位点的插入或缺失造成,识别了终止序列区TAS和保守序列区CSB1、CSB2、CSB3序列。共检测到多态位点66个,占全部序列的8.44%,检测到单倍型33种,平均单倍型多样性(Hd)为0.9347±0.0175,平均核苷酸多样性(π)为0.0175±0.0023。棘头梅童鱼群体内的遗传距离(K2-P)为0.0017～0.0228,群体间的遗传距离为0.0023～0.0433,群体间的分化指数FST为-0.0584～0.8458,基因流为0.05～19.62。AMOVA分析结果显示,群体间的变异为74.21%,群体内的变异为25.79%(P<0.05),表明群体间发生了显著的遗传分化。以NJ法构建的亲缘关系树显示,棘头梅童鱼7个群体分为两个大支,一支以北方类群(南通、启东、芦潮港、温州群体)个体为主,另一支以南方类群(福州和番禹群体)个体为主,而位于南、北方类群中间位置的瑞安群体则与两大类群均有交叉。
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关键词
棘头梅童鱼
群体遗传结构
线粒体控制区
序列
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职称材料
题名
我国沿海棘头梅童鱼(Collichthys lucidus)群体遗传结构的AFLP分析
被引量：
13
1
作者
郑德锋
赵金良
周文玉
严骏骢
机构
农业部水产种质资源与利用重点开放实验室上海海洋大学
上海
市
水产
研究所
出处
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第3期443-447,共5页
基金
上海市科技兴农重点攻关项目资助
沪农科攻字(2007)第4-2号
+1 种基金
上海市重点学科建设项目资助
Y1101号
文摘
利用AFLP技术分析了我国沿海棘头梅童鱼8个地理群体(山东荣成、江苏南通、启东、上海芦潮港、浙江温州、瑞安、福建福州和广州番禺)的遗传结构特征。10对引物组合在8个群体160尾个体中共扩增出272个位点,多态位点72个,多态位点比例为26.47%。8个地理群体的多态位点比例、Nei遗传多样性指数分别为8.82%—15.07%、0.0291—0.0514,表明棘头梅童鱼群体遗传多样性水平较低。AMOVA分析表明,群体间差异对群体遗传总变异的贡献率为47.91%,群体内差异的贡献率为52.09%。8个群体间的遗传分化指数(Fst)为0.1151—0.5995(P<0.05),存在显著分化。聚类分析表明,荣成与南通群体聚为一支,启东、芦潮港、瑞安群体聚为一支,温州、福州和番禺群体聚为一支。我国沿海棘头梅童鱼群体初步呈现南北分化的格局,但不同类群间尚存在交叉分布。
关键词
棘头梅童鱼
群体
遗传结构
AFLP
Keywords
Collichthys lucidus, Population, Genetic structure, Amplified fragment length polymorphism （AFLP）
分类号
Q346 [生物学—遗传学]
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职称材料
题名
棘头梅童鱼线粒体控制区的序列变异与群体遗传结构
被引量：
12
2
作者
郑德锋
赵金良
周文玉
机构
农业部水产种质资源与利用重点开放实验室上海海洋大学
上海
市
水产
研究所
出处
《渔业科学进展》
CSCD
北大核心
2011年第2期34-40,共7页
基金
上海市科技兴农重点攻关项目[沪农科攻字(2007)第4-2号]
上海市重点学科建设项目(Y1101)共同资助
文摘
采用PCR扩增测序法获得了棘头梅童鱼Collichtysiucidus南通、启东、芦潮港、温州、瑞安、福州、番禺7个地理群体53尾鱼的mtDNA控制区全序列。棘头梅童鱼控制区序列长度为778～782bp,序列长度变异主要是由位点的插入或缺失造成,识别了终止序列区TAS和保守序列区CSB1、CSB2、CSB3序列。共检测到多态位点66个,占全部序列的8.44%,检测到单倍型33种,平均单倍型多样性(Hd)为0.9347±0.0175,平均核苷酸多样性(π)为0.0175±0.0023。棘头梅童鱼群体内的遗传距离(K2-P)为0.0017～0.0228,群体间的遗传距离为0.0023～0.0433,群体间的分化指数FST为-0.0584～0.8458,基因流为0.05～19.62。AMOVA分析结果显示,群体间的变异为74.21%,群体内的变异为25.79%(P<0.05),表明群体间发生了显著的遗传分化。以NJ法构建的亲缘关系树显示,棘头梅童鱼7个群体分为两个大支,一支以北方类群(南通、启东、芦潮港、温州群体)个体为主,另一支以南方类群(福州和番禹群体)个体为主,而位于南、北方类群中间位置的瑞安群体则与两大类群均有交叉。
关键词
棘头梅童鱼
群体遗传结构
线粒体控制区
序列
Keywords
Collichtys iucidus Population genetic structure mtDNA control region Sequence
分类号
S931.5 [农业科学—渔业资源]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
我国沿海棘头梅童鱼(Collichthys lucidus)群体遗传结构的AFLP分析
郑德锋
赵金良
周文玉
严骏骢
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2011
13
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
棘头梅童鱼线粒体控制区的序列变异与群体遗传结构
郑德锋
赵金良
周文玉
《渔业科学进展》
CSCD
北大核心
2011
12
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