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淮南猪肌肉组织不同发育阶段的甲基化差异基因筛选
1
作者
陈俊峰
王璟
+4 位作者
靳玮
柴进
张家庆
任巧玲
邢宝松
《华中农业大学学报》
北大核心
2025年第1期183-190,共8页
为进一步开展淮南猪分子选育,提升其生长速度和瘦肉率等经济性状,选取淮南猪胚胎期(days post coitus, dpc)第38、58、78天和出生后第21天4个发育阶段的淮南公猪背最长肌,开展全基因组甲基化测序并通过信号通路富集分析筛选调控肌肉发...
为进一步开展淮南猪分子选育,提升其生长速度和瘦肉率等经济性状,选取淮南猪胚胎期(days post coitus, dpc)第38、58、78天和出生后第21天4个发育阶段的淮南公猪背最长肌,开展全基因组甲基化测序并通过信号通路富集分析筛选调控肌肉发育的甲基化差异的候选基因。结果显示,基因主体的CpG甲基化程度高于基因上下游2 kb序列的CpG甲基化,基因组元件中内含子、3'UTR和重复序列等甲基化程度最高。随着发育时间的增加,基因主体的CpG甲基化水平逐渐下降,上下游2 kb则是下降-上升-下降趋势。基因组元件中内含子区、3'UTR区和重复序列的甲基化水平都逐渐下降,启动子区则为下降-上升-下降趋势。信号通路富集分析显示,在淮南猪相邻的发育阶段38~58 dpc、58~78 dpc、78 dpc~21 d三者间的差异化均达到极显著水平,黏着斑信号通路存在CpG甲基化差异基因,且达到极显著水平(P值分别为0.000 9、0.000 4、0.000 1),细胞黏附连接信号通路存在CHH甲基化差异基因,且分别达到显著或极显著水平(P值分别为0.013 2、0.012 8、0.000 5),生物信息学分析结果显示,在2个信号通路中筛选到辅肌动蛋白Α4基因(actinin-4, ACTN4)和成纤维细胞生长因子受体(fibroblast growth factor receptor, FGFR1)基因。ACTN4基因调节肌动蛋白结合过程,在4个发育阶段的甲基化水平分别为55.75%、11.18%、10.18%、59.75%,FGFR1基因和肌肉细胞分化相关,在4个发育阶段的甲基化水平分别为0.81%、0.78%、7.52%、0.44%。以上结果表明,在淮南猪肌肉组织不同发育阶段筛选到的2个甲基化差异基因ACTN4和FGFR1可作为淮南猪肌肉发育候选基因进行分子育种。
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关键词
淮南猪
甲基化
差异基因
肌肉组织
肌肉发育
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职称材料
一体化模式在湖北奶业发展中的重要性
被引量：
2
2
作者
滑国华
王贵强
+7 位作者
张燊
邵宝顺
万建中
梁爱心
郭妮妮
秦则平
吴喜娟
杨利国
《中国奶牛》
2018年第1期61-63,共3页
近几年,中国奶业发展遭遇瓶颈,奶业发展模式陈旧弊端逐渐显露。传统的奶牛养殖模式各环节严重脱节,加之自然灾害和"三区"划定等客观因素,加剧了湖北省奶业发展困境。在这种形势下,湖北省多家奶牛养殖企业积极探索新的发展模式...
近几年,中国奶业发展遭遇瓶颈,奶业发展模式陈旧弊端逐渐显露。传统的奶牛养殖模式各环节严重脱节,加之自然灾害和"三区"划定等客观因素,加剧了湖北省奶业发展困境。在这种形势下,湖北省多家奶牛养殖企业积极探索新的发展模式,大型奶牛养殖企业采用"种养加一体化"的生产模式,取得了较好的效果,多家中型奶牛养殖企业采用"养殖+奶吧"的发展模式,也提高了养殖经济效益,促进了奶牛养殖企业的发展。
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关键词
奶业
种养加一体化
奶吧
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职称材料
题名
淮南猪肌肉组织不同发育阶段的甲基化差异基因筛选
1
作者
陈俊峰
王璟
靳玮
柴进
张家庆
任巧玲
邢宝松
机构
河南省畜禽繁育及营养调控
重点
实验室
/河南省
农业
科
学院
畜牧兽医研究所
农业
农村部猪
遗传
育种
重点
开放
实验室
/
农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室/华中农业大学动物科技学院
出处
《华中农业大学学报》
北大核心
2025年第1期183-190,共8页
基金
国家重点研发计划项目(2021YFD1301200)
河南省农业科学院科技创新团队项目(2022TD34
2023TD22)。
文摘
为进一步开展淮南猪分子选育,提升其生长速度和瘦肉率等经济性状,选取淮南猪胚胎期(days post coitus, dpc)第38、58、78天和出生后第21天4个发育阶段的淮南公猪背最长肌,开展全基因组甲基化测序并通过信号通路富集分析筛选调控肌肉发育的甲基化差异的候选基因。结果显示,基因主体的CpG甲基化程度高于基因上下游2 kb序列的CpG甲基化,基因组元件中内含子、3'UTR和重复序列等甲基化程度最高。随着发育时间的增加,基因主体的CpG甲基化水平逐渐下降,上下游2 kb则是下降-上升-下降趋势。基因组元件中内含子区、3'UTR区和重复序列的甲基化水平都逐渐下降,启动子区则为下降-上升-下降趋势。信号通路富集分析显示,在淮南猪相邻的发育阶段38~58 dpc、58~78 dpc、78 dpc~21 d三者间的差异化均达到极显著水平,黏着斑信号通路存在CpG甲基化差异基因,且达到极显著水平(P值分别为0.000 9、0.000 4、0.000 1),细胞黏附连接信号通路存在CHH甲基化差异基因,且分别达到显著或极显著水平(P值分别为0.013 2、0.012 8、0.000 5),生物信息学分析结果显示,在2个信号通路中筛选到辅肌动蛋白Α4基因(actinin-4, ACTN4)和成纤维细胞生长因子受体(fibroblast growth factor receptor, FGFR1)基因。ACTN4基因调节肌动蛋白结合过程,在4个发育阶段的甲基化水平分别为55.75%、11.18%、10.18%、59.75%,FGFR1基因和肌肉细胞分化相关,在4个发育阶段的甲基化水平分别为0.81%、0.78%、7.52%、0.44%。以上结果表明,在淮南猪肌肉组织不同发育阶段筛选到的2个甲基化差异基因ACTN4和FGFR1可作为淮南猪肌肉发育候选基因进行分子育种。
关键词
淮南猪
甲基化
差异基因
肌肉组织
肌肉发育
Keywords
Huainan pig
methylation
differential gene
muscle tissue
muscle development
分类号
S828 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
一体化模式在湖北奶业发展中的重要性
被引量：
2
2
作者
滑国华
王贵强
张燊
邵宝顺
万建中
梁爱心
郭妮妮
秦则平
吴喜娟
杨利国
机构
农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室/华中农业大学动物科技学院
水牛繁育与加工湖北省工程研究中心
湖北省畜禽
育种
中心
武汉光明生态示范奶牛场有限公司
出处
《中国奶牛》
2018年第1期61-63,共3页
基金
湖北省现代农业产业技术体系项目和国家现代农业产业技术体系项目(CARS-37)共同资助资助
文摘
近几年,中国奶业发展遭遇瓶颈,奶业发展模式陈旧弊端逐渐显露。传统的奶牛养殖模式各环节严重脱节,加之自然灾害和"三区"划定等客观因素,加剧了湖北省奶业发展困境。在这种形势下,湖北省多家奶牛养殖企业积极探索新的发展模式,大型奶牛养殖企业采用"种养加一体化"的生产模式,取得了较好的效果,多家中型奶牛养殖企业采用"养殖+奶吧"的发展模式,也提高了养殖经济效益,促进了奶牛养殖企业的发展。
关键词
奶业
种养加一体化
奶吧
Keywords
Dairy industry
Dairy industry integration mode
Milk bar
分类号
S8-1 [农业科学—畜牧兽医]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
淮南猪肌肉组织不同发育阶段的甲基化差异基因筛选
陈俊峰
王璟
靳玮
柴进
张家庆
任巧玲
邢宝松
《华中农业大学学报》
北大核心
2025
0
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职称材料
2
一体化模式在湖北奶业发展中的重要性
滑国华
王贵强
张燊
邵宝顺
万建中
梁爱心
郭妮妮
秦则平
吴喜娟
杨利国
《中国奶牛》
2018
2
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职称材料
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