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题名棘头梅童鱼线粒体控制区的序列变异与群体遗传结构
被引量：12
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作者
郑德锋
赵金良
周文玉
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机构
农业部水产种质资源与利用重点开放实验室上海海洋大学
上海市水产研究所
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出处
《渔业科学进展》
CSCD
北大核心
2011年第2期34-40,共7页
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基金
上海市科技兴农重点攻关项目[沪农科攻字(2007)第4-2号]
上海市重点学科建设项目(Y1101)共同资助
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文摘
采用PCR扩增测序法获得了棘头梅童鱼Collichtysiucidus南通、启东、芦潮港、温州、瑞安、福州、番禺7个地理群体53尾鱼的mtDNA控制区全序列。棘头梅童鱼控制区序列长度为778～782bp,序列长度变异主要是由位点的插入或缺失造成,识别了终止序列区TAS和保守序列区CSB1、CSB2、CSB3序列。共检测到多态位点66个,占全部序列的8.44%,检测到单倍型33种,平均单倍型多样性(Hd)为0.9347±0.0175,平均核苷酸多样性(π)为0.0175±0.0023。棘头梅童鱼群体内的遗传距离(K2-P)为0.0017～0.0228,群体间的遗传距离为0.0023～0.0433,群体间的分化指数FST为-0.0584～0.8458,基因流为0.05～19.62。AMOVA分析结果显示,群体间的变异为74.21%,群体内的变异为25.79%(P<0.05),表明群体间发生了显著的遗传分化。以NJ法构建的亲缘关系树显示,棘头梅童鱼7个群体分为两个大支,一支以北方类群(南通、启东、芦潮港、温州群体)个体为主,另一支以南方类群(福州和番禹群体)个体为主,而位于南、北方类群中间位置的瑞安群体则与两大类群均有交叉。
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关键词
棘头梅童鱼
群体遗传结构
线粒体控制区
序列
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Keywords
Collichtys iucidus Population genetic structure mtDNA control region Sequence
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分类号
S931.5
[农业科学—渔业资源]
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