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肉鸽肠道微生物菌群差异分析和抗生素耐药基因预测
1
作者
陶洁
李本强
+3 位作者
程靖华
石迎
刘佩红
刘惠莉
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第12期5293-5300,共8页
本研究旨在利用宏基因组学深入分析上海某鸽场青年鸽(RP)和产鸽(LP)粪便样品的微生物菌群差异。结果显示,肉鸽肠道菌群的优势菌门为厚壁菌(Firmicutes)、变形菌(Proteobacteria)和放线菌(Actinobacteria)。RP组中双歧杆菌(Bifidobacteri...
本研究旨在利用宏基因组学深入分析上海某鸽场青年鸽(RP)和产鸽(LP)粪便样品的微生物菌群差异。结果显示,肉鸽肠道菌群的优势菌门为厚壁菌(Firmicutes)、变形菌(Proteobacteria)和放线菌(Actinobacteria)。RP组中双歧杆菌(Bifidobacterium)、棒状杆菌(Corynebacteriun)、嗜冷杆菌(Psychrobacter)、链球菌属(Streptococcus)含量显著高于LP组,而LP组金黄色葡萄球菌属(Staphyloccus)、短状杆菌属(Brachybacterium)、库特氏菌属(Kurthia)和埃希氏菌属(Escherichia)含量显著高于RP组。LEfSe分析显示,LP和RP组的差异表达基因主要富集于5个KEGG通路。抗生素耐药基因(antibiotic resistance genes,ARGs)鉴定显示,肉鸽体内存在198种ARGs,其中多重耐药类ARGs流行率40%以上,说明该场肉鸽抗生素耐药情况较严重。本研究为后续深入研究肠道菌群与健康养殖、抗生素耐药机制等提供了科学数据。
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关键词
肉鸽
宏基因组学
肠道菌群
抗生素耐药基因
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职称材料
题名
肉鸽肠道微生物菌群差异分析和抗生素耐药基因预测
1
作者
陶洁
李本强
程靖华
石迎
刘佩红
刘惠莉
机构
上海市
农业
科学院畜牧兽医研究所
上海市
农业
遗传育种
重点
实验室
农业
农村部
区域
特色
畜禽
品种
疾病
防控
重点
实验室
(
部
省
共建
)
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第12期5293-5300,共8页
基金
上海市肉鸽产业技术体系(沪农科产字(2022)第12号)
动物疾病防控团队(沪农科卓[2022]012)。
文摘
本研究旨在利用宏基因组学深入分析上海某鸽场青年鸽(RP)和产鸽(LP)粪便样品的微生物菌群差异。结果显示,肉鸽肠道菌群的优势菌门为厚壁菌(Firmicutes)、变形菌(Proteobacteria)和放线菌(Actinobacteria)。RP组中双歧杆菌(Bifidobacterium)、棒状杆菌(Corynebacteriun)、嗜冷杆菌(Psychrobacter)、链球菌属(Streptococcus)含量显著高于LP组,而LP组金黄色葡萄球菌属(Staphyloccus)、短状杆菌属(Brachybacterium)、库特氏菌属(Kurthia)和埃希氏菌属(Escherichia)含量显著高于RP组。LEfSe分析显示,LP和RP组的差异表达基因主要富集于5个KEGG通路。抗生素耐药基因(antibiotic resistance genes,ARGs)鉴定显示,肉鸽体内存在198种ARGs,其中多重耐药类ARGs流行率40%以上,说明该场肉鸽抗生素耐药情况较严重。本研究为后续深入研究肠道菌群与健康养殖、抗生素耐药机制等提供了科学数据。
关键词
肉鸽
宏基因组学
肠道菌群
抗生素耐药基因
Keywords
pigeon
metagenomics
gut microbiota
antibiotic resistance gene
分类号
S836 [农业科学—畜牧学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
肉鸽肠道微生物菌群差异分析和抗生素耐药基因预测
陶洁
李本强
程靖华
石迎
刘佩红
刘惠莉
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
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