免耕水稻土固定CO2自养微生物多样性 被引量：16

1

作者 钱明媚 肖永良 +1 位作者 彭文涛 曹慧 《中国环境科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2015年第12期3754-3761,共8页

使用^(13)CO_2为标记物,采用稳定性同位素核酸探针(DNA-SIP)技术和微宇宙模拟的方法,对两种南方免耕水稻土中的固定CO_2自养微生物群落结构和多样性进行了研究.实验结果表明,经80d的培养后,从^(13)CO_2标记处理的士样提取的DNA经氯化铯... 使用^(13)CO_2为标记物,采用稳定性同位素核酸探针(DNA-SIP)技术和微宇宙模拟的方法,对两种南方免耕水稻土中的固定CO_2自养微生物群落结构和多样性进行了研究.实验结果表明,经80d的培养后,从^(13)CO_2标记处理的士样提取的DNA经氯化铯密度梯度离心后其浮力密度显著区分于^(12)CO_2对照组表明土壤样品中的固定CO_2自养微生物对CO_2具有同化利用.RT-PCR结果表明两种标记土样DNA密度梯度离心分层的cbbLR基因的拷贝数最高分别为1.36×10~5拷贝/g干土和2.21×10~5拷贝/g干土.克隆文库分析和系统发育分析表明两种土壤中的固定CO_2自养微生物群落结构具有一定差异Bradyrhizobium和Rubriviv二是为FG土壤中的主要类群,占全部克隆数的60.40%和13.86%.而TF土壤的主要类群是Rhodopseudomonas,Rhodospirillum,Methylibium和Variovorax,分别占全部克隆数的20.90%、11.94%,16.42%和10.45%.两种^(13)CO_2标记土样的cbbLR基因文库OTU类型、多样性指数均高于^(12)CO_2对照文库,其群落结构也有明显的变化.因此,免耕水稻土存在高度多样性的二氧化碳固定自养微生物,在农田土壤碳素循环方面具有重要作用. 展开更多

关键词 固碳微生物 免耕水稻土 CBB LR基因 DNA-SIP PCR-RFLP分析

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家鸽粪便细菌多样性的高通量测序分析及其环境意义 被引量：8

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作者 李传海 尚健 +2 位作者 聂文芳 李立峰 曹慧 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第1期116-122,共7页

[目的]研究家鸽粪便细菌群落组成与结构特征,明确鸽粪中病原微生物主要类群,探究鸽粪微生物多样性与环境风险之间的关系。[方法]以规模化养殖场家鸽粪便为试验材料,采用Illumina Mi Seq高通量测序方法分析了3个养殖场鸽粪(HP、WB和HH)细... [目的]研究家鸽粪便细菌群落组成与结构特征,明确鸽粪中病原微生物主要类群,探究鸽粪微生物多样性与环境风险之间的关系。[方法]以规模化养殖场家鸽粪便为试验材料,采用Illumina Mi Seq高通量测序方法分析了3个养殖场鸽粪(HP、WB和HH)细菌16S rDNA(V3V4)多样性及其环境意义。[结果]3个鸽粪样品共获得大约12万条有效序列,在Cutoff值为0.03水平上进行可操作分类单元(operational taxonomic unit,OTU)归类,HP、WB、HH分别有4 215、3 672和2 446个OTU类型,Shannon指数为5.00~6.17;VEN图比较分析表明,3个鸽粪样品中微生物种群组成较为一致,细菌共有13个门、31个纲、55个目、101个科和164个属,以拟杆菌门(Bacteroidetes)、变形菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)为主,覆盖了92%以上的物种数。优势菌属为Myroides、Pseudomonas、Sphingobacterium、Sporosarcina、Erysipelothrix、Oceanisphaer,约占总类群的48.5%~54.6%,且鸽粪中存在18.1%细菌16S rDNA序列未能归类。鸽粪中存在大量的好氧微生物,约占总类群的52%,然而,仅有11%的厌氧微生物。此外,发现鸽粪中含有Myroides、Sphingobacterium、Pseudomonas、Erysipelothrix、Acinetobacter 5种致病性微生物菌属。[结论]鸽粪中存在高度丰富的微生物多样性,有一定的传播禽类病原微生物的环境风险。 展开更多

关键词 鸽粪 高通量钡4序 细菌多样性 致病性细菌

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罗尔斯顿菌(Ralstonia sp.)T6对三氯吡啶醇污染土壤的修复及能完全矿化毒死蜱工程菌株的构建 被引量：3

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作者 张扬 王飞 +1 位作者 黄彦 崔中利 《生态与农村环境学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第6期761-767,共7页

以毒死蜱降解中间代谢产物3，5，6－三氯－2－吡啶醇（TCP）高效降解菌罗尔斯顿菌（Ralstonia sp．）T6为材料，研究其在土壤中对TCP的降解特性。结果表明，温度、接菌量和初始底物浓度对TCP的降解都有影响，T6菌株降解TCP的最适温度为3... 以毒死蜱降解中间代谢产物3，5，6－三氯－2－吡啶醇（TCP）高效降解菌罗尔斯顿菌（Ralstonia sp．）T6为材料，研究其在土壤中对TCP的降解特性。结果表明，温度、接菌量和初始底物浓度对TCP的降解都有影响，T6菌株降解TCP的最适温度为30℃，当土壤含菌量〔以菌落形成单位（CFU）计〕小于10×10^8 kg－1时，降解率随着含菌量的增加而提高，当含菌量超过10×10^8 kg－1时，降解率不再提高。降解率随着TCP 初始浓度的增加而降低，当TCP初始浓度为50～100 mg·kg－1时，6 d内可将50 mg·kg－1 TCP降解80％。利用基因工程手段，将来源于寡养单胞菌（ Stenotrophomonas sp．） DSP－1的甲基对硫磷水解酶基因（ mpd）插入菌株T6基因组16S rRNA基因中，成功构建一株可彻底矿化毒死蜱的重组工程菌株T6－mpd。生长试验结果表明罗尔斯顿菌T6－mpd和T6的生长特性基本一致。对T6－mpd菌株降解毒死蜱的特性研究结果表明，在LB培养基中， T6－mpd对毒死蜱的水解效率与DSP－1基本一致，但在基础盐（MSM）培养基中，T6－mpd在60 h内对50 mg·L－1毒死蜱的降解率仅为36％，显著低于DSP－1。模拟土壤原位修复试验结果表明，在含菌量为10^8 kg－1条件下，T6－mpd在2 d内可将50 mg·kg－1毒死蜱降解64％。认为T6－mpd菌株在毒死蜱残留污染环境修复中具有潜在的应用前景。 展开更多

关键词 毒死蜱 3 5 6-三氯-2-吡啶醇 修复 工程菌株

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我国冬小麦主产省小麦茎基腐镰孢菌的组成及其致病力 被引量：49

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作者 张向向 孙海燕 +4 位作者 李伟 邓渊钰 张爱香 于汉寿 陈怀谷 《麦类作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第2期272-278,共7页

为了解我国小麦茎基腐病的致病菌镰孢菌(Fusariumspp.)的组成,2009-2012年从江苏、安徽、河南、河北、山东等5个冬小麦主产省采集茎基腐病样本,从中分离了135个镰孢菌菌株,用PCR-RFLP和ITS序列分析的方法进行了种群鉴定,并分别在温室和... 为了解我国小麦茎基腐病的致病菌镰孢菌(Fusariumspp.)的组成,2009-2012年从江苏、安徽、河南、河北、山东等5个冬小麦主产省采集茎基腐病样本,从中分离了135个镰孢菌菌株,用PCR-RFLP和ITS序列分析的方法进行了种群鉴定,并分别在温室和田间条件下对不同种群及化学型菌株进行致病力测定。结果表明,在分离的135株病菌中,103株为F.asiaticum,17株为F.graminearum,其余为F.acuminatum、F.pseudoraminearum和F.avenaceum,说明引起我国小麦茎基腐的镰孢菌主要由F.asiaticum和F.graminearum组成,且以F.asiaticum种群分布为主。在120个镰孢菌综合物种菌株(F.asiaticum和F.graminearum)中,79株为3-AcDON化学型,17株为15-AcDON化学型,24株为NIV化学型。在F.graminearum菌株中只发现15-AcDON化学型;在F.asiaticum菌株中存在2种化学型,以3-AcDON化学型菌株为主,少部分为NIV化学型菌株。F.asiaticum种群致病力略高于F.graminearum种群,DON化学型菌株致病力略高于NIV化学型菌株,但均无显著性差异。 展开更多

关键词 小麦茎基腐 禾谷镰孢菌 种群结构 毒素类型 致病力

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小麦茎基褐腐病病原菌组成及其致病力研究 被引量：47

5

作者 李伟 陈莹 +3 位作者 张晓祥 张伯桥 于汉寿 陈怀谷 《麦类作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期170-175,共6页

为明确小麦茎基褐腐病(brown foot rot)病原菌的组成,于2008-2009年春从江苏、安徽、河南、湖北、河北和四川6省48个县市的65个地点采集了具有茎基褐腐症状的病株,并分离到110株病原真菌。根据其培养性状、形态学特征以及分子生物学鉴定... 为明确小麦茎基褐腐病(brown foot rot)病原菌的组成,于2008-2009年春从江苏、安徽、河南、湖北、河北和四川6省48个县市的65个地点采集了具有茎基褐腐症状的病株,并分离到110株病原真菌。根据其培养性状、形态学特征以及分子生物学鉴定,可将这些病原菌分为4类,分别为小麦根腐离蠕孢(Bipo-laris sorokiniana,41株)、镰孢菌(Fusariumspp.,33株)、雪霉叶枯病菌(Microdochium nivale,24株)和黑附球菌(Epicoccum nigrum,12株)。对这些菌株在小麦苗期的致病力及重新分离得率的测定结果表明,4类病原菌之间的致病力存在明显差异,其中以小麦根腐离蠕孢(B.sorokiniana)发病率和致病力最强,其次是镰孢菌(Fusariumspp.),雪霉叶枯病菌(M.nivale)和黑附球菌(E.nigrum)则相对较弱;病菌的重新分离得率与其致病力呈正相关。 展开更多

关键词 小麦茎基褐腐病 病原组成 致病力

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两株降解菌对阿特拉津污染土壤的修复效果研究 被引量：24

6

作者 胡江 代先祝 李顺鹏 《土壤学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期323-327,共5页

关键词 阿特拉津 甘蔗田 除草剂 高粱 玉米 防除 污染土壤 降解菌 地下水 莠去津

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中国北纬33度地区小麦纹枯病菌的群体组成及致病力研究 被引量：15

7

作者 陈莹 李伟 +3 位作者 张晓祥 张伯桥 于汉寿 陈怀谷 《麦类作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第6期1110-1114,共5页

为明确中国北纬33度地区小麦纹枯病病原菌的组成和致病力,对分离自江苏、安徽、河南、湖北4省的157株丝核菌,通过Hoechst 33258荧光染色法进行细胞核数量观测,利用菌丝融合的方法测定其所属融合群,并测定了其中111株丝核菌株对3个小麦品... 为明确中国北纬33度地区小麦纹枯病病原菌的组成和致病力,对分离自江苏、安徽、河南、湖北4省的157株丝核菌,通过Hoechst 33258荧光染色法进行细胞核数量观测,利用菌丝融合的方法测定其所属融合群,并测定了其中111株丝核菌株对3个小麦品种(CI12633、陕229、扬麦158)麦苗的致病力。结果表明,在供试菌株中,150株为双核丝核菌,占95.54%,都属于AG-D融合群;7株为多核丝核菌,占4.46%,其中3株属于AG-1-IB融合群,3株属于AG11融合群,1株属于AG5融合群。供试菌株的致病力存在明显差异,双核丝核菌的致病力显著高于多核丝核菌,AG-D融合群中两种不同融合频率的菌株致病力无明显差异。不同地区的菌株间致病力无明显差异,菌株对3个小麦品种的致病力有显著差异,对CI12633致病力最强,对陕229致病力最弱,对扬麦158的致病力居中。 展开更多

关键词 小麦 丝核菌 纹枯病 群体组成 致病力

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耐盐降解性菌株A1(Arthrobactersp.A1)的渗透调节 被引量：1

8

作者 何健 洪青 +3 位作者 李顺鹏 崔中利 顾向阳 刘智 《土壤学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第2期301-305,共5页

菌株A1 (Arthrobactersp .A1 )分离自降解含盐 (NaCl浓度为 0 .77molL- 1)苯乙酸生产污水的活性污泥。该菌株能在NaCl浓度为 0 .1molL- 1～ 2 .0molL- 1,以苯乙酸为惟一碳源的基础培养基中生长。在不同的NaCl浓度下 ,菌株A1细胞内的QAC(... 菌株A1 (Arthrobactersp .A1 )分离自降解含盐 (NaCl浓度为 0 .77molL- 1)苯乙酸生产污水的活性污泥。该菌株能在NaCl浓度为 0 .1molL- 1～ 2 .0molL- 1,以苯乙酸为惟一碳源的基础培养基中生长。在不同的NaCl浓度下 ,菌株A1细胞内的QAC(Quaternaryammoniumcompounds)、游离谷氨酸和K+含量与盐浓度的升高成正相关。在盐激条件下 ,菌株A1细胞内的QAC、游离谷氨酸和K+含量急剧增加 ,当外界的盐浓度突然从 0 .1molL- 1增加到 1 .0molL- 1时 ,其细胞内的QAC和游离谷氨酸含量在 40分钟内分别增加了 4.9倍和 2 .1倍。 展开更多

关键词 QAC 游离谷氨酸 K^+ 环境微生物学 耐盐降解性菌株 A1 ARTHROBACTER sp.Al 渗透调节

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Delftia sp.T3-6酰胺水解酶DamH晶体制备及X-射线衍射分析 被引量：1

9

作者 王飞 张碧滢 +3 位作者 赵晓艳 王秀玲 吴晓玉 崔中利 《江西农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第6期1154-1160,共7页

Dam H是菌株Delftia sp.T3-6产生的具有酯键水解活性的酰胺酶,对其原核表达、纯化、结晶条件及蛋白晶体X-射线衍射条件进行了研究。经过原核表达,采用Ni-NTA亲和层析法和透析法纯化蛋白,成功获得了适合晶体生长的蛋白Dam H。289 K下采... Dam H是菌株Delftia sp.T3-6产生的具有酯键水解活性的酰胺酶,对其原核表达、纯化、结晶条件及蛋白晶体X-射线衍射条件进行了研究。经过原核表达,采用Ni-NTA亲和层析法和透析法纯化蛋白,成功获得了适合晶体生长的蛋白Dam H。289 K下采用座滴气相扩散法进行晶体筛选和制备,在蛋白浓度为15 mg/m L及含有0.2 mol/L乙酸铵,pH 7.1,21%(W/V)聚乙二醇3350的缓冲液中获得了理想的蛋白晶体。在低温100 K下通过X-射线衍射仪(Rigaku Micro Max-007 HF)收集了晶体衍射数据。晶体衍射分辨率为3.4,空间群为三斜晶系P1,晶胞参数为a=14.1,b=23.9,c=85.7,α=112.6°,β=77.2°,γ=89.1°。结晶条件的优化和晶体制备为Delftia sp.T3-6 Dam H高分辨率晶体制备提供了参考,晶体衍射数据的收集为Dam H三维结构的解析奠定了前期基础,将有助于阐明Dam H的催化机制。 展开更多

关键词 酰胺水解酶 纯化 结晶条件优化 X-射线衍射

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长期保护性耕作对纤维素降解基因cbh Ⅰ多样性的影响 被引量：5

10

作者 陈坤 李传海 +3 位作者 朱安宁 彭文涛 钱明媚 曹慧 《土壤学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期406-414,共9页

研究了免耕秸秆覆盖（CntWntS）、耕作秸秆覆盖（CntWtS）、免耕秸秆不覆盖（CntWnt）和耕作秸秆不覆盖（CntWt）四种保护性耕作措施对黄淮海平原典型潮土中纤维素降解菌多样性的影响。采用PCRRFLP技术分别对纤维素降解菌cbh I基因进行... 研究了免耕秸秆覆盖（CntWntS）、耕作秸秆覆盖（CntWtS）、免耕秸秆不覆盖（CntWnt）和耕作秸秆不覆盖（CntWt）四种保护性耕作措施对黄淮海平原典型潮土中纤维素降解菌多样性的影响。采用PCRRFLP技术分别对纤维素降解菌cbh I基因进行多样性分析。结果表明,CntWntS与CntWnt相比,纤维素降解菌的数量增加了148%,而CntWtS与CntWt相比,纤维素降解菌的数量也增加了130%。纤维素降解菌cbh I基因分型在四个处理小区比较丰富,共有44个OTUs,其中CntWntS、CntWtS、CntWnt、CntWt处理中分别有35、34、30、30个OTUs。多样性指数分析显示,Shannon-Wiener指数的数值范围为3.09~3.36。系统发育分析表明,文库中的纤维素降解菌分别属于Basidiomycota（担子菌门）和Ascomycota（子囊菌门）,同时发现土壤中存在大量的未培养纤维素降解菌。因此,免耕和秸秆覆盖等保护性耕作能够明显提高土壤中纤维素降解菌数量和cbh I基因多样性。 展开更多

关键词 保护性耕作 纤维素降解菌 cbh Ⅰ基因多样性 PCR-RFLP分析

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小麦全蚀病菌致病力测定及品种抗病性研究 被引量：6

11

作者 王宁 冯彦霞 +2 位作者 杜文珍 王莹 陈怀谷 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第3期478-483,共6页

近年来,小麦全蚀病在我国黄淮麦区的发生呈上升趋势,为了解该病菌的致病力及目前推广品种的抗病性,本研究比较了全蚀病菌致病力的3种接种测定方法和2种病情分级标准,结果表明以蛭石为培养基质、麦种下2cm接种菌丝块和0～6级的分级标准,... 近年来,小麦全蚀病在我国黄淮麦区的发生呈上升趋势,为了解该病菌的致病力及目前推广品种的抗病性,本研究比较了全蚀病菌致病力的3种接种测定方法和2种病情分级标准,结果表明以蛭石为培养基质、麦种下2cm接种菌丝块和0～6级的分级标准,可比较有效和准确地测定小麦全蚀病菌的致病力。对2010年分离自黄淮麦区河南、江苏、安徽、山东4省10地的52株小麦全蚀病菌进行了致病力测定,结果表明供试菌株的致病力存在明显差异。选取致病性较强的菌株G1037,对69个常用小麦品种进行了苗期抗全蚀病鉴定,结果表明供试小麦品种对全蚀病的抗性水平普遍较低,没有发现免疫和高抗的品种,泛麦5号和太空6号具有较强的抗(耐)性。 展开更多

关键词 小麦 小麦全蚀病 致病力测定 品种抗性

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耕作方式和秸杆还田对纤维素降解细菌多样性的影响 被引量：4

12

作者 景音娟 李传海 +3 位作者 朱安宁 邹芳 肖永良 曹慧 《土壤学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期1027-1036,共10页

免耕和秸秆还田是培肥地力的重要措施,明确其对土壤纤维素降解细菌群落的影响对于土壤质量提升具有重要意义。选择中国科学院封丘农业生态国家试验站耕作秸秆还田(WtS)、免耕秸秆还田(WntS)、耕作秸秆不还田(Wt)和免耕秸秆不还田(Wnt)4... 免耕和秸秆还田是培肥地力的重要措施,明确其对土壤纤维素降解细菌群落的影响对于土壤质量提升具有重要意义。选择中国科学院封丘农业生态国家试验站耕作秸秆还田(WtS)、免耕秸秆还田(WntS)、耕作秸秆不还田(Wt)和免耕秸秆不还田(Wnt)4种处理小区并采集土壤样品,用CMC-Na刚果红培养基对纤维素降解细菌计数,采用PCR-RFLP技术研究保护性耕作和秸秆还田对纤维素降解细菌群落的影响。结果表明,秸秆还田与免耕处理均不同程度提高了纤维素降解细菌数量。WtS、WntS、Wt和Wnt4个纤维素降解细菌基因文库中,OTUs数量分别为23、26、20和19个,秸秆还田加免耕处理多样性指数最高。本文获得的纤维素降解细菌共属于11个属,秸秆还田土壤中Streptomycetaceae、Flavobacterium、Sphingobium相对丰度明显多于秸秆不还田处理土壤;免耕处理土壤中Pseudomonas、Phyllobacterium、Paenibacillus、Promicromonosporaceae、Sphingobacterium相对丰度明显高于耕作处理土壤。典范对应分析显示四种处理纤维素降解细菌群落结构发生了较大变化,p H、全磷、有机碳和全钾与免耕处理呈显著正相关性,全氮、碱解氮、速效钾、速效磷和有机碳与秸秆还田处理呈显著正相关性。免耕和秸秆还田能提高土壤中纤维素降解细菌数量及多样性,改变纤维素降解细菌群落结构。 展开更多

关键词 免耕 秸秆还田 纤维素降解细菌 多样性 PCR-RFLP

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