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中国草原红牛PDK4基因多态性及其与肉质性状的关联分析
被引量：
5
1
作者
马彦茹
于永生
+3 位作者
曹阳
秦立红
赵玉民
吴健
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2022年第6期2186-2194,共9页
【目的】研究中国草原红牛丙酮酸脱氢酶激酶4(pyruvate dehydrogenase kinase 4,PDK4)基因多态性与肉质性状的关系。【方法】挑选120头中国草原红牛为研究对象,采用Sanger测序法检测PDK4基因第1~11外显子的单核苷酸多态性(SNP)位点,分析...
【目的】研究中国草原红牛丙酮酸脱氢酶激酶4(pyruvate dehydrogenase kinase 4,PDK4)基因多态性与肉质性状的关系。【方法】挑选120头中国草原红牛为研究对象,采用Sanger测序法检测PDK4基因第1~11外显子的单核苷酸多态性(SNP)位点,分析SNP位点的基因型频率、基因频率及群体遗传参数等。利用SPSS 21.0软件对中国草原红牛PDK4基因SNP位点多态性与肉质性状(熟肉率、肉嫩度、失水率、pH、滴水损失、肌内脂肪含量、初水分含量、蛋白质含量)进行关联分析。【结果】在中国草原红牛PDK4基因外显子8和外显子11上共检测到3个SNPs;PDK4基因第8外显子57 bp处存在1个SNP位点(G57C),且引起编码氨基酸的改变,存在GG、GC和CC 3种基因型;PDK4基因第11外显子在330和389 bp处存在2个SNPs位点(G330T和C389T),在G330T位点上存在GG、GT和TT 3种基因型;在C389T位点上存在CC、CT和TT 3种基因型。卡方适合性检验结果显示,中国草原红牛第8外显子G57C位点偏离Hardy-Weinberg平衡状态(P<0.05),第11外显子的G330T和C398T符合Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05);群体遗传参数分析发现,第8外显子G57C突变位点属于低度多态性位点(PIC<0.25),等位基因数为1.1429,表明其在中国草原红牛中的变异较小;第11外显子G330T和C398T属于中度多态性位点(0.25<PIC<0.5),等位基因数分别为1.6431和1.6447,说明该遗传标记能够提供遗传信息。关联分析结果表明,PDK4基因第8外显子中G57C位点GG和CC基因型个体肌内脂肪含量显著高于GC基因型(P<0.05);第11外显子G330T位点GG基因型滴水损失和初水分量显著高于GT基因型(P<0.05);GG基因型肉嫩度显著高于TT基因型(P<0.05);GT基因型肌内脂肪含量显著高于TT基因型(P<0.05),C389T处CT基因型失水率显著低于TT基因型(P<0.05)。【结论】PDK4基因多态性与中国草原红牛肉质性状相关,可作为肉质性状的候选基因。
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关键词
PDK4基因
中国草原红牛
肉质性状
多态性
关联分析
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职称材料
题名
中国草原红牛PDK4基因多态性及其与肉质性状的关联分析
被引量：
5
1
作者
马彦茹
于永生
曹阳
秦立红
赵玉民
吴健
机构
吉林
农业
大学动物科学技术学院
吉林省
农业
科学院
农业
农村部
肉牛遗传育种重点实验室
农业农村部东北种牛性能测定中心
吉林省肉牛繁育及养殖技术科技创新
中心
出处
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2022年第6期2186-2194,共9页
基金
国家肉牛牦牛产业技术体系(CARA-37)
吉林省科学技术厅重点科技研发项目(20180201039NY)
+2 种基金
吉林省畜禽良种工程项目(肉用草原红牛培育)
吉林省农业科学院国际合作项目(CXGC202108GH)
吉林省农业科技创新工程(高品质肉牛培育)。
文摘
【目的】研究中国草原红牛丙酮酸脱氢酶激酶4(pyruvate dehydrogenase kinase 4,PDK4)基因多态性与肉质性状的关系。【方法】挑选120头中国草原红牛为研究对象,采用Sanger测序法检测PDK4基因第1~11外显子的单核苷酸多态性(SNP)位点,分析SNP位点的基因型频率、基因频率及群体遗传参数等。利用SPSS 21.0软件对中国草原红牛PDK4基因SNP位点多态性与肉质性状(熟肉率、肉嫩度、失水率、pH、滴水损失、肌内脂肪含量、初水分含量、蛋白质含量)进行关联分析。【结果】在中国草原红牛PDK4基因外显子8和外显子11上共检测到3个SNPs;PDK4基因第8外显子57 bp处存在1个SNP位点(G57C),且引起编码氨基酸的改变,存在GG、GC和CC 3种基因型;PDK4基因第11外显子在330和389 bp处存在2个SNPs位点(G330T和C389T),在G330T位点上存在GG、GT和TT 3种基因型;在C389T位点上存在CC、CT和TT 3种基因型。卡方适合性检验结果显示,中国草原红牛第8外显子G57C位点偏离Hardy-Weinberg平衡状态(P<0.05),第11外显子的G330T和C398T符合Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05);群体遗传参数分析发现,第8外显子G57C突变位点属于低度多态性位点(PIC<0.25),等位基因数为1.1429,表明其在中国草原红牛中的变异较小;第11外显子G330T和C398T属于中度多态性位点(0.25<PIC<0.5),等位基因数分别为1.6431和1.6447,说明该遗传标记能够提供遗传信息。关联分析结果表明,PDK4基因第8外显子中G57C位点GG和CC基因型个体肌内脂肪含量显著高于GC基因型(P<0.05);第11外显子G330T位点GG基因型滴水损失和初水分量显著高于GT基因型(P<0.05);GG基因型肉嫩度显著高于TT基因型(P<0.05);GT基因型肌内脂肪含量显著高于TT基因型(P<0.05),C389T处CT基因型失水率显著低于TT基因型(P<0.05)。【结论】PDK4基因多态性与中国草原红牛肉质性状相关,可作为肉质性状的候选基因。
关键词
PDK4基因
中国草原红牛
肉质性状
多态性
关联分析
Keywords
PDK4 gene
Chinese Steppe Red cattle
meat quality traits
polymorphism
association analysis
分类号
S813.3 [农业科学—畜牧学]
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作者
出处
发文年
被引量
操作
1
中国草原红牛PDK4基因多态性及其与肉质性状的关联分析
马彦茹
于永生
曹阳
秦立红
赵玉民
吴健
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2022
5
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