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长链非编码RNA MSTRG.14200对猪骨骼肌卫星细胞分化及肌纤维转化的影响被引量：1: 1; 作者杨玉铭赵鑫铭 +6 位作者谭宝华肖丽窈芦格言翟立君黄奕扬洪林君顾婷《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期453-461,共9页; [目的]探究长链非编码RNA(lncRNA)MSTRG.14200对猪骨骼肌卫星细胞(PSCs)成肌分化及不同类型肌纤维转化的影响。[方法]选择3头6月龄杜洛克猪,屠宰后采集心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、胃、背最长肌、腿肌、比目鱼肌和趾长伸肌组织,利用... 展开更多; 关键词猪长链非编码RNA(lncRNA) MSTRG.14200 成肌分化肌纤维转化; 在线阅读下载PDF 职称材料

水稻WOX家族基因鉴定及其种子在逆境萌发中的表达分析被引量：5: 2; 作者张琪张爱霞 +3 位作者贾俊婷赵华刘军陈兵先《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第7期1809-1820,共12页; 【目的】开展水稻WOX基因家族成员的鉴定及在种子逆境萌发中的表达分析,可为探究WOX家族基因的功能、作用机制及水稻遗传改良提供理论参考。【方法】对水稻WOX基因家族成员进行鉴定,利用生物信息学软件对其系统进化关系、理化性质、基... 展开更多; 关键词水稻 WOX家族基因生物信息学分析非生物胁迫下的种子萌发基因表达; 在线阅读下载PDF 职称材料

植物基因上游开放阅读框的研究进展被引量：1: 3; 作者薛皦朱庆锋 +6 位作者冯彦钊陈沛刘文华张爱霞刘勤坚张琪于洋《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期157-165,共9页; 上游开放阅读框(upstream open reading frame, uORF)是一类能够精确控制蛋白质翻译的mRNA元件,位于mRNA的5'端前导区,主要通过抑制翻译起始来调节下游主体开放阅读框(main open reading frame, mORF)的翻译。目前对植物uORF的预测... 展开更多; 关键词 UORF 翻译调控核糖体生长发育作物育种; 在线阅读下载PDF 职称材料

应用近红外光谱和化学计量法测定甜玉米种子活力被引量：1: 4; 作者赵冰王爱文赵华《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第7期1875-1882,共8页; 【目的】建立一种利用近红外光谱和化学计量学检测甜玉米种子活力指数的方法,为种子批量无损筛选提供新方法。【方法】在反射和透射模式下分别收集甜玉米种子的近红外光谱,采用主成分分析和蒙特卡罗交叉验证方法对异常值进行识别与剔除... 展开更多; 关键词甜玉米种子活力近红外光谱化学计量学; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名长链非编码RNA MSTRG.14200对猪骨骼肌卫星细胞分化及肌纤维转化的影响被引量：1: 1; 作者杨玉铭赵鑫铭谭宝华肖丽窈芦格言翟立君黄奕扬洪林君顾婷; 机构华南农业大学动物科学学院农业农村部华南现代生物种业重点实验室; 出处《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期453-461,共9页; 基金广东省重点研发计划项目(2022B0202090002)。; 文摘 [目的]探究长链非编码RNA(lncRNA)MSTRG.14200对猪骨骼肌卫星细胞(PSCs)成肌分化及不同类型肌纤维转化的影响。[方法]选择3头6月龄杜洛克猪,屠宰后采集心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、胃、背最长肌、腿肌、比目鱼肌和趾长伸肌组织,利用实时荧光定量PCR检测MSTRG.14200在不同组织中的表达情况。构建MSTRG.14200过表达载体pcDNA3.1-14200并转染PSCs细胞,诱导分化3 d后收集细胞。通过实时荧光定量PCR和Western blotting分别检测肌球蛋白重链(MyHC)、肌细胞生成素(MyoG)和肌分化因子(MyoD)、MyHCⅠ、MyHCⅡa、MyHCⅡb和MyHCⅡx mRNA和蛋白表达情况;利用免疫荧光法检测MyHC、MyHCⅠ和MyHCⅡb阳性细胞比率。[结果]MSTRG.14200在杜洛克猪不同组织中均有表达,且在背最长肌中表达量最高,极显著高于其他组织(P<0.01),在趾长伸肌和比目鱼肌中的表达量存在显著差异(P<0.05)。过表达MSTRG.14200后,细胞分化相关基因MyoD和MyHC的mRNA水平极显著升高(P<0.01),MyoD、MyoG和MyHC蛋白水平显著或极显著升高(P<0.05;P<0.01),MyHC阳性细胞比率极显著升高(P<0.01);肌纤维类型转化相关基因MyHCⅠ的mRNA和蛋白表达量及阳性细胞比例率均显著或极显著降低(P<0.05;P<0.01),MyHCⅡb基因mRNA和蛋白表达量以及阳性细胞比率均显著升高(P<0.05)。[结论]MSTRG.14200具有促进猪骨骼肌成肌分化以及促进慢肌纤维向快肌纤维转化的作用。研究结果为探究猪骨骼肌纤维类型转化的分子机制提供理论基础。; 关键词猪长链非编码RNA(lncRNA) MSTRG.14200 成肌分化肌纤维转化; Keywords pigs long non-coding RNA(lncRNA) MSTRG.14200 myogenic differentiation muscle fiber transformation; 分类号 S828 [农业科学—畜牧学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名水稻WOX家族基因鉴定及其种子在逆境萌发中的表达分析被引量：5: 2; 作者张琪张爱霞贾俊婷赵华刘军陈兵先; 机构广东省农业科学院农业生物基因研究中心/广东省农作物种质资源保护与利用重点实验室广州国家现代农业产业科技创新中心/农业农村部华南现代生物种业重点实验室; 出处《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第7期1809-1820,共12页; 基金广东省自然科学基金面上项目(2020A1515011535) 广东省乡村振兴战略专项(2021KJ382) +1 种基金广东省农业科学院院长基金面上项目(202023)。; 文摘【目的】开展水稻WOX基因家族成员的鉴定及在种子逆境萌发中的表达分析,可为探究WOX家族基因的功能、作用机制及水稻遗传改良提供理论参考。【方法】对水稻WOX基因家族成员进行鉴定,利用生物信息学软件对其系统进化关系、理化性质、基因结构、保守结构域、保守基序、顺式作用元件和染色体定位等进行分析,并利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测其在种子萌发过程的时空表达特征及非生物胁迫下的表达模式。【结果】从PlantTFDB数据库鉴定获得13个水稻WOX基因家族成员(OsWOX1~OsWOX13),可分为3个分支,其中,远古进化支仅含1个基因,中间进化支和现代进化支分别含有6个基因。13个OsWOXs家族基因不均匀地分布在水稻的1、3、4、5、7、8、11号染色体上,其余5条染色体上则不含该家族基因,其基因结构之间存在较大的差异,暗示WOX基因功能具有差异性和多样性。13个水稻WOX蛋白均定位于细胞核,具有Homodomain superfamily保守结构域和10个保守基序,其中Motif 1和Motif 2位于每个蛋白的保守功能域中。OsWOXs基因启动子区域均含有较多的光响应元件和防御胁迫响应元件,种子特异性反应元件(RY-element)存在于OsWOX1、OsWOX9、OsWOX11和OsWOX12基因中。13个OsWOXs基因在水稻种子萌发及逆境胁迫下的表达模式存在明显差异。OsWOX8基因在萌发种子和幼苗中均呈较高的表达量,OsWOX9和OsWOX11基因在种子萌发期表达量较高,而OsWOX2、OsWOX6和OsWOX8基因在幼苗中的表达量较高。干旱胁迫下,幼苗中OsWOX1、OsWOX2、OsWOX4和OsWOX5基因的相对表达量分别是对照(CK)组的15.0倍、8.0倍、3.9倍和3.6倍,而种子中OsWOX3、OsWOX4和OsWOX7基因的相对表达量分别比CK组降低87.2%、86.9%和97.8%。【结论】相较于拟南芥和玉米,水稻WOX基因家族成员在系统发育进化上较先进,仅保留OsWOX8一个古老分支,且其启动子区域均含有大量光响应和胁迫响应元件,推测其在功能上偏向于参与光合作用和逆境应答方面。OsWOXs基因在水稻种子萌发、幼苗及各种非生物胁迫下呈现丰富多样的表达模式,其中OsWOX9和OsWOX11基因为调控种子萌发的关键基因。; 关键词水稻 WOX家族基因生物信息学分析非生物胁迫下的种子萌发基因表达; Keywords rice WOX family genes bioinformatics analysis seed germination under abiotic stresses gene expression; 分类号 S511.035.3 [农业科学—作物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名植物基因上游开放阅读框的研究进展被引量：1: 3; 作者薛皦朱庆锋冯彦钊陈沛刘文华张爱霞刘勤坚张琪于洋; 机构广东省农业科学院农业生物基因研究中心、广东省农作物种质资源保存和利用重点实验室、农业农村部华南现代生物种业重点实验室; 出处《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期157-165,共9页; 基金广东省自然科学基金项目(2021A1515110411) 广东省农业科学院科技人才引进专项资金项目(R2021YJ-QG005) +2 种基金广东省科技计划项目(2020B121201013)。; 文摘上游开放阅读框(upstream open reading frame, uORF)是一类能够精确控制蛋白质翻译的mRNA元件,位于mRNA的5'端前导区,主要通过抑制翻译起始来调节下游主体开放阅读框(main open reading frame, mORF)的翻译。目前对植物uORF的预测和鉴定主要集中于生物信息学和翻译组学鉴定技术。植物uORF广泛参与调节生长发育、营养代谢、抗病免疫等多个生命活动过程。本文对植物uORF的分类、功能机制、预测和鉴定方法、植物规避uORF的方式以及植物uORF的工程应用等进行综述归纳,旨在更系统和深入地理解植物uORF的功能与机制,并为uORF应用于作物分子育种工作提供参考。; 关键词 UORF 翻译调控核糖体生长发育作物育种; Keywords uORF translational regulation ribosome growth and development crop breeding; 分类号 Q943.2 [生物学—植物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名应用近红外光谱和化学计量法测定甜玉米种子活力被引量：1: 4; 作者赵冰王爱文赵华; 机构广州国家现代农业产业科技创新中心/农业农村部华南现代生物种业重点实验室山东大学药学院张掖市农业科学研究院; 出处《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第7期1875-1882,共8页; 基金农业农村部华南现代生物种业重点实验室项目(2105-000000-20-03-457451) 广东省乡村振兴战略专项(2021KJ382)。; 文摘【目的】建立一种利用近红外光谱和化学计量学检测甜玉米种子活力指数的方法,为种子批量无损筛选提供新方法。【方法】在反射和透射模式下分别收集甜玉米种子的近红外光谱,采用主成分分析和蒙特卡罗交叉验证方法对异常值进行识别与剔除;选取最合适的预处理方法和变量选择方法,建立并选取最优偏最小二乘法预测模型。【结果】对于漫反射活力指数定量分析模型,采用532份样品进行建模研究,其最佳预处理方法为多项式平滑导数(Savitzky-Golay derivative,SG)+均值中心化(Mean Center,MC),最佳变量选择方法为竞争自适应重加权抽样(Competitive adaptive reweighted sampling,CARS),其模型的性能参数校正相关系数(R_(c))、交互验证相关系数(R_(cv))、预测相关系数(R_(p))、校正均方根误差(RMSEC)、交互验证均方根误差(RMSECV)和预测均方根误差(RMSEP)分别为0.826、0.783、0.663、0.137、0.151和0.199。对于透射活力指数定量分析模型,采用415份样品进行研究,其最佳预处理方法为SG一阶导数平滑,最佳变量选择方法为相关系数法(Correlation coefficients,CC),模型的性能参数R_(c)、R_(cv)、R_(p)、RMSEC、RMSECV和RMSEP分别为0.783、0.680、0.728、0.121、0.142和0.133,该模型不存在过拟合现象,说明光谱采集的透射模型可能更适合测定种子活力指数。【结论】透射光谱可获得更多有关甜玉米种子活力的信息,透射模块是光谱采集预测种子活力的较好方法。; 关键词甜玉米种子活力近红外光谱化学计量学; Keywords sweet corn seed vigor near infrared spectroscopy chemometrics; 分类号 S513 [农业科学—作物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	长链非编码RNA MSTRG.14200对猪骨骼肌卫星细胞分化及肌纤维转化的影响	杨玉铭赵鑫铭谭宝华肖丽窈芦格言翟立君黄奕扬洪林君顾婷	《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心	2024	1	在线阅读下载PDF 职称材料
2	水稻WOX家族基因鉴定及其种子在逆境萌发中的表达分析	张琪张爱霞贾俊婷赵华刘军陈兵先	《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心	2022	5	在线阅读下载PDF 职称材料
3	植物基因上游开放阅读框的研究进展	薛皦朱庆锋冯彦钊陈沛刘文华张爱霞刘勤坚张琪于洋	《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心	2023	1	在线阅读下载PDF 职称材料
4	应用近红外光谱和化学计量法测定甜玉米种子活力	赵冰王爱文赵华	《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心	2022	1	在线阅读下载PDF 职称材料