该研究旨在通过全基因组关联分析挖掘内蒙古阿尔巴斯白绒山羊早期生长性状的重要变异位点及候选基因,为该品种的遗传改良提供重要的分子标记。基于山羊70 k SNP芯片对2299只内蒙古阿尔巴斯白绒山羊个体进行基因分型,对表型、环境效应以...该研究旨在通过全基因组关联分析挖掘内蒙古阿尔巴斯白绒山羊早期生长性状的重要变异位点及候选基因,为该品种的遗传改良提供重要的分子标记。基于山羊70 k SNP芯片对2299只内蒙古阿尔巴斯白绒山羊个体进行基因分型,对表型、环境效应以及个体基因型建立混合线性模型开展GWAS研究。结果显示,在全基因组上共检测出24个与绒山羊早期生长性状显著相关的SNP位点,定位到31个候选基因,其中与初生重、断奶重、断奶前日增重和周岁重显著相关的候选基因分别有6、 11、 12和2个。GO功能和KEGG通路分析结果表明,这些候选基因中最显著的生物学过程为分子功能的钙依赖性磷脂酶A2活性、通路为α-亚麻酸代谢通路和亚油酸代谢通路。可见,通过全基因组关联分析可筛选到阿尔巴斯白绒山羊早期生长性状的重要候选基因,根据筛选的重要基因可有目标的对阿尔巴斯白绒山羊早期生长性状进行选育。展开更多
利用近红外光谱分析技术快速检测乌珠穆沁羊肉中不同氨基酸含量。选取42只相同饲喂条件、体质量相近的6月龄乌珠穆沁羊,采集背最长肌、臂三头肌、股二头肌3个部位共126块肌肉样本,采集样本近红外光谱并测定氨基酸含量。采用偏最小二乘...利用近红外光谱分析技术快速检测乌珠穆沁羊肉中不同氨基酸含量。选取42只相同饲喂条件、体质量相近的6月龄乌珠穆沁羊,采集背最长肌、臂三头肌、股二头肌3个部位共126块肌肉样本,采集样本近红外光谱并测定氨基酸含量。采用偏最小二乘法关联光谱与氨基酸数据,建立乌珠穆沁羊肉中17种氨基酸的定量预测模型,最后以模型交叉验证均方根及校正决定系数(R2校正)、验证决定系数(R2验证)、预测模型的验证集标准偏差与预测标准偏差比值(ratio of standard deviation of the validation set to standard error of prediction,RPD)作为评价模型的参数。结果表明:所建立的氨基酸含量预测模型准确度较高,其中总氨基酸(total amino acid,TTA)、必需氨基酸(essential amino acid,EAA)、组氨酸、赖氨酸含量的近红外光谱预测模型的R2验证分别为0.818、0.803、0.861和0.858。分别对预测模型进行外部验证,其中EAA、组氨酸、精氨酸、丝氨酸、谷氨酸、甘氨酸、赖氨酸验证结果的RPD值均超过1.74,TAA验证结果的RPD值为2.60,预测模型准确度达到应用水平,可作为一种快速、准确测定羊肉中氨基酸含量的方法。展开更多
文摘该研究旨在通过全基因组关联分析挖掘内蒙古阿尔巴斯白绒山羊早期生长性状的重要变异位点及候选基因,为该品种的遗传改良提供重要的分子标记。基于山羊70 k SNP芯片对2299只内蒙古阿尔巴斯白绒山羊个体进行基因分型,对表型、环境效应以及个体基因型建立混合线性模型开展GWAS研究。结果显示,在全基因组上共检测出24个与绒山羊早期生长性状显著相关的SNP位点,定位到31个候选基因,其中与初生重、断奶重、断奶前日增重和周岁重显著相关的候选基因分别有6、 11、 12和2个。GO功能和KEGG通路分析结果表明,这些候选基因中最显著的生物学过程为分子功能的钙依赖性磷脂酶A2活性、通路为α-亚麻酸代谢通路和亚油酸代谢通路。可见,通过全基因组关联分析可筛选到阿尔巴斯白绒山羊早期生长性状的重要候选基因,根据筛选的重要基因可有目标的对阿尔巴斯白绒山羊早期生长性状进行选育。
文摘利用近红外光谱分析技术快速检测乌珠穆沁羊肉中不同氨基酸含量。选取42只相同饲喂条件、体质量相近的6月龄乌珠穆沁羊,采集背最长肌、臂三头肌、股二头肌3个部位共126块肌肉样本,采集样本近红外光谱并测定氨基酸含量。采用偏最小二乘法关联光谱与氨基酸数据,建立乌珠穆沁羊肉中17种氨基酸的定量预测模型,最后以模型交叉验证均方根及校正决定系数(R2校正)、验证决定系数(R2验证)、预测模型的验证集标准偏差与预测标准偏差比值(ratio of standard deviation of the validation set to standard error of prediction,RPD)作为评价模型的参数。结果表明:所建立的氨基酸含量预测模型准确度较高,其中总氨基酸(total amino acid,TTA)、必需氨基酸(essential amino acid,EAA)、组氨酸、赖氨酸含量的近红外光谱预测模型的R2验证分别为0.818、0.803、0.861和0.858。分别对预测模型进行外部验证,其中EAA、组氨酸、精氨酸、丝氨酸、谷氨酸、甘氨酸、赖氨酸验证结果的RPD值均超过1.74,TAA验证结果的RPD值为2.60,预测模型准确度达到应用水平,可作为一种快速、准确测定羊肉中氨基酸含量的方法。
