大豆种质资源苗期耐盐鉴定及遗传多样性分析 被引量：6

1

作者 林峰 赵慧艳 +9 位作者 史飞飞 高鹏 刘晨煦 岳阳 金昕 张意德 李永光 韩英鹏 赵雪 滕卫丽 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期945-956,共12页

盐碱地是边际土壤的主要类型之一,利用边际土地耕作是减缓耕地紧缺的有效途径。为筛选耐盐性较强的大豆种质资源,提高盐碱土地大豆产量,本研究对392份来自国内外不同地域的大豆种质资源,采用150 mmol/L NaCl进行苗期盐胁迫处理,采用单... 盐碱地是边际土壤的主要类型之一,利用边际土地耕作是减缓耕地紧缺的有效途径。为筛选耐盐性较强的大豆种质资源,提高盐碱土地大豆产量,本研究对392份来自国内外不同地域的大豆种质资源,采用150 mmol/L NaCl进行苗期盐胁迫处理,采用单株分类记载法进行苗期耐盐性鉴定,并利用10个与耐盐基因连锁的SSR标记对高耐及耐盐等级大豆种质资源进行分子辅助鉴定及遗传多样性分析,应用相似性系数分析、聚类分析等方法对高耐及耐盐等级大豆种质资源进行综合评价。结果表明:筛选出58份高耐及耐盐大豆种质资源,包括赤豆1号、东农69等高耐大豆种质资源14份,黑农51、黑河35等耐盐大豆种质资源44份;58份耐盐大豆种质资源分子辅助鉴定表明,绥农1号、合丰50和东大2号携带耐盐等位变异最多,均为6个,标记平均鉴定效率为43.45%,平均准确率为68.46%,其中分子标记Satt201的鉴定效率和鉴定准确率最高,分别为60.34%和96.55%;聚类分析表明,58份大豆种质资源间的相似性系数在0.5385~0.9231之间,平均值为0.6974,相关系数为0.6240,说明58份大豆种质资源大部分遗传关系较近,遗传多样性较低,58份耐盐大豆种质资源并未按地域进行聚类,但一个类群或亚群中大部分种质资源来源地在地理位置上相同或较为接近,可从中筛选亲缘关系较远的大豆种质资源作为亲本,用于培育耐盐大豆新品种奠定遗传基础。 展开更多

关键词 大豆 苗期 盐胁迫 分子辅助鉴定 遗传多样性分析

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大豆NAC转录因子生物信息学分析及GmNAC-1克隆和亚细胞定位 被引量：1

2

作者 曲硕 刘芳 +5 位作者 孙浩文 宋庚辰 胡世豪 姜海鹏 赵雪 韩英鹏 《大豆科学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期523-538,共16页

为研究抗大豆胞囊线虫NAC基因,对大豆东农L10(抗SCN3)和黑农37(感SCN3)进行SCN3逆境胁迫处理,通过RNA-seq筛选差异表达GmNAC基因,采用生物信息学方法分析大豆NAC蛋白理化性质、磷酸化、亲水性和蛋白结构,并进行亚细胞定位、基因共线性... 为研究抗大豆胞囊线虫NAC基因,对大豆东农L10(抗SCN3)和黑农37(感SCN3)进行SCN3逆境胁迫处理,通过RNA-seq筛选差异表达GmNAC基因,采用生物信息学方法分析大豆NAC蛋白理化性质、磷酸化、亲水性和蛋白结构,并进行亚细胞定位、基因共线性分析和启动子区元件分析。克隆GmNAC-1,构建过表达GmNAC-1的pCAMBIA3300质粒,通过农杆菌注射法转化至烟草中,进行亚细胞定位。对SCN3胁迫后抗、感大豆的根、茎、叶进行荧光定量PCR。结果表明:NAC家族蛋白总体呈现电中性;二、三级结构无规则卷曲比例最高;亚细胞定位表明NAC家族蛋白存在于细胞核;蛋白总体呈现亲水性,不存在染色体偏好性;丝氨酸对维持蛋白功能发挥主要作用;蛋白总体上为可溶性蛋白;存在多个响应逆境胁迫应答元件LTR、MRE、TGACG-motif等;共线性分析表明不同物种中的NAC基因存在一定同源性。荧光定量PCR结果表明抗、感大豆在受到SCN3胁迫后,GmNAC-1基因均存在上调表达,但抗病比感病大豆根系GmNAC-1基因上调表达更明显。亚细胞定位结果表明GmNAC-1定位于细胞核中,与生物信息学预测结果一致。本研究通过RNA-seq筛选差异表达基因GmNAC-1,该基因参与SCN逆境胁迫,结果为进一步研究抗大豆抗胞囊线虫基因奠定基础。 展开更多

关键词 大豆胞囊线虫 GmNAC-1 RNA-SEQ 荧光定量PCR 生物信息学

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大豆GmMYB48基因克隆、生物信息学分析及其参与大豆胞囊线虫病抗性功能分析 被引量：3

3

作者 战宇航 胡世豪 +5 位作者 曲硕 宋庚晨 刘芳 赵旷宇 孙浩文 韩英鹏 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期1-12,共12页

MYB转录因子在植物生长发育过程中执行重要调控功能。以大豆胞囊线虫3号生理小种(SCN 3)胁迫下大豆抗病品种“东农L-10”和感病品种“黑农37”转录组数据为基础,筛选出MYB家族差异表达基因GmMYB48,克隆GmMYB48基因并进行生物信息学、亚... MYB转录因子在植物生长发育过程中执行重要调控功能。以大豆胞囊线虫3号生理小种(SCN 3)胁迫下大豆抗病品种“东农L-10”和感病品种“黑农37”转录组数据为基础,筛选出MYB家族差异表达基因GmMYB48,克隆GmMYB48基因并进行生物信息学、亚细胞定位、基因表达模式分析及过表达大豆毛状根。结果表明,GmMYB48基因编码蛋白为碱性蛋白,与拟南芥存在共线性关系,在植物中分布广泛;靶基因预测分析发现GmMYB48基因参与大豆对盐、干旱、金属盐离子等逆境胁迫反应;启动子元件分析显示,该基因存在多个环境胁迫响应相关WUN-motif、MYB等启动子元件;烟草叶片瞬时表达表明GmMYB48基因定位于细胞核中;GmMYB48基因转录响应大豆胞囊线虫胁迫,在抗病材料根部转录水平较高。通过发根农杆菌介导的遗传转化获得GmMYB48基因过表达大豆毛状根,过表达毛状根较野生型毛状根中单位面积内线虫数目明显减少,从表型鉴定中鉴定GmMYB48基因参与大豆对胞囊线虫3号生理小种的抗性反应。研究初步探究GmMYB48基因在抗大豆胞囊线虫中的功能,为进一步研究抗大豆胞囊线虫病机制奠定基础。 展开更多

关键词 大豆胞囊线虫 QRT-PCR 生物信息学 亚细胞定位 遗传转化

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2024年大豆相关性状分子标记应用的研究进展

4

作者 韩英鹏 杨振红 《广东农业科学》 2025年第7期9-20,共12页

近年来,单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)依靠分布密集、突变率小和易于测序自动化等优点成为研究作物相关性状遗传基础的首选分子标记,助力基因组测序和基因分型的改进,在独立于参考基因组的基础上识别表型形成基因... 近年来,单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)依靠分布密集、突变率小和易于测序自动化等优点成为研究作物相关性状遗传基础的首选分子标记,助力基因组测序和基因分型的改进,在独立于参考基因组的基础上识别表型形成基因,加速大豆改良育种的进程。传统育种主要依赖表型选择,即通过观察植株的形态、产量、抗性等外在特征进行筛选,这种方法周期长、效率低,且易受环境因素干扰。相比之下,分子标记辅助育种(Molecular Marker-assisted Breeding,MAS)利用分子标记与决定目标性状基因紧密连锁的特点,通过检测分子标记,即可检测到目的基因的存在,达到选择目标性状和显著提高育种效率的目的。随着高通量测序技术的革新,多种高效基因定位策略应运而生,基于批量分离分析(BSA)的方法〔QTL-seq、梯度测序(Gradient-seq)、QTG-Seq、外显子组QTL-seq和RapMap〕,通过对比极端表型群体的基因组差异快速定位候选基因;基于突变体的方法(MutMap、NIKS算法、MutRenSeq和MutChromSeq),利用诱变群体结合测序技术鉴定功能基因;基于目标序列富集的技术(如RenSeq、AgRenSeq和TACCA)可高效筛选抗病相关SNP。此外,统计方法的优化(混合线性模型MLM、多位点GWAS及机器学习算法的应用)显著提升了经典定位策略和全基因组关联分析的检测精度与效率,使与复杂性状(产量、抗逆性等)相关的微效多基因变异和稀有等位基因得以更准确地识别。为梳理大豆育种工作中SNP标记应用的研究进展,该文汇总了2024年大豆产量、品质、抗逆性以及株型等性状在QTL定位和候选基因功能分析方面的研究成果,希望将更多有效SNP位点应用于分子标记辅助育种。 展开更多

关键词 大豆 SNP标记 QTL定位 高通量测序 分子标记辅助育种 目的性状

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大豆高密度遗传图谱的构建及产量相关性状QTL定位 被引量：4

5

作者 王博 董莹莹 +8 位作者 付雪 刘赫禹 张翔超 刘冀 史飞飞 赵雪 韩英鹏 李文滨 滕卫丽 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第6期1228-1238,共11页

大豆是重要的粮油作物,而我国大豆主要依靠进口,提高大豆产量对保障国家粮油安全意义重大。为定位大豆产量相关性状,本研究以产量差异显著的东农42和东农50作为杂交亲本,构建了包含168个家系的重组自交系(recombination inbred lines,RI... 大豆是重要的粮油作物,而我国大豆主要依靠进口,提高大豆产量对保障国家粮油安全意义重大。为定位大豆产量相关性状,本研究以产量差异显著的东农42和东农50作为杂交亲本,构建了包含168个家系的重组自交系(recombination inbred lines,RILs)群体,对其进行全基因组重测序,构建高密度遗传图谱,并利用R/qtl软件的复合区间作图法(composite interval mapping,CIM)结合两年六点的大豆产量相关性状表型数据,进行QTL定位。结果表明:利用测序获得的660316个SNP标记构建了一张分布在20个连锁群的包含6227个bin标记的大豆高密度遗传图谱,总图距和平均图距分别为2739.15 cM,0.44 cM。在12个染色体上定位到22个大豆产量相关性状QTL,四粒荚数、单株荚数、单株粒重和百粒重性状定位到的QTL分别为5、4、5和8个。在3号和19号染色体上各有一段基因组区域在两年间重复定位,涉及6个主效QTL,分别为qNFSP-19-1(22.976%)、qNFSP-19-2(11.977%)、qNFSP 19-3(17.203%)、qHSW-3-1(11.346%)、qHSW-3-2(11.346%)和qHSW-3-3(11.175%),加性效应值均为负值。在3、7、11、12和20号染色体上新定位到7个产量相关性状QTL,其中表型贡献率最高的为qHSW-3-3(14.276%),包含具有重复定位区间的qHSW-3-2和qHSW-3-3。与前人定位的结果相比,更多QTL极大地缩短了定位区间,表明本文报道的高密度遗传图谱更准确,可以为大豆产量相关性状的精细定位、候选基因的挖掘及分子标记辅助育种奠定基础。 展开更多

关键词 大豆 高密度遗传图谱 四粒荚数 单株荚数 单株粒重 百粒重 QTL

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大豆胞囊线虫病抗性相关AP2/EREBP转录因子生物信息学分析 被引量：3

6

作者 韩英鹏 卜凡珊 +2 位作者 田利峥 姜海鹏 赵雪 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第8期1-8,73,共9页

AP2/EREBP转录因子家族在植物应对逆境胁迫时发挥重要作用,为进一步了解大豆胞囊线虫病3号生理小种抗性相关AP2/EREBP家族转录因子生物学功能,研究利用“东农L-10”转录组测序结果,筛选得到14个与抗性相关AP2/EREBP转录因子序列,并对其... AP2/EREBP转录因子家族在植物应对逆境胁迫时发挥重要作用,为进一步了解大豆胞囊线虫病3号生理小种抗性相关AP2/EREBP家族转录因子生物学功能,研究利用“东农L-10”转录组测序结果,筛选得到14个与抗性相关AP2/EREBP转录因子序列,并对其开展在线生物信息学预测和分析。结果表明,14个转录因子多数为酸性等电点,均属于亲水性蛋白;通过与拟南芥AP2/EREBP转录因子作多序列比对和系谱进化树分析可知,AP2/EREBP转录因子根据其保守结构域特点分为AP2、ERF和DREB等3个亚族,且可分为B3、B5、A2和A5亚类。亚细胞定位预测结果显示AP2/EREBP转录因子发挥重要作用的位置依次为细胞核、线粒体、叶绿体;蛋白质二级结构中氨基酸序列以无规则卷曲为主要组成,α-螺旋次之,β-折叠和β-转角则散布于蛋白质序列中,同一亚族蛋白质三级结构之间无明显差异,而不同亚族之间差异显著,表明大豆胞囊线虫病相关AP2/EREBP转录因子在遗传进化过程中高度保守,其结构和功能可能具有相似性。 展开更多

关键词 大豆胞囊线虫 AP2/EREBP 转录因子 生物信息学

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大豆株型与产量相关性状QTL定位及候选基因预测 被引量：4

7

作者 滕卫丽 高鹏 +7 位作者 刘晨煦 赵慧艳 岳阳 史飞飞 林峰 赵雪 韩英鹏 李文滨 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期1-13,共13页

为探究与大豆株型和产量相关QTL位点及候选基因,对以东农42(♀)和东农50(♂)为亲本,与168个家系构建的F_(2:12)、F_(2:13)重组自交系(Recombination inbred lines,RILs)群体的株高、分枝数、四粒荚数、百粒重性状测定表型数据,运用IBM S... 为探究与大豆株型和产量相关QTL位点及候选基因,对以东农42(♀)和东农50(♂)为亲本,与168个家系构建的F_(2:12)、F_(2:13)重组自交系(Recombination inbred lines,RILs)群体的株高、分枝数、四粒荚数、百粒重性状测定表型数据,运用IBM SPSS Statistics、R语言进行统计和相关性分析,并利用完备区间作图法(Inclusive composite interval mapping,ICIM)进行加性效应及上位效应分析,共计定位到43个QTL位点,贡献率超过10%的主效位点为14个,包括株高3个、分枝数8个、四粒荚数1个和百粒重2个;其中11个位点与前人已报道位点重合,分别位于4、6、8、16和19号染色体上;qBN-6-2(13.21%)、qBN-6-5(19.96%)和qBN-6-6(13.69%)为3个环境重复定位到的位点,qHSW-19-1与多个已报道位点均有重合。通过上位性分析,获得株高、分枝数、四粒荚数和百粒重位点分别为3、6、6和62对。根据所定位到的物理区间和定量预测,筛选到Glyma.04G238800、Glyma.03G181600、Glyma.08G271900、Glyma.18G278800和Glyma.19G187000等5个与株高、分枝数、四粒荚数和百粒重性状相关的候选基因,为分子辅助育种奠定基础。 展开更多

关键词 大豆 株高 分枝数 四粒荚数 百粒重 QTL

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大豆抗病性和分子标记及分子辅助育种研究进展 被引量：3

8

作者 韩英鹏 杨振红 《大豆科技》 2021年第5期18-25,共8页

分子标记和分子辅助育种(MAS)广泛应用于大豆的育种工作。相较传统育种,分子辅助育种(MAS)高效快速的特点成为其优势。随着大豆基因组学、蛋白组学、代谢组学以及表型组学的研究,大量重要农艺性状相关基因被鉴定,将这些遗传位点开发成... 分子标记和分子辅助育种(MAS)广泛应用于大豆的育种工作。相较传统育种,分子辅助育种(MAS)高效快速的特点成为其优势。随着大豆基因组学、蛋白组学、代谢组学以及表型组学的研究,大量重要农艺性状相关基因被鉴定,将这些遗传位点开发成分子标记,结合分子辅助育种,可以快速得到所预期的大豆品种。为了详细了解分子标记的应用范围,综述收集了 2021年分子标记和分子辅助育种在大豆上的研究报告,希望能为大豆研究者提供一些有益信息。 展开更多

关键词 大豆 分子标记 MAS 农艺性状

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大豆胞囊线虫3号生理小种抗性相关TIFY基因生物信息学分析 被引量：2

9

作者 孙浩文 曲硕 +2 位作者 刘芳 姜海鹏 韩英鹏 《大豆科学》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期532-544,共13页

TIFY转录因子参与调节植物的生长和发育,同时参与植物应激反应,在植物生长中具有重要调控功能。为探索TIFY基因家族成员在大豆胞囊线虫病(Soybean Cyst Nematode,SCN)3号生理小种抗性反应中的作用,选择抗病品种东农L-10和感病品种黑农3... TIFY转录因子参与调节植物的生长和发育,同时参与植物应激反应,在植物生长中具有重要调控功能。为探索TIFY基因家族成员在大豆胞囊线虫病(Soybean Cyst Nematode,SCN)3号生理小种抗性反应中的作用,选择抗病品种东农L-10和感病品种黑农37进行SCN 3号生理小种胁迫处理,在转录组测序数据中分析筛选到多个与抗性相关的TIFY转录因子,并对其进行生物信息学预测和分析。结果表明:从转录组数据中鉴定和筛选到23个与SCN 3号生理小种相关的差异表达TIFY转录因子,其中18个转录因子上调表达,5个转录因子下调表达,TIFY基因在大豆的根、茎、叶均存在一定表达量,在相同的大豆胞囊线虫胁迫下,抗病品种中TIFY表达量要高于感病品种。不同TIFY转录因子之间的理化性质存在较大差异。23个转录因子均属于亲水性蛋白,多数为酸性等电点。亚细胞定位预测结果显示,TIFY转录因子发挥重要作用的位置依次为细胞核、细胞质、线粒体。蛋白质二级结构中氨基酸序列以无规则卷曲为主要组成,α-螺旋次之,β-折叠和β-转角则散布于蛋白质序列中。基因分布在大豆的10条染色体上,磷酸化位点丝氨酸偏多,启动子中存在很多响应激素应答和胁迫相关的顺式作用元件,说明TIFY基因所编码的蛋白中部分为响应胁迫的蛋白。研究结果说明筛选到的23个与SCN 3号生理小种相关的TIFY转录因子可为进一步了解大豆TIFY基因的功能提供重要参考。 展开更多

关键词 大豆胞囊线虫 3号生理小种 TIFY转录因子 生物信息学

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大豆抗胞囊线虫锌指蛋白基因GmC_(2)H_(2)-2like克隆与初步功能分析 被引量：2

10

作者 曲硕 刘芳 +4 位作者 宋庚晨 胡世豪 房瑶瑶 赵雪 韩英鹏 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2024年第3期195-207,共13页

为了研究锌指蛋白C_(2)H_(2)在大豆胞囊线虫病(SCN)胁迫应答中起到的重要作用,为进一步研究抗大豆胞囊线虫奠定重要基础。利用东农L-10(抗SCN)、黑农37(感SCN)接种SCN3根系转录组数据,筛选出差异表达基因GmC_(2)H_(2)-2like。倒置荧光... 为了研究锌指蛋白C_(2)H_(2)在大豆胞囊线虫病(SCN)胁迫应答中起到的重要作用,为进一步研究抗大豆胞囊线虫奠定重要基础。利用东农L-10(抗SCN)、黑农37(感SCN)接种SCN3根系转录组数据,筛选出差异表达基因GmC_(2)H_(2)-2like。倒置荧光显微镜下观察该GmC_(2)H_(2)-2like定位情况,对该基因进行生物信息学分析,克隆并构建其超表达载体转化大豆毛状根,研究其对胞囊线虫病的抗性功能。结果表明,GmC_(2)H_(2)-2like编码410个氨基酸残基,分子质量为45.77 ku,等电点为8.73,含47个磷酸化位点,蛋白二级结构含α-螺旋(25.61%)、无规则卷曲(57.32%)、延伸链(13.66%)和β-转角(3.14%)4种结构;亚细胞定位结果发现,其编码蛋白位于细胞核;分析超表达转GmC_(2)H_(2)-2like大豆毛状根发现,其根部组织的单位面积胞囊线虫数量显著低于空载体对照,表明GmC_(2)H_(2)-2like具有抑制胞囊线虫的功能。 展开更多

关键词 大豆 胞囊线虫 GmC_(2)H_(2)-2like 生物信息学 亚细胞定位

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大豆胞囊线虫相关基因GmSBPC的克隆及表达模式分析

11

作者 宋庚晨 曲硕 +4 位作者 胡世豪 刘芳 孙浩文 赵雪 韩英鹏 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期1001-1013,共13页

以黑农37(感)和东农L10(抗)大豆胞囊线虫3号生理小种胁迫RNA-seq数据,筛选出差异表达基因GmSBPC,对该基因编码蛋白的空间结构、蛋白理化性质、亲疏水性等进行生物信息学分析。利用抗病东农L10根系c DNA克隆GmSBPC。将含有pCAMBIA1302-Gm... 以黑农37(感)和东农L10(抗)大豆胞囊线虫3号生理小种胁迫RNA-seq数据,筛选出差异表达基因GmSBPC,对该基因编码蛋白的空间结构、蛋白理化性质、亲疏水性等进行生物信息学分析。利用抗病东农L10根系c DNA克隆GmSBPC。将含有pCAMBIA1302-GmSBPC重组载体转化至大肠杆菌DH5α、农杆菌GV3101(psoup-p19)进行亚细胞定位分析。重组pCAMBIA3300-Gm SBPC转至根癌农杆菌K599进行大豆毛状根侵染。线虫土种植东农L10(抗)、东农50(感),大豆胞囊线虫胁迫处理0 d、3 d、6 d、9 d、12 d、15 d分别取根、茎、叶进行qRT-PCR分析基因表达模式。结果表明,GmSBPC蛋白编码146个氨基酸,为不溶性蛋白,α螺旋区占28.08%、延伸结构占15.75%、无规则卷曲占56.16%。亚细胞定位结果表明基因定位在细胞核中。过表达毛状根相比野生型大豆单位面积内线虫数目减少。大豆胞囊线虫胁迫下该基因在东农50和东农L10根系的表达模式为先升高后降低,整体表达水平东农L10根系>东农50根系,东农L10根系中12 d表达量最高,该时期为线虫侵染大豆的二龄幼虫时期,因此判定该基因对线虫胁迫存在响应应答反应,推测该基因参与大豆胞囊线虫的胁迫反应。这些研究结果有助于进一步探讨SBPC基因在大豆抗胞囊线虫过程中的生理功能。 展开更多

关键词 大豆 GmSBPC QRT-PCR 亚细胞

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大豆胞囊线虫相关基因GmWRKY-3克隆及功能探究

12

作者 刘芳 曲硕 +3 位作者 孙浩文 姜海鹏 赵雪 韩英鹏 《江苏农业科学》 北大核心 2024年第23期30-38,共9页

大豆是世界四大粮食作物之一,与小麦、水稻和玉米并列。大豆胞囊线虫(SCN,Heterodera glycines Ichinohe)是全球大豆最有害的病原体之一。利用大豆胞囊线虫3号生理小种(SCN 3)、感病品种绥农14、抗病品种东农L10为材料,进行转录组分析,... 大豆是世界四大粮食作物之一,与小麦、水稻和玉米并列。大豆胞囊线虫(SCN,Heterodera glycines Ichinohe)是全球大豆最有害的病原体之一。利用大豆胞囊线虫3号生理小种(SCN 3)、感病品种绥农14、抗病品种东农L10为材料,进行转录组分析,筛选出差异表达基因GmWRKY-3。为探究大豆GmWRKY-3基因的生物学功能及潜在用途,克隆GmWRKY-3基因,对GmWRKY-3基因的理化性质、编码的蛋白质的二级结构和三级结构以及系统进化等生物信息学分析;构建pCAMBIA1302-GmWRKY-3利用农杆菌侵染烟草,并进行亚细胞定位分析;构建pCAMBIA3300-GmWRKY-3植物重组质粒,转化农杆菌K599后瞬时侵染大豆毛状根,初步探究GmWRKY-3基因的功能。结果表明,GmWRKY-3基因编码的蛋白分子量约为24.93 ku,等电点为8.46,分子式为C_(1086)H_(1722)N_(312)O_(343)S_(9),不稳定系数为67.73,属于不稳定蛋白质。二级结构以无规则卷曲为主,三级结构由1个α-螺旋和5个β-折叠组成;该基因含有多个光响应元件和多种激素顺式作用元件等。亚细胞定位结果表明,GmWRKY-3基因主要定位于细胞核。农杆菌瞬时侵染大豆毛状根结果表明,与pCAMBIA3300空载体转基因植株相比,pCAMBIA3300-GmWRKY-3重组质粒转基因受体植株东农50中根部线虫数量相对较少。上述结果表明,GmWRKY-3基因对SCN有一定的抵抗能力。 展开更多

关键词 大豆 大豆胞囊线虫 GmWRKY-3 亚细胞定位

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基于主茎力学特性的大豆种质资源抗倒伏性分析 被引量：8

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作者 刘明 王贞杰 +4 位作者 孙亚男 赵彩桐 韩德志 李文滨 姜振峰 《大豆科学》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期23-31,共9页

为从力学角度分析栽培年份、种植密度及主要化学成分指标对大豆种质资源抗倒伏性的影响,为基于主茎力学特性进行大豆抗倒伏的资源鉴定和新品种选育提供理论依据,本研究于2020和2021年在田间种植190份大豆资源,在成熟期测量株高、直径、... 为从力学角度分析栽培年份、种植密度及主要化学成分指标对大豆种质资源抗倒伏性的影响,为基于主茎力学特性进行大豆抗倒伏的资源鉴定和新品种选育提供理论依据,本研究于2020和2021年在田间种植190份大豆资源,在成熟期测量株高、直径、折断力3种主茎表型性状及木质素、纤维素含量两种化学成份指标,对不同种植年份不同大豆资源的主茎表型性状进行方差分析,对各大豆资源3种主茎表型性状进行相关性分析。同时,在2020年筛选抗倒伏特性差异明显的20份大豆材料,于2021年进行盆栽种植,设置两个种植密度处理(20万和30万株·hm^(-2)),在成熟期测定主茎表型性状和化学成份指标,并计算弹性模量和抗倒伏系数,分析种植密度及主茎力学相关指标与大豆抗倒伏性的关系。结果表明:年份与折断力互作、品种(系)与折断力互作显著。年际间环境条件差异对折断力有较大影响,折断力大的品种(系)抗倒伏系数也高。主茎折断力与直径呈正相关,而直径与株高之间无明显规律。大豆抗倒伏系数与折断力、弹性模量呈极显著正相关,相关系数分别为0.90和0.42。两个种植密度下折断力较大的品种(系)植株抗倒伏系数和弹性模量均大于折断力较低的品种(系)。抗倒伏系数与茎秆木质素含量和纤维素含量呈极显著正相关,相关系数分别为0.68和0.72。综上表明大豆植株抗倒伏特性与主茎力学特性指标间关系密切,可以利用主茎折断力对大豆资源抗倒伏特性强弱进行区分,木质素和纤维素含量高的大豆资源抗倒伏能力强。综合考虑具体栽培条件可进一步提高大豆资源抗倒伏性分析结果的准确性。 展开更多

关键词 大豆 种质资源 主茎力学特性 抗倒伏系数 种植密度

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大豆种质耐碱性状全基因组关联分析 被引量：5

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作者 滕卫丽 史飞飞 +6 位作者 林峰 刘晨煦 高鹏 赵慧艳 赵雪 韩英鹏 李文滨 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期1-13,共13页

以255份大豆种质为试验材料,利用混合碱模拟大庆市苏打盐碱地碱胁迫环境,在大豆种质芽期和苗期分别调查耐碱相关性状,结合BLINK和FarmCPU两种方法进行全基因组关联分析。结果表明,共检测到64个关联SNP位点,其中3:37513903、3:37490361、... 以255份大豆种质为试验材料,利用混合碱模拟大庆市苏打盐碱地碱胁迫环境,在大豆种质芽期和苗期分别调查耐碱相关性状,结合BLINK和FarmCPU两种方法进行全基因组关联分析。结果表明,共检测到64个关联SNP位点,其中3:37513903、3:37490361、9:37033917等7个SNP位点相对稳定,可靠性较高;筛选到26个功能注释基因,根据功能注释和基因表达量,推测3个基因与耐碱相关,分别为Glyma.03G160200、Glyma.09G149900和Glyma.19G067400。 展开更多

关键词 大豆 碱胁迫 芽期 苗期 全基因组关联分析

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大豆抗倒伏相关性状全基因组关联分析 被引量：6

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作者 李文滨 吴航 +6 位作者 刘冀 张翔超 郭志文 郑立娜 赵雪 韩英鹏 滕卫丽 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第3期1-12,共12页

研究以150份大豆种质为试验材料开展2年3点试验,在收获期测定抗倒伏相关性状,并利用RTMGWAS方法作关联分析,共检测到99个显著关联SNP位点,其中48个效应显著位点,解释0.28%~3.38%表型变异;89个与环境互作显著位点,解释0.53%~7.04%表型变... 研究以150份大豆种质为试验材料开展2年3点试验,在收获期测定抗倒伏相关性状,并利用RTMGWAS方法作关联分析,共检测到99个显著关联SNP位点,其中48个效应显著位点,解释0.28%~3.38%表型变异;89个与环境互作显著位点,解释0.53%~7.04%表型变异;其中,21个位点主效表型变异解释率高于1%;与6个倒伏相关性状显著关联SNP位点中,与茎粗显著关联SNP位点最多,与抗倒指数显著关联SNP位点最少;获得22个有功能注释基因,根据基因表达量和基因功能注释,推测3个基因(Glyma.18G149700、Glyma.04G244100、Glyma.18G011400)可作为与大豆抗倒伏相关候选基因。 展开更多

关键词 大豆 倒伏性状 全基因组关联分析 候选基因挖掘

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大豆重组自交系群体芽期耐盐性状加性与上位性QTL定位 被引量：4

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作者 滕卫丽 付雪 +7 位作者 刘冀 张翔超 史飞飞 王博 董莹莹 赵雪 韩英鹏 李文滨 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第4期1-8,共8页

研究采用芽期耐盐性状差异显著的东农46和L-100杂交衍生的包含127个家系的F2:12和F2:13重组自交系群体为试验材料,调查耐盐性状:吸胀率(IR)、发芽指数(GI)和发芽率(GR),计算3个相对耐盐指数:相对吸胀率(STIR)、相对发芽指数(STGI)和相... 研究采用芽期耐盐性状差异显著的东农46和L-100杂交衍生的包含127个家系的F2:12和F2:13重组自交系群体为试验材料,调查耐盐性状:吸胀率(IR)、发芽指数(GI)和发芽率(GR),计算3个相对耐盐指数:相对吸胀率(STIR)、相对发芽指数(STGI)和相对发芽率(STGR),利用QTL IciMapping 4.1.0.0软件对3个相对耐盐指数作QTL分析。结果表明,共检测到12个加性QTL,贡献率为4.88%~15.91%,2个位点有重叠区间,3个性状表型贡献率最高QTL分别为qSTIR-9-1(15.91%)、qSTGI-2-1(10.21%)和qSTGR-20-1(12.23%),共检测到108个上位性QTL,贡献率为0.55%~26.59%。该耐盐性状QTL为分子辅助培育抗盐大豆品种奠定基础。 展开更多

关键词 大豆 芽期 耐盐性状 QTL

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不同发育时期大豆豆荚性状QTL动态分析 被引量：3

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作者 滕卫丽 郭志文 +9 位作者 郑立娜 付雪 王博 董莹莹 张丹洋 刘赫禹 冯文婧 赵雪 韩英鹏 李文滨 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第10期1-9,共9页

文章选用母本东农46和父本L-100构建重组自交群体127个家系为试验材料,利用全基因组重测序技术构建高密度遗传连锁图谱,结合群体豆荚长、宽、厚性状R3~R8时期表型数据,利用QTL IciMapping 4.1.0.0软件完备区间作图法分析非条件和条件QT... 文章选用母本东农46和父本L-100构建重组自交群体127个家系为试验材料,利用全基因组重测序技术构建高密度遗传连锁图谱,结合群体豆荚长、宽、厚性状R3~R8时期表型数据,利用QTL IciMapping 4.1.0.0软件完备区间作图法分析非条件和条件QTL加性和上位性效应。结果表明,在豆荚3个性状发育过程中,共检测到40个非条件加性效应QTL,贡献率为4.35%~25.52%;检测到12个条件加性效应QTL,贡献率为3.80%~23.32%。同时检测到多个QTL位点在不同性状或不同生育时期表达,如QPL-7-1、QPL-12-2和QPL-20-1(QPW-20-1)等。通过上位性分析检测到豆荚长度143对、宽度185对和厚度34对QTL位点,贡献率最高分别达29.69%、24.73%和25.17%,表明多基因效应在豆荚生长发育过程中发挥重要作用。 展开更多

关键词 大豆 豆荚性状 QTL 加性效应 上位性效应

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大豆苗期根系根际酶谱原位分析 被引量：3

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作者 姜振峰 李珊珊 +3 位作者 温明星 孙亚男 赵宛瀛 刘志华 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第11期1-9,共9页

利用室内根盒培养建立的原位根际酶活检测方法,分析生长习性不同的Charleston(有限生长习性)、东农594(亚有限生长习性)和DN50(亚有限生长习性)3个大豆品种在正常土壤(有机质含量高)和退化土壤(有机质含量低)条件下根系表型特征,分析大... 利用室内根盒培养建立的原位根际酶活检测方法,分析生长习性不同的Charleston(有限生长习性)、东农594(亚有限生长习性)和DN50(亚有限生长习性)3个大豆品种在正常土壤(有机质含量高)和退化土壤(有机质含量低)条件下根系表型特征,分析大豆根系碳代谢途径关键酶(β-葡萄糖苷酶)活性变化,明确不同类型土壤影响大豆根系生长发育的规律。结果表明,不同生长习性大豆品种对土壤适应性存在基因型差异,根系表型和土壤环境关系密切。大豆根际β-葡萄糖苷酶活性较土壤中β-葡萄糖苷酶活性高。活性表现为沿根系基部逐渐增加,到根尖活性最大的分布规律,在根尖形成酶活性热点。沿根系生长方向的β-葡萄糖苷酶扩散宽度与酶活性强度在不同类型土壤中分布规律一致,均为由基部到根尖逐渐增加。研究结果明确大豆根际碳代谢关键酶活性变化特点,可为大豆生长发育及高产新品种选育提供根系角度理论支持。 展开更多

关键词 大豆 根系 根际酶活性 原位酶谱

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大豆再生相关性状QTL定位 被引量：1

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作者 滕卫丽 郑立娜 +3 位作者 张琦 赵雪 韩英鹏 李文滨 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第4期1-10,共10页

文章采用子叶节法,利用高再生率大豆品种合丰25与低再生率大豆品系L-28及其衍生的重组自交系群体(RIL)100个家系,评价不定芽诱导率、伸长率、生根率和成苗率等指标,比较不同大豆基因型之间再生率差异,并利用简化基因组测序技术作QTL定... 文章采用子叶节法,利用高再生率大豆品种合丰25与低再生率大豆品系L-28及其衍生的重组自交系群体(RIL)100个家系,评价不定芽诱导率、伸长率、生根率和成苗率等指标,比较不同大豆基因型之间再生率差异,并利用简化基因组测序技术作QTL定位分析。结果表明,在大豆RIL群体4个再生性状中,诱导率与伸长率、生根率和成苗率之间均达极显著,表现为连续单峰曲线,符合正态分布特点。同时检测到10个与大豆再生性状显著相关QTL位点,其中独立QTL位点2个,可重复检测QTL位点3个,与诱导率、伸长率、生根率和成苗率显著相关QTL位点分别为2个、3个、3个、2个。研究结果将为探索大豆再生规律、建立高效再生体系、提高大豆遗传转化效率奠定基础。 展开更多

关键词 大豆 再生体系 QTL

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大豆GmFT5a基因启动子受日长调控模式分析 被引量：1

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作者 赵琳 张妍 +1 位作者 刘颖 许崇晶 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期19-25,共7页

研究构建大豆成花素GmFT5a基因启动子与pGreenII 0800双分子萤光素酶融合植物表达载体,农杆菌注射烟草,通过烟草体内瞬时表达活性试验分析长、短日照条件对GmFT5a启动子表达活性的影响,探讨GmFT5a受日长的表达影响。结果表明,经短日照... 研究构建大豆成花素GmFT5a基因启动子与pGreenII 0800双分子萤光素酶融合植物表达载体,农杆菌注射烟草,通过烟草体内瞬时表达活性试验分析长、短日照条件对GmFT5a启动子表达活性的影响,探讨GmFT5a受日长的表达影响。结果表明,经短日照处理的GmFT5a启动子表达活性高于长日照处理。说明短日照诱导GmFT5a启动子表达,进一步说明该基因为光周期调控因子。利用PLANTCARE在线预测工具分析GmFT5a基因启动子序列可知,GmFT5a启动子序列包含BOX 4、G-box、GT1-motif、Gap-box、chs-CMA1a光响应调控元件。由此说明GmFT5a基因可能通过启动子上光响应元件调控参与调控光周期。 展开更多

关键词 大豆 GmFT5a启动子 日长

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