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坛紫菜泛素连接酶PhCUL1基因克隆与功能验证
被引量：
1
1
作者
林键章
王文磊
+4 位作者
徐燕
许凯
纪德华
陈昌生
谢潮添
《渔业科学进展》
CSCD
北大核心
2021年第1期193-200,共8页
高温影响坛紫菜(Pyropia haitanensis)的产量和品质,是制约紫菜产业发展的主要因素。前期研究发现,高温胁迫下,坛紫菜泛素蛋白酶体系统相关基因显著上调表达,但其响应高温胁迫的分子功能还未知。本研究通过分子生物学、遗传学等技术手...
高温影响坛紫菜(Pyropia haitanensis)的产量和品质,是制约紫菜产业发展的主要因素。前期研究发现,高温胁迫下,坛紫菜泛素蛋白酶体系统相关基因显著上调表达,但其响应高温胁迫的分子功能还未知。本研究通过分子生物学、遗传学等技术手段对坛紫菜cullin E3连接酶基因(PhCUL1)的功能进行研究。利用PCR方法克隆了PhCUL1基因的全长,PhCUL1全长为2500 bp,开放阅读框(ORF)长度为2481 bp,该基因存在1个Cullin(407~618 aa)结构域和1个Cullin Nedd8(754~821 aa)结构域,其中,Cullin Nedd8结构域为蛋白融合位点。进化树分析显示,PhCUL1在进化上与脐形紫菜(Porphyra umbilicalis)有较近的亲缘关系。qRT-PCR结果显示,PhCUL1基因被高温显著诱导。为进一步阐明PhCUL1的分子功能,将其转入莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii)进行功能验证,过表达PhCUL1株系比野生型更能耐受高温胁迫。同时,在高温33℃下处理3 h和6 h内,转基因植株的PhCUL1基因呈上调表达。这初步说明PhCUL1基因在坛紫菜响应高温胁迫过程中发挥着重要作用,其具体调控机制有待进一步研究。本研究有助于阐明坛紫菜泛素蛋白酶体系统响应高温胁迫的分子机制,为指导耐高温新品种选育提供理论依据。
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关键词
高温
坛紫菜
泛素连接酶
莱茵衣藻
转基因
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职称材料
坛紫菜转录因子NhbZIP1克隆和功能验证
被引量：
1
2
作者
曾高雄
许凯
+4 位作者
徐燕
纪德华
陈昌生
谢潮添
王文磊
《渔业科学进展》
CSCD
北大核心
2023年第1期201-209,共9页
高温是制约坛紫菜(Neoporphyra haitanensis)产业发展的主要因素之一,阐明坛紫菜高温胁迫应答机理对耐高温品种选育至关重要。人们已分离多个坛紫菜抗逆相关基因,但尚不清楚这些基因的表达调控机制。本研究通过分子生物学和生物信息学...
高温是制约坛紫菜(Neoporphyra haitanensis)产业发展的主要因素之一,阐明坛紫菜高温胁迫应答机理对耐高温品种选育至关重要。人们已分离多个坛紫菜抗逆相关基因,但尚不清楚这些基因的表达调控机制。本研究通过分子生物学和生物信息学技术分离了坛紫菜转录因子NhbZIP1基因。该基因开放阅读框长825 bp,编码274个氨基酸。从开放阅读框推导的氨基酸序列有5个低复杂度区域和1个BRLZ结构。其中,BRLZ是bZIP家族的保守结构域,含有一个α卷曲螺旋结构(121~171aa)。实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测发现,NhbZIP1受高温胁迫显著诱导。为进一步阐明NhbZIP1的功能,将其转入莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii)中。结果显示,高温胁迫下转基因藻株生物量始终高于野生型,且随处理时间增加差异越来越显著。转基因藻株中热激蛋白家族和抗氧化系统相关基因的表达量显著高于野生型。研究表明,NhbZIP1激活下游抗逆基因表达,在坛紫菜应答高温胁迫中发挥重要作用。研究结果有助于阐明bZIP调控坛紫菜响应高温胁迫的分子机制,为耐高温新品种选育提供了基础信息。
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关键词
坛紫菜
高温胁迫
bZIP转录因子
转基因
莱茵衣藻
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职称材料
赤点石斑鱼抗神经坏死病的基因组选择评估
被引量：
1
3
作者
王卓标
方铭
+4 位作者
郑乐云
葛辉
陈欣欣
罗辉玉
王志勇
《渔业研究》
2022年第3期205-212,共8页
赤点石斑鱼(Epinephelus akaara)是中国东南沿海地区一种重要的海水养殖鱼类,多年来其苗种生产深受神经坏死病的困扰,严重制约了其人工养殖业的发展。本研究采集230尾赤点石斑鱼神经坏死病毒(RGNNV)易感(染病死亡)和230尾抗性(最终健康...
赤点石斑鱼(Epinephelus akaara)是中国东南沿海地区一种重要的海水养殖鱼类,多年来其苗种生产深受神经坏死病的困扰,严重制约了其人工养殖业的发展。本研究采集230尾赤点石斑鱼神经坏死病毒(RGNNV)易感(染病死亡)和230尾抗性(最终健康存活)赤点石斑鱼苗进行基因组重测序,分析获得5412683个单核苷酸多态性(SNPs)位点的基因型,并以之对抗病性状进行了遗传评估和基因组选择研究,获得的估计遗传力均值为0.5662,预测基因组估计育种值(GEBV)均值为0.1543。随机选择不同数量标记对基因组选择准确性影响进行评估,结果表明,采用≥5000个(5 k)标记进行赤点石斑鱼抗神经坏死病性状遗传评估就可以获得比较理想的效果。本研究为开展赤点石斑鱼抗神经坏死病基因组选择育种实践提供了有用的理论参考。
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关键词
赤点石斑鱼
基因组选择
基因组最佳线性无偏预测(GBLUP)
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职称材料
题名
坛紫菜泛素连接酶PhCUL1基因克隆与功能验证
被引量：
1
1
作者
林键章
王文磊
徐燕
许凯
纪德华
陈昌生
谢潮添
机构
农业农村部东海海水健康与养殖重点实验室
出处
《渔业科学进展》
CSCD
北大核心
2021年第1期193-200,共8页
基金
国家自然科学基金面上项目(31872567,41806185)
福建省科技重大专项(2019NZ08003)
现代农业产业技术体系(CARS-50)共同资助。
文摘
高温影响坛紫菜(Pyropia haitanensis)的产量和品质,是制约紫菜产业发展的主要因素。前期研究发现,高温胁迫下,坛紫菜泛素蛋白酶体系统相关基因显著上调表达,但其响应高温胁迫的分子功能还未知。本研究通过分子生物学、遗传学等技术手段对坛紫菜cullin E3连接酶基因(PhCUL1)的功能进行研究。利用PCR方法克隆了PhCUL1基因的全长,PhCUL1全长为2500 bp,开放阅读框(ORF)长度为2481 bp,该基因存在1个Cullin(407~618 aa)结构域和1个Cullin Nedd8(754~821 aa)结构域,其中,Cullin Nedd8结构域为蛋白融合位点。进化树分析显示,PhCUL1在进化上与脐形紫菜(Porphyra umbilicalis)有较近的亲缘关系。qRT-PCR结果显示,PhCUL1基因被高温显著诱导。为进一步阐明PhCUL1的分子功能,将其转入莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii)进行功能验证,过表达PhCUL1株系比野生型更能耐受高温胁迫。同时,在高温33℃下处理3 h和6 h内,转基因植株的PhCUL1基因呈上调表达。这初步说明PhCUL1基因在坛紫菜响应高温胁迫过程中发挥着重要作用,其具体调控机制有待进一步研究。本研究有助于阐明坛紫菜泛素蛋白酶体系统响应高温胁迫的分子机制,为指导耐高温新品种选育提供理论依据。
关键词
高温
坛紫菜
泛素连接酶
莱茵衣藻
转基因
Keywords
High temperature
Pyropia haitanensis
Ubiquitin-protein ligase
Chlamydomonas reinhardtii
Transgenic
分类号
S968.431 [农业科学—水产养殖]
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职称材料
题名
坛紫菜转录因子NhbZIP1克隆和功能验证
被引量：
1
2
作者
曾高雄
许凯
徐燕
纪德华
陈昌生
谢潮添
王文磊
机构
集美大学水产学院
福建省水产生物育种与
健康
养殖
工程研究中心
农业农村部东海海水健康与养殖重点实验室
出处
《渔业科学进展》
CSCD
北大核心
2023年第1期201-209,共9页
基金
国家重点研发项目(2018YFD0901500)
福建省重大科技专项(2019NZ08003)
财政部和农业农村部:国家现代农业产业技术体系共同资助。
文摘
高温是制约坛紫菜(Neoporphyra haitanensis)产业发展的主要因素之一,阐明坛紫菜高温胁迫应答机理对耐高温品种选育至关重要。人们已分离多个坛紫菜抗逆相关基因,但尚不清楚这些基因的表达调控机制。本研究通过分子生物学和生物信息学技术分离了坛紫菜转录因子NhbZIP1基因。该基因开放阅读框长825 bp,编码274个氨基酸。从开放阅读框推导的氨基酸序列有5个低复杂度区域和1个BRLZ结构。其中,BRLZ是bZIP家族的保守结构域,含有一个α卷曲螺旋结构(121~171aa)。实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测发现,NhbZIP1受高温胁迫显著诱导。为进一步阐明NhbZIP1的功能,将其转入莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii)中。结果显示,高温胁迫下转基因藻株生物量始终高于野生型,且随处理时间增加差异越来越显著。转基因藻株中热激蛋白家族和抗氧化系统相关基因的表达量显著高于野生型。研究表明,NhbZIP1激活下游抗逆基因表达,在坛紫菜应答高温胁迫中发挥重要作用。研究结果有助于阐明bZIP调控坛紫菜响应高温胁迫的分子机制,为耐高温新品种选育提供了基础信息。
关键词
坛紫菜
高温胁迫
bZIP转录因子
转基因
莱茵衣藻
Keywords
Neoporphyra haitanensis
Heat stress
bZIP transcription factor
Transgenic
Chlamydomonas Reinhardtii
分类号
S968.431 [农业科学—水产养殖]
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职称材料
题名
赤点石斑鱼抗神经坏死病的基因组选择评估
被引量：
1
3
作者
王卓标
方铭
郑乐云
葛辉
陈欣欣
罗辉玉
王志勇
机构
集美大学水产学院
福建省水产研究所
出处
《渔业研究》
2022年第3期205-212,共8页
基金
福建省科技计划项目(2019R1013)
海水鱼产业技术体系项目(CARS-47-G04).
文摘
赤点石斑鱼(Epinephelus akaara)是中国东南沿海地区一种重要的海水养殖鱼类,多年来其苗种生产深受神经坏死病的困扰,严重制约了其人工养殖业的发展。本研究采集230尾赤点石斑鱼神经坏死病毒(RGNNV)易感(染病死亡)和230尾抗性(最终健康存活)赤点石斑鱼苗进行基因组重测序,分析获得5412683个单核苷酸多态性(SNPs)位点的基因型,并以之对抗病性状进行了遗传评估和基因组选择研究,获得的估计遗传力均值为0.5662,预测基因组估计育种值(GEBV)均值为0.1543。随机选择不同数量标记对基因组选择准确性影响进行评估,结果表明,采用≥5000个(5 k)标记进行赤点石斑鱼抗神经坏死病性状遗传评估就可以获得比较理想的效果。本研究为开展赤点石斑鱼抗神经坏死病基因组选择育种实践提供了有用的理论参考。
关键词
赤点石斑鱼
基因组选择
基因组最佳线性无偏预测(GBLUP)
Keywords
red-spotted grouper
genomic selection
genomic best liner unbiased prediction(GBLUP)
分类号
S943 [农业科学—水产养殖]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
坛紫菜泛素连接酶PhCUL1基因克隆与功能验证
林键章
王文磊
徐燕
许凯
纪德华
陈昌生
谢潮添
《渔业科学进展》
CSCD
北大核心
2021
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
坛紫菜转录因子NhbZIP1克隆和功能验证
曾高雄
许凯
徐燕
纪德华
陈昌生
谢潮添
王文磊
《渔业科学进展》
CSCD
北大核心
2023
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
赤点石斑鱼抗神经坏死病的基因组选择评估
王卓标
方铭
郑乐云
葛辉
陈欣欣
罗辉玉
王志勇
《渔业研究》
2022
1
在线阅读
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职称材料
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