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基于微流控芯片的72重单核苷酸多态性族群推断系统的构建
1
作者
任苹
刘京
+5 位作者
蔺日胜
刘杨
黄美莎
胡胜
徐友春
李彩霞
《色谱》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第7期599-607,共9页
建立了常染色体单核苷酸多态性(SNPs)复合检测芯片体系,用于未知个体的族群来源推断。基于前期筛选的74-SNPs组合,采用竞争性等位基因特异性聚合酶链式反应(PCR)的原理构建SNPs的扩增体系,在微流控芯片的每个反应孔内完成一个SNP的检测...
建立了常染色体单核苷酸多态性(SNPs)复合检测芯片体系,用于未知个体的族群来源推断。基于前期筛选的74-SNPs组合,采用竞争性等位基因特异性聚合酶链式反应(PCR)的原理构建SNPs的扩增体系,在微流控芯片的每个反应孔内完成一个SNP的检测,通过高通量PCR微流控芯片实现了其中72个SNPs的同步检测。芯片的扩增由平板PCR仪完成,反应孔的荧光信号通过激光共聚焦扫描仪检测,最终通过提取的荧光值进行结果分析。使用该芯片检测获得52份样本的SNPs分型,分型结果的准确率为100%。以57个人群的3 628个样本为参考人群数据库,进行20份样本的族群来源推断,推断结果与样本的实际来源一致。本研究建立的常染色体72个SNPs微流控芯片体系可以有效地进行SNP多态性分析检测,基于参考数据库,20份检测样本族群推断的准确性为100%。
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关键词
族群推断
单核苷酸多态性复合体系
微流控芯片
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题名
基于微流控芯片的72重单核苷酸多态性族群推断系统的构建
1
作者
任苹
刘京
蔺日胜
刘杨
黄美莎
胡胜
徐友春
李彩霞
机构
山西医科大学
公安
部物证鉴定中心
清华大学生物医学工程系
内蒙古锡林郭勒盟公安局刑警支队
出处
《色谱》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第7期599-607,共9页
基金
国家重点研发计划(2017YFC0803501)
国家自然科学基金项目(81772027)
+2 种基金
基本科研业务费专项资金项目(2016JB039)
公安部物证鉴定中心协同创新工作项目(2017XTCX01)
公安科技成果推广引导计划(2016TGYDGAES14)
文摘
建立了常染色体单核苷酸多态性(SNPs)复合检测芯片体系,用于未知个体的族群来源推断。基于前期筛选的74-SNPs组合,采用竞争性等位基因特异性聚合酶链式反应(PCR)的原理构建SNPs的扩增体系,在微流控芯片的每个反应孔内完成一个SNP的检测,通过高通量PCR微流控芯片实现了其中72个SNPs的同步检测。芯片的扩增由平板PCR仪完成,反应孔的荧光信号通过激光共聚焦扫描仪检测,最终通过提取的荧光值进行结果分析。使用该芯片检测获得52份样本的SNPs分型,分型结果的准确率为100%。以57个人群的3 628个样本为参考人群数据库,进行20份样本的族群来源推断,推断结果与样本的实际来源一致。本研究建立的常染色体72个SNPs微流控芯片体系可以有效地进行SNP多态性分析检测,基于参考数据库,20份检测样本族群推断的准确性为100%。
关键词
族群推断
单核苷酸多态性复合体系
微流控芯片
Keywords
ancestry inference
single nucleotide polymorphism complex system
microfluidic chip
分类号
O658 [理学—分析化学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于微流控芯片的72重单核苷酸多态性族群推断系统的构建
任苹
刘京
蔺日胜
刘杨
黄美莎
胡胜
徐友春
李彩霞
《色谱》
CAS
CSCD
北大核心
2018
0
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