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陆地棉NF-YA基因家族的全基因组鉴定与功能分析
被引量：
5
1
作者
潘奥
王静静
+7 位作者
孙福来
张景霞
高阳
杜召海
焦梦佳
张军
王芙蓉
刘志
《棉花学报》
CSCD
北大核心
2020年第4期316-328,共13页
【目的】通过对陆地棉NF-YA基因家族进行全基因组鉴定,分析其表达特性,鉴定其中与棉花开花相关的基因。【方法】利用生物信息学方法系统分析了其理化性质、基因结构、共线性、Ka/Ks、顺式作用元件和表达模式,实时荧光定量聚合酶链反应(P...
【目的】通过对陆地棉NF-YA基因家族进行全基因组鉴定,分析其表达特性,鉴定其中与棉花开花相关的基因。【方法】利用生物信息学方法系统分析了其理化性质、基因结构、共线性、Ka/Ks、顺式作用元件和表达模式,实时荧光定量聚合酶链反应(Polymerase chain reaction,PCR)分析表达特征,采用病毒诱导基因沉默技术验证基因功能。【结果】陆地棉中鉴定到29个NF-YA基因家族成员,分为5个亚组,定位在18条染色体上;全基因组复制和片段复制是GhNF-YA基因家族扩张的主要动力;启动子区含有大量光反应的顺式作用元件。GhNF-YA基因家族基因在茎、叶中高表达;12个GhNF-YA基因在早熟品种鲁棉研19号和晚熟品种鲁棉研37号中均在第三至六叶时期表达量较高,并且大部分基因在品种间表达差异显著。沉默GhNF-YA18基因的鲁棉研37号植株比对照提前11 d现蕾,并且该基因在白化期和现蕾期的表达量均低于未沉默对照棉株。【结论】本研究对陆地棉NF-YA基因家族进行了鉴定和表达分析,为进一步研究棉花开花调控的分子机制奠定了基础。
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关键词
陆地棉
NF-YA基因家族
生物信息学
表达分析
病毒诱导基因沉默(Virus-induced
gene
silencing
VIGS)
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题名
陆地棉NF-YA基因家族的全基因组鉴定与功能分析
被引量：
5
1
作者
潘奥
王静静
孙福来
张景霞
高阳
杜召海
焦梦佳
张军
王芙蓉
刘志
机构
湖南
农业
大学生物科学技术学院
农业农村部黄淮海棉花遗传改良与栽培生理重点实验室/山东棉花研究中心
山东
省滨州市种子管理站
出处
《棉花学报》
CSCD
北大核心
2020年第4期316-328,共13页
基金
国家现代农业产业技术体系棉花体系(CARS-15-05)
国家自然科学基金(31671742和31601345)
+1 种基金
泰山学者计划(No.ts201511070)
山东省农科院创新工程(CXGC2016A01)。
文摘
【目的】通过对陆地棉NF-YA基因家族进行全基因组鉴定,分析其表达特性,鉴定其中与棉花开花相关的基因。【方法】利用生物信息学方法系统分析了其理化性质、基因结构、共线性、Ka/Ks、顺式作用元件和表达模式,实时荧光定量聚合酶链反应(Polymerase chain reaction,PCR)分析表达特征,采用病毒诱导基因沉默技术验证基因功能。【结果】陆地棉中鉴定到29个NF-YA基因家族成员,分为5个亚组,定位在18条染色体上;全基因组复制和片段复制是GhNF-YA基因家族扩张的主要动力;启动子区含有大量光反应的顺式作用元件。GhNF-YA基因家族基因在茎、叶中高表达;12个GhNF-YA基因在早熟品种鲁棉研19号和晚熟品种鲁棉研37号中均在第三至六叶时期表达量较高,并且大部分基因在品种间表达差异显著。沉默GhNF-YA18基因的鲁棉研37号植株比对照提前11 d现蕾,并且该基因在白化期和现蕾期的表达量均低于未沉默对照棉株。【结论】本研究对陆地棉NF-YA基因家族进行了鉴定和表达分析,为进一步研究棉花开花调控的分子机制奠定了基础。
关键词
陆地棉
NF-YA基因家族
生物信息学
表达分析
病毒诱导基因沉默(Virus-induced
gene
silencing
VIGS)
Keywords
Gossypium hirsutum L.
NF-YA gene family
bioinformatics
expression analysis
virus-induced gene silencing(VIGS)
分类号
S562 [农业科学—作物学]
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1
陆地棉NF-YA基因家族的全基因组鉴定与功能分析
潘奥
王静静
孙福来
张景霞
高阳
杜召海
焦梦佳
张军
王芙蓉
刘志
《棉花学报》
CSCD
北大核心
2020
5
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