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SNP芯片技术原理及其在鸡遗传育种中的应用
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作者 王有栋 曹志平 +3 位作者 李玉茂 栾鹏 李辉 白雪 《畜牧兽医学报》 北大核心 2025年第9期4165-4175,共11页
单核苷酸多态性(SNP)芯片作为高效的基因分型工具,具有分型准确率高、检测速度快、分析流程简单和检测成本低等优势,已被广泛应用于分子遗传学研究和基因组育种等领域。特别是对家禽遗传育种,SNP芯片技术的应用极大地提升了育种效率和... 单核苷酸多态性(SNP)芯片作为高效的基因分型工具,具有分型准确率高、检测速度快、分析流程简单和检测成本低等优势,已被广泛应用于分子遗传学研究和基因组育种等领域。特别是对家禽遗传育种,SNP芯片技术的应用极大地提升了育种效率和准确性。本文旨在全面剖析SNP芯片技术,从固相芯片与液相芯片两大类出发,深入探讨各自的技术原理及其独特优点。同时,本文总结了SNP芯片技术在鸡遗传育种领域的最新研究进展,详细阐述了其在商业育种、重要经济性状相关位点挖掘、抗病育种、品种鉴定以及种质资源保护等方面的应用与贡献。研究结果表明,SNP芯片技术不仅在推动鸡遗传改良方面发挥了重要作用,还为品种多样性的保护提供了有力的工具。未来,随着技术的进一步发展,SNP芯片在鸡遗传育种中的应用潜力将更加广阔。 展开更多
关键词 SNP 固相芯片 液相芯片 育种
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“双一流”建设背景下动物遗传育种与繁殖专业研究生培养的探索与启示
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作者 张慧 常成 《农家科技》 2025年第14期31-33,共3页
在新时代“双一流”建设背景下,高等教育改革不断深化,动物遗传育种与繁殖专业研究生培养也面临新挑战与新机遇。本文基于“双一流”建设的战略目标,探讨了该专业研究生培养的现状、问题及优化路径,旨在通过加强对研究生的创新能力、实... 在新时代“双一流”建设背景下,高等教育改革不断深化,动物遗传育种与繁殖专业研究生培养也面临新挑战与新机遇。本文基于“双一流”建设的战略目标,探讨了该专业研究生培养的现状、问题及优化路径,旨在通过加强对研究生的创新能力、实践技能和跨学科整合能力培养,全面提升研究生培养质量,助力学科发展与行业进步,为我国动物遗传育种与繁殖学科高层次人才培养提供理论支撑和实践指导。 展开更多
关键词 “双一流”建设 动物遗传育种与繁殖专业 研究生培养
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龙骨骨折对产蛋后期蛋鸡恐惧行为、生产性能和蛋品质的影响 被引量:1
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作者 张家麒 杨凯淇 +7 位作者 张静怡 王晓旭 王野 王蕊 于翰林 陈艳青 包军 张润祥 《中国畜牧兽医》 CSCD 北大核心 2024年第1期86-95,共10页
【目的】龙骨骨折(keel bone fracture, KBF)已成为影响蛋鸡健康和生产的重要福利问题。试验旨在评估产蛋期龙骨骨折的发生与否对产蛋后期的蛋鸡恐惧行为、生产性能和蛋品质的影响。【方法】选取60周龄的海兰褐蛋鸡和林甸鸡各100只,单... 【目的】龙骨骨折(keel bone fracture, KBF)已成为影响蛋鸡健康和生产的重要福利问题。试验旨在评估产蛋期龙骨骨折的发生与否对产蛋后期的蛋鸡恐惧行为、生产性能和蛋品质的影响。【方法】选取60周龄的海兰褐蛋鸡和林甸鸡各100只,单笼饲养于传统叠层式鸡笼。利用触诊和便携式X光仪区分龙骨骨折蛋鸡和未骨折蛋鸡,通过紧张不动性测试(TI)、旷场试验(OFT)和惊吓反射试验(SRT)依次测量恐惧行为反应,并测定68周龄时蛋鸡的生产性能和蛋品质。【结果】在TI试验中,2个品种龙骨骨折蛋鸡的紧张不动时长显著高于正常蛋鸡(P<0.05)。在OFT试验中,龙骨骨折的海兰褐蛋鸡和林甸鸡在穿过的格子数、步数和在外圈停留的时间均显著低于正常蛋鸡(P<0.05),在内圈停留的时间显著高于正常蛋鸡(P<0.05),且骨折的海兰褐蛋鸡的运动潜伏期显著高于正常蛋鸡(P<0.05)。在SRT试验中,龙骨骨折蛋鸡惊吓反射总得分显著低于正常蛋鸡(P<0.05)。因此,龙骨骨折蛋鸡的恐惧行为反应较强烈。2个品种龙骨骨折蛋鸡的产蛋率显著低于正常蛋鸡(P<0.05),且骨折的海兰褐蛋鸡蛋形指数低于正常蛋鸡(P<0.05),其余蛋品质参数在骨折蛋鸡和正常蛋鸡中无显著性差异(P>0.05)。【结论】龙骨骨折加剧了蛋鸡的恐惧行为反应,降低了产蛋后期蛋鸡的福利水平和生产性能。 展开更多
关键词 蛋鸡 龙骨骨折 恐惧行为 生产性能 动物福利
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林甸鸡腹部脂肪组织发育规律探究
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作者 刘捷 周迅 +6 位作者 韩雪 周世杰 李玉茂 栾鹏 李辉 王宇祥 冷丽 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期41-48,共8页
肉鸡生产过程中腹脂过度沉积会造成生产效率下降等一系列问题。林甸鸡作为优质地方鸡种之一,产蛋、产肉性能优良,肉质鲜美,深受大众喜爱。为探究林甸鸡腹部脂肪组织发育规律,测定林甸鸡3~22周龄体重及腹脂重,观察并统计腹部脂肪细胞大... 肉鸡生产过程中腹脂过度沉积会造成生产效率下降等一系列问题。林甸鸡作为优质地方鸡种之一,产蛋、产肉性能优良,肉质鲜美,深受大众喜爱。为探究林甸鸡腹部脂肪组织发育规律,测定林甸鸡3~22周龄体重及腹脂重,观察并统计腹部脂肪细胞大小和数量,分析脂肪细胞特性与腹脂沉积之间关系。结果表明,林甸鸡在3~22周龄体重持续增长,腹脂重先升后降再升,腹脂率先降后升;3~10周龄脂肪细胞以增生为主,10~14周龄脂肪细胞以增大占优,19周龄后脂肪细胞增大和增生同时进行,但以增大为主。研究初步确定腹脂重与脂肪细胞特性回归模型,发现脂肪细胞体积对腹脂重的影响最大。试验结果为选育优质特色林甸鸡新品系提供理论参考。 展开更多
关键词 林甸鸡 腹脂 脂肪细胞 发育规律
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鸡胰岛素信号通路的研究进展
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作者 娄明 罗昊玉 +2 位作者 牟芳 李辉 王宁 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第8期3288-3296,共9页
胰岛素作为机体所必需的激素,在动物糖脂代谢、蛋白合成、生长发育、性状形成等生理过程中发挥重要作用。鸡存在天然的胰岛素抵抗,但其发生机制尚不清楚。本文综述了鸡肝脏、肌肉和脂肪组织胰岛素通路的研究进展,提出了鸡胰岛素信号通... 胰岛素作为机体所必需的激素,在动物糖脂代谢、蛋白合成、生长发育、性状形成等生理过程中发挥重要作用。鸡存在天然的胰岛素抵抗,但其发生机制尚不清楚。本文综述了鸡肝脏、肌肉和脂肪组织胰岛素通路的研究进展,提出了鸡胰岛素信号通路和胰岛素抵抗的未来研究方向,以期为深入探究人类胰岛素抵抗以及鸡肉品质遗传改良提供新思路。 展开更多
关键词 胰岛素信号通路 胰岛素抵抗 肝脏 肌肉 脂肪组织
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C/EBPα通过结合鸡神经调节蛋白4基因外显子2正调控其表达
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作者 罗昊玉 黄佳新 +3 位作者 高帆 闫晓红 牟芳 王宁 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第11期1608-1617,共10页
神经调节蛋白4(NRG4)是一个新发现的脂肪细胞因子,它在机体能量平衡、糖脂代谢等许多生理过程中发挥重要调控作用。目前,NRG 4基因的转录调控机制尚不清楚。我们前期的5′RACE分析显示,鸡NRG 4基因转录起始位点(TSS)弥散分布于一段约200... 神经调节蛋白4(NRG4)是一个新发现的脂肪细胞因子,它在机体能量平衡、糖脂代谢等许多生理过程中发挥重要调控作用。目前,NRG 4基因的转录调控机制尚不清楚。我们前期的5′RACE分析显示,鸡NRG 4基因转录起始位点(TSS)弥散分布于一段约200 bp的区域,提示鸡NRG 4基因的启动子为分散型启动子(dispersed promoter)。本研究开展了鸡NRG 4基因近端外显子和内含子的启动子活性分析,报告基因分析显示,包含NRG 4基因外显子1、内含子1和外显子2的基因组片段(-122/+452)具有很强的双向启动子活性。生物信息学分析显示,鸡NRG 4基因外显子2上存在1个转录因子CCAAT增强子结合蛋白α(C/EBPα)的潜在结合位点;报告基因分析发现,删除或突变C/EBPα结合位点会导致C/EBPα丧失对NRG 4基因片段(-122/+452)启动子活性的调控作用。基因表达相关性分析显示,鸡脂肪组织中C/EBPα和NRG 4基因的mRNA表达存在显著正相关(P<0.01)。进一步的脂肪组织ChIP-qPCR分析显示,C/EBPα直接结合鸡NRG 4基因的外显子2。本研究发现,鸡NRG 4基因的近端外显子和内含子具有双向启动子活性,C/EBPα通过直接结合外显子2调控鸡脂肪组织NRG 4基因的表达。 展开更多
关键词 神经调节蛋白4 近端外显子和内含子 启动子活性 转录调控 CCAAT增强子结合蛋白α(C/EBPα)
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靶向RNA的CRISPR/Cas系统及衍生技术 被引量:1
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作者 周迅 周世杰 +1 位作者 刘捷 王宇祥 《遗传》 北大核心 2025年第8期842-860,共19页
RNA编辑是表观遗传学领域重要的研究方向之一。随着研究的深入,科学家们发现CRISPR/Cas系统不仅可以靶向DNA,也可以靶向RNA,从而实现转录水平的基因精准编辑;同时,使用CRISPR/Cas系统进行RNA编辑也可以避免对基因组的破坏。目前,基于靶... RNA编辑是表观遗传学领域重要的研究方向之一。随着研究的深入,科学家们发现CRISPR/Cas系统不仅可以靶向DNA,也可以靶向RNA,从而实现转录水平的基因精准编辑;同时,使用CRISPR/Cas系统进行RNA编辑也可以避免对基因组的破坏。目前,基于靶向RNA的CRISPR系统已开发出多种衍生技术,如RNA敲低和编辑、核酸检测和成像、RNA示踪等。这些衍生技术的出现,为生物遗传机制解析和疾病治疗提供了有利工具。本文归纳总结了靶向RNA的CRISPR/Cas系统的结构、功能、机制以及开发的衍生技术,以期丰富人们对CRISPR/Cas系统编辑RNA的认知。 展开更多
关键词 基因编辑 CRISPR/Cas系统 RNA 功能及应用
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真核生物mRNA 3′非翻译区最新研究进展
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作者 罗昊玉 闫晓红 +1 位作者 牟芳 王宁 《遗传》 北大核心 2025年第6期616-624,共9页
3′非翻译区(3′untranslated regions,3′UTR)是真核生物mRNA的组成部分之一,位于其3′最末端。3′UTR在真核生物基因表达的转录后调控中发挥重要作用,目前已知3′UTR调控mRNA的加尾、稳定性、翻译效率及定位等。近年来,随着研究的深... 3′非翻译区(3′untranslated regions,3′UTR)是真核生物mRNA的组成部分之一,位于其3′最末端。3′UTR在真核生物基因表达的转录后调控中发挥重要作用,目前已知3′UTR调控mRNA的加尾、稳定性、翻译效率及定位等。近年来,随着研究的深入及多种组学技术的出现和使用,人们发现3′UTR还具有许多意想不到的功能。本文综述了近年来真核生物3′UTR的新功能及其作用机制的研究进展,并提出了未来3′UTR的研究方向,以期为全面深入地研究真核生物基因功能及调控提供参考和借鉴。 展开更多
关键词 基因 3′非翻译区 转录后调控 独立3′非翻译区 蛋白多功能性
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抑制剂T0070907对鸡PPARγ基因表达影响的研究 被引量:3
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作者 王宇祥 李超 +4 位作者 翟桂影 庞永佳 李瑞 孙宇航 杜智恒 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期157-162,共6页
为了验证过氧化物酶体增殖物激活受体(PPAR)γ选择性抑制剂T0070907对鸡PPARγ基因表达的促进作用,本研究利用荧光定量PCR检测了不同浓度T0070907对鸡成纤维细胞(DF-1细胞)中PPARγ基因mRNA转录水平的影响,结果显示,随着T0070907浓度的... 为了验证过氧化物酶体增殖物激活受体(PPAR)γ选择性抑制剂T0070907对鸡PPARγ基因表达的促进作用,本研究利用荧光定量PCR检测了不同浓度T0070907对鸡成纤维细胞(DF-1细胞)中PPARγ基因mRNA转录水平的影响,结果显示,随着T0070907浓度的增加,鸡PPARγ基因的表达量逐渐升高,并且在T0070907浓度为5μmol/L时极显著高于对照组(p<0.01);利用western blot检测了T0070907对PPARγ蛋白表达的影响,结果显示,5μmol/L的T0070907对DF-1细胞中PPARγ2蛋白的表达有一定的促进作用;利用双荧光素酶报告基因技术检测了不同浓度T0070907对PPRE报告基因活性的影响,结果显示,随着T0070907浓度的增加,DF-1细胞中PPRE报告基因活性逐渐增强,并且在T0070907浓度为0.5μmol/L时该报告基因活性显著高于对照组(p<0.05),当T0070907浓度为2μmol/L、5μmol/L时,与对照组之间的差异达到极显著水平(p<0.01);利用双荧光素酶报告基因技术检测了T0070907和罗格列酮(Rosi)对PPRE报告基因活性的影响,结果显示,单独添加T0070907或Rosi均可显著增强PPRE报告基因活性(p<0.05),同时,添加T0070907并不能降低Rosi对PPRE报告基因活性的促进作用。本研究结果表明,作为PPARγ抑制剂的T0070907对鸡PPARγ基因的mRNA的转录水平、蛋白表达及其蛋白活性均具有促进作用,推测与哺乳动物不同,鸡PPARγ可能具有其独特的表达方式和调控机制。本研究结果对完善PPARγ抑制剂在生理学及药理学上的研究、为PPARγ功能研究选择准确的拮抗剂、预防和治疗炎症相关疾病等方面具有重要意义。 展开更多
关键词 T0070907 抑制剂 PPARΓ 基因表达
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鸡miR-17-92基因簇上游A/T富集区启动子活性鉴定与分析
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作者 王宁 靳艳飞 +4 位作者 邢天宇 崔婷婷 黄佳新 闫晓红 李辉 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第7期57-67,共11页
文章采用基因定点突变和报告基因技术作A/T富集区启动子鉴定和转录调控分析,研究鸡miR-17-92基因簇上游A/T富集区是否具有启动子活性。PromPredict预测分析提示miR-17-92基因簇上游-388^-444 bp处可能是启动子区域。转录因子结合位点分... 文章采用基因定点突变和报告基因技术作A/T富集区启动子鉴定和转录调控分析,研究鸡miR-17-92基因簇上游A/T富集区是否具有启动子活性。PromPredict预测分析提示miR-17-92基因簇上游-388^-444 bp处可能是启动子区域。转录因子结合位点分析发现,A/T富集区存在3个E2F1潜在结合位点,分别位于miR-17-92基因簇上游-1 273 bp(结合位点1)、-1 186 bp(结合位点2)和-753 bp(结合位点3)处。报告基因活性分析发现,鸡miR-17-92基因簇上游A/T富集区具有启动子活性,其中miR-17-92基因簇上游-440/-1区域启动子活性最强。共转染分析显示,转录因子E2F1极显著抑制该A/T富集区启动子活性(P<0.01);进一步定点突变分析表明E2F1通过E2F1结合位点1和2抑制A/T富集区启动子活性。报告基因分析发现,与对A/T富集区启动子作用不同,E2F1促进miR-17-92基因簇宿主基因(MIR17HG)启动子活性。文章首次发现鸡miR-17-92基因簇上游存在一个新的转录调控区,对揭示鸡miR-17-92基因簇转录调控具有重要意义。 展开更多
关键词 miR-17-92基因簇 A/T富集区 启动子 E2F1
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肉鸡屠体脂肪含量间接选择方法及其效果评估 被引量:7
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作者 李辉 陈冲 +6 位作者 冷丽 王守志 宿志勇 肖凡 郭怀顺 李玉茂 栾鹏 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第8期39-46,共8页
研究以东北农业大学肉鸡高、低腹脂双向选择品系第18世代、第22世代和第23世代鸡为试验材料,测定其腹脂性状、饲料转化效率性状和屠体脂肪含量,比较分析高、低脂系鸡腹脂性状、饲料转化效率性状和屠体脂肪含量差异,评估上述测定性状遗... 研究以东北农业大学肉鸡高、低腹脂双向选择品系第18世代、第22世代和第23世代鸡为试验材料,测定其腹脂性状、饲料转化效率性状和屠体脂肪含量,比较分析高、低脂系鸡腹脂性状、饲料转化效率性状和屠体脂肪含量差异,评估上述测定性状遗传参数。两系间性状差异比较结果表明,高脂系肉鸡腹脂重(AFW)、腹脂率(AFP)、饲料转化率(FCR)、剩余采食量(RFI)、屠体干物质含量(DMPC)、屠体干物质中脂肪含量(FPDM)和屠体鲜样中脂肪含量(FPWC)极显著高于低脂系肉鸡(P<0.01);遗传参数估计结果表明,AFW和AFP为中等遗传力(h^2=0.30,0.35)性状;FCR和RFI为高遗传力(h^2=0.41,0.43)性状;DMPC、FPDM和FPWC为高遗传力(0.48≤h2≤0.64)性状;腹脂性状与饲料转化效率性状呈较高程度正遗传相关(0.52≤rg≤0.62);腹脂性状与屠体脂肪含量呈中等偏高程度正遗传相关(0.28≤rg≤0.47);饲料转化效率性状与屠体脂肪含量呈较高程度正遗传相关(0.38≤rg≤0.78)。通过肉鸡腹脂性状或饲料转化效率性状选择可有效降低肉鸡屠体脂肪含量;饲料转化效率性状包括FCR和RFI,从遗传参数估计结果看,RFI间接选择肉鸡屠体脂肪含量效果更好。研究为肉鸡屠体脂肪含量间接选择提供理论依据。 展开更多
关键词 肉鸡 腹脂性状 饲料转化效率性状 屠体脂肪含量 遗传参数
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鸡胰岛素样生长因子2基因(IGF2)外显子区功能性SNP预测与分析 被引量:11
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作者 李玉冬 王伟佳 +5 位作者 李紫薇 李瑞楚 张长超 王宁 李辉 王守志 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第11期2665-2678,共14页
旨在采用生物信息学方法筛选鸡IGF2基因中具有潜在生物学功能的非同义单核苷酸多态性(non-synonymous single nucleotide polymorphisms,nsSNPs)位点,为开展标记辅助选择改良鸡重要经济性状提供理论参考。本研究从dbSNP数据库中检索出鸡... 旨在采用生物信息学方法筛选鸡IGF2基因中具有潜在生物学功能的非同义单核苷酸多态性(non-synonymous single nucleotide polymorphisms,nsSNPs)位点,为开展标记辅助选择改良鸡重要经济性状提供理论参考。本研究从dbSNP数据库中检索出鸡IGF2基因的12个nsSNPs位点,利用生物信息学软件SIFT、Polyphen-2、PhD-SNP和SNAP预测其中可能的功能性SNP;使用I-Mutant3.0和Mupro方法对突变位点的氨基酸稳定性进行分析;对鸡IGF2基因编码的氨基酸序列进行多序列比对和进化位点保守性预测,并结合MutPred2预测突变可能造成的功能后果;最后使用Sopma预测IGF2野生型和突变型的蛋白质二级结构,运用I-TASSER构建它们的蛋白质三级结构。结果发现,rs740391349(E29G)、rs735633122(T30P)、rs739078786(L31P)、rs736255842(E35G)及rs736800980(V37G)这5个nsSNPs可能影响鸡IGF2的蛋白功能,且所有位点突变都会使IGF2蛋白稳定性降低。多序列比对及保守性分析显示,rs740391349(E29G)、rs735633122(T30P)和rs736255842(E35G)为高度保守并暴露的功能性残基,MutPred2与二级结构分析结果表明,rs735633122(T30P)和rs736255842(E35G)这两个位点上的突变都导致了α螺旋百分比下降。三级结构分析表明,rs735633122(T30P)和rs736255842(E35G)这2个nsSNPs均会导致IGF2的蛋白空间结构发生变化。综上所述,T30P和E35G位点突变严重影响鸡IGF2蛋白质的结构,可能是影响鸡生长和体组成性状的重要功能性SNPs。 展开更多
关键词 IGF2基因 SNP功能预测 生物信息学
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高、低脂系肉鸡饲料转化效率与消化系统相关性研究 被引量:4
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作者 宿志勇 姜海煦 +5 位作者 冷丽 白雪 李玉茂 栾鹏 李辉 程博涵 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第12期1-8,共8页
研究以东北农业大学肉鸡高、低腹脂双向选择品系(简称高、低脂系)第23世代鸡为试验材料,测定个体饲料转化效率及消化系统相关性状,比较高、低脂系肉鸡饲料转化效率及消化系统相关性状差异,估计上述测定性状遗传参数。测定结果表明,低脂... 研究以东北农业大学肉鸡高、低腹脂双向选择品系(简称高、低脂系)第23世代鸡为试验材料,测定个体饲料转化效率及消化系统相关性状,比较高、低脂系肉鸡饲料转化效率及消化系统相关性状差异,估计上述测定性状遗传参数。测定结果表明,低脂系肉鸡饲料转化率(FCR)、剩余采食量(RFI)、十二指肠长度(DL)、空肠长度(JL)均显著低于高脂系(P<0.05),低脂系肉鸡回肠长度(IL)、直肠长度(RL)显著高于高脂系(P<0.05),其他性状差异不显著(P>0.05)。遗传力结果表明,腺肌胃重(GMSW)、JL、IL属于高遗传力性状(0.41≤h^(2)≤0.45),肝脏重(LW)和盲肠长度(CL)属于中等遗传力性状(h^(2)=0.36,0.35),DL和RL属于低遗传力性状(h^(2)=0.09,0)。遗传相关结果表明,FCR与GMSW和JL呈中等程度负遗传相关(r_(g)=-0.35,-0.37),FCR与IL和CL呈较低程度负遗传相关(r_(g)=-0.14,-0.12),FCR与DL呈中等程度正遗传相关(r_(g)=0.25),FCR与LW呈较低程度正遗传相关(r_(g)=0.07);RFI与GMSW呈较高程度负遗传相关(r_(g)=-0.46),RFI与JL呈中等程度负遗传相关(r_(g)=-0.32),RFI与IL、CL呈较低程度负遗传相关(r_(g)=-0.18,-0.10),RFI与LW、DL呈较低程度正遗传相关(r_(g)=0.14,0.14)。推测当选育提高肉鸡饲料转化效率,导致GMSW、JL、IL、CL升高,LW、DL下降。研究结果为完善肉鸡平衡育种体系提供参考依据。 展开更多
关键词 肉鸡 饲料转化效率 消化系统 遗传参数
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鸡脂肪组织TCF 21基因启动子区DNA甲基化与其表达的关系 被引量:5
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作者 刘雨萌 马艳艳 +4 位作者 姜海煦 张心扬 武春艳 程博涵 李辉 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第12期3375-3389,共15页
旨在研究鸡脂肪组织中TCF 21基因启动子区DNA甲基化水平与其表达的关系。以东北农业大学高、低腹脂双向选择品系(简称高、低脂系)第24世代7周龄肉鸡为试验材料,利用RT-qPCR检测高、低脂系肉鸡腹部脂肪组织中TCF 21基因的mRNA表达水平;... 旨在研究鸡脂肪组织中TCF 21基因启动子区DNA甲基化水平与其表达的关系。以东北农业大学高、低腹脂双向选择品系(简称高、低脂系)第24世代7周龄肉鸡为试验材料,利用RT-qPCR检测高、低脂系肉鸡腹部脂肪组织中TCF 21基因的mRNA表达水平;利用生物信息学和双荧光素酶报告系统分析TCF 21基因启动子的结构与功能;利用Sequenom MassARRAY飞行质谱检测高、低脂系肉鸡腹部脂肪组织中TCF 21基因启动子区CpG位点的甲基化水平;利用CpG甲基转移酶处理TCF 21启动子报告基因质粒,分析DNA甲基化对TCF 21基因启动子活性的影响。结果显示,高脂系肉鸡腹部脂肪组织中TCF 21基因的mRNA表达水平极显著高于低脂系(P<0.001);TCF 21基因的启动子区存在40个CpG位点,且在启动子的近端和远端均有分布,但不存在CpG岛;将TCF 21基因的启动子划分为5个功能区域,分别为R1区域(-2000~-1500 bp)、R2区域(-1500~-1000 bp)、R3区域(-1000~-500 bp)、R4区域(-500~-200 bp)和Core区域(-200~-100 bp);高脂系R2、R3和R2+R3区域的DNA甲基化水平显著或极显著高于低脂系(P<0.05或P<0.001);R2、R3、R2+R3区域的DNA甲基化水平与TCF 21基因mRNA表达水平呈显著正相关(R2区域:r=0.438,P<0.05;R3区域:r=0.371,P<0.05;R2+R3区域:r=0.489,P<0.05);R2区域的DNA甲基化显著抑制其转录活性(P<0.05)。综上所述,TCF 21基因在高、低脂系肉鸡腹部脂肪组织中的表达水平主要与其启动子R2区域的DNA甲基化水平有关。 展开更多
关键词 TCF21基因 启动子 DNA甲基化 基因表达 脂肪组织
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鸡OBR基因g.7851G>A单核苷酸多态性功能性鉴定及分析 被引量:3
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作者 王守志 谢可嘉 +4 位作者 李紫薇 张长超 王伟佳 王宁 李辉 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期71-79,共9页
瘦蛋白受体(OBR)对脂肪沉积和体重调节有重要影响。基于前期发现鸡(Gallus gallus)OBR基因g.7851G>A单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)与鸡腹脂重极显著相关(P=0.0076)。生物信息学分析显示,该SNP位于多个转录因... 瘦蛋白受体(OBR)对脂肪沉积和体重调节有重要影响。基于前期发现鸡(Gallus gallus)OBR基因g.7851G>A单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)与鸡腹脂重极显著相关(P=0.0076)。生物信息学分析显示,该SNP位于多个转录因子结合区域,可能与某个或某些转录因子结合,影响OBR基因转录效率,为功能性SNP。为确定SNP功能性,研究该基因在高、低脂两系肉鸡各组织中差异表达;构建含该SNP位点A和G等位基因荧光素酶报告基因载体,利用双荧光素酶报告系统分析转录因子C/EBPα和PPARα对该SNP位点不同等位基因荧光素酶活性的影响。Real-timeRT-PCR结果表明,肝脏和腹部脂肪中,高脂系公鸡OBR基因表达量显著高于低脂系公鸡;在大脑中,高脂系公鸡OBR基因表达量显著低于低脂系公鸡(P<0.05)。报告基因结果表明,A等位基因荧光素酶活性显著高于G等位基因(P<0.05)。此外,转录因子PPAR录对G等位基因荧光素酶活性抑制作用显著强于A等位基因(P<0.05),转录因子C/EBα因对G等位基因荧光素酶活性抑制作用显著弱于A等位基因(P<0.05)。研究表明,OBR基因g.7851G>A可能是功能性SNP位点,确定为优质鸡育种功能性分子标记。研究为深入探讨OBR基因对脂肪代谢分子机制的影响提供试验依据。 展开更多
关键词 鸡(Gallusgallus) 瘦蛋白受体基因(OBR) 内含子 功能性单核苷酸多态性
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鸡HMG box蛋白1(HBP1)基因启动子区多态性与腹脂率关联分析 被引量:2
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作者 王守志 张长超 +4 位作者 李紫薇 王伟佳 李玉东 王宁 李辉 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第4期55-60,共6页
为探讨HMG box蛋白1(HMG box protein 1,HBP1)基因启动子区多态性对鸡腹脂率的影响,以东北农业大学高、低脂双向选择品系第十九世代肉鸡为试验材料,采用直接测序法检测HBP1基因多态性和个体基因型,共获得168个SNPs位点基因型。应用滑动... 为探讨HMG box蛋白1(HMG box protein 1,HBP1)基因启动子区多态性对鸡腹脂率的影响,以东北农业大学高、低脂双向选择品系第十九世代肉鸡为试验材料,采用直接测序法检测HBP1基因多态性和个体基因型,共获得168个SNPs位点基因型。应用滑动窗口法对位于该基因启动子区54个多态性位点构建单倍型,分别开展单位点和单倍型与鸡腹脂率的关联分析。结果表明,HBP1基因启动子区有7个(g.-5335G>A、g.-4354T>A、g.-3328C>T、g.-3327G>A、g.-1013T>C、g.-990G>A和g.-159A>C)位点显著影响肉鸡腹脂率(P<0.05)。此外,等位基因频率分析显示,这些位点等位基因频率在两系间分布存在极显著差异(P<0.0001)。研究结果表明,HBP1基因为影响鸡腹脂率重要候选基因,7个多态性位点为影响鸡腹脂率重要分子标记。 展开更多
关键词 肉鸡 腹脂率 HBP1基因 SNPS
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低脂肉鸡选育方法研究进展 被引量:2
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作者 冷丽 张慧 +2 位作者 王宇祥 王守志 李辉 《中国家禽》 北大核心 2019年第12期1-4,共4页
肉鸡腹脂沉积过多有许多负面影响,选育节粮型低脂肉鸡配套系是我国也是世界范围内肉鸡育种的重要目标之一。本文对利用表型直接选择、利用血液生化标记进行间接选择,以及分子标记辅助选择、全基因组选择等方面对低脂肉鸡的选育方法进行... 肉鸡腹脂沉积过多有许多负面影响,选育节粮型低脂肉鸡配套系是我国也是世界范围内肉鸡育种的重要目标之一。本文对利用表型直接选择、利用血液生化标记进行间接选择,以及分子标记辅助选择、全基因组选择等方面对低脂肉鸡的选育方法进行了综述。 展开更多
关键词 肉鸡 脂肪 选育方法
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lncRNA1926和lncRNA3223在肉鸡胚胎肝细胞脂肪代谢中的功能研究 被引量:1
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作者 李辉 张惠莉 +5 位作者 王有栋 程博涵 冷丽 栾鹏 李玉茂 白雪 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第8期17-26,共10页
RNA-Seq分析发现LOC107051926(命名为lncRNA1926)和LOC112533223(命名为lncRNA3223)在肉鸡胚胎肝脏组织脂肪代谢过程发挥重要作用,但其具体功能尚不清楚。采用油红O染色、GPO-PAP和RT-qPCR方法对lncRNA1926和lncRNA3223作功能研究。结... RNA-Seq分析发现LOC107051926(命名为lncRNA1926)和LOC112533223(命名为lncRNA3223)在肉鸡胚胎肝脏组织脂肪代谢过程发挥重要作用,但其具体功能尚不清楚。采用油红O染色、GPO-PAP和RT-qPCR方法对lncRNA1926和lncRNA3223作功能研究。结果表明,敲低lncRNA1926或lncRNA3223后,显著降低胚胎原代肝细胞中脂滴沉积和甘油三酯含量;lncRNA1926是脂肪酸合成(ACC、FAS)、甘油三酯合成(GPAT)、脂肪酸降解(CPT1)相关基因正调控因子;lncRNA3223是脂肪酸合成(ACC、FAS)、甘油三酯合成(GPAT、DGAT和MOGAT2)相关基因正调控因子。敲低lncRNA1926或lncRNA3233,通过抑制脂肪酸合成和甘油三酯合成相关基因表达降低甘油三酯含量,从而降低胚胎原代肝细胞中脂滴沉积。研究结果有助于增进对鸡肝脏脂肪代谢分子调控的理解,为肉鸡体脂性状遗传改良提供理论依据。 展开更多
关键词 肉鸡 lncRNA 脂肪代谢 胚胎原代肝细胞
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低钙日粮对蛋鸡龙骨微结构参数和骨骼元素浓度的影响 被引量:2
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作者 张润祥 陈艳青 +6 位作者 杨凯淇 于翰林 王晓萱 魏海东 李纯 李剑虹 包军 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第9期39-46,共8页
钙(Ca)是家禽产蛋和维持骨骼健康最重要营养元素之一。为更好了解钙对蛋鸡龙骨微结构参数和骨骼元素浓度的影响,将180只罗曼白蛋鸡随机分成对照组和低钙饮食组,饲粮钙浓度分别为3.37%和1.5%。蛋鸡饲养于富集笼,每组6个重复,每个富集笼为... 钙(Ca)是家禽产蛋和维持骨骼健康最重要营养元素之一。为更好了解钙对蛋鸡龙骨微结构参数和骨骼元素浓度的影响,将180只罗曼白蛋鸡随机分成对照组和低钙饮食组,饲粮钙浓度分别为3.37%和1.5%。蛋鸡饲养于富集笼,每组6个重复,每个富集笼为1个重复,每个重复15只蛋鸡,试验周期20~37周。分别在第25、29、33和37周收集龙骨样品测量骨矿物质密度、骨微结构参数和骨元素浓度。结果表明,随蛋鸡年龄增加,低钙组蛋鸡正常龙骨比例减少,龙骨损伤率高于对照组,37周龙骨偏离率为31.25%,骨折率为56.25%。低钙组龙骨微结构参数与对照组相比,TV、Conn.D.、Tb.Sp、BS、BS/BV、BMD降低(P<0.05),BV、BV/TV、Tb.Th、DA增加(P<0.05)。低钙组蛋鸡钾、铁、铜、锶、钼、锰、锌、钒、硒、铊、铅含量增加(P<0.05),钙、镍、锂、汞含量下降(P<0.05)。产蛋期饲喂低钙水平日粮影响蛋鸡龙骨生长和代谢,改变龙骨骨密度、微观结构和元素稳态,损害龙骨质量和蛋鸡健康。 展开更多
关键词 低钙日粮 蛋鸡 龙骨 骨骼微结构 骨元素浓度
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鸡NRG4基因组及转录本结构分析 被引量:1
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作者 高智慧 黄佳新 +7 位作者 罗昊玉 徐海冬 娄明 宁博林 邢晓旭 牟芳 李辉 王宁 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期447-458,共12页
神经调节蛋白4(neuregulin 4,NRG4)是一个重要的脂肪细胞因子,在维持哺乳动物能量平衡、调节糖脂代谢和预防非酒精性脂肪性肝病中起着非常重要的作用。目前,人NRG4基因的基因组结构、转录异构体和蛋白异构体等已有深入的研究。本实验室... 神经调节蛋白4(neuregulin 4,NRG4)是一个重要的脂肪细胞因子,在维持哺乳动物能量平衡、调节糖脂代谢和预防非酒精性脂肪性肝病中起着非常重要的作用。目前,人NRG4基因的基因组结构、转录异构体和蛋白异构体等已有深入的研究。本实验室前期研究显示,鸡脂肪组织也表达NRG4,但是目前有关鸡NRG4(chicken NRG4,cNRG4)基因的基因组结构、转录异构体和蛋白异构体尚不清楚。为此,本研究采用RACE(rapid-amplification of cDNA ends)和RT-PCR(reverse transcription-PCR)等技术,系统开展了cNRG4基因的基因组和转录本的结构分析。结果发现,cNRG4基因编码区很小,但该基因却非常复杂,存在选择性转录起始位点、选择性拼接、内含子滞留、隐匿外显子和选择性多聚腺苷酸化,这导致cNRG4基因产生4种不同的5ʹUTR异构体(cNRG4 A、cNRG4 B、cNRG4 C和cNRG4 D)和6种不同的3ʹUTR异构体(cNRG4 a、cNRG4 b、cNRG4 c、cNRG4 d、cNRG4 e和cNRG4 f)。基因组结构分析发现,cNRG4基因跨越基因组21,969 bp(Chr.10:3,490,314~3,512,282),由11个外显子和10个内含子构成。与NCBI数据库中的cNRG4基因mRNA序列(NM_001030544.4)相比,本研究发现了cNRG4基因的2个新外显子和1个隐匿外显子。生物信息学分析、RT-PCR、克隆和测序分析发现,cNRG4基因能编码3种蛋白异构体(cNRG4-1、cNRG4-2和cNRG4-3)。本研究为进一步开展cNRG4基因的功能和调控研究奠定了基础。 展开更多
关键词 NRG4 基因组结构 转录异构体 蛋白异构体
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