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一株羊口疮病毒的全基因组测序及功能分析
1
作者 李阳 马园 +3 位作者 王国华 田普厚 李成龙 张七斤 《中国动物传染病学报》 CAS 北大核心 2024年第4期46-52,共7页
为了更好了解羊口疮病毒(Orf virus,ORFV)基因组的数据库信息及功能分析,本试验通过Illumina TruSeq^(TM)Nano DNA Sample Prep Kit方法构建文库对分离株ORFV-Q进行全基因组测序,进行NR注释、GO注释、KEGG注释等进行生物信息学分析。试... 为了更好了解羊口疮病毒(Orf virus,ORFV)基因组的数据库信息及功能分析,本试验通过Illumina TruSeq^(TM)Nano DNA Sample Prep Kit方法构建文库对分离株ORFV-Q进行全基因组测序,进行NR注释、GO注释、KEGG注释等进行生物信息学分析。试验结果显示,ORFV-Q株基因组大小为127160 bp,GC含量分布未见异常,预测到123个基因。根据NR数据库注释对比结果,有116个基因得到注释;根据GO数据库注释,其中参与生物学途径基因有30个,细胞组分基因有33个,分子功能基因有8个;通过与KEGG代谢通路数据库进行比对,有5个基因可以对应;Swiss-Prot数据库注释共有75个基因的蛋白序列功能被注释。本研究通过对ORFV-Q株进行全基因组测序,并对其进行基因组组分分析和基因功能注释,不仅为ORFV基因组的研究提供数据支持,也为后续疫苗的开发研究提供了理论依据。 展开更多
关键词 羊口疮病毒 全基因组测序 功能分析
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大白猪的胎次对窝重性状的影响
2
作者 梁任杰 潘相臣 +3 位作者 王立辉 白书瑜 崔亚轩 白俊艳 《河南畜牧兽医》 2024年第23期6-8,共3页
目前我国正处于生猪养殖规模化的加速时期,母猪是规模化养猪场的核心,母猪的繁殖性能直接关系着我国猪场规模化的速度,而且繁殖性能随着胎次的增加而变化。利用EXCEL软件对民权正大3000母猪场大白猪的五项繁殖数据进行整理后,再用SPSS... 目前我国正处于生猪养殖规模化的加速时期,母猪是规模化养猪场的核心,母猪的繁殖性能直接关系着我国猪场规模化的速度,而且繁殖性能随着胎次的增加而变化。利用EXCEL软件对民权正大3000母猪场大白猪的五项繁殖数据进行整理后,再用SPSS软件依次对大白猪的五项繁殖性状进行胎次的回归分析,根据最优回归模型得出大白猪繁殖性能随胎次的变化规律。 展开更多
关键词 大白猪 回归分析 胎次 繁殖性能
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猪繁殖与呼吸综合征净化:美国的目标与措施
3
作者 张书存 郭海军 廖智慧 《猪业科学》 2013年第6期49-52,共4页
自1991年蓝耳病的病因被确认为RNA病毒以来，美国对这种疫病的控制既有诸多成功的经验，也有不少失败的教训。1994年美国明尼苏达大学的ScottDee博士首次采用检测与淘汰结合部分清群措施率先在美国的一些猪场净化蓝耳病。
关键词 猪繁殖与呼吸综合征 猪场净化 美国 明尼苏达大学 RNA病毒 结合部分 蓝耳病 疫病
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羊源与骆驼源羊口疮病毒免疫相关基因的比较分析 被引量：3
4
作者 丁学东 王国华 +6 位作者 潘相臣 刘冬冬 罗学东 马园 李茂林 崔琦 张七斤 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2020年第12期3815-3824,共10页
试验旨在探究羊口疮病毒(Orf virus,ORFV)在感染不同物种后其免疫相关基因所表现出的差异变化。对采集到的羊和骆驼ORFV病料进行病毒基因组提取,分别命名为ORFV-Y和ORFV-LT。根据GenBank中ORFV全基因组序列(登录号:KF234407.1)设计并合... 试验旨在探究羊口疮病毒(Orf virus,ORFV)在感染不同物种后其免疫相关基因所表现出的差异变化。对采集到的羊和骆驼ORFV病料进行病毒基因组提取,分别命名为ORFV-Y和ORFV-LT。根据GenBank中ORFV全基因组序列(登录号:KF234407.1)设计并合成3对特异性引物,分别扩增ORFV-Y和ORFV-LT的B2L、F1L和VIR基因片段,并将扩增得到的基因片段分别克隆到pMD19-T载体上,转化大肠杆菌DH5α感受态细胞,对重组质粒进行鉴定,选取阳性克隆质粒进行测序,用DNAStar软件对所获序列进行拼接后,与NCBI上已公布的13组ORFV全基因组相应基因序列进行同源性比对、氨基酸序列分析和系统进化树构建。结果显示,两组基因组与参考序列的B2L、F1L和VIR基因核苷酸同源性分别为92.8%~99.2%、95.7%~99.5%和77.6%~100%。将两组基因组与参考序列进行氨基酸序列比对分析后发现,两组基因组之间的免疫相关基因均表现出较为明显的差异,且F1L基因有一定的规律可循。对B2L、F1L和VIR基因进行系统进化树构建分析后发现,ORFV-Y与中国福建山羊株亲缘关系较近,而ORFV-LT与参考毒株进化关系均较远,且单独成为一个分支。综上,ORFV在感染羊和骆驼时其免疫相关基因出现了较为明显的差异,为深入探究ORFV感染不同物种其基因序列发生的变化及未来针对不同物种的疫苗研制提供参考。 展开更多
关键词 羊口疮病毒(ORFV) 羊 骆驼 免疫相关基因
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口蹄疫病毒O型泛亚株VP1蛋白的二级结构及抗原表位预测 被引量：3
5
作者 李阳 马园 +4 位作者 王国华 田普厚 李成龙 刘冬冬 张七斤 《中国动物检疫》 CAS 2021年第11期101-109,共9页
为获得口蹄疫病毒(FMDV)O/PanAsia毒株VP1蛋白的抗原信息,从而为制备多肽疫苗提供理论依据,运用生物信息学软件,对O/PanAsia毒株的结构蛋白VP1理化性质、结构功能以及细胞表位进行分析,预测抗原表位以选择合适肽段。应用ProParam、TMHMM... 为获得口蹄疫病毒(FMDV)O/PanAsia毒株VP1蛋白的抗原信息,从而为制备多肽疫苗提供理论依据,运用生物信息学软件,对O/PanAsia毒株的结构蛋白VP1理化性质、结构功能以及细胞表位进行分析,预测抗原表位以选择合适肽段。应用ProParam、TMHMM Server、ProScale和SignaIP等在线工具,分析VP1蛋白氨基酸序列,运用计算机技术和分子生物学软件,分析预测VP1蛋白的基本理化性质、结构功能以及可能的B细胞和T细胞抗原表位,筛选B细胞表位肽段并对VP1的两个主要T细胞表位CTL和Th细胞表位进行预测。结果显示:O/PanAsia毒株VP1蛋白的等电点为9.49,相对分子质量为23520.83;VP1蛋白的B细胞表位为8~23、135~149和193~205位氨基酸。预测该VP1有10个CTL和10个Th细胞抗原表位,表明其具有较好的免疫原性;最终筛选出VP1蛋白的5个CTL和5个Th优势表位。用生物信息学方法预测O/PanAsia毒株VP1蛋白为稳定性蛋白,含有T、B淋巴细胞抗原表位。本研究为FMDV的进一步研究和疫苗制备奠定了基础。 展开更多
关键词 口蹄疫病毒 VP1蛋白 理化性质 抗原表位
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口蹄疫病毒VP1基因密码子偏好性分析 被引量：1
6
作者 马园 仲亮 +8 位作者 王国华 田普厚 张涛 武俊兰 刘月 马红艳 徐婉瑛 石顺利 张七斤 《中国动物检疫》 CAS 2021年第4期116-123,共8页
VP1蛋白是口蹄疫病毒(FMDV)的主要结构蛋白,可诱导机体产生中和抗体以及激发保护性免疫应答。为探究VP1基因密码子偏好性,筛选出其最佳体外表达系统,使用Visual Gene Developer、CodonW、GraphPad Prism等软件,对VP1基因进行密码子偏好... VP1蛋白是口蹄疫病毒(FMDV)的主要结构蛋白,可诱导机体产生中和抗体以及激发保护性免疫应答。为探究VP1基因密码子偏好性,筛选出其最佳体外表达系统,使用Visual Gene Developer、CodonW、GraphPad Prism等软件,对VP1基因进行密码子偏好性分析,同时将VP1基因密码子使用频率与大肠杆菌、毕赤酵母、昆虫杆状病毒和哺乳动物细胞表达系统作了比较。结果显示,VP1基因的CAI为0.21,ENC为55.43,GC3S为65.26%,表明该基因密码子使用偏好较弱并且密码子偏好以G/C碱基结尾。结合VP1基因与各表达系统密码子使用频率比值,发现其与昆虫杆状病毒表达系统频率比值差异最小且CAI最大,因此推断昆虫杆状病毒表达系统是FMDV VP1基因最适体外表达系统。本研究为FMDV亚单位疫苗研制等提供了技术基础。 展开更多
关键词 口蹄疫病毒 VP1基因 密码子 外源表达 昆虫杆状病毒表达系统
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猪场口蹄疫净化和免疫无疫区建设的思考 被引量：1
7
作者 杨志华 姚国忠 +1 位作者 刘辉 章红兵 《今日养猪业》 2023年第1期28-30,共3页
猪口蹄疫是感染性极强,严重威胁着养猪业的健康发展。我国现阶段主要采取以强制免疫为主的综合防控措施和加强东北、山东和海南等无疫区的建设,对口蹄疫的防控已经取得初步成效,为更多的无疫区建设打好坚实的基础。
关键词 口蹄疫 无疫区 强制免疫 养猪业 综合防控措施 猪场 感染性
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PRRS病原学分析 被引量：1
8
作者 桑军亮 《今日养猪业》 2017年第8期10-12,共3页
20世纪80年代，美国猪群暴发了几次疾病，特点为严重的繁殖障碍、呼吸道疾病、生长迟缓以及死亡率增加。当时该病的病因不明。1990年11月德国也暴发了具有相似临床症状的疾病。但是该病在德国与美国暴发之间并没有相关性。该病传播迅速... 20世纪80年代，美国猪群暴发了几次疾病，特点为严重的繁殖障碍、呼吸道疾病、生长迟缓以及死亡率增加。当时该病的病因不明。1990年11月德国也暴发了具有相似临床症状的疾病。但是该病在德国与美国暴发之间并没有相关性。该病传播迅速，仅1991年5月德国记录在案的就暴发了3000余次，并在此后的4年间便传遍了整个欧洲。在亚洲，该病于1988年首先在日本暴发，中国台湾于1991年也暴发该病。 展开更多
关键词 PRRS 呼吸道疾病 学分 病原 繁殖障碍 生长迟缓 临床症状 死亡率
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不同佐剂制备牛口蹄疫O型灭活疫苗的效力评价试验
9
作者 辛俊宝 李少英 +4 位作者 黄凯 赵炳武 么亮 史永贵 于雪 《中国奶牛》 2013年第5期36-38,共3页
本研究采用两种不同佐剂分别与同种抗原乳化制备成两批牛口蹄疫O型灭活疫苗(对应代号分别为A和B),并对其物理性状、安全性、效力等方面进行检验。结果表明,A疫苗的保护率高于B疫苗,佐剂对疫苗的保护率有一定的影响。
关键词 佐剂 口蹄疫疫苗 效力评价
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国内PRRS的流行病学
10
作者 桑军亮 《今日养猪业》 2017年第8期15-16,共2页
PRRS最早于1987年报道于美国南部。在20世纪90年代初期便传遍了整个西欧。在亚洲，我国台湾地区1991年出现此病，日本于1994年暴发该病，在我国大陆地区，郭宝清等1996年首次从疑似PRRS的流产猪胎儿中分离出了PRRSV。我国PRRSV主要为美... PRRS最早于1987年报道于美国南部。在20世纪90年代初期便传遍了整个西欧。在亚洲，我国台湾地区1991年出现此病，日本于1994年暴发该病，在我国大陆地区，郭宝清等1996年首次从疑似PRRS的流产猪胎儿中分离出了PRRSV。我国PRRSV主要为美洲型。2006年我国江西首先暴发高致病性猪繁殖与呼吸综合征，随后出现在我国很多省份，给我国养猪业造成了巨大的经济损失。 展开更多
关键词 PRRSV 流行病学 猪繁殖与呼吸综合征 国内 美国南部 台湾地区 大陆地区 高致病性
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