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中间锦鸡儿CiUPF0114克隆与表达及豆科UPF0114基因家族成员分析
1
作者
杨杞
牛肖翠
+1 位作者
王瑞刚
李国婧
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第3期760-768,共9页
本研究克隆了中间锦鸡儿一个CiUPF0114基因,该基因编码框长876 bp,编码291个氨基酸的蛋白质,预测等电点9.83,分子量32.13 kD。利用荧光定量PCR检测发现,在干旱、脱水和冷处理后,CiUPF0114基因转录水平的表达量均明显上调。通过全基因组...
本研究克隆了中间锦鸡儿一个CiUPF0114基因,该基因编码框长876 bp,编码291个氨基酸的蛋白质,预测等电点9.83,分子量32.13 kD。利用荧光定量PCR检测发现,在干旱、脱水和冷处理后,CiUPF0114基因转录水平的表达量均明显上调。通过全基因组筛选,获得了29个来自于8种豆科植物以及模式植物拟南芥和水稻中的UPF0114基因家族成员,并对其进行了系统进化分析、基因结构和保守基序分析。系统进化分析将UPF0114基因分成A和B两个亚家族,A亚家族又分成A1和A2两个组,本研究中克隆的中间锦鸡儿CiUPF0114属于B亚家族成员。通过对蛋白长度、结构域数量、分子量、等电点、基因结构和保守基序的分析发现,29个UPF0114基因差异不大,说明该基因家族成员在进化上相对保守。该研究为进一步验证CiUPF0114基因的功能奠定了基础。
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关键词
CiUPF0114
基因克隆
中间锦鸡儿
基因家族
进化分析
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职称材料
中间锦鸡儿WRKY15基因克隆及其生物信息学分析
被引量：
3
2
作者
张文静
李思
+3 位作者
刘杨
王瑞刚
李国婧
万永青
《中国草地学报》
CSCD
北大核心
2019年第4期23-31,共9页
WRKY家族是高等植物中最大的转录因子家族之一,参与多种生物与非生物胁迫过程的调节。本研究采用PCR技术从中间锦鸡儿(Caragana intermedia)中克隆了CiWRKY15基因。结合生物信息学方法对CiWRKY15基因编码的蛋白质进行理化性质、亚细胞...
WRKY家族是高等植物中最大的转录因子家族之一,参与多种生物与非生物胁迫过程的调节。本研究采用PCR技术从中间锦鸡儿(Caragana intermedia)中克隆了CiWRKY15基因。结合生物信息学方法对CiWRKY15基因编码的蛋白质进行理化性质、亚细胞定位、蛋白结构以及系统进化等进行预测分析。结果显示:CiWRKY15基因序列包含1005bp开放阅读框,编码335个氨基酸,含有一个典型的WRKY结构域,属于Group IId亚族。预测蛋白分子量为47.39KD,等电点为8.59,它的亚细胞定位于细胞核内。该研究结果为进一步挖掘与非生物胁迫相关的WRKY15转录因子的功能,以及为改进植物抗生物和非生物逆境的特性提供了理论依据。
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关键词
中间锦鸡儿
WRKY15
基因克隆
生物信息学
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职称材料
中间锦鸡儿CiPUB22基因克隆与功能分析
3
作者
岳文冉
于秀敏
+4 位作者
岳俊燕
杨杞
韩晓东
王瑞刚
李国婧
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第11期1961-1967,共7页
中间锦鸡儿(Caragana intermedia)耐旱、耐寒、耐盐碱,是西北干旱地区的重要固沙灌木,筛选其优良抗逆境基因,可以作为林草基因工程的基因源。该研究在中间锦鸡儿干旱胁迫转录组文库中找到1条CiPUB22 (plant U-box 22)基因的cDNA全长序列...
中间锦鸡儿(Caragana intermedia)耐旱、耐寒、耐盐碱,是西北干旱地区的重要固沙灌木,筛选其优良抗逆境基因,可以作为林草基因工程的基因源。该研究在中间锦鸡儿干旱胁迫转录组文库中找到1条CiPUB22 (plant U-box 22)基因的cDNA全长序列,CiPUB22基因包括1 260bp开放阅读框,编码419个氨基酸。实时荧光定量PCR结果表明,在脱水、盐和ABA处理1h后CiPUB22基因表达量上升并达到最高水平,分别为对照表达量的12倍、35倍和7倍,干旱处理后12d达到最高值,为对照的2.5倍,表明CiPUB22的转录水平受非生物胁迫诱导。构建CiPUB22基因的过表达载体并转化野生型拟南芥,对转基因纯合体株系抗逆性分析发现,在150mmol/L NaCl、1μmol/L ABA和400mmol/L甘露醇处理下,过表达株系的萌发率均低于野生型,说明过表达CiPUB22基因降低了拟南芥在种子萌发过程中对盐和渗透胁迫的耐受性。
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关键词
E3泛素连接酶
中间锦鸡儿
CiPUB22
种子萌发
渗透胁迫
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职称材料
题名
中间锦鸡儿CiUPF0114克隆与表达及豆科UPF0114基因家族成员分析
1
作者
杨杞
牛肖翠
王瑞刚
李国婧
机构
内蒙古
农业大学生命科学学院
内蒙古自治区
植物
逆
境生理
与分子
生物学重点实验室
内蒙古自治区抗逆植物遗传资源利用与分子改良科技创新团队
出处
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第3期760-768,共9页
基金
国家自然科学基金项目(31560199)~~
文摘
本研究克隆了中间锦鸡儿一个CiUPF0114基因,该基因编码框长876 bp,编码291个氨基酸的蛋白质,预测等电点9.83,分子量32.13 kD。利用荧光定量PCR检测发现,在干旱、脱水和冷处理后,CiUPF0114基因转录水平的表达量均明显上调。通过全基因组筛选,获得了29个来自于8种豆科植物以及模式植物拟南芥和水稻中的UPF0114基因家族成员,并对其进行了系统进化分析、基因结构和保守基序分析。系统进化分析将UPF0114基因分成A和B两个亚家族,A亚家族又分成A1和A2两个组,本研究中克隆的中间锦鸡儿CiUPF0114属于B亚家族成员。通过对蛋白长度、结构域数量、分子量、等电点、基因结构和保守基序的分析发现,29个UPF0114基因差异不大,说明该基因家族成员在进化上相对保守。该研究为进一步验证CiUPF0114基因的功能奠定了基础。
关键词
CiUPF0114
基因克隆
中间锦鸡儿
基因家族
进化分析
Keywords
CiUPF0114
gene clone
Caragana intermedia Kuang & H.C.Fu
gene family
phylogenetic analysis
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
中间锦鸡儿WRKY15基因克隆及其生物信息学分析
被引量：
3
2
作者
张文静
李思
刘杨
王瑞刚
李国婧
万永青
机构
内蒙古
农业大学生命科学学院
大连市食品检验所
内蒙古自治区
植物
逆
境生理
与分子
生物学重点实验室
内蒙古自治区抗逆植物遗传资源利用与分子改良科技创新团队
北京智飞绿竹生物制药有限公司
出处
《中国草地学报》
CSCD
北大核心
2019年第4期23-31,共9页
基金
国家自然科学基金项目(31860217)资助
文摘
WRKY家族是高等植物中最大的转录因子家族之一,参与多种生物与非生物胁迫过程的调节。本研究采用PCR技术从中间锦鸡儿(Caragana intermedia)中克隆了CiWRKY15基因。结合生物信息学方法对CiWRKY15基因编码的蛋白质进行理化性质、亚细胞定位、蛋白结构以及系统进化等进行预测分析。结果显示:CiWRKY15基因序列包含1005bp开放阅读框,编码335个氨基酸,含有一个典型的WRKY结构域,属于Group IId亚族。预测蛋白分子量为47.39KD,等电点为8.59,它的亚细胞定位于细胞核内。该研究结果为进一步挖掘与非生物胁迫相关的WRKY15转录因子的功能,以及为改进植物抗生物和非生物逆境的特性提供了理论依据。
关键词
中间锦鸡儿
WRKY15
基因克隆
生物信息学
Keywords
Caragana intermedia
WRKY15
Gene cloning
Bioinformatics
分类号
S793.3 [农业科学—林木遗传育种]
在线阅读
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职称材料
题名
中间锦鸡儿CiPUB22基因克隆与功能分析
3
作者
岳文冉
于秀敏
岳俊燕
杨杞
韩晓东
王瑞刚
李国婧
机构
内蒙古
农业大学生命科学学院
出处
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第11期1961-1967,共7页
基金
内蒙古自治区科技创新引导项目(KCBJ2018012).
文摘
中间锦鸡儿(Caragana intermedia)耐旱、耐寒、耐盐碱,是西北干旱地区的重要固沙灌木,筛选其优良抗逆境基因,可以作为林草基因工程的基因源。该研究在中间锦鸡儿干旱胁迫转录组文库中找到1条CiPUB22 (plant U-box 22)基因的cDNA全长序列,CiPUB22基因包括1 260bp开放阅读框,编码419个氨基酸。实时荧光定量PCR结果表明,在脱水、盐和ABA处理1h后CiPUB22基因表达量上升并达到最高水平,分别为对照表达量的12倍、35倍和7倍,干旱处理后12d达到最高值,为对照的2.5倍,表明CiPUB22的转录水平受非生物胁迫诱导。构建CiPUB22基因的过表达载体并转化野生型拟南芥,对转基因纯合体株系抗逆性分析发现,在150mmol/L NaCl、1μmol/L ABA和400mmol/L甘露醇处理下,过表达株系的萌发率均低于野生型,说明过表达CiPUB22基因降低了拟南芥在种子萌发过程中对盐和渗透胁迫的耐受性。
关键词
E3泛素连接酶
中间锦鸡儿
CiPUB22
种子萌发
渗透胁迫
Keywords
E3 ubiquitin ligase
Caragana intermedia
CiPUB 22
seed germination
osmotic stress
分类号
Q786 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
中间锦鸡儿CiUPF0114克隆与表达及豆科UPF0114基因家族成员分析
杨杞
牛肖翠
王瑞刚
李国婧
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
中间锦鸡儿WRKY15基因克隆及其生物信息学分析
张文静
李思
刘杨
王瑞刚
李国婧
万永青
《中国草地学报》
CSCD
北大核心
2019
3
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
中间锦鸡儿CiPUB22基因克隆与功能分析
岳文冉
于秀敏
岳俊燕
杨杞
韩晓东
王瑞刚
李国婧
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018
0
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职称材料
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