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ANLN在肾透明细胞癌中的表达及其与预后和免疫浸润相关性的生物信息学分析 被引量:1
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作者 刘东洋 张楠 +3 位作者 李海玲 王昱锜 苏俞菠 高玉敏 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第8期1726-1734,共9页
目的:探讨肌动蛋白结合蛋白ANLN在肾透明细胞癌(ccRCC)中的诊断和预后价值及其与肿瘤微环境的关系。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载ccRCC基因表达数据和临床数据。Wilcoxon秩和检验和Logistic回归评估ANLN表达与临床病理特征的... 目的:探讨肌动蛋白结合蛋白ANLN在肾透明细胞癌(ccRCC)中的诊断和预后价值及其与肿瘤微环境的关系。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载ccRCC基因表达数据和临床数据。Wilcoxon秩和检验和Logistic回归评估ANLN表达与临床病理特征的关系。受试者工作特征(ROC)曲线评估ANLN表达在ccRCC中的诊断价值。Kaplan-Meier和Cox回归分析研究ANLN表达对总生存期的影响。基因集富集分析(GSEA)识别ccRCC中ANLN相关信号通路。ESTIMATE算法、肿瘤免疫估计资源(TIMER)数据库和CIBERSORT算法分析ANLN表达与免疫浸润的关系。CellMiner数据库计算ANLN与药物敏感性的关系。结果:ANLN在ccRCC组织中表达明显上调。ccRCC中ANLN表达与临床病理特征显著相关。ROC分析显示,ANLN在ccRCC中具有较高的诊断价值。ANLN高表达与预后不良显著相关。多变量Cox回归分析显示ANLN高表达是ccRCC患者总生存期的独立危险因素。GSEA显示ANLN与多种信号通路有关。在免疫方面,ANLN与ccRCC肿瘤微环境、免疫浸润和免疫检查点分子密切相关。ANLN表达与多数抗肿瘤药物敏感性呈负相关。结论:ANLN是ccRCC潜在的诊断和预后生物标志物和免疫治疗靶点。 展开更多
关键词 ANLN 肾透明细胞癌 预后 生物标志物 免疫浸润
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蒙古族瘦素受体、脂联素受体基因多态性与2型糖尿病交互作用研究 被引量:4
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作者 邬倩 高玉敏 +6 位作者 李乌云塔娜 庞慧 赵燕平 蔚培尧 王志迪 陈乐 赵灵燕 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2022年第1期57-61,共5页
目的探究瘦素受体(LEPR)基因rs3790433与rs12037879、脂联素受体(ADIPOR1)基因rs10920533和ADIPOR2基因rs11061971位点多态性与环境因素交互作用对蒙古族2型糖尿病的影响。方法采用病例-对照方法,病例组来自呼和浩特市、锡林浩特市和通... 目的探究瘦素受体(LEPR)基因rs3790433与rs12037879、脂联素受体(ADIPOR1)基因rs10920533和ADIPOR2基因rs11061971位点多态性与环境因素交互作用对蒙古族2型糖尿病的影响。方法采用病例-对照方法,病例组来自呼和浩特市、锡林浩特市和通辽市的238例蒙古族2型糖尿病患者,对照组为238例同期健康蒙古族人群。多重高温连接酶检测反应检测基因位点多态性,广义多因素降维法(GMDR)分析基因多态性与环境因素的交互作用。结果rs3790433位点CC+CT基因型、rs1106197位点AA+AT基因型为蒙古族2型糖尿病"高危险"基因型。GMDR结果显示,一阶交互最优模型为rs3790433与超重/肥胖的交互作用模型(P<0.05)。结论LEPR、ADIPOR基因位点多态性与蒙古族2型糖尿病易感性相关,LEPR和ADIPOR2基因与环境的交互作用可能增加蒙古族2型糖尿病的发病风险。 展开更多
关键词 蒙古族 2型糖尿病 单核苷酸多态性 环境因素 交互作用
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2017-2019年呼和浩特市甲型A(H1N1)pdm09流感病毒基因特征分析 被引量:4
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作者 刘东洋 杨月清 +6 位作者 樊红霞 罗云 杨海荣 郝建峰 李海玲 刘艳超 高玉敏 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期376-382,共7页
目的了解呼和浩特市甲型A(H1N1)pdm09流感病毒遗传进化特征及抗原位点、糖基化位点和耐药位点的变异情况,为流感防控提供科学依据。方法采集2017-2019年呼和浩特市3家哨点医院的流感样病例(ILI)咽拭子标本进行核酸检测,阳性样本通过MDC... 目的了解呼和浩特市甲型A(H1N1)pdm09流感病毒遗传进化特征及抗原位点、糖基化位点和耐药位点的变异情况,为流感防控提供科学依据。方法采集2017-2019年呼和浩特市3家哨点医院的流感样病例(ILI)咽拭子标本进行核酸检测,阳性样本通过MDCK细胞和鸡胚进行病毒分离。随机抽取15株甲型A(H1N1)pdm09流感毒株进行基因测序分析。采用MEGA7.0.14软件、DNASTAR7.0.1软件和NetNGlyc1.0软件进行基因进化树分析、核苷酸同源性分析和糖基化位点分析。结果呼和浩特市2017-2019年15株甲型A(H1N1)pdm09分离株与疫苗株A/Brisbane/02/2018和A/Michigan/45/2015共同属于6B.1分支。各年度分离株与疫苗株A/Brisbane/02/2018的组间遗传距离分别为0.004、0.011和0.013。相较于疫苗株A/California/07/2009和A/Michigan/45/2015,2017年起甲型A(H1N1)pdm09病毒抗原位点变异较大,但与疫苗株A/Brisbane/02/2018相比并未发生抗原漂移现象,与疫苗株匹配效果较好。分离株与疫苗株A/California/07/2009相比多了糖基化位点162NQS/T。分离株与神经氨酸酶抑制剂耐药相关的9个关键氨基酸位点没有发生变异。结论随着时间推移,呼和浩特市甲型A(H1N1)pdm09流感病毒与疫苗株的基因相似性逐渐降低,提示呼和浩特市病毒在不断进化中,应持续监测。本次研究中的分离株与WHO推荐的2019-2020年北半球疫苗株A/Brisbane/02/2018相比未发生抗原漂移现象,WHO推荐的疫苗株对目前流行的甲型A(H1N1)pdm09流感仍有较好的保护效果。所有分离株NA基因均未发生H275Y耐药突变,提示呼和浩特市流行的甲型A(H1N1)pdm09流感仍然对奥司他韦等NA抑制剂药物敏感。 展开更多
关键词 甲型A(H1N1)pdm09 流感病毒 血凝素 神经氨酸酶 基因特征
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2型糖尿病患者瘦素受体基因多态性与环境交互作用研究 被引量:8
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作者 王志迪 庞慧 +2 位作者 崔萌 陈乐 赵灵燕 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2020年第17期2390-2394,共5页
目的探讨2型糖尿病(type 2 diabetes mellitus,T2DM)遗传易感性与LEPR基因rs1892534、rs2211651、rs1805096位点多态性及环境因素的交互作用。方法病例组来源于内蒙古医科大学附属医院、中医医院及国际蒙医医院的203例2型糖尿病患者,对... 目的探讨2型糖尿病(type 2 diabetes mellitus,T2DM)遗传易感性与LEPR基因rs1892534、rs2211651、rs1805096位点多态性及环境因素的交互作用。方法病例组来源于内蒙古医科大学附属医院、中医医院及国际蒙医医院的203例2型糖尿病患者,对照组为203例健康体检人群。多重高温连接酶检测反应(iMLDR)检测LEPR基因SNP位点多态性,广义多因子降维法(GMDR)分析LEPR基因与环境交互作用。结果LEPR基因rs1805096、rs1892534、rs2211651基因型频率分布在病例组和对照组之间的差异有统计学意义(P<0.05),单体型GCG在两组间差异有统计学意义;交互作用分析结果显示,一阶交互最优模型是rs1805096、高脂饮食(P<0.05);二阶模型rs1805096、rs1892534及高血压疾病史模型和rs1805096、rs2211651及高脂饮食模型均存在交互作用(P<0.05)。结论呼和浩特地区汉族人群LEPR基因rs1805096、rs1892534、rs2211651单核苷酸多态性与T2DM易感性相关,GCG是T2DM的易感单体型,LEPR基因-环境的交互作用可能会增加T2DM的发病风险。 展开更多
关键词 2型糖尿病 LEPR基因 单体型 环境因素 交互作用 单核苷酸多态性
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