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蓖麻PIP5K1基因克隆、生物信息学及功能分析
1
作者
李明静
袁朴芳
+5 位作者
罗蕊
尹明达
王志妍
户雪妹
顾晓慧
黄风兰
《中国种业》
2024年第1期88-94,共7页
蓖麻PIP5K1基因在植物生长发育和抗逆过程中起重要作用。为探究蓖麻PIP5K1基因在蓖麻物种中的生物学功能和不同时期雌性植株中的表达情况,以aLmAB2品系的蓖麻花序为试验材料,克隆PIP5K1基因,对该基因编码的蛋白质进行生物信息学分析,并...
蓖麻PIP5K1基因在植物生长发育和抗逆过程中起重要作用。为探究蓖麻PIP5K1基因在蓖麻物种中的生物学功能和不同时期雌性植株中的表达情况,以aLmAB2品系的蓖麻花序为试验材料,克隆PIP5K1基因,对该基因编码的蛋白质进行生物信息学分析,并对PIP5K1基因在不同时期雌性系植株的表达模式进行分析。结果表明:从蓖麻花序轴顶端将总RNA提取出来,并将其反转录成cDNA,克隆后得到一个全长为2325bp的PIP5K1基因片段,经测序后比对这一基因序列和NCBI参考基因序列相同。对该基因所编码蛋白展开生物信息学分析,确定PIP5K1基因所编码蛋白质的氨基酸等电点为8.85,氨基酸数目为774,分子量大小为87967.37Da,是一种亲水性稳定蛋白;无跨膜螺旋区,属于非跨膜蛋白;蛋白质二级结构由α螺旋、β转角、伸展链及无规卷曲构成;三级结构与二级结构预测结果一致;与同属于大戟科的木薯亲缘关系较近,与其他科亲缘关系较远。qRT-PCR分析表明,PIP5K1在标雌系、单雌系、两性系花序中均有不同程度的上调和下调,推测PIP5K1基因参与蓖麻花序发育的调控。本研究为探究PIP5K1基因促进蓖麻植株的生长发育机制奠定了理论基础。
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关键词
蓖麻
PIP5K1
基因克隆
生物信息学分析
功能分析
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题名
蓖麻PIP5K1基因克隆、生物信息学及功能分析
1
作者
李明静
袁朴芳
罗蕊
尹明达
王志妍
户雪妹
顾晓慧
黄风兰
机构
内蒙古
民族大学生命科学与食品学院
内蒙古自治区蓖麻育种国家民委重点实验室/内蒙古自治区蓖麻育种与综合利用重点实验室/蓖麻产业技术创新内蒙古自治区工程研究中心/内蒙古自治区高校蓖麻产业工程技术研究中心
出处
《中国种业》
2024年第1期88-94,共7页
基金
国家自然科学基金项目(31860071)
教育部新农科研究与改革实践项目(2020114)
+6 种基金
内蒙古自然科学基金面上项目(2021MS03008)
内蒙古自治区草原英才创新团队—蓖麻分子育种研究创新人才团队滚动支持计划(2022)
2021年度国家民委高等教育教学改革研究项目(21082)
内蒙古自治区科技厅立项内蒙古自治区蓖麻育种与综合利用重点实验室建设项目
内蒙古民族大学2022年度自治区直属高校基本科研业务费项目(237)
内蒙古民族大学2023年度自治区直属高校基本科研业务费项目(225,227,243,244)
内蒙古自治区蓖麻产业协同创新中心开放基金项目(MDK2021011,MDK2022014)。
文摘
蓖麻PIP5K1基因在植物生长发育和抗逆过程中起重要作用。为探究蓖麻PIP5K1基因在蓖麻物种中的生物学功能和不同时期雌性植株中的表达情况,以aLmAB2品系的蓖麻花序为试验材料,克隆PIP5K1基因,对该基因编码的蛋白质进行生物信息学分析,并对PIP5K1基因在不同时期雌性系植株的表达模式进行分析。结果表明:从蓖麻花序轴顶端将总RNA提取出来,并将其反转录成cDNA,克隆后得到一个全长为2325bp的PIP5K1基因片段,经测序后比对这一基因序列和NCBI参考基因序列相同。对该基因所编码蛋白展开生物信息学分析,确定PIP5K1基因所编码蛋白质的氨基酸等电点为8.85,氨基酸数目为774,分子量大小为87967.37Da,是一种亲水性稳定蛋白;无跨膜螺旋区,属于非跨膜蛋白;蛋白质二级结构由α螺旋、β转角、伸展链及无规卷曲构成;三级结构与二级结构预测结果一致;与同属于大戟科的木薯亲缘关系较近,与其他科亲缘关系较远。qRT-PCR分析表明,PIP5K1在标雌系、单雌系、两性系花序中均有不同程度的上调和下调,推测PIP5K1基因参与蓖麻花序发育的调控。本研究为探究PIP5K1基因促进蓖麻植株的生长发育机制奠定了理论基础。
关键词
蓖麻
PIP5K1
基因克隆
生物信息学分析
功能分析
分类号
S565.6 [农业科学—作物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
蓖麻PIP5K1基因克隆、生物信息学及功能分析
李明静
袁朴芳
罗蕊
尹明达
王志妍
户雪妹
顾晓慧
黄风兰
《中国种业》
2024
0
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